Alcazar:Master: Difference between revisions

From OpenWetWare
Jump to navigationJump to search
No edit summary
No edit summary
Line 65: Line 65:
To request more information, please contact Dr. Ruben Alcazar (Ramón y Cajal researcher at the Unit of Plant Physiology, Faculty of Pharmacy (UB). E-mail: ralcazar@ub.edu
To request more information, please contact Dr. Ruben Alcazar (Ramón y Cajal researcher at the Unit of Plant Physiology, Faculty of Pharmacy (UB). E-mail: ralcazar@ub.edu


'''
'''Master Alumni''''''


Academic year 2014-15: Ester Murillo Villuendas, biotechnologist.
'''Master Alumni''' <br>
 
Academic year 2014-15: Ester Murillo Villuendas, biotechnologist.

Revision as of 09:06, 30 July 2015




Dept. Biology, Healthcare & Environment
Section of Plant Physiology
Facultat de Farmàcia, Av. Joan XXIII 27-31
08028 Barcelona, Spain

<html><a href="http://www.revolvermaps.com/?target=enlarge&i=0ewrbw4fec7"><img src="//ra.revolvermaps.com/h/m/a/0/fff600/128/40/0ewrbw4fec7.png" width="156" height="100" alt="Map" style="border:0;"></a>


OFERTES MÀSTER 2015-16 | MASTER OFFER 2015-16

OFERTA DE MÀSTER EN BIOTECNOLOGIA MOLECULAR
UNIVERSITAT DE BARCELONA CURS 2015-16

--- APPLICATION OPEN --- (SEE ENGLISH VERSION BELOW)

BIOLOGIA MOLECULAR DE LA RESPOSTA IMMUNE VEGETAL



Les plantes, de manera anàloga als animals, posseeixen un sistema immune que les protegeix de la invasió per microorganismes patogènics com ara bacteris, fongs, virus i insectes. Aquest sistema immune, innat i invariable, es fonamenta en l’existència d’un gran nombre de proteïnes receptores que reconeixen estructures i molècules de patògens i activen l’expressió de gens de defensa de la planta. Aquesta activació porta a l’acumulació de metabòlits i proteïnes protectores que inhibeixen el creixement de patògens de forma natural, sense necessitat de tractaments químics. Un dels metabòlits més destacables en la resposta immune de la planta és l’àcid salicílic, que activa l’anomenada SAR (resposta sistèmica adquirida) a través de la qual la senyal d’infecció produïda en una part de la planta es transmet a cèl·lules llunyanes que no han estat exposades directament al patogen. D’aquesta manera, es produeix una resposta conjunta de tot l’organisme per tal d’aturar la propagació de la infecció.


Recerca de màster


El nostre laboratori treballa amb receptors intracel·lulars de plantes que activen el sistema immunitari provocant l’acumulació de grans quantitats d’àcid salicílic de forma endògena i que immunitzen a les plantes enfront a la infecció per patògens. Donada la seva potencial aplicabilitat en la indústria biotecnològica, ens interessa estudiar els mecanismes moleculars que activen aquesta resposta i com controlar-la. Per tal d’aconseguir-ho, proposem fer servir dues tecnologies que permeten “introduir o eliminar” receptors de patògens en plantes mitjançant tècniques de manipulació genètica vegetal. Mitjançant transformació genètica mediada per Agrobacterium tumefaciens, clonarem i introduirem receptors de patògens que confereixin a la planta resistència a infecció. També farem servir la recentment introduïda tecnologia CRISPR/CAS9, que permet editar el genoma de forma dirigida, per tal d’introduir mutacions de pèrdua de funció en receptors que no s’adaptin bé al reconeixement patogènic. Aquesta és una forma de teràpia gènica aplicada a les plantes. Al voltant d’aquestes dues tecnologies, es faran servir un gran nombre de tècniques moleculars fonamentals com ara expressió de proteïnes recombinants, co-immunoprecipitació, genotipat per PCR, manipulació de DNA, clonatge de gens, transformació de bactèries, identificació de GMOs, seqüenciació de DNA, anàlisi d’expressió gènica (real time PCR), etc. en la planta model per excel·lència Arabidopsis thaliana.


Perfil de l’aplicant


Busquem estudiants de farmàcia, biologia, bioquímica, biotecnologia i afins, interessats en la recerca biotecnològica molecular de plantes i en aprendre noves tecnologies pioneres en la seva manipulació molecular.


Per a sol·licitar més informació, poseu-vos en contacte amb el Dr. Rubén Alcázar (Investigador Ramón y Cajal a la Unitat de Fisiologia Vegetal, Facultat de Farmàcia (UB). E-mail: ralcazar@ub.edu



MASTER OFFER 2014-15

MASTER IN MOLECULAR BIOTECHNOLOGY
UNIVERSITY OF BARCELONA ACADEMIC YEAR 2014-15


MASTER OFFER ASSOCIATED TO OUR LAB: MOLECULAR BIOLOGY OF PLANT IMMUNE RESPONSES


Plants, like animals, are provided with an immune system that protects against invasion by pathogenic microorganisms. This immune system, which is innate and invariable, fundamentally relies on a large number of receptor proteins that recognize pathogen structures and molecules ultimately leading to changes in expression of defense-related genes. This in turn leads to accumulation of protective compounds that inhibit pathogen colonization naturally, without the need of chemical treatment.

Research

Our laboratory works with intracellular plant receptors that trigger activation of defense. We are interested in studying the molecular mechanisms that control the activation of such receptors. To achieve this, we propose to use two technologies for this master that allow to "introduce or eliminate" receptors in plants. We will use classical genetic transformation mediated by Agrobacterium tumefaciens, and introduce cloned receptors into plants to induce resistance to infection. We will also use the technology CRISPR / CAS9, which allows editing the genome and introducing specific mutations that produce loss-of-function alleles. This is a type of ‘gene therapy’ in plants. Around these two technologies, we will use a number of basic molecular techniques such as expression of recombinant proteins, co-immunoprecipitation, PCR genotyping, DNA manipulation, gene cloning, bacterial transformation, identification of GMOs, DNA sequencing, gene expression analysis (real-time PCR), etc. in the model plant Arabidopsis thaliana.

This Master Offer is in frame of the Master in Molecular Biotechnology of the University of Barcelona.


We seek for students in pharmacy, biology, biochemistry, biotechnology or related life sciences interested in plant molecular biotechnology willing to learn new technologies on molecular manipulation of plant genomes.


To request more information, please contact Dr. Ruben Alcazar (Ramón y Cajal researcher at the Unit of Plant Physiology, Faculty of Pharmacy (UB). E-mail: ralcazar@ub.edu


Master Alumni 
Academic year 2014-15: Ester Murillo Villuendas, biotechnologist.