FCCT Biochemistry Lab:Courses:BiomedSeminars: Difference between revisions

From OpenWetWare
Jump to navigationJump to search
MDolinar (talk | contribs)
No edit summary
MDolinar (talk | contribs)
No edit summary
Line 1: Line 1:
== Splošno ==
== Splošno ==
Z letom 2007/8 se je prejšnji štiriletni univerzitetni podiplomski znanstveni program Biomedicina preoblikoval v triletni [http://www.uni-lj.si/files/ULJ/userfiles/ulj/studij_na_univerzi/podiplomski_studij/biomedicina/BrosuraBiomedicinaDoktorski2007.pdf doktorski študij], ki ga koordinira Medicinska fakulteta UL. Študenti, ki so se v preteklih vpisali v stari program, bodo študij po starem programu tudi dokončali, tisti, ki ste se vpisali v tem študijskem letu v 1. letnik, pa boste študirali po novem programu. Ta vključuje nove predmete in ima drugačna študijska pravila.<br>
Z letom 2007/8 se je prejšnji štiriletni univerzitetni podiplomski znanstveni program Biomedicina preoblikoval v triletni [http://www.uni-lj.si/files/ULJ/userfiles/ulj/studij_na_univerzi/podiplomski_studij/biomedicina/BrosuraBiomedicinaDoktorski2007.pdf doktorski študij], ki ga koordinira Medicinska fakulteta UL. Študenti, ki so se v preteklih vpisali v stari program, bodo študij po starem programu tudi dokončali, tisti, ki ste se vpisali v tem študijskem letu v 1. letnik, pa boste študirali po novem programu. Ta vključuje nove predmete in ima drugačna študijska pravila.<br>
V študijskem letu 2007/8 bodo pri doc. Dolinarju v okviru 2. modula (''Struktura in funkcija bioloških molekul'') pri predmetu ''I[http://www.uni-lj.si/files/ULJ/userfiles/ulj/studij_na_univerzi/podiplomski_studij/biomedicina/Urniki0708/BMB-0708.pdf zbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije]'' na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (14. februarja 2008), Renaturacija rekombinantnih proteinov (19. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (21. februarja). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 v veliki predavalnici Kemijskega inštituta na Hajdrihovi 19.  
 
V študijskem letu 2008/9 bodo pri doc. Dolinarju v okviru 2. modula (''Struktura in funkcija bioloških molekul'') pri predmetu ''I[http://www.uni-lj.si/files/ULJ/userfiles/ulj/studij_na_univerzi/podiplomski_studij/biomedicina/Urniki0708/BMB-0708.pdf zbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije]'' na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (12. februarja 2009), Renaturacija rekombinantnih proteinov (17. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (19. februarja). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 v veliki predavalnici Kemijskega inštituta na Hajdrihovi 19.  
Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji po naslednjem razporedu:
Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji po naslednjem razporedu:


Line 12: Line 13:
!referent
!referent
|-
|-
|14. 02. 2008
|17. 02. 2008
|Thomas A. Kost et al. (2005) Baculovirus as versatile vectors for protein expression in insect and mammalian cells. [http://www.nature.com/nbt/journal/v23/n5/abs/nbt1095.html Nature Biotechnol. 23, 567-575]
|članek 1
|Blaž Nemec
|študent 1
|-
|17. 02. 2008
|članek 2
|študent 2
|-
|-
|19. 02. 2008
|19. 02. 2008
|Ursula Rinas et al. (2007) Inclusion body anatomy and functioning of chaperone-mediated in vivo inclusion body disassembly during high-level recombinant protein production in ''Escherichia coli''. [http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6T3C-4KDV0HY-1&_user=634383&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_sort=d&view=c&_acct=C000033638&_version=1&_urlVersion=0&_userid=634383&md5=80ede503454915bc583f59a721447198 J. Biotechnol. 127, 244–257]
|članek 3
|Katarina Trdina
|študent 3
|-
|-
|19. 02. 2008
|19. 02. 2008
|Elena Garcia-Fruitos et al. (2007) Divergent genetic control of protein solubility and conformational quality in ''Escherichia coli''. [http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6WK7-4PMJK6P-5&_user=634383&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_sort=d&view=c&_acct=C000033638&_version=1&_urlVersion=0&_userid=634383&md5=215fa12ca177ba305d4faa157c79994f J. Mol. Biol. 374, 195–205]
|članek 4
|Barbara Muščet
|študent 4
|-
|21. 02. 2008
|Yanhua Fan et al. (2007) Expression of a ''Beauveria bassiana'' chitinase (Bbchit1) in ''Escherichia coli'' and ''Pichia pastoris''. [http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6WPJ-4P5NX48-3&_user=634383&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_sort=d&view=c&_acct=C000033638&_version=1&_urlVersion=0&_userid=634383&md5=812a467c68b4b1bcce35a2ecd0688320 Protein Expr. Purif. 56, 93-99]
|Maja Anko
|-
|21. 02. 2008
|Jean-Philippe Gaudry et al. (2008) Purification of the extracellular domain of the membrane protein GlialCAM expressed in HEK and CHO cells and comparison of the glycosylation. [http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6WPJ-4R3358G-1&_user=634383&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_sort=d&view=c&_acct=C000033638&_version=1&_urlVersion=0&_userid=634383&md5=08452be8631f95398d9232dc2b141c10 Protein Expr. Purif. 58, 94-102]
|Nina Kočevar
|}
|}


Naslovi člankov in povezave do njih bodo na voljo konec januarja. Prijave sprejemam do zasedbe mest.
== Navodila za pripravo ==
== Navodila za pripravo ==


Line 46: Line 45:
- predstavitev v programu PowerPoint v obsegu in na način, ki bo omogočil natančen vpogled v snov, predstavljeno v članku in bo služil kot osnova za razpravo <br>
- predstavitev v programu PowerPoint v obsegu in na način, ki bo omogočil natančen vpogled v snov, predstavljeno v članku in bo služil kot osnova za razpravo <br>


'''Predstavitve naj bi bile dolge okrog 45 minut. V tem času boste morali razložiti:'''<br>
'''Predstavitve naj bi bile dolge okrog 30 minut. V tem času boste morali razložiti:'''<br>
- ozadje/problem, ki ga članek obravnava, pri čemer poskušajte izluščiti ne samo namen dela, pač pa tudi delovno hipotezo <br>
- ozadje/problem, ki ga članek obravnava, pri čemer poskušajte izluščiti ne samo namen dela, pač pa tudi delovno hipotezo <br>
- predhodno opravljeno delo (ali stanje stvari na tem področju) <br>
- predhodno opravljeno delo (ali stanje stvari na tem področju) <br>

Revision as of 10:23, 2 October 2008

Splošno

Z letom 2007/8 se je prejšnji štiriletni univerzitetni podiplomski znanstveni program Biomedicina preoblikoval v triletni doktorski študij, ki ga koordinira Medicinska fakulteta UL. Študenti, ki so se v preteklih vpisali v stari program, bodo študij po starem programu tudi dokončali, tisti, ki ste se vpisali v tem študijskem letu v 1. letnik, pa boste študirali po novem programu. Ta vključuje nove predmete in ima drugačna študijska pravila.

V študijskem letu 2008/9 bodo pri doc. Dolinarju v okviru 2. modula (Struktura in funkcija bioloških molekul) pri predmetu Izbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (12. februarja 2009), Renaturacija rekombinantnih proteinov (17. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (19. februarja). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 v veliki predavalnici Kemijskega inštituta na Hajdrihovi 19. Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji po naslednjem razporedu:

Seznam seminarjev

datum članek za seminar referent
17. 02. 2008 članek 1 študent 1
17. 02. 2008 članek 2 študent 2
19. 02. 2008 članek 3 študent 3
19. 02. 2008 članek 4 študent 4

Naslovi člankov in povezave do njih bodo na voljo konec januarja. Prijave sprejemam do zasedbe mest.

Seminarji predstavljajo pomemben del modula in jih bomo tako tudi ocenjevali. Samo 50 % ocene modula bodo predstavljali odgovori na izpitna vprašanja, 50 % ocene pa je ocena seminarja. Ta polovica ocene se oblikuje iz 60 % za predstavitev in povzetek ter 40 % za sodelovanje pri razpravah o seminarjih.

Vsak doktorski študent, ki je vpisal 2. modul, mora:
- prebrati vsakega od člankov, ki jih bomo obravnavali na seminarjih, do datuma predstavitve
- pripraviti vprašanja za razpravo
- sodelovati v razpravi

Vsak od petih referentov mora pripraviti naslednje:
- povzetek seminarja s 1200-1600 besedami - lahko vključuje tudi slike, ni pa nujno (sklicujete se lahko na slike v originalnem članku); povzetek oddate na dan predstavitve v elektronski obliki in ga bodo dobili vsi vpisani študenti kot pomoč pri pripravi na izpit
- predstavitev v programu PowerPoint v obsegu in na način, ki bo omogočil natančen vpogled v snov, predstavljeno v članku in bo služil kot osnova za razpravo

Predstavitve naj bi bile dolge okrog 30 minut. V tem času boste morali razložiti:
- ozadje/problem, ki ga članek obravnava, pri čemer poskušajte izluščiti ne samo namen dela, pač pa tudi delovno hipotezo
- predhodno opravljeno delo (ali stanje stvari na tem področju)
- konkreten delovni načrt za izvedbo raziskave
- rezultate in metode (metodo smiselno vključite v rezultate)
- kritično mnenje o članku (kaj je bilo dobro zastavljeno, izvedeno, predstavljeno, razloženo... in kaj ne)
- uvod v razpravo

Razprava o vsakem članku naj bi trajala vsaj 30 minut in mora biti poglobljena in argumentirana. Zato je res nujno, da članke berete sproti in temeljito!