FCCT Biochemistry Lab:Courses:BiomedSeminars: Difference between revisions

From OpenWetWare
Jump to navigationJump to search
No edit summary
No edit summary
Line 1: Line 1:
== Splošno ==
== Splošno ==
Z letom 2007/8 se je prejšnji štiriletni univerzitetni podiplomski znanstveni program Biomedicina preoblikoval v triletni [http://www.uni-lj.si/files/ULJ/userfiles/ulj/studij_na_univerzi/podiplomski_studij/biomedicina/BrosuraBiomedicinaDoktorski2007.pdf doktorski študij], ki ga koordinira Medicinska fakulteta UL. Študenti, ki so se v preteklih vpisali v stari program, bodo študij po starem programu tudi dokončali, tisti, ki ste se vpisali v tem študijskem letu v 1. letnik, pa boste študirali po novem programu. Ta vključuje nove predmete in ima drugačna študijska pravila.<br>
Z letom 2007/8 se je prejšnji štiriletni univerzitetni podiplomski znanstveni program Biomedicina preoblikoval v triletni [http://www.uni-lj.si/files/ULJ/userfiles/ulj/studij_na_univerzi/podiplomski_studij/biomedicina/BrosuraBiomedicinaDoktorski2007.pdf doktorski študij], ki ga koordinira Medicinska fakulteta UL. Študenti, ki so se v preteklih vpisali v stari program, bodo študij po starem programu tudi dokončali, tisti, ki ste se vpisali v tem študijskem letu v 1. letnik, pa boste študirali po novem programu. Ta vključuje nove predmete in ima drugačna študijska pravila.<br>
V študijskem letu 2007/8 bodo pri doc. Dolinarju v okviru 2. modula (''Struktura in funkcija bioloških molekul'') pri predmetu ''I[http://www.uni-lj.si/files/ULJ/userfiles/ulj/studij_na_univerzi/podiplomski_studij/biomedicina/Urniki0708/BMB-0708.pdf zbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije]'' na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (14. februarja 2008), Renaturacija rekombinantnih proteinov (19. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (21. februarja). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 v veliki predavalnici Kemijskega inštituta na Hajdrihovi 19.  
 
V študijskem letu 2008/9 bodo pri doc. Dolinarju v okviru 2. modula (''Struktura in funkcija bioloških molekul'') pri predmetu ''I[http://www.uni-lj.si/files/ULJ/userfiles/ulj/studij_na_univerzi/podiplomski_studij/biomedicina/Urniki0708/BMB-0708.pdf zbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije]'' na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (12. februarja 2009), Renaturacija rekombinantnih proteinov (17. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (19. februarja). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 v veliki predavalnici Kemijskega inštituta na Hajdrihovi 19.  
Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji po naslednjem razporedu:
Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji po naslednjem razporedu:


Line 12: Line 13:
!referent
!referent
|-
|-
|14. 02. 2008
|17. 02. 2008
|Thomas A. Kost et al. (2005) Baculovirus as versatile vectors for protein expression in insect and mammalian cells. [http://www.nature.com/nbt/journal/v23/n5/abs/nbt1095.html Nature Biotechnol. 23, 567-575]
|članek 1
|Blaž Nemec
|študent 1
|-
|17. 02. 2008
|članek 2
|študent 2
|-
|-
|19. 02. 2008
|19. 02. 2008
|Ursula Rinas et al. (2007) Inclusion body anatomy and functioning of chaperone-mediated in vivo inclusion body disassembly during high-level recombinant protein production in ''Escherichia coli''. [http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6T3C-4KDV0HY-1&_user=634383&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_sort=d&view=c&_acct=C000033638&_version=1&_urlVersion=0&_userid=634383&md5=80ede503454915bc583f59a721447198 J. Biotechnol. 127, 244–257]
|članek 3
|Katarina Trdina
|študent 3
|-
|-
|19. 02. 2008
|19. 02. 2008
|Elena Garcia-Fruitos et al. (2007) Divergent genetic control of protein solubility and conformational quality in ''Escherichia coli''. [http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6WK7-4PMJK6P-5&_user=634383&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_sort=d&view=c&_acct=C000033638&_version=1&_urlVersion=0&_userid=634383&md5=215fa12ca177ba305d4faa157c79994f J. Mol. Biol. 374, 195–205]
|članek 4
|Barbara Muščet
|študent 4
|-
|21. 02. 2008
|Yanhua Fan et al. (2007) Expression of a ''Beauveria bassiana'' chitinase (Bbchit1) in ''Escherichia coli'' and ''Pichia pastoris''. [http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6WPJ-4P5NX48-3&_user=634383&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_sort=d&view=c&_acct=C000033638&_version=1&_urlVersion=0&_userid=634383&md5=812a467c68b4b1bcce35a2ecd0688320 Protein Expr. Purif. 56, 93-99]
|Maja Anko
|-
|21. 02. 2008
|Jean-Philippe Gaudry et al. (2008) Purification of the extracellular domain of the membrane protein GlialCAM expressed in HEK and CHO cells and comparison of the glycosylation. [http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6WPJ-4R3358G-1&_user=634383&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_sort=d&view=c&_acct=C000033638&_version=1&_urlVersion=0&_userid=634383&md5=08452be8631f95398d9232dc2b141c10 Protein Expr. Purif. 58, 94-102]
|Nina Kočevar
|}
|}


Naslovi člankov in povezave do njih bodo na voljo konec januarja. Prijave sprejemam do zasedbe mest.
== Navodila za pripravo ==
== Navodila za pripravo ==


Line 46: Line 45:
- predstavitev v programu PowerPoint v obsegu in na način, ki bo omogočil natančen vpogled v snov, predstavljeno v članku in bo služil kot osnova za razpravo <br>
- predstavitev v programu PowerPoint v obsegu in na način, ki bo omogočil natančen vpogled v snov, predstavljeno v članku in bo služil kot osnova za razpravo <br>


'''Predstavitve naj bi bile dolge okrog 45 minut. V tem času boste morali razložiti:'''<br>
'''Predstavitve naj bi bile dolge okrog 30 minut. V tem času boste morali razložiti:'''<br>
- ozadje/problem, ki ga članek obravnava, pri čemer poskušajte izluščiti ne samo namen dela, pač pa tudi delovno hipotezo <br>
- ozadje/problem, ki ga članek obravnava, pri čemer poskušajte izluščiti ne samo namen dela, pač pa tudi delovno hipotezo <br>
- predhodno opravljeno delo (ali stanje stvari na tem področju) <br>
- predhodno opravljeno delo (ali stanje stvari na tem področju) <br>

Revision as of 03:23, 2 October 2008

Splošno

Z letom 2007/8 se je prejšnji štiriletni univerzitetni podiplomski znanstveni program Biomedicina preoblikoval v triletni doktorski študij, ki ga koordinira Medicinska fakulteta UL. Študenti, ki so se v preteklih vpisali v stari program, bodo študij po starem programu tudi dokončali, tisti, ki ste se vpisali v tem študijskem letu v 1. letnik, pa boste študirali po novem programu. Ta vključuje nove predmete in ima drugačna študijska pravila.

V študijskem letu 2008/9 bodo pri doc. Dolinarju v okviru 2. modula (Struktura in funkcija bioloških molekul) pri predmetu Izbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (12. februarja 2009), Renaturacija rekombinantnih proteinov (17. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (19. februarja). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 v veliki predavalnici Kemijskega inštituta na Hajdrihovi 19. Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji po naslednjem razporedu:

Seznam seminarjev

datum članek za seminar referent
17. 02. 2008 članek 1 študent 1
17. 02. 2008 članek 2 študent 2
19. 02. 2008 članek 3 študent 3
19. 02. 2008 članek 4 študent 4

Naslovi člankov in povezave do njih bodo na voljo konec januarja. Prijave sprejemam do zasedbe mest.

Navodila za pripravo

Seminarji predstavljajo pomemben del modula in jih bomo tako tudi ocenjevali. Samo 50 % ocene modula bodo predstavljali odgovori na izpitna vprašanja, 50 % ocene pa je ocena seminarja. Ta polovica ocene se oblikuje iz 60 % za predstavitev in povzetek ter 40 % za sodelovanje pri razpravah o seminarjih.

Vsak doktorski študent, ki je vpisal 2. modul, mora:
- prebrati vsakega od člankov, ki jih bomo obravnavali na seminarjih, do datuma predstavitve
- pripraviti vprašanja za razpravo
- sodelovati v razpravi

Vsak od petih referentov mora pripraviti naslednje:
- povzetek seminarja s 1200-1600 besedami - lahko vključuje tudi slike, ni pa nujno (sklicujete se lahko na slike v originalnem članku); povzetek oddate na dan predstavitve v elektronski obliki in ga bodo dobili vsi vpisani študenti kot pomoč pri pripravi na izpit
- predstavitev v programu PowerPoint v obsegu in na način, ki bo omogočil natančen vpogled v snov, predstavljeno v članku in bo služil kot osnova za razpravo

Predstavitve naj bi bile dolge okrog 30 minut. V tem času boste morali razložiti:
- ozadje/problem, ki ga članek obravnava, pri čemer poskušajte izluščiti ne samo namen dela, pač pa tudi delovno hipotezo
- predhodno opravljeno delo (ali stanje stvari na tem področju)
- konkreten delovni načrt za izvedbo raziskave
- rezultate in metode (metodo smiselno vključite v rezultate)
- kritično mnenje o članku (kaj je bilo dobro zastavljeno, izvedeno, predstavljeno, razloženo... in kaj ne)
- uvod v razpravo

Razprava o vsakem članku naj bi trajala vsaj 30 minut in mora biti poglobljena in argumentirana. Zato je res nujno, da članke berete sproti in temeljito!