BioBuilding: Synthetic Biology for Students in Portuguese: Lab 1: Difference between revisions
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* Medir a população bacteriana, inferindo seu crescimento no tempo; | * Medir a população bacteriana, inferindo seu crescimento no tempo; | ||
* Descrever a curva de crescimento bacteriano; | * Descrever a curva de crescimento bacteriano; | ||
* Definir e usar apropriadamente os termos da Biologia Sintética: [[http://youtu.be/X7FUTCvmiE8 Parte | * Definir e usar apropriadamente os termos da Biologia Sintética: [[http://youtu.be/X7FUTCvmiE8 Parte]], [[http://youtu.be/aPqqS8vIAKA Dispositivo]], [[http://youtu.be/ER2wz3I-2KU Inversor]]; | ||
* Definir e usar apropriadamente os termos da Biologia Molecular: [[http://youtu.be/8oHSRBZGMdM Promotor | * Definir e usar apropriadamente os termos da Biologia Molecular: [[http://youtu.be/8oHSRBZGMdM Promotor]], [[http://youtu.be/8oHSRBZGMdM sítio de ligação ribossômica ("RBS")]], [[http://youtu.be/2x8pkL6bAeQ esqueleto de leitura aberta ("ORF")]], [[http://youtu.be/8oHSRBZGMdM Terminador]], [[http://openwetware.org/wiki/BioBuilding:_Synthetic_Biology_for_Students:_Glossary Plasmídeo]]. | ||
==Para pensar...== | ==Para pensar...== |
Revision as of 17:16, 10 April 2014
Laboratório Águas de Cheiro |
Laboratório 1: Águas de Cheiro
Agradecimentos: Esta atividade foi desenvolvida com os materiais e a orientação do Time de 2006 do MIT no iGEM (em inglês), e as ideias e o suporte da Ginkgo Bioworks.ObjetivosAo concluir este módulo, você deverá estar apto a:
Para pensar...
IntroduçãoNo iGEM de 2006, estudantes do MIT fizeram o design da Eau d’coli, uma população de E. coli que produz o aroma natural de banana durante a fase estacionária de seu crescimento. Conseguiram isso inserindo nas bactérias um dispositivo contendo um promotor responsivo à fase estacionária acoplado a um dispositivo gerador de aroma de banana. O dispositivo gerador é composto por um sítio de ligação ribossômica (RBS), um esqueleto de leitura aberta (ORF) que codifica a enzima ATF1 e uma sequência terminadora. A enzima ATF1 participa da conversão do álcool isoamílico no éster acetato de isoamila, que dá o odor característico da banana. Foi considerado que seria útil desenhar esse dispositivo gerador de aroma alinhando-o à fase log do crescimento bacteriano. No entanto, há diferentes designs que podem executar a tarefa. Todos devem produzir o aroma natural de banana, característico do dispositivo gerador, mas é possível variar o promotor e a atuação dele. Podemos acoplar o dispositivo gerador de aroma a uma nova parte, um promotor responsivo à fase log de crescimento, ou a um promotor sensível à fase estacionária. Podemos ainda adicionar um dispositivo inversor entre o promotor de fase estacionária e o nosso dispositivo gerador. Inversores gênicos que podemos utilizar em nossos designs são constantemente desenvolvidos pela comunidade da Biologia Sintética e podem dar novos significados a nossos dispositivos. Para esta atividade trabalhamos com quatro cepas de E. coli, três com dispositivos e um controle: Nossa tarefa é crescer as populações bacterianas e testar o cheiro de banana produzido na medida em que elas passam pela fase log e atingem a estacionária. Podemos determinar o crescimento populacional através da espectrofotometria ou do padrão de turbidez de McFarland, inferindo a densidade de bactérias nas culturas. Na medida em que a população cresce, podemos verificar o odor, comparando com diferentes diluições de extrato de banana.
ProcedimentosEsta Atividade pode ser realizada de duas maneiras, seguindo dois diferentes protocolos: Quando terminados os experimentos (Protocolo A ou Protocolo B), você poderá subir seus dados no site da BioBuilder clicando aqui. Assim você poderá comparar seus resultados com os resultados obtidos por outros alunos ao redor do mundo. Relatório da AtividadeAs you write, be sure to define and properly use all highlighted terms throughout the introduction and other parts of the lab. I. Introduction
II. Methods
III. Results
IV. Discussion
V. Citations and references
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