FCCT Biochemistry Lab:Courses:BiomedSeminars: Difference between revisions
No edit summary |
No edit summary |
||
| (32 intermediate revisions by the same user not shown) | |||
| Line 1: | Line 1: | ||
== Splošno == | == Splošno == | ||
V študijskem letu | V študijskem letu 2012/13 bodo pri prof. Dolinarju v okviru 2. modula (''Struktura in funkcija bioloških molekul'') pri predmetu ''[http://www.uni-lj.si/files/ULJ/userfiles/ulj/studij_na_univerzi/podiplomski_studij/biomedicina/Urniki0809/BMB_%200809.pdf Izbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije]'' na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (26. februarja 2013), Renaturacija rekombinantnih proteinov (28. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (5. marca). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 in bodo potekala na Kemijskem inštitutu na Hajdrihovi 19. | ||
Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji | Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji. Glede na število vpisanih študentov v 2. modul bomo letos izvedli štiri seminarje. Članki, ki so osnova za pripravo, so navedeni spodaj. | ||
== Seznam seminarjev == | == Seznam seminarjev == | ||
| Line 13: | Line 12: | ||
!referent | !referent | ||
|- | |- | ||
| | |26. 02. 2013/ | ||
| | |Moazen et al.: [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3544109/ Optimization of Taq DNA polymerase enzyme expression in ''Escherichia coli'']. Adv. Biomed. Res. (2012)... | ||
| | |Sandra Ropret | ||
|- | |- | ||
| | |28. 02. 2013/ | ||
| | |Jaehme & Michel: [http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/febs.12105/pdf Evaluation of cell-free protein synthesis for the crystallization of membrane proteins – a case study on a member of the glutamate transporter family from ''Staphylothermus marinus'']. FEBS J. (2013)... | ||
| | |Matic Kisovec | ||
|- | |- | ||
| | |28.02. 2013/ | ||
| | | | ||
| | | | ||
|- | |- | ||
| | |05. 03. 2013/ | ||
| | |Han et al.: [http://www.pnas.org/content/109/31/12467.full.pdf Monitoring cotranslational protein folding in mammalian cells at codon resolution]. PNAS (2012)... | ||
| | |Neža Juvan | ||
|- | |||
|05. 03. 2013/ | |||
|Huang et al.: [http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0042207 Expression, Purification, and Mass Spectrometric Analysis of 15N, 13C-Labeled RGD-Hirudin, Expressed in ''Pichia pastoris'', for NMR Studies]. PLOS One (2012)... | |||
|Mirijam Kozorog | |||
|- | |||
|/ | |||
|-- | |||
|} | |} | ||
Prijave | Prijave bom sprejemal po e-pošti do zasedbe vseh seminarskih tem. | ||
== Navodila za pripravo == | == Navodila za pripravo == | ||
| Line 41: | Line 47: | ||
- sodelovati v razpravi<br> | - sodelovati v razpravi<br> | ||
'''Vsak od | '''Vsak od referentov mora pripraviti naslednje:'''<br> | ||
- povzetek seminarja s 1200-1600 besedami - lahko vključuje tudi slike, ni pa nujno (sklicujete se lahko na | - povzetek seminarja s 1200-1600 besedami - lahko vključuje tudi slike, ni pa nujno (sklicujete se lahko na številke slik v originalnem članku); povzetek oddate na dan predstavitve v elektronski obliki in ga pošljite tudi vsem vpisanim študentom kot pomoč pri pripravi na izpit <br> | ||
- predstavitev v programu PowerPoint v obsegu in na način, ki bo omogočil natančen vpogled v snov, predstavljeno v članku in bo služil kot osnova za razpravo <br> | - predstavitev v programu PowerPoint v obsegu in na način, ki bo omogočil natančen vpogled v snov, predstavljeno v članku in bo služil kot osnova za razpravo <br> | ||
Revision as of 01:07, 30 January 2013
Splošno
V študijskem letu 2012/13 bodo pri prof. Dolinarju v okviru 2. modula (Struktura in funkcija bioloških molekul) pri predmetu Izbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (26. februarja 2013), Renaturacija rekombinantnih proteinov (28. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (5. marca). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 in bodo potekala na Kemijskem inštitutu na Hajdrihovi 19. Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji. Glede na število vpisanih študentov v 2. modul bomo letos izvedli štiri seminarje. Članki, ki so osnova za pripravo, so navedeni spodaj.
Seznam seminarjev
| datum | članek za seminar | referent |
|---|---|---|
| 26. 02. 2013/ | Moazen et al.: Optimization of Taq DNA polymerase enzyme expression in Escherichia coli. Adv. Biomed. Res. (2012)... | Sandra Ropret |
| 28. 02. 2013/ | Jaehme & Michel: Evaluation of cell-free protein synthesis for the crystallization of membrane proteins – a case study on a member of the glutamate transporter family from Staphylothermus marinus. FEBS J. (2013)... | Matic Kisovec |
| 28.02. 2013/ | ||
| 05. 03. 2013/ | Han et al.: Monitoring cotranslational protein folding in mammalian cells at codon resolution. PNAS (2012)... | Neža Juvan |
| 05. 03. 2013/ | Huang et al.: Expression, Purification, and Mass Spectrometric Analysis of 15N, 13C-Labeled RGD-Hirudin, Expressed in Pichia pastoris, for NMR Studies. PLOS One (2012)... | Mirijam Kozorog |
| / |
Prijave bom sprejemal po e-pošti do zasedbe vseh seminarskih tem.
Seminarji predstavljajo pomemben del modula in jih bomo tako tudi ocenjevali. Samo 50 % ocene modula bodo predstavljali odgovori na izpitna vprašanja, 50 % ocene pa je ocena seminarja. Ta polovica ocene se oblikuje iz 60 % za predstavitev in povzetek ter 40 % za sodelovanje pri razpravah o seminarjih.
Vsak doktorski študent, ki je vpisal 2. modul, mora:
- prebrati vsakega od člankov, ki jih bomo obravnavali na seminarjih, do datuma predstavitve
- pripraviti vprašanja za razpravo
- sodelovati v razpravi
Vsak od referentov mora pripraviti naslednje:
- povzetek seminarja s 1200-1600 besedami - lahko vključuje tudi slike, ni pa nujno (sklicujete se lahko na številke slik v originalnem članku); povzetek oddate na dan predstavitve v elektronski obliki in ga pošljite tudi vsem vpisanim študentom kot pomoč pri pripravi na izpit
- predstavitev v programu PowerPoint v obsegu in na način, ki bo omogočil natančen vpogled v snov, predstavljeno v članku in bo služil kot osnova za razpravo
Predstavitve naj bi bile dolge okrog 30 minut. V tem času boste morali razložiti:
- ozadje/problem, ki ga članek obravnava, pri čemer poskušajte izluščiti ne samo namen dela, pač pa tudi delovno hipotezo
- predhodno opravljeno delo (ali stanje stvari na tem področju)
- konkreten delovni načrt za izvedbo raziskave
- rezultate in metode (metodo smiselno vključite v rezultate)
- kritično mnenje o članku (kaj je bilo dobro zastavljeno, izvedeno, predstavljeno, razloženo... in kaj ne)
- uvod v razpravo
Razprava o vsakem članku naj bi trajala vsaj 30 minut in mora biti poglobljena in argumentirana. Zato je res nujno, da članke berete sproti in temeljito!
