FCCT Biochemistry Lab:Courses:BiomedSeminars: Difference between revisions
No edit summary |
No edit summary |
||
(45 intermediate revisions by the same user not shown) | |||
Line 1: | Line 1: | ||
V študijskem letu | == Splošno == | ||
Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji | |||
V študijskem letu 2012/13 bodo pri prof. Dolinarju v okviru 2. modula (''Struktura in funkcija bioloških molekul'') pri predmetu ''[http://www.uni-lj.si/files/ULJ/userfiles/ulj/studij_na_univerzi/podiplomski_studij/biomedicina/Urniki0809/BMB_%200809.pdf Izbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije]'' na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (26. februarja 2013), Renaturacija rekombinantnih proteinov (28. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (5. marca). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 in bodo potekala na Kemijskem inštitutu na Hajdrihovi 19. | |||
Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji. Glede na število vpisanih študentov v 2. modul bomo letos izvedli štiri seminarje. Članki, ki so osnova za pripravo, so navedeni spodaj. | |||
== Seznam seminarjev == | |||
{| | {| | ||
Line 6: | Line 10: | ||
!datum | !datum | ||
!članek za seminar | !članek za seminar | ||
!referent | !referent | ||
|- | |- | ||
| | |26. 02. 2013/ | ||
| | |Moazen et al.: [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3544109/ Optimization of Taq DNA polymerase enzyme expression in ''Escherichia coli'']. Adv. Biomed. Res. (2012)... | ||
|Sandra Ropret | |||
| | |||
|- | |- | ||
| | |28. 02. 2013/ | ||
| | |Jaehme & Michel: [http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/febs.12105/pdf Evaluation of cell-free protein synthesis for the crystallization of membrane proteins – a case study on a member of the glutamate transporter family from ''Staphylothermus marinus'']. FEBS J. (2013)... | ||
|Matic Kisovec | |||
| | |||
|- | |- | ||
| | |28.02. 2013/ | ||
| | | | ||
| | |||
| | |||
|- | |- | ||
| | |05. 03. 2013/ | ||
| | |Han et al.: [http://www.pnas.org/content/109/31/12467.full.pdf Monitoring cotranslational protein folding in mammalian cells at codon resolution]. PNAS (2012)... | ||
|Neža Juvan | |||
| | |||
|- | |- | ||
| | |05. 03. 2013/ | ||
| | |Huang et al.: [http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0042207 Expression, Purification, and Mass Spectrometric Analysis of 15N, 13C-Labeled RGD-Hirudin, Expressed in ''Pichia pastoris'', for NMR Studies]. PLOS One (2012)... | ||
| | |Mirijam Kozorog | ||
| | |- | ||
|/ | |||
|-- | |||
|} | |} | ||
Prijave bom sprejemal po e-pošti do zasedbe vseh seminarskih tem. | |||
== Navodila za pripravo == | |||
Seminarji predstavljajo pomemben del modula in jih bomo tako tudi ocenjevali. Samo 50 % ocene modula bodo predstavljali odgovori na izpitna vprašanja, 50 % ocene pa je ocena seminarja. Ta polovica ocene se oblikuje iz 60 % za predstavitev in povzetek ter 40 % za sodelovanje pri razpravah o seminarjih. | |||
'''Vsak doktorski študent, ki je vpisal 2. modul, mora:'''<br> | |||
- prebrati vsakega od člankov, ki jih bomo obravnavali na seminarjih, do datuma predstavitve<br> | |||
- pripraviti vprašanja za razpravo<br> | |||
- sodelovati v razpravi<br> | |||
'''Vsak od referentov mora pripraviti naslednje:'''<br> | |||
- povzetek seminarja s 1200-1600 besedami - lahko vključuje tudi slike, ni pa nujno (sklicujete se lahko na številke slik v originalnem članku); povzetek oddate na dan predstavitve v elektronski obliki in ga pošljite tudi vsem vpisanim študentom kot pomoč pri pripravi na izpit <br> | |||
- predstavitev v programu PowerPoint v obsegu in na način, ki bo omogočil natančen vpogled v snov, predstavljeno v članku in bo služil kot osnova za razpravo <br> | |||
'''Predstavitve naj bi bile dolge okrog 30 minut. V tem času boste morali razložiti:'''<br> | |||
- ozadje/problem, ki ga članek obravnava, pri čemer poskušajte izluščiti ne samo namen dela, pač pa tudi delovno hipotezo <br> | |||
- predhodno opravljeno delo (ali stanje stvari na tem področju) <br> | |||
- konkreten delovni načrt za izvedbo raziskave <br> | |||
- rezultate in metode (metodo smiselno vključite v rezultate) <br> | |||
- kritično mnenje o članku (kaj je bilo dobro zastavljeno, izvedeno, predstavljeno, razloženo... in kaj ne) <br> | |||
- uvod v razpravo <br> | |||
'''Razprava o vsakem članku naj bi trajala vsaj 30 minut in mora biti poglobljena in argumentirana.''' Zato je res nujno, da članke berete sproti in temeljito! |
Revision as of 01:07, 30 January 2013
Splošno
V študijskem letu 2012/13 bodo pri prof. Dolinarju v okviru 2. modula (Struktura in funkcija bioloških molekul) pri predmetu Izbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (26. februarja 2013), Renaturacija rekombinantnih proteinov (28. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (5. marca). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 in bodo potekala na Kemijskem inštitutu na Hajdrihovi 19. Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji. Glede na število vpisanih študentov v 2. modul bomo letos izvedli štiri seminarje. Članki, ki so osnova za pripravo, so navedeni spodaj.
Seznam seminarjev
datum | članek za seminar | referent |
---|---|---|
26. 02. 2013/ | Moazen et al.: Optimization of Taq DNA polymerase enzyme expression in Escherichia coli. Adv. Biomed. Res. (2012)... | Sandra Ropret |
28. 02. 2013/ | Jaehme & Michel: Evaluation of cell-free protein synthesis for the crystallization of membrane proteins – a case study on a member of the glutamate transporter family from Staphylothermus marinus. FEBS J. (2013)... | Matic Kisovec |
28.02. 2013/ | ||
05. 03. 2013/ | Han et al.: Monitoring cotranslational protein folding in mammalian cells at codon resolution. PNAS (2012)... | Neža Juvan |
05. 03. 2013/ | Huang et al.: Expression, Purification, and Mass Spectrometric Analysis of 15N, 13C-Labeled RGD-Hirudin, Expressed in Pichia pastoris, for NMR Studies. PLOS One (2012)... | Mirijam Kozorog |
/ |
Prijave bom sprejemal po e-pošti do zasedbe vseh seminarskih tem.
Seminarji predstavljajo pomemben del modula in jih bomo tako tudi ocenjevali. Samo 50 % ocene modula bodo predstavljali odgovori na izpitna vprašanja, 50 % ocene pa je ocena seminarja. Ta polovica ocene se oblikuje iz 60 % za predstavitev in povzetek ter 40 % za sodelovanje pri razpravah o seminarjih.
Vsak doktorski študent, ki je vpisal 2. modul, mora:
- prebrati vsakega od člankov, ki jih bomo obravnavali na seminarjih, do datuma predstavitve
- pripraviti vprašanja za razpravo
- sodelovati v razpravi
Vsak od referentov mora pripraviti naslednje:
- povzetek seminarja s 1200-1600 besedami - lahko vključuje tudi slike, ni pa nujno (sklicujete se lahko na številke slik v originalnem članku); povzetek oddate na dan predstavitve v elektronski obliki in ga pošljite tudi vsem vpisanim študentom kot pomoč pri pripravi na izpit
- predstavitev v programu PowerPoint v obsegu in na način, ki bo omogočil natančen vpogled v snov, predstavljeno v članku in bo služil kot osnova za razpravo
Predstavitve naj bi bile dolge okrog 30 minut. V tem času boste morali razložiti:
- ozadje/problem, ki ga članek obravnava, pri čemer poskušajte izluščiti ne samo namen dela, pač pa tudi delovno hipotezo
- predhodno opravljeno delo (ali stanje stvari na tem področju)
- konkreten delovni načrt za izvedbo raziskave
- rezultate in metode (metodo smiselno vključite v rezultate)
- kritično mnenje o članku (kaj je bilo dobro zastavljeno, izvedeno, predstavljeno, razloženo... in kaj ne)
- uvod v razpravo
Razprava o vsakem članku naj bi trajala vsaj 30 minut in mora biti poglobljena in argumentirana. Zato je res nujno, da članke berete sproti in temeljito!