Undergrad | Graduação
The course "IBM1029 - Introduction to Bioinformatics" will be offered in 2009's 1st semester. This course will be a collaboration between LabPIB and GBI - Grupo de Bioinformática (http://gbi.fmrp.usp.br/) each one being responsible for each half of the course. This course will be held in Portuguese. The half under LabPIB's responsibility will comprise:
- Phylogenetic Trees - types of trees
- Phylogenetic Trees - inference methods
- RNA Secondary structure prediction
- Gene Prediction
- Protein Prediction
- Gene Expression Measurement
- Genome Analysis
- Orthologous and Paralogous in Proteomes
- Genome Analysis - functional classification
- The Concept of Pipelines
O curso "IBM1029 - Introdução à Bioinformática" será oferecido no 1o semestre de 2009. Esse curso será ministrado como uma colaboração entre o LabPIB e o GBI - Grupo de Bioinformática (http://gbi.fmrp.usp.br/), cada um sendo responsável por cada uma das metades do curso. A metade do LabPIB cobrirá:
- Árvores Filogenéticas - Tipos de árvores filogenéticas
- Árvores Filogenéticas - Métodos para inferência filogenética
- Predição de Estrutura Secundária de RNA
- Predição de Genes
- Predição de Proteínas
- Medidas de Expressão Gênica
- Análise de Genomas
- Comparação por ortólogos, parálogos e proteomas
- Análise de Genomas- Classificação de acordo com a função
- Conceito de Pipeline
Grad | Pós-graduação
A course in Systems Biology (or at least, its computational and mathematical aspects) is being planned for 2009's 2nd semester. It would be offered jointly to the USP's Inter-institutional Program on Bioinformatics and to the FMRP-USP Genetics Department's Program on Genetics as an optional course. The content is still being decided and suggestions are yet welcome. The course will be in Portuguese.
Um curso em Biologia Sistêmica (ou pelo menos seus aspectos computacionais e matemáticos) esta sendo planejado para o 2o semestre de 2009. Ele seria oferecido conjuntamente pelo Programa de Doutorado Interunidades em Bioinformática da USP e pelo Progama de Pós-Graduação em Genética do Depto. de Genética da FMRP-USP como uma disciplina optativa. O conteúdo do curso ainda está sendo decidido e sugestões ainda são bem-vindas.
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