FCCT Biochemistry Lab:Courses:BiomedSeminars: Difference between revisions

From OpenWetWare
Jump to navigationJump to search
No edit summary
Line 1: Line 1:
== Splošno ==
== Splošno ==
Z letom 2007/8 se je prejšnji štiriletni univerzitetni podiplomski znanstveni program Biomedicina preoblikoval v triletni [http://www.uni-lj.si/files/ULJ/userfiles/ulj/studij_na_univerzi/podiplomski_studij/biomedicina/BrosuraBiomedicinaDoktorski2007.pdf doktorski študij], ki ga koordinira Medicinska fakulteta UL. Študenti, ki so se v preteklih vpisali v stari program, bodo študij po starem programu tudi dokončali, tisti, ki ste se vpisali v tem študijskem letu v 1. letnik, pa boste študirali po novem programu. Ta vključuje nove predmete in ima drugačna študijska pravila.<br>


V študijskem letu 2009/10 bodo pri doc. Dolinarju v okviru 2. modula (''Struktura in funkcija bioloških molekul'') pri predmetu ''[http://www.uni-lj.si/files/ULJ/userfiles/ulj/studij_na_univerzi/podiplomski_studij/biomedicina/Urniki0809/BMB_%200809.pdf Izbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije]'' na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (18. februarja 2009), Renaturacija rekombinantnih proteinov (23. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (25. februarja). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 in bodo potekala na Kemijskem inštitutu na Hajdrihovi 19.  
V študijskem letu 2010/11 bodo pri doc. Dolinarju v okviru 2. modula (''Struktura in funkcija bioloških molekul'') pri predmetu ''[http://www.uni-lj.si/files/ULJ/userfiles/ulj/studij_na_univerzi/podiplomski_studij/biomedicina/Urniki0809/BMB_%200809.pdf Izbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije]'' na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (15. februarja 2009), Renaturacija rekombinantnih proteinov (17. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (22. februarja). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 in bodo potekala na Kemijskem inštitutu na Hajdrihovi 19.  
Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji. Glede na število vpisanih študentov v 2. modul bomo letos izvedli šest seminarjev. Članki, ki so osnova za pripravo, so navedeni spodaj.
Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji. Glede na število vpisanih študentov v 2. modul bomo letos izvedli šest seminarjev. Članki, ki so osnova za pripravo, so navedeni spodaj.


Line 13: Line 12:
!referent
!referent
|-
|-
|18. 02. 2010 /
|15. 02. 2011 /
|Khabir et al.: [http://dx.doi.org/10.1016/j.pep.2010.01.002 Purification and functional characterization of a Camelid-like single-domain antimycotic antibody by engineering in affinity tag]. Protein Expr. Purif., v tisku (2010)...
|Khabir et al.: [http://dx.doi.org/10.1016/j.pep.2010.01.002 Purification and functional characterization of a Camelid-like single-domain antimycotic antibody by engineering in affinity tag]. Protein Expr. Purif., v tisku (2010)...
|Jernej Rojko
|
|-
|-
|18. 02. 2010 /
|15. 02. 2011 /
|Bhatla et al.: [http://www.sciencedirect.com/science?_ob=MImg&_imagekey=B6T4X-4Y4R306-1-1&_cdi=4986&_user=634383&_orig=search&_coverDate=01%2F11%2F2010&_sk=999999999&view=c&wchp=dGLzVtb-zSkWz&md5=1b4f92902698448945b54f6e2f502443&ie=/sdarticle.pdf Use of oil bodies and oleosins in recombinant protein production and other biotechnological applications]. Biotechnol. Adv., v tisku (2010)...
|Finnis et al.: [http://www.microbialcellfactories.com/content/9/1/87 High-level production of animal-free recombinant transferrin from ''Saccharomyces cerevisiae'']. Microbial cell Fact. 9:87 (2010)...
|Katja Ota
|
|-
|-
|23. 02. 2010 /
|17. 02. 2011 /
|Dee et al.: [http://www.sciencedirect.com/science?_ob=MImg&_imagekey=B73DJ-4X378FF-2-9&_cdi=11472&_user=634383&_orig=search&_coverDate=12%2F31%2F2009&_sk=982059987&view=c&wchp=dGLbVzz-zSkWb&md5=f7a8c5362f07bc161e59499267b7bea5&ie=/sdarticle.pdf Recombinant prosegment acts as a folding catalyst and inhibitor of native pepsin]. Biochim. Biophys. Acta 1794, 1795-1801 (2009)...
|Nguyen et al.: [http://www.microbialcellfactories.com/content/10/1/1 Pre-expression of a sulfhydryl oxidase significantly increases the yields of eukaryotic disulfide bond containing proteins expressed in the cytoplasm of ''E. coli'']. Microbial Cell Fact. 10:1 (2011)...
|Nataša Beranič
|
|-
|-
|23. 02. 2010 /
|17. 02. 2011 /
|Sahu et al.: [http://www.springerlink.com/content/y702650477562178/fulltext.pdf GroES and GroEL are essential chaperones for refolding of recombinant human phospholipid scramblase 1 in E. coli]. Biotechnol. Lett. 31, 1745-1752 (2009)...
|Sahu et al.: [http://www.springerlink.com/content/y702650477562178/fulltext.pdf GroES and GroEL are essential chaperones for refolding of recombinant human phospholipid scramblase 1 in E. coli]. Biotechnol. Lett. 31, 1745-1752 (2009)...
|Eva Sodja
|
|-
|-
|25. 02. 2008 /
|22. 02. 2011 /
|Rao et al.: [http://www.jmb.or.kr/submission/Journal/019/JMB019-12-20_FDOC_2.pdf Design and expression of recombinant antihypertensive peptide multimer gene in Escherichia coli BL21]. J. Microbiol. Biotechnol. 19,1620-1627 (2009)...
|Hartwig et al.: [http://www.microbialcellfactories.com/content/9/1/98 High yield expression of leptospirosis vaccine candidates LigA and LipL32 in the methylotrophic yeast Pichia pastoris]. Microbial Cell Fact. 9:98 (2010)...
|Jernej Kovač
|
|-
|-
|25. 02. 2010 /
|22. 02. 2011 /
|Shen et al.: [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2780291/pdf/pone.0008119.pdf Simplified, enhanced protein purification using an inducible, autoprocessing enzyme tag]. PLoS One 4, e8119 (2009)...
|Shen et al.: [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2780291/pdf/pone.0008119.pdf Simplified, enhanced protein purification using an inducible, autoprocessing enzyme tag]. PLoS One 4, e8119 (2009)...
|Matjaž Deželak
|
|}
|}



Revision as of 04:34, 13 January 2011

Splošno

V študijskem letu 2010/11 bodo pri doc. Dolinarju v okviru 2. modula (Struktura in funkcija bioloških molekul) pri predmetu Izbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (15. februarja 2009), Renaturacija rekombinantnih proteinov (17. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (22. februarja). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 in bodo potekala na Kemijskem inštitutu na Hajdrihovi 19. Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji. Glede na število vpisanih študentov v 2. modul bomo letos izvedli šest seminarjev. Članki, ki so osnova za pripravo, so navedeni spodaj.

Seznam seminarjev

datum članek za seminar referent
15. 02. 2011 / Khabir et al.: Purification and functional characterization of a Camelid-like single-domain antimycotic antibody by engineering in affinity tag. Protein Expr. Purif., v tisku (2010)...
15. 02. 2011 / Finnis et al.: High-level production of animal-free recombinant transferrin from Saccharomyces cerevisiae. Microbial cell Fact. 9:87 (2010)...
17. 02. 2011 / Nguyen et al.: Pre-expression of a sulfhydryl oxidase significantly increases the yields of eukaryotic disulfide bond containing proteins expressed in the cytoplasm of E. coli. Microbial Cell Fact. 10:1 (2011)...
17. 02. 2011 / Sahu et al.: GroES and GroEL are essential chaperones for refolding of recombinant human phospholipid scramblase 1 in E. coli. Biotechnol. Lett. 31, 1745-1752 (2009)...
22. 02. 2011 / Hartwig et al.: High yield expression of leptospirosis vaccine candidates LigA and LipL32 in the methylotrophic yeast Pichia pastoris. Microbial Cell Fact. 9:98 (2010)...
22. 02. 2011 / Shen et al.: Simplified, enhanced protein purification using an inducible, autoprocessing enzyme tag. PLoS One 4, e8119 (2009)...

Prijave sem sprejemal do zasedbe mest.

Navodila za pripravo

Seminarji predstavljajo pomemben del modula in jih bomo tako tudi ocenjevali. Samo 50 % ocene modula bodo predstavljali odgovori na izpitna vprašanja, 50 % ocene pa je ocena seminarja. Ta polovica ocene se oblikuje iz 60 % za predstavitev in povzetek ter 40 % za sodelovanje pri razpravah o seminarjih.

Vsak doktorski študent, ki je vpisal 2. modul, mora:
- prebrati vsakega od člankov, ki jih bomo obravnavali na seminarjih, do datuma predstavitve
- pripraviti vprašanja za razpravo
- sodelovati v razpravi

Vsak od treh referentov mora pripraviti naslednje:
- povzetek seminarja s 1200-1600 besedami - lahko vključuje tudi slike, ni pa nujno (sklicujete se lahko na številke slik v originalnem članku); povzetek oddate na dan predstavitve v elektronski obliki in ga pošljite tudi vsem vpisanim študentom kot pomoč pri pripravi na izpit
- predstavitev v programu PowerPoint v obsegu in na način, ki bo omogočil natančen vpogled v snov, predstavljeno v članku in bo služil kot osnova za razpravo

Predstavitve naj bi bile dolge okrog 30 minut. V tem času boste morali razložiti:
- ozadje/problem, ki ga članek obravnava, pri čemer poskušajte izluščiti ne samo namen dela, pač pa tudi delovno hipotezo
- predhodno opravljeno delo (ali stanje stvari na tem področju)
- konkreten delovni načrt za izvedbo raziskave
- rezultate in metode (metodo smiselno vključite v rezultate)
- kritično mnenje o članku (kaj je bilo dobro zastavljeno, izvedeno, predstavljeno, razloženo... in kaj ne)
- uvod v razpravo

Razprava o vsakem članku naj bi trajala vsaj 30 minut in mora biti poglobljena in argumentirana. Zato je res nujno, da članke berete sproti in temeljito!