Etchevers:Main

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--[[User:Etchevers|Alethea]] 06:22, 4 December 2006 (EST)
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=== Human neural crest cell differentiation ===
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Our current project concerns the transcriptional and phenotypic characterization of highly multipotent neural crest cells (NCC) derived from human embryos. Such characterization is a prerequisite to developing cell-based replacement therapies for congenital malformations or progressive diseases in which neural crest-derived lineages play a primary pathogenic role (“neurocristopathies”).
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A quantitative SAGE analysis of the entire set of mRNA transcripts derived from primary human NCC has been completed in our laboratory, in order to establish the transcriptional profile of genes that distinguish the undifferentiated state for this cell type. The SAGE data is being supplemented with that from a different functional genomics tool that is being exploited in our parent research group in the INSERM U781 and with our collaborators at Institut Curie, Affymetrix DNA microarrays. Statistical analysis and comparison of the SAGE and microarray results using bioinformatics allows us to class transcripts into functional clusters and identify groups of genes that are up- or down-regulated during NCC differentiation.
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In order to rapidly assess gene function, our group looks at the expression of candidate genes for certain neurocristopathies during normal human embryonic development using '' in situ '' hybridization on sections. We can also test the effects of gain or loss of gene function by targeting the NCC of the chicken embryo (a model with many technical advantages) using electroporation, and performing short- and long-term analyses.
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Over the long term, our group also plans to immortalize human NCC shortly after their initial migration, when they most resemble “true” stem cells in their potential. We will test the capacity of the cells to differentiate appropriately after transplantation '' in vivo '' into the developing chicken embryo. In this way, we can define the capacity of multipotent NCC to acquire diverse cell phenotypes in an appropriate environment.
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Our group is particularly interested in neurocristopathies of the cephalic pole, including eye malformations of the anterior chamber, congenital heart defects, and in the congenital giant naevus.
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=== Différenciation de la crête neurale humaine ===
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'' Notre projet concerne la caractérisation transcriptionnelle et phénotypique des cellules multipotentes de la crête neurale (CN) dérivée d’embryons humains. Cette recherche est indispensable avant d’envisager de développer des cytothérapies de remplacement pour des « neurocristopathies » congénitales ou progressives tels le syndrome de Hirschsprung ou certaines neuropathies périphériques.''
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'' Nous entreprenons d’immortaliser des lignées de CN humaine peu de temps après la migration initiale de ces cellules, quand ils ont le plus grand potentiel de différenciation. Nous allons tester la capacité des lignées de se différencier correctement'' in vivo '' chez l’embryon de poulet. Une analyse quantitative SAGE du transcriptome entier des cellules CN humaines vient de terminer, afin d’établir le profil des gènes qui caractérisent l’état indifférencié de la CN.''
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'' Enfin, nous corroborons ces résultats avec un autre outil de génomique fonctionnel, des puces Affymetrix, utilisés par les collaborateurs de l’équipe 2 de l’INSERM U781 et à l’Institut Curie. Nous comparons par exemple le profil transcriptionnel des ganglions fœtaux avec celui de leurs précurseurs multipotents. Une analyse statistique et une comparaison bio-informatique des résultats SAGE et microarray nous permet de classer les transcrits par groupes fonctionnels qui sont modulés au cours de la différenciation.''
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'' Afin d’évaluer rapidement la fonction de tels groupes, nous examinons l’expression de gènes candidats pour des neurocristopathies humaines par l’hybridation'' in situ '' sur des coupes d’embryons humains normaux. Nous effectons aussi des gains ou pertes de fonction de ces gènes au sein de la CN de l’embryon de poulet afin de voir l’effet sur sa différenciation dans un environnement approprié. Ainsi, nous espérons identifier des nouveaux gènes responsables de neurocristopathies ainsi que de connaître leurs modes de fonctionnement qui pourront mener à des voies thérapeutiques.''
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'' Le groupe s'intéresse particulièrement aux malformations congénitales qui touchent le pole céphalique, le coeur, la chambre antérieure de l'oeil et la peau.''
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--[[User:Etchevers|Alethea]] 04:11, 24 January 2006 (EST)
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Revision as of 07:22, 4 December 2006

Functional Genomics of the Human Embryo

Contents

Nuts and bolts

Equipe Avenir (Etchevers)
INSERM U781, Tour Lavoisier, 2ème étage
Hôpital Necker - Enfants Malades
149, rue de Sèvres
75743 Paris Cedex 15
France
tel: (+33) 1 44 49 40 00 poste 97838
fax: (+33) 1 44 49 51 50 • External web page with phone extensions

Current lab members

Heather Corbett Etchevers
Sophie Thomas
Christelle Golzio
Geneviève Guédu
Lekbir Baala
Jean-Claude Quintyn
Nicolas Chassaing

Former lab members

Géraldine Mattei Goudefroye
Eric Detrait

Other important people

• Equipe #2 of INSERM U781, Handicaps Génétiques de l'Enfant
Visitors


Local techniques

PBS-PBT recipes




Trucs utiles

• Comment envoyer un Fedex
• Paperasse autour de la radioactivité


Presentation (PDF) on neural crest development M1 2006

Publications

Research

--Alethea 06:22, 4 December 2006 (EST)

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