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| =Brainstorming=
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| ==synthetic biology で世界を救う==
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| いままでにやられてるものリストアップ。
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| ===エネルギー===
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| *ブタノール生産菌
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| **Albertaだっけ?08
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| *Amyris Biotechnology
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| ===メディカル===
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| *癌細胞をやっつける
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| **Anderson JC et.al. (2006) [http://voigtlab.ucsf.edu/papers/2006_anderson_jmb_invasion.pdf Environmentally Controlled Invasion of Cancer Cells by Engineered Bacteria]
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| *bactoblood（赤血球大腸菌）
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| **UC berkeley 07
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| *プロビオ大腸菌
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| **caltech 08
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| *アーテミシニン（抗マラリア薬）
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| **Amyris Biotechnology
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| ===環境===
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| ===食糧===
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| *[http://www.goldenrice.org/ golden rice]
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| **コメに遺伝子を２個（phytoene synthaseとphytoene desaturase）いれてβカロテンをつくるgolden riceをつくったのだった。
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| **βカロテンはビタミンAの前駆体となる物質。人間はβカロテンは合成できないけどβカロテンからビタミンAを作る酵素は持ってる。βカロテンを摂取することでビタミンA欠乏症を回避できる
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| **※βカロテンを合成するには酵素がもうひとつ(lycopene cyclase）が必要だけど実はコメはこの遺伝子持ってる：コメのvegetative tissuesでは以上の全ての遺伝子を発現しててβカロテンまで合成してるのだけどgrainではlycopene cyclaseしか発現してないらしい。のでここで上記の２個の遺伝子を導入するとgrain中のlycopene cyclaseの基質ができてβカロテンをつくるらしい
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| <br />
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| ===あそび===
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| *bugbrick
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| *ラジコン菌（遠隔操作で走性を制御）
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| **磁性細菌だとそもそも出来るな（でも走性じゃないか）
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| *化学科っぽくできるといい（でも指導できなそう）
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| *ミニセル
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| ==Chiba2009はなにをやる？==
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| ===なにやりたい？===
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| ====野澤====
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| ====やまもと欄====
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| ====いやま欄====
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| *スイッチ
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| *既存のパーツを使って、去年作ったものの頭部位になるスイッチを作りたい。
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| **どんなセンサー系パーツがあるのか？
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| **去年UVがダメだった理由を詳しく調査する必要があるのでは？
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| **今まで作られてきたスイッチとは？
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| *大腸菌で人をあつめたい
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| ==去年の続きとか==
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| ===「大腸菌タイマー」===
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| *遺伝子発現のシーケンス／順序制御。
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| *"入力"の後，規定の順番（＆時間？）でonになるスイッチ群。
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| *例：１回インダクションを書けると，もう外部刺激がなくともぜったい赤＞青＞緑 の順で蛍光タンパク質が発現。とか...?
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| ===しくみ===
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| *シグナル生産菌：入力を受けてAHLを合成（AHLは培地中を拡散／蓄積）
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| *earlyスイッチ：薄めのAHL濃度で蛍光タンパク質１発現
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| *midスイッチ：中のAHL濃度で蛍光タンパク質２発現
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| *lateスイッチ：濃いAHL濃度で蛍光タンパク質３発現
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| こいつらを混ぜてインダクションかけて蛍光を見る。
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| ===考えるべきこと===
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| #スイッチの濃度感受性の違いをどのように造り出すか
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| #*スイッチ：luxプロモータ。
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| #*方法１）luxR変異体を使用。感度の高いもの／低いものなど
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| #*方法２）luxR-type proteinsのクロストークを利用
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| #*方法３）違う種類のAHLを合成さしてクロストークを利用
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| #*'''方法１のluxR変異体が一番ゴールに近そう'''
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| #培地中にAHLは蓄積するのか／分解しないのか
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| #AHLは大腸菌の外膜／内膜をどれくらいの速度？平衡？で通過するのか
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| #細胞の増殖はどのように影響するか
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| *まあどちにしろAHLが系に"徐々に"蓄積してゆくことを確認すれば，2と4は別にそな重大じゃないですね。3はちょと気になる
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| ===調べること=== | | ===調べること=== |
| #luxR mutants候補 | | #luxR mutants候補 |
