Labpib:Teaching

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Web Classes | Aulas na web We at LabPIB believe in the role of Information Technology to create new learning paradigms. This doesn't mean the replacement of the teacher by the machine, but rather a new kind of master-student relationship. Nós no LabPIB acreditamos no papel da Tecnologia da Informação em criar novos paradigmas de aprendizado. Isso não significa a substituição do professor pela máquina, mas sim uma nova forma de relação mestre-estudante. Learning to Learn - Khan Academy Example | Aprendendo a Aprender - Exemplo do Khan Academy (video) Introduction to Computer Programing - Excel Programing (Portuguese audio) | Introdução à Programação - Programando em Excel (video) Introduction to Computer Programing - Basic following Khan Academy classes (Portuguese audio) | Introdução à Programação - Básico seguindo vídeo-aula do Khan Academy (video) Introduction to Computer Programing - Learning C with IFVIDEOS's youtube-based course (Portuguese audio) | Introdução à Programação - USP - Aprendendo C c/ IFVIDEOS (video) Introduction to Computer Programing - Learning C with UFV INF100's youtube-based course (Portuguese audio) | Introdução à Programação - Aprendendo C c/ Curso INF100 UFV Youtube (video) Boolean Algebra - Synthetic Biology Motivation (Portuguese) | Álgebra Booleana - Motivação em Biologia Sintética (video) Boolean Algebra - Modern Abstract Algebra's Instance (Portuguese) | Álgebra Booleana - Instância da Álgebra Moderna Abstrata (video) Boolean Algebra - Propositional Logic | Álgebra Booleana - Lógica Proposicional (video) Algorithms and Data Structures - Adjacency Matrix | Algortimos e Estruturas de Dados - Matrizes de Adjacências em Grafos (video, blackboard | lousa) Algorithms and Data Structures - Metabolism as Graphs (KEGG) | Algortimos e Estruturas de Dados - Metabolismo como Grafos (KEGG)(video, blackboard | lousa) Algorithms and Data Structures - Sparse matrices (Portuguese audio) | Algortimos e Estruturas de Dados - Matrizes esparsas (video, blackboard | lousa) Algorithms and Data Structures - Celular Automata (Portuguese audio) | Algortimos e Estruturas de Dados - Autômatos celulares (video, blackboard | lousa) Algorithms and Data Structures - Binary Search (Portuguese audio) | Algortimos e Estruturas de Dados - Busca Binária (video, blackboard | lousa) Introduction to Probabilities - Enumeration (Portuguese audio) | Introdução às Probabilidades - Enumeração (video, blackboard | lousa) Introduction to Probabilities - Intuition of from discrete r.v. to continuous (Portuguese audio) | Introdução às Probabilidades - Intuição de v.a. contínuas das discretas (video) Pattern Recognition - Probability Density | Reconhecimento de Padrões - Densidade de Probabilidade (video, blackboard | lousa) Pattern Recognition - Intuition for Bayes' Rule and an Application | Reconhecimento de Padrões - Intuição da Regra de Bayes e Aplicação (video, blackboard | lousa) Pattern Recognition - Intuition for Bayes Error Rate | Reconhecimento de Padrões - Intuição da Bayes Error Rate (video, blackboard | lousa) Pattern Recognition - Minimum Square classifier (Portuguese audio) | Reconhecimento de Padrões - classificador de Mínimos Quadrados (video, blackboard | lousa) Pattern Recognition - Multidimensional Normal Density (Portuguese audio) | Reconhecimento de Padrões - Normal Multidimensional (video, blackboard | lousa) Pattern Recognition - Classification Error with Normal Density (Portuguese audio) | Reconhecimento de Padrões - Erro de Classificação com Normal Multidimensional (video, blackboard | lousa) Pattern Recognition - Mixture of Normal Densities (Portuguese audio) | Reconhecimento de Padrões - Mistura de Normais Multidimensionais (video, blackboard | lousa) Pattern Recognition - (PCA) Principal Component Analysis (Portuguese audio) | Reconhecimento de Padrões - Análise de Componentes Principais (PCA) (video, blackboard | lousa) Bioinformatics - Introduction to RNAseq Sequencing (Portuguese audio) | Bioinformática - Introdução ao Sequenciamento para RNAseq (video, presentation | apresentação) Signal Segmentation for Bioinformatics - Gaggle Genome Browser (Portuguese audio) | Segmentação de Sinais p/ Bioinformática - Gaggle Genome Browser (video, software) Signal Segmentation for Bioinformatics - Edge Finding with Gaussian Convolution (Portuguese audio) | Segmentação de Sinais p/ Bioinformática - Busca de Bordas por Convolução c/ Gaussiana (video, blackboard | lousa) Signal Segmentation for Bioinformatics - Optimization Parameters (Portuguese audio) | Segmentação de Sinais p/ Bioinformática - Otimização dos Parâmetros (video, blackboard | lousa) Machine Learning - Neuron with sigmoid and gaussian transfer function (Portuguese audio) | Aprendizado de Máquinas - Neurônio com função de transferência sigmóide e gaussiana (video, blackboard | lousa) Machine Learning - Training a neuron using minimum square error (Portuguese audio) | Aprendizado de Máquinas - Treinando neurônio com mínimo erro quadrático (video, blackboard | lousa) Machine Learning - Training a neuron using minimum classification error (Portuguese audio) | Aprendizado de Máquinas - Treinando neurônio com mínimo erro de classificação (video, blackboard | lousa) Machine Learning - Combining several simple neurons in a multilayer fashion (Portuguese audio) | Aprendizado de Máquinas - compondo vários neurônios simples em multicamadas (video, blackboard | lousa) As Salman Khan, funder of Khan Academy, once said "I assign the lectures for homework, and what used to be homework, I now have the students doing in the classroom" (t=6:07 in Let's use video to reinvent education). This is the kind of revolution we would like to foster. Como Salman Khan, fundador da Khan Academy, disse uma vez "eu proponho as aulas como tarefa-de-casa e, o que costumava ser tarefa-de-casa, eu peço para os estudantes fazerem em sala-de-aula" (t=6:07 em Vamos usar o video para reinventar a educação). Esse é o tipo de revolução que gostaríamos de incentivar. Courses | Cursos We at LabPIB are responsible (or co-responsible) for some undergrad and grad level courses, offered periodically at the University of Sao Paulo (in Portuguese only). Since 2009, the courses were: IBM1029 - Introduction to Bioinformatics (undergrad, 2009/2nd semester) IBM1036 - Introduction to Statistical Physics (undergrad, 2009/2nd) IBM1045 - Bioinformatics Laboratory I (undergrad, 2010/1st) IBM1072 - Undergraduate Projects (undergrad, 2009/2nd, 2010/1st, 2010/2nd) IBM1054 - Content-based Image Retrieval (undergrad, 2010/2nd) IBM1027 - Molecular and Populational Genetics (undergrad, 2010/2nd) IBI5014 - Basic Statistics for Bioinformatics (grad, 2009/2nd, 2010/1st, 2011/2nd) IBI5070 - Seminaries on Advanced Topics in Bioinformatics (grad, 2009/1st) RGM5898 - Introduction to Bioinformatics for Systems Biology (grad, 2010/1st) IBI5016 - Statistical Methods in Bioinformatics (grad, 2010/2nd) IBM1014 - Algorithms and Data Structures I (undergrad, 2011/1st) IBM1082 - Boolean Algebra and Applications (undergrad, 2011/1st) 5912010 - Computer Programming (undergrad, 2012/1st) 5912011 - Algorithms and Data Structures (undergrad, 2011/2nd) IBI5020 - Data Structures for Bioinformatics (grad, 2011/1st, 2011/2nd) Nós no LabPIB somos responsáveis (ou co-responsáveis) por alguns cursos de graduação e pós-graduação, oferecidos perdiodicamente pela Universidade de São Paulo. Desde 2009, os cursos foram: IBM1029 - Introdução à Bioinformática (graduação, 2009/1o semestre) IBM1036 - Introdução à Física Estatística (graduação, 2009/2o) IBM1045 - Laboratório de Bioinformática I (graduação, 2010/1o) IBM1072 - Projeto de Graduação (graduação, 2009/2o, 2010/1o, 2010/2o) IBM1054 - Recuperação de Imagens a Partir de seu Conteúdo (graduação, 2010/2o) IBM1027 - Genética Molecular e de Populações (graduação, 2010/2o) IBI5014 - Estatística Básica em Bioinformática (pós, 2009/2o, 2010/1o, 2011/2o) IBI5070 - Seminários em Tópicos Avançados de Bioinformática (pós, 2009/2o) RGM5898 - Introdução à Bioinformática em Biologia Sistêmica (pós, 2010/1o) IBI5016 - Métodos Estatísticos em Bioinformática (pós, 2010/2o) IBM1014 - Algoritmos e Estruturas de Dados I (graduação, 2011/1o) IBM1082 - Álgebra Booleana e Aplicações (graduação, 2011/1o) 5912010 - Programação de Computadores (graduação, 2012/1o) 5912011 - Algoritmos e Estrutura de Dados (graduação, 2011/2o) IBI5020 - Estruturas de Dados para Bioinformática (pós, 2011/1o, 2011/2o)