BIOMOL LCS/2010:Schedule: Difference between revisions
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'''No quadro abaixo pode encontrar informação detalhada sobre os conteúdos abordados em cada aula teórica e referências a consultar. | |||
- TUDO O QUE PRECISO PARA ESTUDAR PARA O EXAME! - | |||
Actualizado a 11/06/2010''' | |||
{| border="1" cellpadding="4" cellspacing="0" style="border:#c9c9c9 1px solid; margin: 1em 1em 1em 0; border-collapse: collapse; width:px" | {| border="1" cellpadding="4" cellspacing="0" style="border:#c9c9c9 1px solid; margin: 1em 1em 1em 0; border-collapse: collapse; width:px" | ||
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(Cap. 3: Key Experiment: Antimetabolites and Chemotherapy, pg: 98. Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 115-116. Cap 9. DNA Replication, pgs: 201-211) | (Cap. 3: Key Experiment: Antimetabolites and Chemotherapy, pg: 98. Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 115-116. Cap 9. DNA Replication, pgs: 201-211) | ||
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| [[Talk:BIOMOL LCS/2010:Caso2.1 Investigação]] | | [[Talk:BIOMOL LCS/2010:Caso2.1 | Investigação]] | ||
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(Cap. 6: Replication, Maintenance, and Rearrangements of Genomic DNA, pgs: 242-244. Cap. 9: The Nucleus, pgs: 361-370) | (Cap. 6: Replication, Maintenance, and Rearrangements of Genomic DNA, pgs: 242-244. Cap. 9: The Nucleus, pgs: 361-370) | ||
| [http://jpkc.ncmc.edu.cn/cb/unizh/MCB2401N.html Animação HIV Alberts] | | [http://jpkc.ncmc.edu.cn/cb/unizh/MCB2401N.html Animação HIV Alberts] | ||
[http://hivinsite.ucsf.edu/InSite?page=kb-02-01-02#S1X HIVinSite@UCSF] | [http://hivinsite.ucsf.edu/InSite?page=kb-02-01-02#S1X HIVinSite@UCSF] | ||
Alberts online: | Alberts online: | ||
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A1052&rendertype=figure&id=A1095 Regulação da tradução por frame-shift] | [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A1052&rendertype=figure&id=A1095 Regulação da tradução por frame-shift] | ||
| | |[[Media:LCS_BM15.pdf | Apresentação Aula 15]] | ||
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| Partes III e IV: Armazenamento e Transmissão da Informação. | | Partes III e IV: Armazenamento e Transmissão da Informação. | ||
Mutações, Variabilidade Genética e Selecção Natural. Resistência a Fármacos. Genotipagem - aplicações na clínica, epidemiologia e e estudo da evolução. | Mutações, Variabilidade Genética e Selecção Natural. Resistência a Fármacos. Genotipagem - aplicações na clínica, epidemiologia e e estudo da evolução. | ||
|[http://evolution.berkeley.edu/evolibrary/article/0_0_0/medicine_04 HIV, evolução e resistência] | |[http://evolution.berkeley.edu/evolibrary/article/0_0_0/medicine_04 HIV, evolução e resistência] | ||
[http://hivdb.stanford.edu/ Base de dados de resistência do HIV] | [http://hivdb.stanford.edu/ Base de dados de resistência do HIV] | ||
[ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2762761/?tool=pubmed | |||
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2762761/?tool=pubmed Artigo/animação - Pandemia H1N1] | |||
Alberts online: | Alberts online: | ||
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A1402#A1425 Variabilidade Genética] | [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A1402#A1425 Variabilidade Genética] | ||
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A1402#A1404 Árvores filogenéticas] | [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A1402#A1404 Árvores filogenéticas] | ||
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Aula 18 | Aula 18 | ||
| Caso de Estudo 2: Discussão | | Caso de Estudo 2: Discussão | ||
| | | Parte IV: Transmissão da Informação. | ||
HIV e Linfoma. | |||
| | Definição dos tópicos de investigação. | ||
[http://www. | | Alberts online: | ||
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=mboc4&part=A4294#A4302 Causas do Cancro] | |||
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Aula 19 | Aula 19 | ||
| Caso de Estudo 2: Bases moleculares do Cancro | | Caso de Estudo 2: Bases moleculares do Cancro | ||
| | | Parte IV: Transmissão da Informação. | ||
| [http://www.molecularmovies.com/movies/kellermcgill_clonalconveyorbelt.mov] | Alterações celulares no Cancro. Desregulação do ciclo celular, apoptose e diferenciação. Oncogenes e Oncossupressores. Retrotransposões e cancro. | ||
(Cap 18: Cancer, pgs 719-741, 744 , 746-750, 753-754)) | |||
|[http://www.molecularmovies.com/movies/kellermcgill_clonalconveyorbelt.mov Animação Criptas Intestinais] | |||
[http://www.nature.com/nm/journal/v16/n5/abs/nm0510-517.html# Artigo Retrotransposões e cancro] | |||
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| 20/5 | | 20/5 | ||
Aula 20 | Aula 20 | ||
| Caso de Estudo 2: Transcritómica | | Caso de Estudo 2: Transcritómica | ||
| | | Partes II, IV e V: Expressão, Transmissão e Manipulação da Informação. | ||
| [http://learn.genetics.utah.edu/content/labs/microarray/ | Diferenciação celular e perfis de expressão génica. Regulação Epigenética. Microarrays. Perfis transcricionais na classificação e prognóstico de tumores. | ||
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(Cap. 17: Cell Death and Cell Renewal, pgs 700-708) | |||
| [http://learn.genetics.utah.edu/content/labs/microarray/ Microarrays de DNA] | |||
| [[Media:LCS_BM20.pdf | Apresentação Aula 20]] | |||
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Aula 21 | Aula 21 | ||
| Caso de Estudo 2: Novos alvos terapêuticos | | Caso de Estudo 2: Novos alvos terapêuticos | ||
| Partes II, IV e V: Expressão, Transmissão e Manipulação da Informação. | |||
Integração dos conceitos explorados: Design dirigido de medicamentos contra novos alvos terapêuticos. Inibidores de cinases e vias de sinalização no tratamento do cancro. Novas fronteiras da Medicina Genómica e Personalizada. | |||
(Cap. 18: Cancer, pgs 755-760. Molecular Medicine: STI-571 Cancer Treatment Targeted against the bcr/abl Oncogene, pg: 759) | |||
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| | | [[Media:LCS_BM21.pdf | Apresentação Aula 21]] | ||
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| 27/5 | | 27/5 | ||
Aula 22 | Aula 22 | ||
| | | siRNA e microRNAs | ||
| - | | Partes II, IV e V: Expressão, Transmissão e Manipulação da Informação. | ||
| [http://www.pbs.org/wgbh/nova/sciencenow/3210/02.html Filme] | Pequenos RNAs não codificantes: descoberta, biogénese e funções celulares. Papel na regulação transcricional e pós-transcricional. Outros tipos de RNAs não codificantes: Xist e a inactivação do cromossoma X. Regulação epigenética e RNA. | ||
(Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 145-147. Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:285-287) | |||
| [http://www.pbs.org/wgbh/nova/sciencenow/3210/02.html Filme siRNA] | |||
[http://nobelprize.org/nobel_prizes/medicine/laureates/2006/adv.pdf siRNAs: Nobel da Medicina 2006] | |||
| [[Media:LCS_BM22.pdf | Apresentação Aula 22]] | |||
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Latest revision as of 11:27, 11 June 2010
“De uma coisa temos a certeza: metade do que aprendemos é verdadeiro e a outra metade ou é falsa ou irá ficar rapidamente desactualizada. O problema é que ninguém sabe qual é a metade certa.”
A aprendizagem baseada em problemas (Problem based learning – PBL) é um processo educativo diferente do ensino convencional e tem como objectivo a aquisição de uma base de conhecimento extensa e integrada que seja facilmente recordada e aplicada à análise e resolução de problemas no futuro. Este método assenta no desenvolvimento, por parte do aluno, das capacidades de autoaprendizagem, auto-avaliação, resolução de problemas, e trabalho de equipa.
Neste tipo de ensino, os alunos assumem maior responsabilidade pela sua própria aprendizagem, identificando os conhecimentos que necessitam de aquirir e as fontes onde o podem ir buscar. Desta forma, o aluno tem a oportunidade de construir uma aprendizagem mais dirigida às suas necessidades e interesses individuais. O conhecimento é construido de uma forma iterativa ao longo de várias sessões de discussão em que os alunos apresentam os resultados das suas pesquisas individuais, integram a informação e recebem novos dados do docente.
O docente surge, não como fonte de transmissão de um conhecimento previamente seleccionado, mas como orientador do trabalho dos alunos. O seu papel principal centra-se na escolha de problemas apropriados que permitam a exploração dos conceitos importantes na área de estudo, e no acompanhamento do trabalho dos alunos. Enquanto tutor do processo de aprendizagem, o docente irá fornecendo ou facilitando o acesso à informação requerida pelos alunos, apoiar a integração do conhecimento construído num corpo coerente e participar na avaliação dos progressos efectuados.
No quadro abaixo pode encontrar informação detalhada sobre os conteúdos abordados em cada aula teórica e referências a consultar.
- TUDO O QUE PRECISO PARA ESTUDAR PARA O EXAME! -
Actualizado a 11/06/2010
Data/Aula | Conteúdo | Tópicos (Cooper) | Multimédia | Textos de apoio |
23/2
Aula 0 |
Apresentação | Funcionamento do curso e utilização do OpenWetWare | Openwetware Help | Como trabalhar em PBL |
2/3
Aula 1 |
Introdução à Biologia Molecular | Parte I: Origens e Aplicações da Biologia Molecular
Biologia Molecular: Origens e Perspectiva Histórica, Objectivos, Conceitos e Aplicações (Cap. 1: An Overview of Cells and Cell Research, pgs:4-21. Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 103-115) |
Biologia Molecular - Enciclopédia Stanford de Filosofia | Apresentação Aula 1 |
3/3
Aula 2 |
Introdução ao Caso de Estudo 1 | Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação
Hemoglobina e talassémias. Definição dos tópicos de investigação. |
Alberts online: | Caso de Estudo 1 |
9/3
Aula 3 |
Caso de Estudo 1 - apresentação dos resultados da investigação | Partes II, III e IV: Expressão, Armazenamento e Transmissão da Informação
Organização dos genes da globina. Talassémias. Mecanismos básicos da transcrição. (Cap. 5: The Organization and Sequences of Cellular Genomes. Cap. 7:RNA Synthesis and Processing, pgs:253-268) |
Alberts online:
Cluster dos genes da globina Evolução do cluster da globinaComplementar: Evolução dos genomas |
Apresentação Aula 3 Investigação |
11/3
Aula 4 |
Caso de Estudo 1 - apresentação dos resultados da investigação | Parte II: Expressão da Informação
Regulação da transcrição: Expressão específica de tecido e dependente do desenvolvimento. Regulação da transcrição e diferenciação celular. (Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:268-283) |
Scitable:
DNA Footprinting Transcrição e diferenciação celular Alberts online: Controlo da expressão da globina Complementar: como funciona um switch genético |
|
16/3
Aula 5 |
Caso de Estudo 1 - Que terapias para a Maria? | Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação
Mutações e expressão génica. Classificação funcional de mutações pontuais: silent, nonsense, misense. Dominância e recessividade ao nível molecular. Parte IV: Manipulação da Informação Introdução à terapia génica. |
Scitable: | - |
18/3
Aula 6 |
Caso de Estudo 1 - Polimorfismo ou mutação? | Partes II, III e IV: Expressão, Armazenamento e Transmissão da Informação
Origem e papel das mutações: variabilidade genética, evolução e doença. Polimorfismo e Mutação: Frequência vs Consequência. Caracterização experimental dos efeitos de uma variação pontual na expressão génica. Mutações pontuais silenciosas: impacto na expressão génica ao nível do RNA. |
Alberts online: | |
23/3
Aula 7 |
Processamento do pré-mRNA (splicing) | Parte II: Expressão da Informação
O spliceosoma e factores auxiliares. Sequências reguladoras. Mecanismo do splicing. Splicing alternativo – regulação e importância biológica. (Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:290-300) |
- | Apresentação Aula 7 |
25/3
Aula 8 |
Caso de Estudo 1 - integração | Parte II: Expressão da Informação
Mutações e splicing: destruição de sequências consenso ou activição de locais de splicing crípticos. |
Alberts online: | |
8/4
Aula 9 |
Caso de Estudo 1 - vida e morte de um mRNA | Parte II: Expressão da Informação
Integração dos conceitos. Dinâmica do processo de expressão génica. Exportação e tradução de um mRNA. (Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:301-303. Cap.8: Protein Synthesis, Processing and Regulation, pgs: 309-329) |
Animação: Biogénese e tradução de um mRNA | Apresentação Aula 9 |
13/4
Aula 10 |
Seminários de Investigação:
Docentes convidados - Noélia Custódio, FML e Luisa Romão, INSA |
Parte II: Expressão da Informação
Controlo de qualidade na expressão génica. Mecanismos de vigilância transcricionais e pós-transcricional. A via do "nonsense-mediated mRNA decay." Abordagens experimentais em Biologia Molecular. (Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 118-147) |
- | Seminário 1 |
15/4
Aula 11 |
Caso de Estudo 1 - controlo de qualidade na beta-talassémia | Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação
Integração dos conteúdos abordados. Papel dos mecanismos de controlo de qualidade no fenótipo recessivo/dominante de uma doença hereditária. |
- | - |
20/4
Aula 12 |
Conclusão do caso de Estudo 1 - uma terapia para a Maria? | Parte IV: Manipulação da Informação
Desenvolvimento de novas terapia e ensaios clínicos. Terapias de RNA na modulação da expressão génica. |
Ensaio clínico de terapia de morfolinos | Apresentação Aula 12 |
22/4
Aula 13 |
Apresentação do Caso de Estudo 2 | Partes II, III e IV: Expressão e Armazenamento e Transmissão da Informação.
SIDA e HIV. Definição dos tópicos de investigação. (Cap. 4: Molecular Medicine: HIV and AIDS, pg: 120) |
Caso de Estudo 2 | |
27/4
Aula 14 |
Caso de Estudo 2 - Ciclo de vida do HIV | Partes II, III e IV: Expressão, Armazenamento e Transmissão da Informação.
Infecção por HIV: Ciclo de infecção viral e células alvo. Estrutura do vírus HIV. Genoma do HIV. Mecanismo de acção AZT. (Cap. 3: Key Experiment: Antimetabolites and Chemotherapy, pg: 98. Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 115-116. Cap 9. DNA Replication, pgs: 201-211) |
- | Investigação |
29/4
Aula 15 |
Caso de Estudo 2: Biologia Molecular do HIV | Partes II e III: Expressão e Armazenamento da Informação.
Estrutura do vírus, entrada na célula, transcrição reversa, integração e expressão. Mecanismos pós-transcricionais de regulação da expressão viral: transporte de RNA, regulação traducional e pós-traducional. Terapias anti-HIV. (Cap. 6: Replication, Maintenance, and Rearrangements of Genomic DNA, pgs: 242-244. Cap. 9: The Nucleus, pgs: 361-370) |
Animação HIV Alberts
Alberts online: Regulação da tradução por frame-shift |
Apresentação Aula 15 |
4/5
Aula 16 |
Retrotransposões e elementos móveis | Partes III e IV: Armazenamento e Transmissão da Informação.
Organização do genoma humano: sequências repetitivas e DNA satélite. Elementos genéticos móveis. Mecanismos de recombinação e transposição. (Cap. 5: The Organization and Sequences of Cellular Genomes, pgs: 161-164. Cap. 6: Replication, Maintenance, and Rearrangements of Genomic DNA, pgs: 233 e 239-247). |
Barbara McClintock e a Descoberta dos Transposões | Apresentação Aula 16 |
6/5
Aula 17 |
Caso de Estudo 2: Diversidade genética | Partes III e IV: Armazenamento e Transmissão da Informação.
Mutações, Variabilidade Genética e Selecção Natural. Resistência a Fármacos. Genotipagem - aplicações na clínica, epidemiologia e e estudo da evolução. |
HIV, evolução e resistência
Base de dados de resistência do HIV Artigo/animação - Pandemia H1N1 Alberts online: |
Apresentação Aula 17 |
11/5
Aula 18 |
Caso de Estudo 2: Discussão | Parte IV: Transmissão da Informação.
HIV e Linfoma. Definição dos tópicos de investigação. |
Alberts online: | - |
18/5
Aula 19 |
Caso de Estudo 2: Bases moleculares do Cancro | Parte IV: Transmissão da Informação.
Alterações celulares no Cancro. Desregulação do ciclo celular, apoptose e diferenciação. Oncogenes e Oncossupressores. Retrotransposões e cancro. (Cap 18: Cancer, pgs 719-741, 744 , 746-750, 753-754)) |
Animação Criptas Intestinais | |
20/5
Aula 20 |
Caso de Estudo 2: Transcritómica | Partes II, IV e V: Expressão, Transmissão e Manipulação da Informação.
Diferenciação celular e perfis de expressão génica. Regulação Epigenética. Microarrays. Perfis transcricionais na classificação e prognóstico de tumores. (Cap. 17: Cell Death and Cell Renewal, pgs 700-708) |
Microarrays de DNA | Apresentação Aula 20 |
25/5
Aula 21 |
Caso de Estudo 2: Novos alvos terapêuticos | Partes II, IV e V: Expressão, Transmissão e Manipulação da Informação.
Integração dos conceitos explorados: Design dirigido de medicamentos contra novos alvos terapêuticos. Inibidores de cinases e vias de sinalização no tratamento do cancro. Novas fronteiras da Medicina Genómica e Personalizada. (Cap. 18: Cancer, pgs 755-760. Molecular Medicine: STI-571 Cancer Treatment Targeted against the bcr/abl Oncogene, pg: 759) |
- | Apresentação Aula 21 |
27/5
Aula 22 |
siRNA e microRNAs | Partes II, IV e V: Expressão, Transmissão e Manipulação da Informação.
Pequenos RNAs não codificantes: descoberta, biogénese e funções celulares. Papel na regulação transcricional e pós-transcricional. Outros tipos de RNAs não codificantes: Xist e a inactivação do cromossoma X. Regulação epigenética e RNA. (Cap. 4: Fundamentals of Molecular Biology, pgs: 145-147. Cap. 7: RNA Synthesis and Processing, pgs:285-287) |
Filme siRNA | Apresentação Aula 22 |
1/6
Aula 23 |
Conclusão do curso: Avaliação contínua e revisões | - | - | - |