Labpib:Danillo C. Almeida-e-Silva

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Danillo Cunha de Almeida e Silva (Almeida-e-Silva, D. C.) Introduction | Introdução PhD student in the Bioinformatics Program at the University of São Paulo (USP), MSc student in the Bioinformatics Program at the University of São Paulo (USP) and majored in Biological Sciences by Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP. I have experience in Computer Science, which I have studied for two years and experience in the field of genetics, with emphasis on bioinformatics. I worked with "in silico" search for genes that express miRNAs. Moreover, I carried out research focusing on molecular biology of plants and organisms. I worked in bioinformatics related to sugarcane (Saccharum officinarum) and bioenergy at LabPIB. Currently, my research in bioinformatics is related to Halobacterium salinarum's transcriptome. Doutorando pelo programa de Bioinformática Interunidades pela Universidade de São Paulo (USP), Mestre pelo mesmo programa e graduado em Ciências Biológicas pela Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, tem experiência na área de Ciência da Computação, onde atuou durante dois anos e tem experiência na área de Genética, com ênfase em Bioinformática. Trabalhou com busca "in silico" de genes que expressam miRNAs e pesquisas com ênfase em Biologia Molecular de plantas e organismos. Desenvolveu pesquisas em bioinformática relacionadas à cana-de-açúcar (Saccharum officinarum) e bioenergia no Laboratório de Processamento de Informação Biológica (LabPIB). Atualmente desenvolve pesquisas em bioinformática relacionadas ao transcritoma de Halobacterium salinarum. Detailed master's project description | Descrição detalhada do projeto de mestrado: MicrosoftResearch-FAPESP Este projeto já foi destaque em | This project has been highlighted in: Revista INFO | INFO Magazine - Jan/2010 (portuguese only): Revista INFO Revista Pesquisa FAPESP (Especial de 50 anos) | "Pesquisa FAPESP" Periodical (50th Anniversary Edition) - May/2012 (portuguese only): Pesquisa FAPESP Education | Formação 2013-201__, PhD in Bioinformatics - USP - Ribeirão Preto (inter-institutional)| 2010-201_, Doutorado em Bioinformática - USP - Ribeirão Preto (programa interunidades) 2010-2013, Master in Bioinformatics - USP - Ribeirão Preto (inter-institutional)| 2010-2013, Mestrado em Bioinformática - USP - Ribeirão Preto (programa interunidades) 2005-2009, Major in Biology - USP/FFCLRP - Ribeirão Preto | 2005-2009, Licenciatura em Ciências Biológicas - Universidade de São Paulo/FFCLRP - Ribeirão Preto Curriculum lattes: CNPq-Lattes Publications | Publicações SIFTER-T: A scalable and optimized framework for the SIFTER phylogenomic method of probabilistic protein domain annotation. Almeida-e-Silva, DC & Vêncio, RZN (2015) Biotechniques, 58:140-142. doi: 10.2144/000114266 - full article Sifter-T: A scalable framework for phylogenomic probabilistic protein domain functional annotation In: 1st ISCB Latin American Student Council Symposium 2014. Almeida-e-Silva, DC & Vêncio, RZN (2015) Highlights from the 1st ISCB Latin American Student Council Symposium 2014. BMC Bioinformatics, 2015. v.16. p.A4. doi 10.1186/1471-2105-16-S8-A4 - full article Research interests | Assuntos para Pesquisa Modelos preditivos | Predictive models Biologia Sistêmica | System Biology Anotação Funcional | Functional Annotation Contact Information | Informações para Contato Danillo C. Almeida-e-Silva MSc. Danillo Cunha de Almeida e Silva E-mail: danillosilva@usp.br Laboratory for Biological Information Processing (LabPIB) | Laboratório de Processamento de Informação Biológica (LabPIB) University of Sao Paulo | Universidade de São Paulo Faculty of Philosophy, Sciences, Languages and Literature of Ribeirão Preto | Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto Department of Computing and Mathematics | Departamento de Computação e Matemática Phone | Tel.: (+55) (16) 3315-0439 Av. Bandeirantes, 3900 Monte Alegre ZIP | CEP 14049-901 Ribeirao Preto, SP Brazil | Brasil