IGEM:Chiba/2009/Brainstorming: Difference between revisions
From OpenWetWare
Jump to navigationJump to search
Line 54: | Line 54: | ||
#AHLは大腸菌の外膜/内膜をどれくらいの速度?平衡?で通過するのか | #AHLは大腸菌の外膜/内膜をどれくらいの速度?平衡?で通過するのか | ||
#細胞の増殖はどのように影響するか | #細胞の増殖はどのように影響するか | ||
*まあどちにしろAHLが系に"徐々に"蓄積してゆくことを確認すれば,2と3と4は別にそな重大じゃないですね。 | |||
<br /> | |||
===調べること=== | |||
#luxR mutants候補 | |||
#*Collins CHの論文が2報くらいあった気がする | |||
#*TraRの構造の論文が参考になるかも | |||
#うちにあるluxR mutants([[IGEM:Chiba/2008/Projects|ソース]]) | |||
##I45F: wtの10倍sensitve(何がだろ?) | |||
##L42A: wtの1/15 | |||
##L42S: wtの1/1000 | |||
#AHLが"徐々に"蓄積してゆくことを調べる | |||
#*もしシグナル菌がAHLを徐々にではなく一気に飽和するくらい合成しまくってたら,それはただluxR側の発現速度を見るだけになってるので。調べる必要アリ。 | |||
#*シグナル生産菌を培養,一定時間ごとに集菌して上澄み液を回収。この培養上澄み液(<蓄積したAHL入り)でluxプロモータ下においた蛍光タンパクをインダクションしてみてその蛍光をみる。これである程度線形に増えてたらok!とか? | |||
#*いやluxプロモータは割とシグモイドカーブぽい挙動を示すのでそれは無理でした。 | |||
#*AHLを精製して分析するとかしかないのかなあ。 | |||
<br /> | <br /> |
Revision as of 08:13, 29 March 2009
Brainstormingいままでにやられてるものリストアップ。 synthetic biology で世界を救うエネルギー
メディカル
環境
食糧
あそび
去年の続きとか「大腸菌タイマー」
しくみ
こいつらを混ぜてインダクションかけて蛍光を見る。 考えるべきこと
調べること
synbioなツールをつくる
pickup
|