Labpib:Research: Difference between revisions

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===Research | Pesquisa===
===Research | Pesquisa===


In general terms, the research field in which we at LabPIB work is known as [http://en.wikipedia.org/wiki/Bioinformatics Bioinformatics]. Given the broad implications of Bioinformatics to modern Biotechnology, we consider this field of major importance but also incredibly challenging. A working definition that LabPIB uses to understand what is Bioinformatics is the one in line with the inclusive interpretation for this term: '''Bioinformatics is the application of computational and mathematical techniques to generate and manage information from/for Biology and/or Medicine'''. According to this understanding, Bioinformatics is an [http://en.wikipedia.org/wiki/Informatics Informatics] specialization. Of course, although we understand Bioinformatics in this wide sense, LabPIB develops research in specific sub(sub-sub-...)-fields related to [http://en.wikipedia.org/wiki/Molecular_biology Molecular Biology] and [http://en.wikipedia.org/wiki/Systems_biology Systems Biology].
In general terms, the research field in which we at LabPIB work is known as [http://en.wikipedia.org/wiki/Bioinformatics Bioinformatics]. Given the broad implications of Bioinformatics to modern Biotechnology, we consider this field of major importance but also incredibly challenging. A working definition that LabPIB uses to understand what is Bioinformatics is the one in line with the inclusive interpretation for this term: '''Bioinformatics is the application of computational and mathematical techniques to generate and manage information from/for Biology and/or Medicine'''. According to this understanding, Bioinformatics is an [http://en.wikipedia.org/wiki/Informatics Informatics] specialization. Of course, although we understand Bioinformatics in this broad sense, LabPIB develops research in specific sub(sub-sub-...)-fields related to [http://en.wikipedia.org/wiki/Molecular_biology Molecular Biology] and [http://en.wikipedia.org/wiki/Systems_biology Systems Biology].




Em termos bem gerais, a área de pesquisa em que o LabPIB trabalha é a [http://pt.wikipedia.org/wiki/Bioinform%C3%A1tica Bioinformática]. Dadas as vastas implicações da Bioinformática para a Biotecnologia moderna, nós consideramos esta área de primordial importância mas também um incrível desafio. A definição de trabalho que o LabPIB usa para entender o que é Bioinformática está em linha com a interpretação mais inclusiva do termo:  
Em termos bem gerais, a área de pesquisa em que o LabPIB trabalha é a [http://pt.wikipedia.org/wiki/Bioinform%C3%A1tica Bioinformática]. Dadas as vastas implicações da Bioinformática para a Biotecnologia moderna, nós consideramos esta área de primordial importância mas também um incrível desafio. A definição de trabalho que o LabPIB usa para entender o que é Bioinformática está em linha com a interpretação mais inclusiva do termo:  
'''Bioinformática é o estudo da aplicação de técnicas computacionais e matemáticas à geração e gerenciamento de informação pela/para Biologia e/ou Medicina'''. De acordo com esta visão, Bioinformática é uma especialização da [http://pt.wikipedia.org/wiki/Inform%C3%A1tica Informática]. Evidentemente, apesar de entender a Bioinformática dessa forma ampla, o LabPIB desenvolve pesquisas em sub(sub-sub-...)-áreas específicas, relacionadas à [http://pt.wikipedia.org/wiki/Biologia_molecular Biologia Molecular] e [http://pt.wikipedia.org/wiki/Biologia_Sist%C3%AAmica Biologia Sistêmica].
'''Bioinformática é o estudo da aplicação de técnicas computacionais e matemáticas à geração e gerenciamento de informação pela/para Biologia e/ou Medicina'''. De acordo com esta visão, Bioinformática é uma especialização da [http://pt.wikipedia.org/wiki/Inform%C3%A1tica Informática]. Evidentemente, apesar de entender a Bioinformática dessa forma ampla, o LabPIB desenvolve pesquisas em sub(sub-sub-...)-áreas específicas, relacionadas à [http://pt.wikipedia.org/wiki/Biologia_molecular Biologia Molecular] e [http://pt.wikipedia.org/wiki/Biologia_Sist%C3%AAmica Biologia Sistêmica].
===Projects | Projetos===
The laboratory is involved in some specific projects, but their soul is, in fact, the '''people''' behind them:
* Probabilistic functional annotation in genomics (Daniel Bojczuk & Fabio Filocomo)
* Predictive models in systems microbiology (J.C. Garcia)
* Chagas Disease agent ''T. cruzi'' transcriptomics (Andre Vinci)
* Ontologies for the 'gene expression' knowledge domain (Flavia Miyazaki)
* Sugarcane metabolomics (Leonardo Rippel)
* Dermatophyte ''T. rubrum'' transcriptomics (Gabriela Persinoti)
O laboratório está envolvido em alguns projetos específicos, mas, na verdade, sua essência são as '''pessoas''' por trás deles:
* Anotação funcional probabilística em genômica (Daniel Bojczuk & Fabio Filocomo)
* Modelos preditivos em microbiologia sistêmica (J.C. Garcia)
* Transcritômica do agente da Doença de Chagas ''T. cruzi'' (Andre Vinci)
* Ontologias para o domínio de conhecimento 'expressão gênica' (Flavia Miyazaki)
* Metabolômica da cana-de-açúcar (Leonardo Rippel)
* Transcritômica do dermatófito ''T. rubrum'' (Gabriela Persinoti)
===Future Projects | Projetos Futuros===
Nowadays (Jun/2009) we are recruting students interested in next-gen sequencing technologies for transcriptome analysis. Please see "Join the Team" link.
Atualmente (Jun/2009) estamos recrutanto estudantes interessados em estudar tecnologias modernas de sequenciamento para a análise de transcritomas. Por favor veja o link "Junte-se ao Grupo".
===Past Projects | Projetos Passados===
None yet... work in progress ;-)
Nenhum ainda... em preparação ;-)

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Research | Pesquisa

In general terms, the research field in which we at LabPIB work is known as Bioinformatics. Given the broad implications of Bioinformatics to modern Biotechnology, we consider this field of major importance but also incredibly challenging. A working definition that LabPIB uses to understand what is Bioinformatics is the one in line with the inclusive interpretation for this term: Bioinformatics is the application of computational and mathematical techniques to generate and manage information from/for Biology and/or Medicine. According to this understanding, Bioinformatics is an Informatics specialization. Of course, although we understand Bioinformatics in this broad sense, LabPIB develops research in specific sub(sub-sub-...)-fields related to Molecular Biology and Systems Biology.


Em termos bem gerais, a área de pesquisa em que o LabPIB trabalha é a Bioinformática. Dadas as vastas implicações da Bioinformática para a Biotecnologia moderna, nós consideramos esta área de primordial importância mas também um incrível desafio. A definição de trabalho que o LabPIB usa para entender o que é Bioinformática está em linha com a interpretação mais inclusiva do termo: Bioinformática é o estudo da aplicação de técnicas computacionais e matemáticas à geração e gerenciamento de informação pela/para Biologia e/ou Medicina. De acordo com esta visão, Bioinformática é uma especialização da Informática. Evidentemente, apesar de entender a Bioinformática dessa forma ampla, o LabPIB desenvolve pesquisas em sub(sub-sub-...)-áreas específicas, relacionadas à Biologia Molecular e Biologia Sistêmica.


Projects | Projetos

The laboratory is involved in some specific projects, but their soul is, in fact, the people behind them:

  • Probabilistic functional annotation in genomics (Daniel Bojczuk & Fabio Filocomo)
  • Predictive models in systems microbiology (J.C. Garcia)
  • Chagas Disease agent T. cruzi transcriptomics (Andre Vinci)
  • Ontologies for the 'gene expression' knowledge domain (Flavia Miyazaki)
  • Sugarcane metabolomics (Leonardo Rippel)
  • Dermatophyte T. rubrum transcriptomics (Gabriela Persinoti)


O laboratório está envolvido em alguns projetos específicos, mas, na verdade, sua essência são as pessoas por trás deles:

  • Anotação funcional probabilística em genômica (Daniel Bojczuk & Fabio Filocomo)
  • Modelos preditivos em microbiologia sistêmica (J.C. Garcia)
  • Transcritômica do agente da Doença de Chagas T. cruzi (Andre Vinci)
  • Ontologias para o domínio de conhecimento 'expressão gênica' (Flavia Miyazaki)
  • Metabolômica da cana-de-açúcar (Leonardo Rippel)
  • Transcritômica do dermatófito T. rubrum (Gabriela Persinoti)

Future Projects | Projetos Futuros

Nowadays (Jun/2009) we are recruting students interested in next-gen sequencing technologies for transcriptome analysis. Please see "Join the Team" link.

Atualmente (Jun/2009) estamos recrutanto estudantes interessados em estudar tecnologias modernas de sequenciamento para a análise de transcritomas. Por favor veja o link "Junte-se ao Grupo".


Past Projects | Projetos Passados

None yet... work in progress ;-)

Nenhum ainda... em preparação ;-)