Labpib:Research

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Research | Pesquisa Em termos bem gerais, a área de pesquisa em que o LabPIB trabalha é a Bioinformática. In general terms, the research field in which we at LabPIB work is known as Bioinformatics. A definição de trabalho que o LabPIB usa para entender o que é Bioinformática está em linha com a interpretação mais inclusiva do termo: Bioinformática é o estudo da aplicação de técnicas computacionais e matemáticas à geração e gerenciamento de informação pela/para Biologia e/ou Medicina. De acordo com esta visão, Bioinformática é uma especialização da Informática. Evidentemente, apesar de entender a Bioinformática dessa forma ampla, o LabPIB desenvolve pesquisas em sub(sub-sub-...)-áreas específicas, relacionadas à Biologia Molecular e Biologia Sistêmica. A working definition that LabPIB uses to understand what is Bioinformatics is the one in line with the inclusive interpretation for this term: Bioinformatics is the application of computational and mathematical techniques to generate and manage information from/for Biology and/or Medicine. According to this understanding, Bioinformatics is an Informatics specialization. Of course, although we understand Bioinformatics in this wide sense, LabPIB develops research in specific sub(sub-sub-...)-fields related to Molecular Biology and Systems Biology. O LabPIB está trabalhando recentemente (dez/2008) numa linha central, mas também sustenta, principalmente por meio de colaborações, outras linhas satélite. As linhas satélite incluem a análise computacional e matemática de: microarranjos, seqüenciamento quantitativo, métodos estatísticos em transcriptômica, redes de regulação gênica, etc. Recently (Dec/2008), LabPIB is working on a main research line, but also maintains, mainly by means of collaborations, other satellite research lines. The satellite research lines include the computational and mathematical analysis of: microarrays, quantitative sequencing, statistical methods in transcriptomics, gene regulatory networks, etc. A linha central, na qual o LabPIB pretende concentrar seus esforços de pesquisa surgiu em decorrência do Projeto: The main research line, on which LabPIB intent to concentrate its research efforts, was established due to the Project: Anotação Genômica Probabilística: Inteligência Artificial aplicada a genomas de interesse estratégico nacional Descrição: Chamada: Edital MCT/CNPq 14/2008 - Universal Processo: 470616/2008-3 Aporte: R$ 15.400,00 Resumo: Atualmente, a abordagem filogenômica se apresenta como o paradigma disponível mais adequado para estabelecer anotações de alta qualidade. O presente projeto tem por objetivo o desenvolvimento de um ambiente computacional de Inteligência Artificial, destinado a automatizar a anotação de genomas completos de organismos que apresentam interesse estratégico nacional. O alvo é a construção de um sistema de software que viabilize aos biologistas a tarefa de anotação automatizada, integrando fontes de evidências quantitativas e qualitativas de forma probabilística. A anotação probabilística tem como produto final a estimativa da probabilidade de um dado gene pertencer a uma certa classe funcional, um processo ou um componente celular, ao invés de atribuições fixas simplistas sem estimativa de incerteza e sem considerar os diferentes graus/qualidade de evidência. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Automatic Probabilistic Annotation: Artificial Intelligence applied to genomes of strategic national interest