Labpib:Teaching

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* Learning to Learn - Khan Academy Example | Aprendendo a Aprender - Exemplo do Khan Academy ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLBD109B96E282C964 video])
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* Aprendendo a Aprender - Exemplo do Khan Academy ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLBD109B96E282C964 video])
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* Introduction to Computer Programing - Excel Programing (Portuguese audio) | Introdução à Programação - Programando em Excel ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL86DB13AD5F9F936B video])
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* Introdução à Programação - Programando em Excel ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL86DB13AD5F9F936B video])
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* Introduction to Computer Programing - Basic following Khan Academy classes (Portuguese audio) | Introdução à Programação - Básico seguindo vídeo-aula do Khan Academy  ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL8C04110C911D8E69 video])
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* Introdução à Programação - Básico seguindo vídeo-aula do Khan Academy  ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL8C04110C911D8E69 video])
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* Introduction to Computer Programing - Learning C with IFVIDEOS's youtube-based course (Portuguese audio) | Introdução à Programação - USP - Aprendendo C c/ IFVIDEOS  ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLA75B65D971FE0C6E video])
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* Introdução à Programação (p/ Físicos) - Laço (Loop, for) ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL-lVSjBozU-GVCBaMIjlWPK-9R6JRCppa video])
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* Introduction to Computer Programing - Learning C with UFV INF100's youtube-based course (Portuguese audio) | Introdução à Programação - Aprendendo C c/ Curso INF100 UFV Youtube ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL4359B3FCA5833D08 video])
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* Introdução à Programação (p/ Físicos) - Laços encaixados ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL-lVSjBozU-GVCBaMIjlWPK-9R6JRCppa video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/IntroducaoAProgramacaoParaFisicosUSP lousa])
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* Boolean Algebra - Synthetic Biology Motivation (Portuguese) | Álgebra Booleana - Motivação em Biologia Sintética ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL4A0D8DA9B233914E video])
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* Álgebra Booleana - Motivação em Biologia Sintética ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL4A0D8DA9B233914E video])
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* Boolean Algebra - Modern Abstract Algebra's Instance (Portuguese) | Álgebra Booleana - Instância da Álgebra Moderna Abstrata ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL6E4315C41F51F471 video])
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* Álgebra Booleana - Instância da Álgebra Moderna Abstrata ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL6E4315C41F51F471 video])
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* Boolean Algebra - Propositional Logic | Álgebra Booleana - Lógica Proposicional ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL970D80E446932E9A video])
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* Álgebra Booleana - Lógica Proposicional ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL970D80E446932E9A video])
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* Algorithms and Data Structures - Sparse matrices (Portuguese audio) | Algortimos e Estruturas de Dados - Matrizes esparsas ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLDE07C44D7E8F091A video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/AlgoritmosEEstruturaDeDadosUSP blackboard | lousa])
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* Organização de Computadores - Portas Lógicas via PBL ([http://youtu.be/-2vKM3sLDt8 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/AlgebraBooleanaEOrganizacaoDeComputadores lousa])
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* Algorithms and Data Structures - Celular Automata (Portuguese audio) | Algortimos e Estruturas de Dados - Autômatos celulares ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLFFE349615ACEA610 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/AlgoritmosEEstruturaDeDadosUSP blackboard | lousa])
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* Organização de Computadores - {T,F} vs {1,0} vs {ON, OFF} vs etc (PBL) ([http://youtu.be/pjlOeSCj4Kw video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/AlgebraBooleanaEOrganizacaoDeComputadores lousa])
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* Algorithms and Data Structures - Binary Search (Portuguese audio) | Algortimos e Estruturas de Dados - Busca Binária ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL2117B99FDA229301 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/AlgoritmosEEstruturaDeDadosUSP blackboard | lousa])
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* Organização de Computadores - Circuitos "SoP" Soma de Produtos (PBL) ([http://youtu.be/PZzbmgX1tZ8 video])
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* Introduction to Probabilities - Enumeration (Portuguese audio) | Introdução às Probabilidades - Enumeração ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLBEA2EB1243D6691F video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/IntroducaoAProbabilidadeUSP blackboard | lousa])
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* Algortimos e Estruturas de Dados - Matrizes de Adjacências em Grafos ([http://youtu.be/q3lh8NcmH14 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/AlgoritmosEEstruturaDeDadosUSP lousa])
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* Pattern Recognition - Minimum Square classifier (Portuguese audio) | Reconhecimento de Padrões - classificador de Mínimos Quadrados ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLE405AF89364E2DF2 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/ReconhecimentoDePadroesUSP blackboard | lousa])
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* Algortimos e Estruturas de Dados - Metabolismo como Grafos (KEGG)([http://youtu.be/1E6ZECNiOhI video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/AlgoritmosEEstruturaDeDadosUSP lousa])
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* Pattern Recognition - Multidimensional Normal Density (Portuguese audio) | Reconhecimento de Padrões - Normal Multidimensional ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL354AAC4F9794445D video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/ReconhecimentoDePadroesUSP blackboard | lousa])
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* Algortimos e Estruturas de Dados - Matrizes esparsas ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLDE07C44D7E8F091A video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/AlgoritmosEEstruturaDeDadosUSP lousa])
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* Pattern Recognition - Classification Error with Normal Density (Portuguese audio) | Reconhecimento de Padrões - Erro de Classificação com Normal Multidimensional ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLE2E80CB6D5518D51 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/ReconhecimentoDePadroesUSP blackboard | lousa])
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* Algortimos e Estruturas de Dados - Autômatos celulares ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLFFE349615ACEA610 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/AlgoritmosEEstruturaDeDadosUSP lousa])
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* Pattern Recognition - Mixture of Normal Densities (Portuguese audio) | Reconhecimento de Padrões - Mistura de Normais Multidimensionais ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL5E81BFA7184CE209 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/ReconhecimentoDePadroesUSP blackboard | lousa])
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* Algortimos e Estruturas de Dados - Busca Binária ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL2117B99FDA229301 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/AlgoritmosEEstruturaDeDadosUSP lousa])
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* Pattern Recognition - (PCA) Principal Component Analysis (Portuguese audio) | Reconhecimento de Padrões - Análise de Componentes Principais (PCA) ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLF2A972E390252A13 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/ReconhecimentoDePadroesUSP blackboard | lousa])
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* Introdução às Probabilidades - Enumeração ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLBEA2EB1243D6691F video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/IntroducaoAProbabilidadeUSP lousa])
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* Bioinformatics - Introduction to RNAseq Sequencing (Portuguese audio) | Bioinformática - Introdução ao Sequenciamento para RNAseq ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLC87EC148C0755DDA video], [http://labpib.fmrp.usp.br/~rvencio/CVBioinfo_rnaseq.pdf presentation | apresentação])
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* Introdução às Probabilidades - Intuição de v.a. contínuas das discretas ([http://youtu.be/5SrVNQtiMU0 video])
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* Signal Segmentation for Bioinformatics - Gaggle Genome Browser (Portuguese audio) | Segmentação de Sinais p/ Bioinformática - Gaggle Genome Browser ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL02E76571DAAF6B5A video], [http://gaggle.systemsbiology.net/docs/geese/genomebrowser/ software])
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* Reconhecimento de Padrões - Densidade de Probabilidade ([http://youtu.be/29p7KNJRVRo video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/ReconhecimentoDePadroesUSP lousa])
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* Signal Segmentation for Bioinformatics - Edge Finding with Gaussian Convolution (Portuguese audio) | Segmentação de Sinais p/ Bioinformática - Busca de Bordas por Convolução c/ Gaussiana ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLB39E5E6F3E7B4A68 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/SegmentacaoBioinformaticaUSP blackboard | lousa])
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* Reconhecimento de Padrões - Intuição da Regra de Bayes e Aplicação ([http://youtu.be/rDAHPM3Pkn0 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/ReconhecimentoDePadroesUSP lousa])
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* Signal Segmentation for Bioinformatics - Optimization Parameters (Portuguese audio) | Segmentação de Sinais p/ Bioinformática - Otimização dos Parâmetros ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLDCF11E174CFAA345 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/SegmentacaoBioinformaticaUSP blackboard | lousa])
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* Reconhecimento de Padrões - Intuição da Bayes Error Rate ([http://youtu.be/5hYc26d9ayw video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/ReconhecimentoDePadroesUSP lousa])
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* Reconhecimento de Padrões - classificador de Mínimos Quadrados ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLE405AF89364E2DF2 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/ReconhecimentoDePadroesUSP lousa])
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* Reconhecimento de Padrões - Normal Multidimensional ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL354AAC4F9794445D video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/ReconhecimentoDePadroesUSP lousa])
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As Salman Khan, funder of [http://www.khanacademy.org/ Khan Academy], once said "I assign the lectures for homework, and what used to be homework, I now have the students doing in the classroom" (t=6:07 in [http://on.ted.com/9hLJ ''Let's use video to reinvent education'']). This is the kind of revolution we would like to foster.
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* Reconhecimento de Padrões - Erro de Classificação com Normal Multidimensional ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLE2E80CB6D5518D51 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/ReconhecimentoDePadroesUSP lousa])
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* Reconhecimento de Padrões - Mistura de Normais Multidimensionais ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL5E81BFA7184CE209 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/ReconhecimentoDePadroesUSP lousa])
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* Reconhecimento de Padrões - Análise de Componentes Principais (PCA) ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLF2A972E390252A13 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/ReconhecimentoDePadroesUSP lousa])
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* Bioinformática - Introdução ao Sequenciamento para RNAseq ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLC87EC148C0755DDA video], [http://labpib.fmrp.usp.br/~rvencio/CVBioinfo_rnaseq.pdf presentation | apresentação])
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* Segmentação de Sinais p/ Bioinformática - Gaggle Genome Browser ([http://www.youtube.com/playlist?list=PL02E76571DAAF6B5A video], [http://gaggle.systemsbiology.net/docs/geese/genomebrowser/ software])
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* Segmentação de Sinais p/ Bioinformática - Busca de Bordas por Convolução c/ Gaussiana ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLB39E5E6F3E7B4A68 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/SegmentacaoBioinformaticaUSP lousa])
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* Segmentação de Sinais p/ Bioinformática - Otimização dos Parâmetros ([http://www.youtube.com/playlist?list=PLDCF11E174CFAA345 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/SegmentacaoBioinformaticaUSP lousa])
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* Aprendizado de Máquinas - Neurônio com função de transferência sigmóide e gaussiana ([http://youtu.be/Dc6rxNy-OPE video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/RedesNeuraisUSP lousa])
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* Aprendizado de Máquinas - Treinando neurônio com mínimo erro quadrático ([http://youtu.be/32bBh0v4Nik video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/RedesNeuraisUSP lousa])
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* Aprendizado de Máquinas - Treinando neurônio com mínimo erro de classificação ([http://youtu.be/Bvi-UAqaSgE video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/RedesNeuraisUSP lousa])
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* Aprendizado de Máquinas - compondo vários neurônios simples em multicamadas ([http://youtu.be/41Mxc129cM0 video], [https://picasaweb.google.com/LabPIB/RedesNeuraisUSP lousa])
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As Salman Khan, founder of [http://www.khanacademy.org/ Khan Academy], once said "I assign the lectures for homework, and what used to be homework, I now have the students doing in the classroom" (t=6:07 in [http://on.ted.com/9hLJ ''Let's use video to reinvent education'']). This is the kind of revolution we would like to foster.
Como Salman Khan, fundador da [http://www.khanacademy.org/ Khan Academy], disse uma vez "eu proponho as aulas como tarefa-de-casa e, o que costumava ser tarefa-de-casa, eu peço para os estudantes fazerem em sala-de-aula" (t=6:07 em [http://on.ted.com/9hLJ ''Vamos usar o video para reinventar a educação'']). Esse é o tipo de revolução que gostaríamos de incentivar.
Como Salman Khan, fundador da [http://www.khanacademy.org/ Khan Academy], disse uma vez "eu proponho as aulas como tarefa-de-casa e, o que costumava ser tarefa-de-casa, eu peço para os estudantes fazerem em sala-de-aula" (t=6:07 em [http://on.ted.com/9hLJ ''Vamos usar o video para reinventar a educação'']). Esse é o tipo de revolução que gostaríamos de incentivar.

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Web Classes | Aulas na web

We at LabPIB believe in the role of Information Technology to create new learning paradigms. This doesn't mean the replacement of the teacher by the machine, but rather a new kind of master-student relationship.

Nós no LabPIB acreditamos no papel da Tecnologia da Informação em criar novos paradigmas de aprendizado. Isso não significa a substituição do professor pela máquina, mas sim uma nova forma de relação mestre-estudante.


  • Aprendendo a Aprender - Exemplo do Khan Academy (video)
  • Introdução à Programação - Programando em Excel (video)
  • Introdução à Programação - Básico seguindo vídeo-aula do Khan Academy (video)
  • Introdução à Programação (p/ Físicos) - Laço (Loop, for) (video)
  • Introdução à Programação (p/ Físicos) - Laços encaixados (video, lousa)
  • Álgebra Booleana - Motivação em Biologia Sintética (video)
  • Álgebra Booleana - Instância da Álgebra Moderna Abstrata (video)
  • Álgebra Booleana - Lógica Proposicional (video)
  • Organização de Computadores - Portas Lógicas via PBL (video, lousa)
  • Organização de Computadores - {T,F} vs {1,0} vs {ON, OFF} vs etc (PBL) (video, lousa)
  • Organização de Computadores - Circuitos "SoP" Soma de Produtos (PBL) (video)
  • Algortimos e Estruturas de Dados - Matrizes de Adjacências em Grafos (video, lousa)
  • Algortimos e Estruturas de Dados - Metabolismo como Grafos (KEGG)(video, lousa)
  • Algortimos e Estruturas de Dados - Matrizes esparsas (video, lousa)
  • Algortimos e Estruturas de Dados - Autômatos celulares (video, lousa)
  • Algortimos e Estruturas de Dados - Busca Binária (video, lousa)
  • Introdução às Probabilidades - Enumeração (video, lousa)
  • Introdução às Probabilidades - Intuição de v.a. contínuas das discretas (video)
  • Reconhecimento de Padrões - Densidade de Probabilidade (video, lousa)
  • Reconhecimento de Padrões - Intuição da Regra de Bayes e Aplicação (video, lousa)
  • Reconhecimento de Padrões - Intuição da Bayes Error Rate (video, lousa)
  • Reconhecimento de Padrões - classificador de Mínimos Quadrados (video, lousa)
  • Reconhecimento de Padrões - Normal Multidimensional (video, lousa)
  • Reconhecimento de Padrões - Erro de Classificação com Normal Multidimensional (video, lousa)
  • Reconhecimento de Padrões - Mistura de Normais Multidimensionais (video, lousa)
  • Reconhecimento de Padrões - Análise de Componentes Principais (PCA) (video, lousa)
  • Segmentação de Sinais p/ Bioinformática - Gaggle Genome Browser (video, software)
  • Segmentação de Sinais p/ Bioinformática - Busca de Bordas por Convolução c/ Gaussiana (video, lousa)
  • Segmentação de Sinais p/ Bioinformática - Otimização dos Parâmetros (video, lousa)
  • Aprendizado de Máquinas - Neurônio com função de transferência sigmóide e gaussiana (video, lousa)
  • Aprendizado de Máquinas - Treinando neurônio com mínimo erro quadrático (video, lousa)
  • Aprendizado de Máquinas - Treinando neurônio com mínimo erro de classificação (video, lousa)
  • Aprendizado de Máquinas - compondo vários neurônios simples em multicamadas (video, lousa)


As Salman Khan, founder of Khan Academy, once said "I assign the lectures for homework, and what used to be homework, I now have the students doing in the classroom" (t=6:07 in Let's use video to reinvent education). This is the kind of revolution we would like to foster.

Como Salman Khan, fundador da Khan Academy, disse uma vez "eu proponho as aulas como tarefa-de-casa e, o que costumava ser tarefa-de-casa, eu peço para os estudantes fazerem em sala-de-aula" (t=6:07 em Vamos usar o video para reinventar a educação). Esse é o tipo de revolução que gostaríamos de incentivar.


Courses | Cursos

We at LabPIB are responsible (or co-responsible) for some undergrad and grad level courses, offered periodically at the University of Sao Paulo (in Portuguese only). Since 2009, the courses were:

  • IBM1029 - Introduction to Bioinformatics (undergrad, 2009/2nd semester)
  • IBM1036 - Introduction to Statistical Physics (undergrad, 2009/2nd)
  • IBM1045 - Bioinformatics Laboratory I (undergrad, 2010/1st)
  • IBM1072 - Undergraduate Projects (undergrad, 2009/2nd, 2010/1st, 2010/2nd)
  • IBM1054 - Content-based Image Retrieval (undergrad, 2010/2nd)
  • IBM1027 - Molecular and Populational Genetics (undergrad, 2010/2nd)
  • IBI5014 - Basic Statistics for Bioinformatics (grad, 2009/2nd, 2010/1st, 2011/2nd)
  • IBI5070 - Seminaries on Advanced Topics in Bioinformatics (grad, 2009/1st)
  • RGM5898 - Introduction to Bioinformatics for Systems Biology (grad, 2010/1st)
  • IBI5016 - Statistical Methods in Bioinformatics (grad, 2010/2nd)
  • IBM1014 - Algorithms and Data Structures I (undergrad, 2011/1st)
  • IBM1082 - Boolean Algebra and Applications (undergrad, 2011/1st)
  • 5912010 - Computer Programming (undergrad, 2012/1st)
  • 5912011 - Algorithms and Data Structures (undergrad, 2011/2nd)
  • IBI5020 - Data Structures for Bioinformatics (grad, 2011/1st, 2011/2nd)


Nós no LabPIB somos responsáveis (ou co-responsáveis) por alguns cursos de graduação e pós-graduação, oferecidos perdiodicamente pela Universidade de São Paulo. Desde 2009, os cursos foram:

  • IBM1029 - Introdução à Bioinformática (graduação, 2009/1o semestre)
  • IBM1036 - Introdução à Física Estatística (graduação, 2009/2o)
  • IBM1045 - Laboratório de Bioinformática I (graduação, 2010/1o)
  • IBM1072 - Projeto de Graduação (graduação, 2009/2o, 2010/1o, 2010/2o)
  • IBM1054 - Recuperação de Imagens a Partir de seu Conteúdo (graduação, 2010/2o)
  • IBM1027 - Genética Molecular e de Populações (graduação, 2010/2o)
  • IBI5014 - Estatística Básica em Bioinformática (pós, 2009/2o, 2010/1o, 2011/2o)
  • IBI5070 - Seminários em Tópicos Avançados de Bioinformática (pós, 2009/2o)
  • RGM5898 - Introdução à Bioinformática em Biologia Sistêmica (pós, 2010/1o)
  • IBI5016 - Métodos Estatísticos em Bioinformática (pós, 2010/2o)
  • IBM1014 - Algoritmos e Estruturas de Dados I (graduação, 2011/1o)
  • IBM1082 - Álgebra Booleana e Aplicações (graduação, 2011/1o)
  • 5912010 - Programação de Computadores (graduação, 2012/1o)
  • 5912011 - Algoritmos e Estrutura de Dados (graduação, 2011/2o)
  • IBI5020 - Estruturas de Dados para Bioinformática (pós, 2011/1o, 2011/2o)
Personal tools