基礎ゼミチーム/basic seminar team/experiment result: Difference between revisions

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<h3>2012/8/21</h3>
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<li>S2,S3の動作の確認</li>
<li>S2,S3の動作の確認</li>
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<li>S1,S2が自分同士でアグッているか、お互いにアグッている可能性あり</li>
<li>S1,S2が自分同士でアグッているか、お互いにアグッている可能性あり</li>
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<!-- 8月22日 -->
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<h3>2012/08/22</h3>
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<!-- 8月24日 -->
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<h3>2012/08/24</h3>
<h3 id="title">2012/08/24</h3>
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Revision as of 07:54, 2 September 2012

<html lang="ja"> <head> <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=Shift_JIS"> <meta http-equiv="content-style-type" content="text/css"> <title>BIOMOD 2012 Tohoku basic seminar team Wiki</title>



<style type="text/css"> @charset "Shift_JIS";

/* CDP 001 css 06/12/1 */ /* Copyright (c) 2006 WebDesignTemplates[1] All rights reserved. */

/* default */ body,div,dl,dt,dd,ul,ol,li,h1,h2,h3,h4,h5,h6,pre,form,fieldset,input,p,blockquote,th,td{margin:0;padding:0;} table{border-collapse:collapse;border-spacing:0;} fieldset,img{border:0;} address,caption,cite,code,dfn,em,strong,th,var{font-style:normal;font-weight:normal;} ol,ul {list-style:none;} caption,th {text-align:left;} h1,h2,h3,h4,h5,h6{font-size:100%;} q:before,q:after{content:;} /* fonts(Yahoo UI) */ body { font: 13px arial,helvetica,clean,sans-serif; *font-size:small; *font:x-small; } table { font-size: inherit; font: 100%; } select,input,textarea { font: 99% arial,helvetica,clean,sans-serif; }

/* 全体設定 */ html {

} body { } body#INDEX { } div#PAGETOP { width: 100%; font-size: 100%; color: #454341; } hr { display: none; } a:link { color: #414191; } a:visited { color: #414161; } a:hover { color: #914141; } a:active { color: #914141; }

/* ヘッダー */ div#HEADER { margin-bottom: 20px; border-top: solid 4px #595956; border-bottom: double 3px #FFFFFF; background: #DCDCDA; } h1#wiki-mode1 { padding: 0.3em 1em 0.3em 21px; font-size: 167%; letter-spacing: 0.2em; color: #9A4414; } ul#PAN { position: absolute; top: 10px; right: 0px; text-align: right; }

  1. INDEX ul#PAN{

display: none; }

  1. PAN li{

display: inline; }

  1. PAN a{

text-decoration: none; }

  1. PAN a:after{

content: "->"; }

/* メニュー */ div#MENU { width: 210px; float: left; }

  1. MENU h2{

width: 150px; margin: 0 20px 1em 20px; padding: 0.2em 10px; border: none; font-size: 107%; letter-spacing: 0.2em; color: #BA7464; }

  1. MENU ul{

width: 170px; margin: 0 20px 1em 20px; border-bottom: double 3px #FBFBFA; }

  1. MENU li{

margin-bottom: 15px; padding-top: 0.1em; background: #FBFBFA; }

  1. MENU li.menu-on {

background: #ECECEA; }

  1. MENU li a{

display: block; width: 150px; padding: 0.4em 10px 0.4em 10px; border-bottom: dotted 2px #DCDCDA; font-weight: bold; text-decoration: none; }

  1. MENU li a:hover,#MENU li a:active{

border-bottom: solid 2px #BA8474; text-decoration: none; }

/* 記事部分 */ div#KIZI { margin: 0 20px 0 210px; padding: 0 0 0 20px; border-left: solid 10px #FBFBFA; } h2#wiki-mode2 { padding: 0.3em 0; border-bottom: solid 1px #CCCCCA; color: #BA7464; font-size: 122%; letter-spacing: 0.2em; } div.text { margin: 0.5em 2.5em 1.5em 0; line-height: 1.7; } .text p { margin-bottom: 1em; } h3 { padding: 0.6em 0 0.4em 0; letter-spacing: 0.1em; } h4 { padding: 0.5em 0 0.2em 0; letter-spacing: 0.1em; } h5,h6 { padding: 0.4em 0 0.2em 0; } .text ul.modori { text-align: right; font-size: 85%; list-style: none; } .modori a:link,.modori a:visited{ color: #BA7464; }


/* リスト */ .text ol { margin: 0 0 1em 35px; list-style: decimal; } .text ul { margin: 0 0 1em 35px; list-style: square; } dl { margin: 0 0 1em 5px; } dt { color: #9A5434; font-weight: bold; } dd { margin: 0 1em 1em 1.5em; }

/* フッター */ div#FOOTER { width: 100%; clear: left; text-align: right; margin-top: 20px; border-top: double 3px #FFFFFF; border-bottom: solid 6px #595956; background: #DCDCDA; }

  1. FOOTER h2 {

display: none; }

  1. FOOTER ul {

padding: 0.8em 2em; }

  1. FOOTER li {

display: inline; padding: 0 0.5em; font-size: 92%; }

  1. FOOTER a{

text-decoration: none; } address { display: inline; }

/* 強調・追加・削除 */ em { font-weight: bold; } strong{ font-weight: bold; color: #814121; } ins { text-decoration: underline; } del { text-decoration: line-through; }

/* フォーム */

input { margin-top: 0.5em; } input#TEXT { border: solid 1px #CCCCCA; } input#BUTTON { padding: 1px 0.5em; border: double 3px #CCCCCA; background: #EDEDEA; } textarea { margin-top: 0.5em; border: solid 1px #CCCCCA; } select { margin-top: 0.5em; border: solid 1px #CCCCCA; }

/* 引用 */ blockquote { padding-left: 0.8em; margin: 1em; border-left: 2px dashed #EAEAED; } cite,q { text-decoration: underline; }

/* 整形済みテキスト */ pre { padding: 0.3em; border: solid 1px #DADADC; font-size: 92%; font-family: monospace; }

  1. marker {

padding:3px; border-style:solid; border-width:0px 0px 0px 3px; border-color:#333; float:left; }

  1. photo{

}

/* 物理要素 */ b { font-weight: bold; } /* 太字 */ i { font-style: italic; } /* 斜体 */ big { font-size: 107%; } /* 文字大 */ small { font-size: 85%; } /* 文字小 */ tt { font-family: monospace; } /* 等幅 */


  1. outer{

background-color:#eee; text-align:center; }

  1. title-1{

background-color:white;margin:10px 0px 10px 0px;border-style:solid;border-width:18px;border-color:#eee; }

  1. kind{

background-color:white; text-align:center; border-style:solid;border-width:0px 50px 0px 50px;border-color:#eee; }

div#ul{ background-color:white; text-align:left; background-color:white;border-style:solid;border-width:18px;border-color:#eee; }

</style> </head> <body id="INDEX">




<a href="http://openwetware.org/wiki/%E5%9F%BA%E7%A4%8E%E3%82%BC%E3%83%9F%E3%83%81%E3%83%BC%E3%83%A0/basic_seminar_team/experiment_result/test">テスト</a>

Experiment result

  • Tar = Target DNA
  • S1,S2,S3 = Selector1,Selector2,Selector3



2012/08/09

<img src="http://openwetware.org/images/a/ac/Loop_tornament01.jpg" name="pic1" id="photo">

10%アクリルアミド

  • アクリルアミド10%と20%のゲルを用いて実験
  • 10%はmidori greenを用いて染色したがバンドを確認できず(写真なし)
  • 20 %はsyber goldで染色し上の写真が撮影できた
  • 1+3,1+4はハイブリが成功している様子

2012/08/17

<img src="http://openwetware.org/images/8/8b/20120817.tornamentandloop.45min.sybergold.jpg" id="photo">

10%アクリルアミド


  • 今日の実験はDNAにMg2+の1.25%バッファー15μLを入れ忘れたためバンドが拡散しうまく出なかった
  • DNAを放置する時間を50分に延長


2012/08/20

<img src="http://openwetware.org/images/2/2a/Tornament-loop10%25.3h.50%2C100v.jpg" id="photo">

10%アクリルアミド



<img src="http://openwetware.org/images/5/56/Tornament-loop20%25.4h.50%2C100v.jpg" id="photo">

20%アクリルアミド

  • 20%はバンドがゆがんでいたため結果が分からなかった。20%は結果が出にくく時間もかかるので今後は10％で行うことに
  • 結果の考察は10%について
  • 染色液はsyber goldを使用
  • TargetがSelectorを移動するための時間を1時間に増加
  • 電気泳動を冷蔵庫の中(4℃)で行う
  • 電圧を50Vで行った
  • 結果として、1+2+3では1と3がハイブリしているものが確認できた。1+2+3+4では1と4がハイブリしているものが確認できた。
  • 2から3、3から4の移動が可能か
  • Tar+S1+S2でTarとS1のバンドと、TarとS2のバンドが両方濃く出てしまっており、TarがS1からS2に移動したのか疑問が残る
  • Tar+S1+S2+S3においてS1の周辺にバンドが出ておらず、入れ忘れてしまった可能性が高い
  • S1からS2の移動が確認できなかったが、TarのS2からS3の移動は可能性が高い


2012/8/21

<img src="http://openwetware.org/images/b/bf/Tornament-loop10%25.3h.not1234.jpg" id="photo">

10%アクリルアミド

  • S2,S3の動作の確認
  • Tar+S1+S2+S3を抜いて20日と同様に実験
  • 結果として、Tar+S1+S2においてS1のバンドが消えているがS2のバンドがシングルストランドと同じところに出ておりTarがどちらにもくっついていないように見受けられる
  • S1,S2が自分同士でアグッているか、お互いにアグッている可能性あり


  • <a href="#PAGETOP">TOP</a>

履歴

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