BIOMOL LCS/2010:Schedule: Difference between revisions

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{| border="1" cellpadding="4" cellspacing="0" style="border:#c9c9c9 1px solid; margin: 1em 1em 1em 0; border-collapse: collapse; width:710px"  
 
'''No quadro abaixo pode encontrar informação detalhada sobre os conteúdos abordados em cada aula teórica e referências a consultar.
 
- TUDO O QUE PRECISO PARA ESTUDAR PARA O EXAME! -
 
 
 
 
Actualizado a 11/06/2010'''
 
{| border="1" cellpadding="4" cellspacing="0" style="border:#c9c9c9 1px solid; margin: 1em 1em 1em 0; border-collapse: collapse; width:px"  
 
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| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''Conteúdo'''
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''Conteúdo'''
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''Trabalho prévio'''
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''Tópicos (Cooper)'''
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''Para fazer/ler'''
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''Multimédia'''
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''Até'''
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|--
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| 23 de Fevereiro
| 23/2
Aula 0
| Apresentação
| Apresentação
| -
| Funcionamento do curso e utilização do OpenWetWare
| Inscrição no OpenWetWare/Ler secção de ajuda do OpenWetWare
| [[Help:Contents | Openwetware Help]]
| Final da semana/Próxima aula T
| [[BIOMOL LCS/2010:PBL | Como trabalhar em PBL]]
|--
|--
| 2 de Março
| 2/3
| Aula 1: Introdução à Biologia Molecular
Aula 1
| -
| Introdução à Biologia Molecular  
| Parte I: Origens e Aplicações da Biologia Molecular
Biologia Molecular: Origens e Perspectiva Histórica, Objectivos, Conceitos e Aplicações
 
(Cap. 1: An Overview of Cells and Cell Research, pgs:4-21. Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 103-115)
|[http://plato.stanford.edu/entries/molecular-biology Biologia Molecular - Enciclopédia Stanford de Filosofia]
|[http://plato.stanford.edu/entries/molecular-biology Biologia Molecular - Enciclopédia Stanford de Filosofia]
| -
|[[Media:LCS_BM1.pdf | Apresentação Aula 1]]
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| 3 de Março
 
| Aula 2: Caso de Estudo 1
| 3/3
|[[BIOMOL LCS/2010:PBL | Como trabalhar em PBL]]/ [[BIOMOL LCS/2010:Caso1.1 | Caso de Estudo]]
Aula 2
| Trabalho de investigação sobre hemoglobina e talassémias
| Introdução ao Caso de Estudo 1
| Próxima aula T
| Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação
 
Hemoglobina e talassémias.
 
Definição dos tópicos de investigação.
 
| Alberts online:
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A1402&rendertype=figure&id=A1418 Hemoglobina]
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A596&rendertype=figure&id=A603 Gene da beta-globina]
| [[BIOMOL LCS/2010:Caso1.1 | Caso de Estudo 1]]
|--
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| 9 de Março
| Aula 3: Caso de Estudo 1 - apresentação dos resultados da investigação
Mecanismos básicos da transcrição
| [[BIOMOL LCS/2010:Caso1.1 | Actualização do caso de Estudo]]
| Cooper and Hausman
Cap. "The Organization and Sequences of Cellular Genomes"


Cap. "RNA Synthesis and Processing" (secções sobre transcrição)
| 9/3
Aula 3
| Caso de Estudo 1 - apresentação dos resultados da investigação
| Partes II, III e IV: Expressão, Armazenamento e Transmissão da Informação
 
Organização dos genes da globina. Talassémias. Mecanismos básicos da transcrição.
 
(Cap. 5: The Organization and Sequences of Cellular Genomes. Cap. 7:RNA Synthesis and Processing, pgs:253-268)


| -
| Alberts online:
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A1269&rendertype=figure&id=A1314 Cluster dos genes da globina]
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A1402&rendertype=figure&id=A1419 Evolução do cluster da globina][http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A1402#A1417 Complementar: Evolução dos genomas]
|[[Media:LCS_BM3.pdf | Apresentação Aula 3]] [[Talk:BIOMOL_LCS/2010:Caso1.1 | Investigação]]
|--
|--
| 11 de Março
| Aula 4: Caso de Estudo 1 - apresentação dos resultados da investigação
| -
| Pesquisa sobre terapia génica
[http://www.nature.com/scitable/topicpage/Do-Transcription-Factors-Actually-Bind-DNA-DNA-1029 Saber mais: DNA Footprinting]


[http://www.nature.com/scitable/topicpage/Gene-Expression-Regulates-Cell-Differentiation-931 Saber mais: Transcrição e diferenciação celular]
| 11/3
| Próxima aula T
Aula 4
-
| Caso de Estudo 1 - apresentação dos resultados da investigação
-
| Parte II: Expressão da Informação
 
Regulação da transcrição: Expressão específica de tecido e dependente do desenvolvimento. Regulação da transcrição e diferenciação celular.
 
(Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:268-283)
 
|Scitable:
[http://www.nature.com/scitable/topicpage/Do-Transcription-Factors-Actually-Bind-DNA-DNA-1029 DNA Footprinting]
[http://www.nature.com/scitable/topicpage/Gene-Expression-Regulates-Cell-Differentiation-931 Transcrição e diferenciação celular]  
Alberts online:
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A1269&rendertype=figure&id=A1313 Controlo da expressão da globina]
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A1269#A1314 Complementar: como funciona um switch genético]
|
|--
|--
| 16 de Março
 
| Aula 5: Caso de Estudo 1 - Que terapias para a Maria?
| 16/3
Terapia génica
Aula 5
|Caso de Estudo 1 - Que terapias para a Maria?
| Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação
 
Mutações e expressão génica. Classificação funcional de mutações pontuais: silent, nonsense, misense. Dominância e recessividade ao nível molecular.
 
Parte IV: Manipulação da Informação
 
Introdução à terapia génica.
 
| Scitable:
[http://www.nature.com/scitable/topicpage/Gene-Therapy-760 Terapia génica]
| -
| -
| Investigar efeitos de mutações pontuais na expressão génica
[http://www.nature.com/scitable/topicpage/Gene-Therapy-760 Saber mais: Terapia génica]
| Próxima aula T
-
|--
|--
| 18 de Março
 
| Aula 6: Caso de Estudo 1 - Polimorfismo ou mutação?
| 18/3
| [[BIOMOL LCS/2010:Caso1.1 | Actualização do caso de Estudo]]
Aula 6
| -
| Caso de Estudo 1 - Polimorfismo ou mutação?
| -
| Partes II, III e IV: Expressão, Armazenamento e Transmissão da Informação
 
Origem e papel das mutações: variabilidade genética, evolução e doença. Polimorfismo e Mutação: Frequência vs Consequência. Caracterização experimental dos efeitos de uma variação pontual na expressão génica. Mutações pontuais silenciosas: impacto na expressão génica ao nível do RNA.
 
| Alberts online:
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A748#A752 Mutações e evolução]
|  
|--
|--
| 23 de Março
 
| Aula 7: Processamento de RNA
| 23/3
| -
Aula 7
| -
| Processamento do pré-mRNA (splicing)
| Parte II: Expressão da Informação
 
O spliceosoma e factores auxiliares. Sequências reguladoras. Mecanismo do splicing. Splicing alternativo – regulação e importância biológica.
 
(Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:290-300)
| -
| -
| [[Media:LCS_BM7.pdf | Apresentação Aula 7]]
|--
|--
| 25 de Março
 
| Aula 8: Caso de Estudo 1 - discussão dos dados
| 25/3
| -
Aula 8
| -
| Caso de Estudo 1 - integração
| -
| Parte II: Expressão da Informação
Mutações e splicing: destruição de sequências consenso ou activição de locais de splicing crípticos.
| Alberts online:
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A975&rendertype=figure&id=A1030 Mutações causadoras de talassémia]
|  
|--
|--
| 30 de Março
 
| Não há aula - início das férias da Páscoa
| 8/4
| -
Aula 9
| -
| Caso de Estudo 1 - vida e morte de um mRNA
| -
| Parte II: Expressão da Informação
Integração dos conceitos. Dinâmica do processo de expressão génica. Exportação e tradução de um mRNA.
 
(Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:301-303. Cap.8: Protein Synthesis, Processing and Regulation, pgs: 309-329)
| [http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/lifecyclemrna.html Animação: Biogénese e tradução de um mRNA]
| [[Media:LCS_BM9.pdf | Apresentação Aula 9]]
|--
|--
| 8 de Abril
 
| Aula 9: Caso de Estudo 1 - vida e morte de um mRNA
| 13/4
| -
Aula 10
| -
| Seminários de Investigação:  
| -
|--
| 13 de Abril
| Aula 10: Seminários de Investigação:
Docentes convidados - Noélia Custódio, FML e Luisa Romão, INSA
Docentes convidados - Noélia Custódio, FML e Luisa Romão, INSA
| Parte II: Expressão da Informação
Controlo de qualidade na expressão génica. Mecanismos de vigilância transcricionais e pós-transcricional. A via do "nonsense-mediated mRNA decay."
Abordagens experimentais em Biologia Molecular.
(Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 118-147)
| -
| -
| -
| [[Media:LCS_NCustodio.pdf | Seminário 1]]
| -
 
[[Media:Media-LCS_LRomao.pdf | Seminário 2]]
|--
|--
| 15 de Abril
 
| Aula 11: Caso de Estudo 1 - controlo de qualidade na beta-talassémia
| 15/4
| -
Aula 11
| Caso de Estudo 1 - controlo de qualidade na beta-talassémia
| Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação
Integração dos conteúdos abordados. Papel dos mecanismos de controlo de qualidade no fenótipo recessivo/dominante de uma doença hereditária.
| -
| -
| -
| -
|--
|--
| 20 de Abril
 
| Aula 12: Conclusão do caso de Estudo 1 - uma terapia para a Maria?
| 20/4
Desenvolvimento de novas terapia e ensaios clínicos
Aula 12
| -
| Conclusão do caso de Estudo 1 - uma terapia para a Maria?
| Parte IV: Manipulação da Informação
Desenvolvimento de novas terapia e ensaios clínicos.
Terapias de RNA na  modulação da expressão génica.
| [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2755039/?tool=pubmed Ensaio clínico de terapia de morfolinos]
| [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2755039/?tool=pubmed Ensaio clínico de terapia de morfolinos]
| -
| [[Media:LCS_BM11.pdf | Apresentação Aula 12]]
|--
|--
| 22 de Abril
 
| Aula 13: Apresentação do caso de Estudo 2
| 22/4
Aula 13
| Apresentação do Caso de Estudo 2
| Partes II, III e IV: Expressão e Armazenamento e Transmissão da Informação.
 
SIDA e HIV.
 
Definição dos tópicos de investigação.
 
(Cap. 4: Molecular Medicine: HIV and AIDS, pg: 120)
|
| [[BIOMOL LCS/2010:Caso2.1 | Caso de Estudo 2]]
| [[BIOMOL LCS/2010:Caso2.1 | Caso de Estudo 2]]
| Investigação sobre o Caso de Estudo
| Para apresentar na Aula 14
|--
|--
| 27 de Abril
 
| Aula 14: Ciclo de vida do HIV
| 27/4
| -
Aula 14
| -
| Caso de Estudo 2 - Ciclo de vida do HIV
| Partes II, III e IV: Expressão, Armazenamento e Transmissão da Informação.
 
Infecção por HIV: Ciclo de infecção viral e células alvo. Estrutura do vírus HIV. Genoma do HIV. Mecanismo de acção AZT.
 
(Cap. 3: Key Experiment: Antimetabolites and Chemotherapy, pg: 98. Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 115-116. Cap 9. DNA Replication, pgs: 201-211)
| -
| -
| [[Talk:BIOMOL LCS/2010:Caso2.1 | Investigação]]
|--
|--
| 29 de Abril
| 29/4
| Aula 15: Biologia Molecular do HIV
Aula 15
| -
| Caso de Estudo 2: Biologia Molecular do HIV
| -
| Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação.
| -
Estrutura do vírus, entrada na célula, transcrição reversa, integração e expressão. Mecanismos pós-transcricionais de regulação da expressão viral: transporte de RNA, regulação traducional e pós-traducional. Terapias anti-HIV.
 
(Cap. 6: Replication, Maintenance, and Rearrangements of Genomic DNA, pgs: 242-244. Cap. 9: The Nucleus,  pgs: 361-370)
| [http://jpkc.ncmc.edu.cn/cb/unizh/MCB2401N.html Animação HIV Alberts]
 
[http://hivinsite.ucsf.edu/InSite?page=kb-02-01-02#S1X HIVinSite@UCSF]
 
Alberts online:
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A1052&rendertype=figure&id=A1095 Regulação da tradução por frame-shift]
 
|[[Media:LCS_BM15.pdf | Apresentação Aula 15]]
|--
|--
| 4 de Maio
 
| Aula 16: Retrotransposões e elementos móveis
| 4/5
| -
Aula 16
| -
|  Retrotransposões e elementos móveis
| -
| Partes III e IV: Armazenamento e Transmissão da Informação.
Organização do genoma humano: sequências repetitivas e DNA satélite. Elementos genéticos móveis. Mecanismos de recombinação e transposição.
 
(Cap. 5: The Organization and Sequences of Cellular Genomes, pgs: 161-164. Cap. 6: Replication, Maintenance, and Rearrangements of Genomic DNA, pgs: 233 e 239-247).
 
| [http://www.dnalc.org/resources/nobel/mcclintock.html Barbara McClintock e a Descoberta dos Transposões]
| [[Media:LCS_BM16.pdf | Apresentação Aula 16]]
|--
|--
| 6 de Maio
 
| Aula 17: Diversidade genética
| 6/5
| -
Aula 17
| -
| Caso de Estudo 2: Diversidade genética
| -
| Partes III e IV: Armazenamento e Transmissão da Informação.
Mutações, Variabilidade Genética e Selecção Natural. Resistência a Fármacos. Genotipagem - aplicações na clínica, epidemiologia e e estudo da evolução.
 
|[http://evolution.berkeley.edu/evolibrary/article/0_0_0/medicine_04 HIV, evolução e resistência]
 
[http://hivdb.stanford.edu/ Base de dados de resistência do HIV]
 
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2762761/?tool=pubmed Artigo/animação - Pandemia H1N1]
 
Alberts online:
 
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A1402#A1425 Variabilidade Genética]
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A1402#A1404 Árvores filogenéticas]
| [[Media:LCS_BM17.pdf | Apresentação Aula 17]]
|--
|--
| 11 de Maio
 
| Aula 18:Discussão do caso de Estudo
| 11/5
| [[BIOMOL LCS/2010:Caso2.1 | Actualização do Caso de Estudo 2]]
Aula 18
| [http://www.nature.com/nm/journal/v16/n5/abs/nm0510-517.html# Artigo]
| Caso de Estudo 2: Discussão  
| Parte IV: Transmissão da Informação.
HIV e Linfoma.  
Definição dos tópicos de investigação.
| Alberts online:
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A4294#A4302 Causas do Cancro]
| -
| -
|--
|--
| 13 de Maio
 
| Não há aula
| 18/5
|  
Aula 19
| -
| Caso de Estudo 2: Bases moleculares do Cancro
| -
| Parte IV: Transmissão da Informação.
Alterações celulares no Cancro. Desregulação do ciclo celular, apoptose e diferenciação. Oncogenes e Oncossupressores. Retrotransposões e cancro.
 
(Cap 18: Cancer, pgs 719-741, 744 , 746-750, 753-754))
|[http://www.molecularmovies.com/movies/kellermcgill_clonalconveyorbelt.mov Animação Criptas Intestinais]
[http://www.nature.com/nm/journal/v16/n5/abs/nm0510-517.html# Artigo Retrotransposões e cancro]
|
|--
|--
| 18 de Maio
 
| Aula 19: Bases moleculares do Cancro
 
| [[BIOMOL LCS/2010:Caso2.1 | Actualização do Caso de Estudo 2]]
| 20/5
| -
Aula 20
| -
| Caso de Estudo 2: Transcritómica
| Partes II, IV e V: Expressão, Transmissão e Manipulação da Informação.
Diferenciação celular e perfis de expressão génica. Regulação Epigenética. Microarrays. Perfis transcricionais na classificação e prognóstico de tumores.
 
(Cap. 17: Cell Death and Cell Renewal, pgs 700-708)
| [http://learn.genetics.utah.edu/content/labs/microarray/ Microarrays de DNA]
| [[Media:LCS_BM20.pdf | Apresentação Aula 20]]
|--
|--
| 20 de Maio
 
| Aula 20: Transcritómica
| 25/5
| [http://learn.genetics.utah.edu/content/labs/microarray/ Introdução básica mas divertida aos microarrays de DNA]
Aula 21
| -
| Caso de Estudo 2: Novos alvos terapêuticos
| Partes II, IV e V: Expressão, Transmissão e Manipulação da Informação.
Integração dos conceitos explorados: Design dirigido de medicamentos contra novos alvos terapêuticos. Inibidores de cinases e vias de sinalização no tratamento do cancro. Novas fronteiras da Medicina Genómica e Personalizada.
 
(Cap. 18: Cancer, pgs 755-760. Molecular Medicine: STI-571 Cancer Treatment Targeted against the bcr/abl Oncogene, pg: 759)
| -
| -
| [[Media:LCS_BM21.pdf | Apresentação Aula 21]]
|--
|--
| 25 de Maio
 
| Aula 21: Novos alvos terapêuticos
| 27/5
| -
Aula 22
| -
| siRNA e microRNAs
| -
| Partes II, IV e V: Expressão, Transmissão e Manipulação da Informação.
Pequenos RNAs não codificantes: descoberta, biogénese e funções celulares. Papel na regulação transcricional e pós-transcricional. Outros tipos de RNAs não codificantes: Xist e a inactivação do cromossoma X. Regulação epigenética e RNA.
 
(Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 145-147. Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:285-287)
 
| [http://www.pbs.org/wgbh/nova/sciencenow/3210/02.html Filme siRNA]
[http://nobelprize.org/nobel_prizes/medicine/laureates/2006/adv.pdf siRNAs: Nobel da Medicina 2006]
| [[Media:LCS_BM22.pdf | Apresentação Aula 22]]
|--
|--
| 27 de Maio
 
| Aula 22: siRNA e microRNAs
| 1/6
| -
Aula 23
| [http://nobelprize.org/nobel_prizes/medicine/laureates/2006/adv.pdf Prémio Nobel da Medicina 2006]
| Conclusão do curso: Avaliação contínua e revisões
| -
|--
| 1 de Junho
| Aula 23: Avaliação contínua e revisões
| -
| -
| -
|--
| 3 de Junho
| Feriado - Final do semestre
| -
| -
| -
| -
| -
| -
|--
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Latest revision as of 11:27, 11 June 2010


Início        Pessoas        Material de apoio        Programa Teóricas        Programa TPs        Ajuda       

“De uma coisa temos a certeza: metade do que aprendemos é verdadeiro e a outra metade ou é falsa ou irá ficar rapidamente desactualizada. O problema é que ninguém sabe qual é a metade certa.”

A aprendizagem baseada em problemas (Problem based learning – PBL) é um processo educativo diferente do ensino convencional e tem como objectivo a aquisição de uma base de conhecimento extensa e integrada que seja facilmente recordada e aplicada à análise e resolução de problemas no futuro. Este método assenta no desenvolvimento, por parte do aluno, das capacidades de autoaprendizagem, auto-avaliação, resolução de problemas, e trabalho de equipa.

Neste tipo de ensino, os alunos assumem maior responsabilidade pela sua própria aprendizagem, identificando os conhecimentos que necessitam de aquirir e as fontes onde o podem ir buscar. Desta forma, o aluno tem a oportunidade de construir uma aprendizagem mais dirigida às suas necessidades e interesses individuais. O conhecimento é construido de uma forma iterativa ao longo de várias sessões de discussão em que os alunos apresentam os resultados das suas pesquisas individuais, integram a informação e recebem novos dados do docente.

O docente surge, não como fonte de transmissão de um conhecimento previamente seleccionado, mas como orientador do trabalho dos alunos. O seu papel principal centra-se na escolha de problemas apropriados que permitam a exploração dos conceitos importantes na área de estudo, e no acompanhamento do trabalho dos alunos. Enquanto tutor do processo de aprendizagem, o docente irá fornecendo ou facilitando o acesso à informação requerida pelos alunos, apoiar a integração do conhecimento construído num corpo coerente e participar na avaliação dos progressos efectuados.

Como trabalhar em PBL


No quadro abaixo pode encontrar informação detalhada sobre os conteúdos abordados em cada aula teórica e referências a consultar.

- TUDO O QUE PRECISO PARA ESTUDAR PARA O EXAME! -



Actualizado a 11/06/2010

Data/Aula Conteúdo Tópicos (Cooper) Multimédia Textos de apoio
23/2

Aula 0

Apresentação Funcionamento do curso e utilização do OpenWetWare Openwetware Help Como trabalhar em PBL
2/3

Aula 1

Introdução à Biologia Molecular Parte I: Origens e Aplicações da Biologia Molecular

Biologia Molecular: Origens e Perspectiva Histórica, Objectivos, Conceitos e Aplicações

(Cap. 1: An Overview of Cells and Cell Research, pgs:4-21. Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 103-115)

Biologia Molecular - Enciclopédia Stanford de Filosofia Apresentação Aula 1
3/3

Aula 2

Introdução ao Caso de Estudo 1 Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação

Hemoglobina e talassémias.

Definição dos tópicos de investigação.

Alberts online:

Hemoglobina Gene da beta-globina

Caso de Estudo 1
9/3

Aula 3

Caso de Estudo 1 - apresentação dos resultados da investigação Partes II, III e IV: Expressão, Armazenamento e Transmissão da Informação

Organização dos genes da globina. Talassémias. Mecanismos básicos da transcrição.

(Cap. 5: The Organization and Sequences of Cellular Genomes. Cap. 7:RNA Synthesis and Processing, pgs:253-268)

Alberts online:

Cluster dos genes da globina Evolução do cluster da globinaComplementar: Evolução dos genomas

Apresentação Aula 3 Investigação
11/3

Aula 4

Caso de Estudo 1 - apresentação dos resultados da investigação Parte II: Expressão da Informação

Regulação da transcrição: Expressão específica de tecido e dependente do desenvolvimento. Regulação da transcrição e diferenciação celular.

(Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:268-283)

Scitable:

DNA Footprinting Transcrição e diferenciação celular Alberts online: Controlo da expressão da globina Complementar: como funciona um switch genético

16/3

Aula 5

Caso de Estudo 1 - Que terapias para a Maria? Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação

Mutações e expressão génica. Classificação funcional de mutações pontuais: silent, nonsense, misense. Dominância e recessividade ao nível molecular.

Parte IV: Manipulação da Informação

Introdução à terapia génica.

Scitable:

Terapia génica

-
18/3

Aula 6

Caso de Estudo 1 - Polimorfismo ou mutação? Partes II, III e IV: Expressão, Armazenamento e Transmissão da Informação

Origem e papel das mutações: variabilidade genética, evolução e doença. Polimorfismo e Mutação: Frequência vs Consequência. Caracterização experimental dos efeitos de uma variação pontual na expressão génica. Mutações pontuais silenciosas: impacto na expressão génica ao nível do RNA.

Alberts online:

Mutações e evolução

23/3

Aula 7

Processamento do pré-mRNA (splicing) Parte II: Expressão da Informação

O spliceosoma e factores auxiliares. Sequências reguladoras. Mecanismo do splicing. Splicing alternativo – regulação e importância biológica.

(Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:290-300)

- Apresentação Aula 7
25/3

Aula 8

Caso de Estudo 1 - integração Parte II: Expressão da Informação

Mutações e splicing: destruição de sequências consenso ou activição de locais de splicing crípticos.

Alberts online:

Mutações causadoras de talassémia

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Aula 9

Caso de Estudo 1 - vida e morte de um mRNA Parte II: Expressão da Informação

Integração dos conceitos. Dinâmica do processo de expressão génica. Exportação e tradução de um mRNA.

(Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:301-303. Cap.8: Protein Synthesis, Processing and Regulation, pgs: 309-329)

Animação: Biogénese e tradução de um mRNA Apresentação Aula 9
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Aula 10

Seminários de Investigação:

Docentes convidados - Noélia Custódio, FML e Luisa Romão, INSA

Parte II: Expressão da Informação

Controlo de qualidade na expressão génica. Mecanismos de vigilância transcricionais e pós-transcricional. A via do "nonsense-mediated mRNA decay." Abordagens experimentais em Biologia Molecular.

(Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 118-147)

- Seminário 1

Seminário 2

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Aula 11

Caso de Estudo 1 - controlo de qualidade na beta-talassémia Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação

Integração dos conteúdos abordados. Papel dos mecanismos de controlo de qualidade no fenótipo recessivo/dominante de uma doença hereditária.

- -
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Aula 12

Conclusão do caso de Estudo 1 - uma terapia para a Maria? Parte IV: Manipulação da Informação

Desenvolvimento de novas terapia e ensaios clínicos. Terapias de RNA na modulação da expressão génica.

Ensaio clínico de terapia de morfolinos Apresentação Aula 12
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Aula 13

Apresentação do Caso de Estudo 2 Partes II, III e IV: Expressão e Armazenamento e Transmissão da Informação.

SIDA e HIV.

Definição dos tópicos de investigação.

(Cap. 4: Molecular Medicine: HIV and AIDS, pg: 120)

Caso de Estudo 2
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Aula 14

Caso de Estudo 2 - Ciclo de vida do HIV Partes II, III e IV: Expressão, Armazenamento e Transmissão da Informação.

Infecção por HIV: Ciclo de infecção viral e células alvo. Estrutura do vírus HIV. Genoma do HIV. Mecanismo de acção AZT.

(Cap. 3: Key Experiment: Antimetabolites and Chemotherapy, pg: 98. Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 115-116. Cap 9. DNA Replication, pgs: 201-211)

- Investigação
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Aula 15

Caso de Estudo 2: Biologia Molecular do HIV Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação.

Estrutura do vírus, entrada na célula, transcrição reversa, integração e expressão. Mecanismos pós-transcricionais de regulação da expressão viral: transporte de RNA, regulação traducional e pós-traducional. Terapias anti-HIV.

(Cap. 6: Replication, Maintenance, and Rearrangements of Genomic DNA, pgs: 242-244. Cap. 9: The Nucleus, pgs: 361-370)

Animação HIV Alberts

HIVinSite@UCSF

Alberts online: Regulação da tradução por frame-shift

Apresentação Aula 15
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Aula 16

Retrotransposões e elementos móveis Partes III e IV: Armazenamento e Transmissão da Informação.

Organização do genoma humano: sequências repetitivas e DNA satélite. Elementos genéticos móveis. Mecanismos de recombinação e transposição.

(Cap. 5: The Organization and Sequences of Cellular Genomes, pgs: 161-164. Cap. 6: Replication, Maintenance, and Rearrangements of Genomic DNA, pgs: 233 e 239-247).

Barbara McClintock e a Descoberta dos Transposões Apresentação Aula 16
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Aula 17

Caso de Estudo 2: Diversidade genética Partes III e IV: Armazenamento e Transmissão da Informação.

Mutações, Variabilidade Genética e Selecção Natural. Resistência a Fármacos. Genotipagem - aplicações na clínica, epidemiologia e e estudo da evolução.

HIV, evolução e resistência

Base de dados de resistência do HIV

Artigo/animação - Pandemia H1N1

Alberts online:

Variabilidade Genética Árvores filogenéticas

Apresentação Aula 17
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Aula 18

Caso de Estudo 2: Discussão Parte IV: Transmissão da Informação.

HIV e Linfoma. Definição dos tópicos de investigação.

Alberts online:

Causas do Cancro

-
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Aula 19

Caso de Estudo 2: Bases moleculares do Cancro Parte IV: Transmissão da Informação.

Alterações celulares no Cancro. Desregulação do ciclo celular, apoptose e diferenciação. Oncogenes e Oncossupressores. Retrotransposões e cancro.

(Cap 18: Cancer, pgs 719-741, 744 , 746-750, 753-754))

Animação Criptas Intestinais

Artigo Retrotransposões e cancro

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Aula 20

Caso de Estudo 2: Transcritómica Partes II, IV e V: Expressão, Transmissão e Manipulação da Informação.

Diferenciação celular e perfis de expressão génica. Regulação Epigenética. Microarrays. Perfis transcricionais na classificação e prognóstico de tumores.

(Cap. 17: Cell Death and Cell Renewal, pgs 700-708)

Microarrays de DNA Apresentação Aula 20
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Aula 21

Caso de Estudo 2: Novos alvos terapêuticos Partes II, IV e V: Expressão, Transmissão e Manipulação da Informação.

Integração dos conceitos explorados: Design dirigido de medicamentos contra novos alvos terapêuticos. Inibidores de cinases e vias de sinalização no tratamento do cancro. Novas fronteiras da Medicina Genómica e Personalizada.

(Cap. 18: Cancer, pgs 755-760. Molecular Medicine: STI-571 Cancer Treatment Targeted against the bcr/abl Oncogene, pg: 759)

- Apresentação Aula 21
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Aula 22

siRNA e microRNAs Partes II, IV e V: Expressão, Transmissão e Manipulação da Informação.

Pequenos RNAs não codificantes: descoberta, biogénese e funções celulares. Papel na regulação transcricional e pós-transcricional. Outros tipos de RNAs não codificantes: Xist e a inactivação do cromossoma X. Regulação epigenética e RNA.

(Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 145-147. Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:285-287)

Filme siRNA

siRNAs: Nobel da Medicina 2006

Apresentação Aula 22
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Aula 23

Conclusão do curso: Avaliação contínua e revisões - - -
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