Labpib:Research

From OpenWetWare

(Difference between revisions)
Jump to: navigation, search
(1st draft. Still working.)
(whole new version of this page.)
Line 5: Line 5:
|style="background: white"|
|style="background: white"|
===Research | Pesquisa===
===Research | Pesquisa===
 +
Em termos bem gerais, a área de pesquisa em que o LabPIB trabalha é a [http://pt.wikipedia.org/wiki/Bioinform%C3%A1tica Bioinformática].
-
Em termos bem gerais, as áreas de pesquisa em que o LabPIB trabalha são: Bioinformática e Biologia Sistêmica (computacional).
+
A definição de trabalho que o LabPIB usa para entender o que é Bioinformática está em linha com a interpretação mais inclusiva do termo: '''Bioinformática é o estudo da aplicação de técnicas computacionais e matemáticas à geração e gerenciamento de informação pela/para Biologia e/ou Medicina'''. De acordo com esta visão, Bioinformática é uma especialização da [http://pt.wikipedia.org/wiki/Inform%C3%A1tica Informática].
-
A definição de trabalho que o LabPIB usa para definir o que é Bioinformática está em linha com a interpretação mais inclusiva do termo: Bioinformática é o estudo da aplicação de técnicas computacionais e matemáticas à geração e gerenciamento de (bio)informação. Por esta visão, Bioinformática é uma especialização da [http://pt.wikipedia.org/wiki/Inform%C3%A1tica Informática], na medida em que aplica-se à informação originada pela/para [[Biologia]].
+
 
 +
Evidentemente, apesar de entender a Bioinformática dessa forma ampla, o LabPIB desenvolve pesquisas em sub(sub-sub-...)-áreas específicas, relacionadas à Biologia Molecular e Biologia Sistêmica.
 +
 
 +
 
 +
O LabPIB está trabalhando recentemente (Dez/2008) numa linha central, mas também sustenta, principalmente por meio de colaborações, outras linhas satélite.
 +
 
 +
As linhas satélite, incluem a análise computacional e matemática de: microarranjos, seqüenciamento quantitativo, métodos estatísticos em transcriptômica, redes de regulação gênica, etc.
 +
 
 +
A linha central, na qual o LabPIB pretende concentrar seus esforços de pesquisa surgiu em decorrência do Projeto:
 +
 
 +
'''Anotação Genômica Probabilística: Inteligência Artificial aplicada a genomas de interesse estratégico nacional'''
 +
Descrição: Chamada: Edital MCT/CNPq 14/2008 - Universal Processo: 470616/2008-3 Aporte: R$ 15.400,00
 +
Resumo: Atualmente, a abordagem filogenômica se apresenta como o paradigma disponível mais adequado para estabelecer anotações de alta qualidade. O presente projeto tem por objetivo o desenvolvimento de um ambiente computacional de Inteligência Artificial, destinado a automatizar a anotação de genomas completos de organismos que apresentam interesse estratégico nacional. O alvo é a construção de um sistema de software que viabilize aos biologistas a tarefa de anotação automatizada, integrando fontes de evidências quantitativas e qualitativas de forma probabilística. A anotação probabilística tem como produto final a estimativa da probabilidade de um dado gene pertencer a uma certa classe funcional, um processo ou um componente celular, ao invés de atribuições fixas simplistas sem estimativa de incerteza e sem considerar os diferentes graus/qualidade de evidência.
 +
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
 +
Integrantes: Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio - Coordenador.
 +
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

Revision as of 16:09, 22 December 2008


Image:Usp_logo_header_LabPIB.jpg

Home|Apresentação    Research|Pesquisa    Teaching|Ensino    Outreach|Extensão    Members|Membros   

Publications|Publicações    Contact|Contato    Join the Team|Junte-se ao Grupo    Lab Policy|Regras do Lab   

Research | Pesquisa

Em termos bem gerais, a área de pesquisa em que o LabPIB trabalha é a Bioinformática.

A definição de trabalho que o LabPIB usa para entender o que é Bioinformática está em linha com a interpretação mais inclusiva do termo: Bioinformática é o estudo da aplicação de técnicas computacionais e matemáticas à geração e gerenciamento de informação pela/para Biologia e/ou Medicina. De acordo com esta visão, Bioinformática é uma especialização da Informática.


Evidentemente, apesar de entender a Bioinformática dessa forma ampla, o LabPIB desenvolve pesquisas em sub(sub-sub-...)-áreas específicas, relacionadas à Biologia Molecular e Biologia Sistêmica.


O LabPIB está trabalhando recentemente (Dez/2008) numa linha central, mas também sustenta, principalmente por meio de colaborações, outras linhas satélite.

As linhas satélite, incluem a análise computacional e matemática de: microarranjos, seqüenciamento quantitativo, métodos estatísticos em transcriptômica, redes de regulação gênica, etc.

A linha central, na qual o LabPIB pretende concentrar seus esforços de pesquisa surgiu em decorrência do Projeto:

Anotação Genômica Probabilística: Inteligência Artificial aplicada a genomas de interesse estratégico nacional Descrição: Chamada: Edital MCT/CNPq 14/2008 - Universal Processo: 470616/2008-3 Aporte: R$ 15.400,00 Resumo: Atualmente, a abordagem filogenômica se apresenta como o paradigma disponível mais adequado para estabelecer anotações de alta qualidade. O presente projeto tem por objetivo o desenvolvimento de um ambiente computacional de Inteligência Artificial, destinado a automatizar a anotação de genomas completos de organismos que apresentam interesse estratégico nacional. O alvo é a construção de um sistema de software que viabilize aos biologistas a tarefa de anotação automatizada, integrando fontes de evidências quantitativas e qualitativas de forma probabilística. A anotação probabilística tem como produto final a estimativa da probabilidade de um dado gene pertencer a uma certa classe funcional, um processo ou um componente celular, ao invés de atribuições fixas simplistas sem estimativa de incerteza e sem considerar os diferentes graus/qualidade de evidência. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

Personal tools