Labpib:Research

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===Research | Pesquisa===
===Research | Pesquisa===
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Em termos bem gerais, a área de pesquisa em que o LabPIB trabalha é a [http://pt.wikipedia.org/wiki/Bioinform%C3%A1tica Bioinformática].
 
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In general terms, the research field in which we at LabPIB work is known as [http://en.wikipedia.org/wiki/Bioinformatics Bioinformatics].
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In general terms, the research field in which we at LabPIB work is known as [http://en.wikipedia.org/wiki/Bioinformatics Bioinformatics]. Given the broad implications of Bioinformatics to modern Biotechnology, we consider this field of major importance but also incredibly challenging. A working definition that LabPIB uses to understand what is Bioinformatics is the one in line with the inclusive interpretation for this term: '''Bioinformatics is the application of computational and mathematical techniques to generate and manage information from/for Biology and/or Medicine'''. According to this understanding, Bioinformatics is an [http://en.wikipedia.org/wiki/Informatics Informatics] specialization. Of course, although we understand Bioinformatics in this wide sense, LabPIB develops research in specific sub(sub-sub-...)-fields related to [http://en.wikipedia.org/wiki/Molecular_biology Molecular Biology] and [http://en.wikipedia.org/wiki/Systems_biology Systems Biology].
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Em termos bem gerais, a área de pesquisa em que o LabPIB trabalha é a [http://pt.wikipedia.org/wiki/Bioinform%C3%A1tica Bioinformática]. Dadas as vastas implicações da Bioinformática para a Biotecnologia moderna, nós consideramos esta área de primordial importância mas também um incrível desafio. A definição de trabalho que o LabPIB usa para entender o que é Bioinformática está em linha com a interpretação mais inclusiva do termo:  
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A definição de trabalho que o LabPIB usa para entender o que é Bioinformática está em linha com a interpretação mais inclusiva do termo:  
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'''Bioinformática é o estudo da aplicação de técnicas computacionais e matemáticas à geração e gerenciamento de informação pela/para Biologia e/ou Medicina'''. De acordo com esta visão, Bioinformática é uma especialização da [http://pt.wikipedia.org/wiki/Inform%C3%A1tica Informática]. Evidentemente, apesar de entender a Bioinformática dessa forma ampla, o LabPIB desenvolve pesquisas em sub(sub-sub-...)-áreas específicas, relacionadas à [http://pt.wikipedia.org/wiki/Biologia_molecular Biologia Molecular] e [http://pt.wikipedia.org/wiki/Biologia_Sist%C3%AAmica Biologia Sistêmica].
'''Bioinformática é o estudo da aplicação de técnicas computacionais e matemáticas à geração e gerenciamento de informação pela/para Biologia e/ou Medicina'''. De acordo com esta visão, Bioinformática é uma especialização da [http://pt.wikipedia.org/wiki/Inform%C3%A1tica Informática]. Evidentemente, apesar de entender a Bioinformática dessa forma ampla, o LabPIB desenvolve pesquisas em sub(sub-sub-...)-áreas específicas, relacionadas à [http://pt.wikipedia.org/wiki/Biologia_molecular Biologia Molecular] e [http://pt.wikipedia.org/wiki/Biologia_Sist%C3%AAmica Biologia Sistêmica].
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A working definition that LabPIB uses to understand what is Bioinformatics is the one in line with the inclusive interpretation for this term: '''Bioinformatics is the application of computational and mathematical techniques to generate and manage information from/for Biology and/or Medicine'''. According to this understanding, Bioinformatics is an [http://en.wikipedia.org/wiki/Informatics Informatics] specialization. Of course, although we understand Bioinformatics in this wide sense, LabPIB develops research in specific sub(sub-sub-...)-fields related to [http://en.wikipedia.org/wiki/Molecular_biology Molecular Biology] and [http://en.wikipedia.org/wiki/Systems_biology Systems Biology].
 
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O LabPIB está trabalhando recentemente (dez/2008) numa linha central, mas também sustenta, principalmente por meio de colaborações, outras linhas satélite. As linhas satélite incluem a análise computacional e matemática de: microarranjos, seqüenciamento quantitativo, métodos estatísticos em transcriptômica, redes de regulação gênica, etc.
 
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Recently (Dec/2008), LabPIB is working on a main research line, but also maintains, mainly by means of collaborations, other satellite research lines. The satellite research lines include the computational and mathematical analysis of: microarrays, quantitative sequencing, statistical methods in transcriptomics, gene regulatory networks, etc.
 
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A linha central, na qual o LabPIB pretende concentrar seus esforços de pesquisa surgiu em decorrência do Projeto:
 
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The main research line, on which LabPIB intent to concentrate its research efforts, was established due to the Project:
 
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'''Anotação Genômica Probabilística: Inteligência Artificial aplicada a genomas de interesse estratégico nacional'''
 
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Descrição: Chamada: Edital MCT/CNPq 14/2008 - Universal Processo: 470616/2008-3 Aporte: R$ 15.400,00
 
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Resumo: Atualmente, a abordagem filogenômica se apresenta como o paradigma disponível mais adequado para estabelecer anotações de alta qualidade. O presente projeto tem por objetivo o desenvolvimento de um ambiente computacional de Inteligência Artificial, destinado a automatizar a anotação de genomas completos de organismos que apresentam interesse estratégico nacional. O alvo é a construção de um sistema de software que viabilize aos biologistas a tarefa de anotação automatizada, integrando fontes de evidências quantitativas e qualitativas de forma probabilística. A anotação probabilística tem como produto final a estimativa da probabilidade de um dado gene pertencer a uma certa classe funcional, um processo ou um componente celular, ao invés de atribuições fixas simplistas sem estimativa de incerteza e sem considerar os diferentes graus/qualidade de evidência.
 
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Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
 
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'''Automatic Probabilistic Annotation: Artificial Intelligence applied to genomes of strategic national interest'''
 

Revision as of 16:48, 20 June 2009

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Research | Pesquisa

In general terms, the research field in which we at LabPIB work is known as Bioinformatics. Given the broad implications of Bioinformatics to modern Biotechnology, we consider this field of major importance but also incredibly challenging. A working definition that LabPIB uses to understand what is Bioinformatics is the one in line with the inclusive interpretation for this term: Bioinformatics is the application of computational and mathematical techniques to generate and manage information from/for Biology and/or Medicine. According to this understanding, Bioinformatics is an Informatics specialization. Of course, although we understand Bioinformatics in this wide sense, LabPIB develops research in specific sub(sub-sub-...)-fields related to Molecular Biology and Systems Biology.


Em termos bem gerais, a área de pesquisa em que o LabPIB trabalha é a Bioinformática. Dadas as vastas implicações da Bioinformática para a Biotecnologia moderna, nós consideramos esta área de primordial importância mas também um incrível desafio. A definição de trabalho que o LabPIB usa para entender o que é Bioinformática está em linha com a interpretação mais inclusiva do termo: Bioinformática é o estudo da aplicação de técnicas computacionais e matemáticas à geração e gerenciamento de informação pela/para Biologia e/ou Medicina. De acordo com esta visão, Bioinformática é uma especialização da Informática. Evidentemente, apesar de entender a Bioinformática dessa forma ampla, o LabPIB desenvolve pesquisas em sub(sub-sub-...)-áreas específicas, relacionadas à Biologia Molecular e Biologia Sistêmica.

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