Labpib:Teaching: Difference between revisions

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===Undergrad | Graduação===
===Undergrad | Graduação===


We at LabPIB are responsible (or co-responsible) for some undergrad and grad level courses, offered periodically at the University of Sao Paulo (in Portuguese only). Since 2009, the courses were:


The course "IBM1029 - Introduction to Bioinformatics" will be offered in 2009's 1st semester. This course will be a collaboration between LabPIB and GBI - Grupo de Bioinformática (http://gbi.fmrp.usp.br/) each one being responsible for each half of the course. This course will be held in Portuguese. The half under LabPIB's responsibility will comprise:
* IBM1029 - Introduction to Bioinformatics (undergrad, 2009/2nd semester)
* IBM1036 - Introduction to Statistical Physics (undergrad, 2010/1st)
* IBI5014 - Basic Statistics for Bioinformatics (grad, 2010/1st)
* IBI5070 - Seminaries on Advanced Topics in Bioinformatics


* Phylogenetic Trees - types of trees
* Phylogenetic Trees - inference methods
* RNA Secondary structure prediction
* Gene Prediction
* Protein Prediction
* Gene Expression Measurement
* Genome Analysis
* Orthologous and Paralogous in Proteomes
* Genome Analysis - functional classification
* The Concept of Pipelines




O curso "IBM1029 - Introdução à Bioinformática" será oferecido no 1o semestre de 2009. Esse curso será ministrado como uma colaboração entre o LabPIB e o GBI - Grupo de Bioinformática (http://gbi.fmrp.usp.br/), cada um sendo responsável por cada uma das metades do curso. A metade do LabPIB cobrirá:
Nós no LabPIB somos responsáveis (ou co-responsáveis) por alguns cursos de graduação e pós-graduação, oferecidos perdiodicamente pela Universidade de São Paulo. Desde 2009, os cursos foram:


* Árvores Filogenéticas - Tipos de árvores filogenéticas
* IBM1029 - Introdução à Bioinformática (graduação, 2009/2o semestre)
* Árvores Filogenéticas - Métodos para inferência filogenética
* IBM1036 - Introdução à Física Estatística (graduação, 2010/1o)
* Predição de Estrutura Secundária de RNA
* IBI5014 - Estatística Básica em Bioinformática (pós, 2010/1o)
* Predição de Genes
* IBI5070 - Seminários em Tópicos Avançados de Bioinformática (pós, 2010/1o)
* Predição de Proteínas
* Medidas de Expressão Gênica
* Análise de Genomas
* Comparação por ortólogos, parálogos e proteomas
* Análise de Genomas- Classificação de acordo com a função
* Conceito de Pipeline
 
 
===Grad | Pós-graduação===
 
A course in Systems Biology (or at least, its computational and mathematical aspects) is being planned for 2009's 2nd semester. It would be offered jointly to the USP's Inter-institutional Program on Bioinformatics and to the FMRP-USP Genetics Department's Program on Genetics as an optional course. The content is still being decided and suggestions are yet welcome. The course will be in Portuguese.
 
 
Um curso em Biologia Sistêmica (ou pelo menos seus aspectos computacionais e matemáticos) esta sendo planejado para o 2o semestre de 2009. Ele seria oferecido conjuntamente pelo Programa de Doutorado Interunidades em Bioinformática da USP e pelo Progama de Pós-Graduação em Genética do Depto. de Genética da FMRP-USP como uma disciplina optativa. O conteúdo do curso ainda está sendo decidido e sugestões ainda são bem-vindas.

Revision as of 16:59, 20 June 2009

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Undergrad | Graduação

We at LabPIB are responsible (or co-responsible) for some undergrad and grad level courses, offered periodically at the University of Sao Paulo (in Portuguese only). Since 2009, the courses were:

  • IBM1029 - Introduction to Bioinformatics (undergrad, 2009/2nd semester)
  • IBM1036 - Introduction to Statistical Physics (undergrad, 2010/1st)
  • IBI5014 - Basic Statistics for Bioinformatics (grad, 2010/1st)
  • IBI5070 - Seminaries on Advanced Topics in Bioinformatics


Nós no LabPIB somos responsáveis (ou co-responsáveis) por alguns cursos de graduação e pós-graduação, oferecidos perdiodicamente pela Universidade de São Paulo. Desde 2009, os cursos foram:

  • IBM1029 - Introdução à Bioinformática (graduação, 2009/2o semestre)
  • IBM1036 - Introdução à Física Estatística (graduação, 2010/1o)
  • IBI5014 - Estatística Básica em Bioinformática (pós, 2010/1o)
  • IBI5070 - Seminários em Tópicos Avançados de Bioinformática (pós, 2010/1o)
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