Labpib:Research

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Research | Pesquisa

In general terms, the research field in which we at LabPIB work is known as Bioinformatics. Given the broad implications of Bioinformatics to modern Biotechnology, we consider this field of major importance but also incredibly challenging. A working definition that LabPIB uses to understand what is Bioinformatics is the one in line with the inclusive interpretation for this term: Bioinformatics is the application of computational and mathematical techniques to generate and manage information from/for Biology. According to this understanding, Bioinformatics is an Informatics specialization. Of course, although we understand Bioinformatics in this broad sense, LabPIB develops research in specific sub(sub-sub-...)-fields related to Molecular Biology and Systems Biology of extremophilic archaea.


Em termos bem gerais, a área de pesquisa em que o LabPIB trabalha é a Bioinformática. Dadas as vastas implicações da Bioinformática para a Biotecnologia moderna, nós consideramos esta área de primordial importância mas também um incrível desafio. A definição de trabalho que o LabPIB usa para entender o que é Bioinformática está em linha com a interpretação mais inclusiva do termo: Bioinformática é o estudo da aplicação de técnicas computacionais e matemáticas à geração e gerenciamento de informação pela/para Biologia e/ou Medicina. De acordo com esta visão, Bioinformática é uma especialização da Informática. Evidentemente, apesar de entender a Bioinformática dessa forma ampla, o LabPIB desenvolve pesquisas em sub(sub-sub-...)-áreas específicas, relacionadas à Biologia Molecular e Biologia Sistêmica (vídeo) de arquéias extremófilas.


Projects | Projetos

The LabPIB is engaged in some specific projects, but their essence is, in fact, the people behind them:

  • Probabilistic functional annotation for bioenergy genomics (Danillo Almeida-e-Silva)
  • Sugarcane metabolomics (Ricardo Silva)
  • Dermatophyte T. rubrum transcriptomics (Gabriela Persinoti)
  • SNPs and CNV analysis for variomics (Diego Martinez)
  • Plasmodium vivax transcriptomics (Bruna R. S. Corrêa)
  • Protein-RNA interaction of Halobacterium salinarum (Marcos Abraão Fonseca)


O LabPIB está desenvolvendo alguns projetos específicos, mas, na verdade, a essência são as pessoas por trás deles:

  • Anotação funcional probabilística em genômica p/ bioenergia (Danillo Almeida-e-Silva)
  • Metabolômica de cana-de-açúcar (Ricardo Silva)
  • Transcritômica do dermatófito T. rubrum (Gabriela Persinoti)
  • Análise de SNPs e CNVs em variômica (Diego Martinez)
  • Transcritômica de Plasmodium vivax (Bruna R. S. Corrêa)
  • Interação proteína-RNA em Halobacterium salinarum (Marcos Abraão Fonseca)


Future Projects | Projetos Futuros

Recently (early 2011), LabPIB reoriented its collective efforts towards a more close collaboration with the [LaBiSisMi http://koide.openwetware.org/] studying microorganisms from a systems biology perspective. These microbes are archea and extremophile unicelular beings with fascinating properties and life-styles. Future projects will be more focused on the study of such creatures.


Recentemente (inicio de 2011), o LabPIB reorientou seus esforços coletivos na direção de uma colaboração mais próxima com o [LaBiSisMi http://koide.openwetware.org/] no estudo de microorganismos por uma perspectiva da Biologia Sistêmica. Esses micróbios são arquéias e extremófilos, seres unicelulares com propriedades e habitats fascinantes. Projetos futuros serão focados no estudo dessas criaturas.

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