FCCT Biochemistry Lab:Courses:BiomedSeminars: Difference between revisions

From OpenWetWare
Jump to navigationJump to search
No edit summary
No edit summary
Line 1: Line 1:
== Splošno ==
== Splošno ==


V študijskem letu 2012/13 bodo pri prof. Dolinarju v okviru 2. modula (''Struktura in funkcija bioloških molekul'') pri predmetu ''[http://www.uni-lj.si/files/ULJ/userfiles/ulj/studij_na_univerzi/podiplomski_studij/biomedicina/Urniki0809/BMB_%200809.pdf Izbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije]'' na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (26. februarja 2013), Renaturacija rekombinantnih proteinov (28. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (5. marca). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 in bodo potekala na Kemijskem inštitutu na Hajdrihovi 19.  
V študijskem letu 2014/15 bodo pri prof. Dolinarju v okviru 2. modula (''Struktura in funkcija bioloških molekul'') pri predmetu ''[http://www.uni-lj.si/mma/Urnik%20BMB%2020142015%204.11./2014110513233417/ Izbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije]'' na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (12. februarja 2015), Renaturacija rekombinantnih proteinov (17. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (19. februarja). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 in bodo potekala na Kemijskem inštitutu na Hajdrihovi 19 v Fegeševi sobi.  
Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji. Glede na število vpisanih študentov v 2. modul bomo letos izvedli štiri seminarje. Članki, ki so osnova za pripravo, so navedeni spodaj.
Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji. Glede na število vpisanih študentov v 2. modul bomo letos izvedli dva seminarja. Članka, ki sta osnova za pripravo, sta navedena spodaj.


== Seznam seminarjev ==
== Seznam seminarjev ==
Line 12: Line 12:
!referent
!referent
|-
|-
|26. 02. 2013/
|12. 02. 2015/
|Moazen et al.: [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3544109/ Optimization of Taq DNA polymerase enzyme expression in ''Escherichia coli'']. Adv. Biomed. Res. (2012)...
|(samo predavanja)...
|Sandra Ropret
|
|-
|-
|28. 02. 2013/
|17. 02. 2015/
|Jaehme & Michel: [http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/febs.12105/pdf Evaluation of cell-free protein synthesis for the crystallization of membrane proteins – a case study on a member of the glutamate transporter family from ''Staphylothermus marinus'']. FEBS J. (2013)...
|Vink et al.: [http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1046202313002673# A simple, robust and highly efficient transient expression system for producing antibodies]. Methods (2014)...
|Matic Kisovec
| xxxxx xxxxxx
|-
|-
|28.02. 2013/
|19.02. 2015/
|  
|Beiroti et al.: [http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1046592814001508 Effect of post-solubilization conditions on the yield and efficiency of recombinant streptokinase purification at large-scale]. Protein Expression and Purification (2014)...
|
| yyyyy yyyyyy
|-
|05. 03. 2013/
|Han et al.: [http://www.pnas.org/content/109/31/12467.full.pdf Monitoring cotranslational protein folding in mammalian cells at codon resolution]. PNAS (2012)...
|Neža Juvan
|-
|05. 03. 2013/
|Huang et al.: [http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0042207 Expression, Purification, and Mass Spectrometric Analysis of 15N, 13C-Labeled RGD-Hirudin, Expressed in ''Pichia pastoris'', for NMR Studies]. PLOS One (2012)...
|Mirijam Kozorog
|-
|-
|19.02. 2015/
|Naknadno bom izbral še en članek, ki ga bomo obdelali skupaj, ne bo pa imel celovite predstavitve enega od vas
|/
|/
|--
|--
|}
|}


Prijave bom sprejemal po e-pošti do zasedbe vseh seminarskih tem.
Prijave bom sprejemal po e-pošti do zasedbe seminarskih tem.


== Navodila za pripravo ==
== Navodila za pripravo ==

Revision as of 07:56, 14 January 2015

Splošno

V študijskem letu 2014/15 bodo pri prof. Dolinarju v okviru 2. modula (Struktura in funkcija bioloških molekul) pri predmetu Izbrani procesi iz biokemije in molekularne biologije na sporedu tri teme: Ekspresijski sistemi (12. februarja 2015), Renaturacija rekombinantnih proteinov (17. februarja) in Izolacija in karakterizacija rekombinantnih proteinov (19. februarja). Predavanja in seminarji se bodo začeli vsakič ob 14:15 in bodo potekala na Kemijskem inštitutu na Hajdrihovi 19 v Fegeševi sobi. Uvodnemu predavanju bodo sledili seminarji. Glede na število vpisanih študentov v 2. modul bomo letos izvedli dva seminarja. Članka, ki sta osnova za pripravo, sta navedena spodaj.

Seznam seminarjev

datum članek za seminar referent
12. 02. 2015/ (samo predavanja)...
17. 02. 2015/ Vink et al.: A simple, robust and highly efficient transient expression system for producing antibodies. Methods (2014)... xxxxx xxxxxx
19.02. 2015/ Beiroti et al.: Effect of post-solubilization conditions on the yield and efficiency of recombinant streptokinase purification at large-scale. Protein Expression and Purification (2014)... yyyyy yyyyyy
19.02. 2015/ Naknadno bom izbral še en članek, ki ga bomo obdelali skupaj, ne bo pa imel celovite predstavitve enega od vas /

Prijave bom sprejemal po e-pošti do zasedbe seminarskih tem.

Navodila za pripravo

Seminarji predstavljajo pomemben del modula in jih bomo tako tudi ocenjevali. Samo 50 % ocene modula bodo predstavljali odgovori na izpitna vprašanja, 50 % ocene pa je ocena seminarja. Ta polovica ocene se oblikuje iz 60 % za predstavitev in povzetek ter 40 % za sodelovanje pri razpravah o seminarjih.

Vsak doktorski študent, ki je vpisal 2. modul, mora:
- prebrati vsakega od člankov, ki jih bomo obravnavali na seminarjih, do datuma predstavitve
- pripraviti vprašanja za razpravo
- sodelovati v razpravi

Vsak od referentov mora pripraviti naslednje:
- povzetek seminarja s 1200-1600 besedami - lahko vključuje tudi slike, ni pa nujno (sklicujete se lahko na številke slik v originalnem članku); povzetek oddate na dan predstavitve v elektronski obliki in ga pošljite tudi vsem vpisanim študentom kot pomoč pri pripravi na izpit
- predstavitev v programu PowerPoint v obsegu in na način, ki bo omogočil natančen vpogled v snov, predstavljeno v članku in bo služil kot osnova za razpravo

Predstavitve naj bi bile dolge okrog 30 minut. V tem času boste morali razložiti:
- ozadje/problem, ki ga članek obravnava, pri čemer poskušajte izluščiti ne samo namen dela, pač pa tudi delovno hipotezo
- predhodno opravljeno delo (ali stanje stvari na tem področju)
- konkreten delovni načrt za izvedbo raziskave
- rezultate in metode (metodo smiselno vključite v rezultate)
- kritično mnenje o članku (kaj je bilo dobro zastavljeno, izvedeno, predstavljeno, razloženo... in kaj ne)
- uvod v razpravo

Razprava o vsakem članku naj bi trajala vsaj 30 minut in mora biti poglobljena in argumentirana. Zato je res nujno, da članke berete sproti in temeljito!