Biomod/2012/TeamJapan/Sendai/Results/Electrophoresis: Difference between revisions

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!  style="background:#efefef;" |ステイプル(field)②
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| フィールドステイプル 222本  各1μL
| フィールドステイプル222本    各1μL
| M13(84nM) 4.8μL
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| mQ    33μL
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| 10×TAE Mg<sup>2+</sup>   10μL
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| ステイプル(field)①  10μL
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| mQ 75.2μL
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|計    250μL
|計    100μL
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ステイプル(field)②を95°C~25°Cまで1°C2分の条件でサーマルサイクラーにかけ、アニーリングを行う。
 
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! style="background:#efefef;" | ステイプル(三角柱)①
!  style="background:#efefef;" |ステイプル(三角柱)②
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|計 250μL
| 三角柱ステイプル33本    各1μL
|計 100μL
| M13(84nM)  10μL
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| mQ    92μL
| 5×TAE Mg<sup>2+</sup>      20μL
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| ステイプル(三角柱)①     10μL
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| mQ    60μL
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|計   125μL
|計   100μL
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ステイプル(field)②を95°C~25°Cまで1°C2分の条件でサーマルサイクラーにかけ、アニーリングを行う。
フィールドステイプルと同様、95°C~25°Cまで1°C2分の条件でサーマルサイクラーにかけ、アニーリングを行う。
 


これらを高速AFMにより観察した結果が以下である。


②DNAオリガミの精製を行う。(PEG沈、エタ沈)
②DNAオリガミの精製を行う。(PEG沈、エタ沈)
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④加える脂質のパラメータを決める。用いるDNAに対しての濃度の決定。
④加える脂質のパラメータを決める。用いるDNAに対しての濃度の決定。
⑤脂質を加えて引っ付くかどうかを確認する。
⑤脂質を加えて引っ付くかどうかを確認する。
昨年BIOMODで用いたDNAorigamiのレースフィールドを

Revision as of 20:19, 9 August 2012

<実験>

STAGE1目的:脂質でDNAオリガミが引っ付くかの確認
①BIOMOD2011のフィールドおよび三角柱を製作する。 昨年BIOMODで用いたDNAorigamiのレースフィールドおよびロボット本体であった三角柱を作成する。 参考[1]
実験条件

ステイプル(field)① ステイプル(field)②
フィールドステイプル222本 各1μL M13(84nM) 4.8μL
mQ 33μL 10×TAE Mg2+ 10μL
ステイプル(field)①  10μL
mQ 75.2μL
計 250μL 計 100μL

ステイプル(field)②を95°C~25°Cまで1°C2分の条件でサーマルサイクラーにかけ、アニーリングを行う。

ステイプル(三角柱)① ステイプル(三角柱)②
三角柱ステイプル33本 各1μL M13(84nM) 10μL
mQ 92μL 5×TAE Mg2+ 20μL
ステイプル(三角柱)①  10μL
mQ 60μL
計 125μL 計 100μL

フィールドステイプルと同様、95°C~25°Cまで1°C2分の条件でサーマルサイクラーにかけ、アニーリングを行う。

これらを高速AFMにより観察した結果が以下である。

②DNAオリガミの精製を行う。(PEG沈、エタ沈) ③引っ付けるためにどのような脂質を用いるか決める。 ④加える脂質のパラメータを決める。用いるDNAに対しての濃度の決定。 ⑤脂質を加えて引っ付くかどうかを確認する。