Michaux:Positions: Difference between revisions

Revision as of 07:20, 9 April 2014

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Projet de thèse 2014

Contexte socioéconomique et scientifique

L'absorption intestinale dépend de la présence de microvillosités qui augmentent considérablement la surface d'échange à la membrane apicale des entérocytes. Certaines maladies rares, comme l'atrophie microvillositaire, se caractérisent par une absence de microvillosités et une perte complète de la capacité d'absorption des patients qui reçoivent alors une nutrition parentérale. La formation des microvillosités dépend de la mise en place et du maintien de la polarité épithéliale, processus dans lequel le trafic intracellulaire a une fonction essentielle. Par exemple, en utilisant le nématode C. elegans, nous avons révélé un rôle crucial du trafic intracellulaire polarisé contrôlé par le complexe adaptateur pour la clathrine AP-1 dans le maintien de l'intégrité du pôle apical des cellules intestinales (Shafaq-Zadah et al, Development, 2012). L'objectif de cette thèse est d'établir et exploiter C. elegans comme modèle des pathologies affectant l'absorption intestinale.

Les hypothèses et questions posées

L'objectif de ce projet consiste à caractériser in vivo le rôle du trafic intracellulaire polarisé dans le contrôle de l'absorption intestinale. On cherchera en particulier à identifier les gènes essentiels pour l'adressage apical dans l'intestin de C. elegans. On caractérisera ensuite leur fonction dans la formation et le maintien du pôle apical et notamment des microvillosités. On cherchera également à établir leur fonction physiologique dans le contrôle de l'absorption intestinale in vivo. Enfin on exploitera ces résultats afin de mieux comprendre les pathologies affectant l'absorption chez l'homme.

Les grandes étapes de la thèse et démarche

En se basant sur des cribles déjà réalisés in vivo chez C. elegans et les connaissances acquises dans d'autres modèles y compris chez l'homme dans le cadre de pathologies de l'absorption intestinale, la première étape de la thèse consistera à sélectionner et examiner le rôle de gènes candidats et on établira leur fonction dans l'adressage à la membrane apicale dans l'intestin. On utilisera notamment une série de marqueurs tels que les déterminants de polarité (PAR-3, PAR-6, aPKC, Cdc42) ou les protéines essentielles pour l'organisation des microvillosités (les ERM ou EPS-8 par exemple), ainsi que des protéines transmembranaires. Lors de la deuxième étape on caractérisera la fonction des gènes essentiels identifiés en s'appuyant sur l'analyse de leur phénotype et de leurs interactions génétiques. La troisième étape consistera à établir et exploiter des protocoles permettant de tester in vivo la fonction de ces gènes dans l'absorption intestinale. Enfin les résultats obtenus permettront d'explorer de nouvelles approches pour mieux comprendre les pathologies de l'absorption intestinale

Contact : Grégoire Michaux (gmichaux@univ-rennes1.fr)

Candidature via l'école doctorale VAS : http://www.vas.univ-rennes1.fr/fr/vous-souhaitez-realiser-une-these/recrutement-VAS/inscription/

PhD, post-doc and internship

If you are interested by any kind of position (PhD, post-doc or insternship) please contact Grégoire Michaux (gmichaux@univ-rennes1.fr). For PhD positions see also the "École doctorale VAS" website.

Pour un stage (M1, M2, IUT, BTS, stage volontaire)

Contacter Grégoire Michaux ou Anne Pacquelet. Nous avons chaque année plusieurs stagiaires de tous niveaux.

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-'''URGENT'''
-Nous recherchons actuellement un/e stagiaire pour la rentrée de septembre 2013. Le projet consistera à effectuer un crible de localisation subcellulaire d'une protéine essentielle au maintien de la polarité épithéliale chez C. elegans. Le stage aura lieu de début septembre à Noël ; extension possible en janvier et février. Une gratification sera versée pendant toute la durée du stage.
+'''Projet de thèse 2014'''
-Contact : gmichaux@univ-rennes1.fr
+'''Contexte socioéconomique et scientifique'''
-'''PhD, post-doc and internship'''
+L'absorption intestinale dépend de la présence de microvillosités qui augmentent considérablement la surface
+d'échange à la membrane apicale des entérocytes. Certaines maladies rares, comme l'atrophie microvillositaire, se
+caractérisent par une absence de microvillosités et une perte complète de la capacité d'absorption des patients qui
+reçoivent alors une nutrition parentérale. La formation des microvillosités dépend de la mise en place et du maintien
+de la polarité épithéliale, processus dans lequel le trafic intracellulaire a une fonction essentielle. Par exemple, en
+utilisant le nématode ''C. elegans'', nous avons révélé un rôle crucial du trafic intracellulaire polarisé contrôlé par le
+complexe adaptateur pour la clathrine AP-1 dans le maintien de l'intégrité du pôle apical des cellules intestinales
+(Shafaq-Zadah et al, Development, 2012). L'objectif de cette thèse est d'établir et exploiter ''C. elegans'' comme
+modèle des pathologies affectant l'absorption intestinale.
-If you are interested by any kind of position (PhD, post-doc or insternship) please contact Grégoire Michaux (gmichaux@univ-rennes1.fr). For PhD positions see also the "École doctorale VAS" [http://www.vas.univ-rennes1.fr/en/ website].
+'''Les hypothèses et questions posées'''
+L'objectif de ce projet consiste à caractériser in vivo le rôle du trafic intracellulaire polarisé dans le contrôle de
+l'absorption intestinale. On cherchera en particulier à identifier les gènes essentiels pour l'adressage apical dans
+l'intestin de ''C. elegans''. On caractérisera ensuite leur fonction dans la formation et le maintien du pôle apical et
+notamment des microvillosités. On cherchera également à établir leur fonction physiologique dans le contrôle de
+l'absorption intestinale ''in vivo''. Enfin on exploitera ces résultats afin de mieux comprendre les pathologies affectant
+l'absorption chez l'homme.
-'''Pour un stage (M1, M2, IUT, BTS, stage volontaire) '''
+'''Les grandes étapes de la thèse et démarche'''
-Contacter Grégoire Michaux ou Anne Pacquelet. Nous avons chaque année plusieurs stagiaires de tous niveaux.
+En se basant sur des cribles déjà réalisés ''in vivo'' chez ''C. elegans'' et les connaissances acquises dans d'autres
-Nous proposerons '''deux projets de stage de M2 en 2014'''.
+modèles y compris chez l'homme dans le cadre de pathologies de l'absorption intestinale, la première étape de la
+thèse consistera à sélectionner et examiner le rôle de gènes candidats et on établira leur fonction dans l'adressage à
+la membrane apicale dans l'intestin. On utilisera notamment une série de marqueurs tels que les déterminants de
+polarité (PAR-3, PAR-6, aPKC, Cdc42) ou les protéines essentielles pour l'organisation des microvillosités (les ERM
+ou EPS-8 par exemple), ainsi que des protéines transmembranaires. Lors de la deuxième étape on caractérisera la
+fonction des gènes essentiels identifiés en s'appuyant sur l'analyse de leur phénotype et de leurs interactions
+génétiques. La troisième étape consistera à établir et exploiter des protocoles permettant de tester in vivo la
+fonction de ces gènes dans l'absorption intestinale. Enfin les résultats obtenus permettront d'explorer de nouvelles
+approches pour mieux comprendre les pathologies de l'absorption intestinale
+Contact : Grégoire Michaux (gmichaux@univ-rennes1.fr)
-'''Stage de M2 2014 - Premier projet : Localisation de la E-cadhérine et adhérence des cellules épithéliales''' - '''''Grégoire Michaux'''''
+Candidature via l'école doctorale VAS : http://www.vas.univ-rennes1.fr/fr/vous-souhaitez-realiser-une-these/recrutement-VAS/inscription/
-Le maintien de l'intégrité des tissus épithéliaux où surviennent 80% des cancers est essentiel pour prévenir les transitions épithélium-mésenchyme qui sont le prélude à la migration des cellules cancéreuses et la formation de métastases. Les mécanismes moléculaires conduisant à une transition épithélium-mésenchyme convergent tous vers une déstabilisation de la E-cadhérine. Ce suppresseur de tumeur est un composant essentiel des jonctions intercellulaires où il assure l'adhérence entre les cellules et la cohésion des tissus épithéliaux.
-Nous avons récemment montré qu'un défaut dans la localisation polarisée de la E-cadhérine peut induire une déstabilisation des jonctions et une perte d'adhérence des cellules épithéliales chez le nématode C. elegans (Shafaq-Zadah et al, en prép). Afin de mieux comprendre comment la localisation polarisée de la E-cadhérine est contrôlée, nous avons initié un crible de localisation subcellulaire de la E-cadhérine par microscopie confocale in vivo dans l'épiderme de C. elegans. Environ un millier de gènes sont impliqués dans le trafic intracellulaire ou l'organisation du cytosquelette. Sur les 500 premiers candidats testés nous avons identifié cinq gènes qui sont spécifiquement requis pour la localisation polarisée de la E-cadhérine et l'adhérence des cellules épithéliales.
+'''PhD, post-doc and internship'''
-Dans la cadre de ce stage nous proposons de compléter ce crible et d'examiner la fonction des 500 gènes non encore testés ; on s'interessera particulièrement aux gènes induisant une délocalisation basolatérale de la E-cad et un défaut d'adhérence. Ce projet nécessite d'avoir suivi une formation en biologie cellulaire et/ou biologie du développement.
+If you are interested by any kind of position (PhD, post-doc or insternship) please contact Grégoire Michaux (gmichaux@univ-rennes1.fr). For PhD positions see also the "École doctorale VAS" [http://www.vas.univ-rennes1.fr/en/ website].
-'''Stage de M2 2014 - Deuxième projet :  Rôle de la kinase PAR-4 et de la culline CUL-5 dans la division asymétrique de l'embryon précoce chez C. elegans''' - '''''Anne Pacquelet'''''
+'''Pour un stage (M1, M2, IUT, BTS, stage volontaire) '''
-La division cellulaire asymétrique est un processus essentiel générant deux cellules filles d’identités différentes ; elle permet en particulier aux cellules souches de produire une cellule différenciée et une autre conservant la capacité de se diviser. La régulation précise de ce type de division est essentielle pour maintenir l’équilibre prolifération/différenciation au sein d’un tissu et sa dérégulation peut aboutir à la formation de tumeurs.
+Contacter Grégoire Michaux ou Anne Pacquelet. Nous avons chaque année plusieurs stagiaires de tous niveaux.
-Nous étudions les mécanismes régulant la division asymétrique en utilisant comme modèle d’étude la première division de l’embryon de C. elegans. Avant cette division, le fuseau mitotique est déplacé vers le pôle postérieur de la cellule mère. Il induit alors la formation du sillon de cytocinèse, donnant naissance à deux cellules de tailles et d’identités différentes. Le positionnement correct du sillon de cytocinèse est donc une étape essentielle de cette division asymétrique.
-Nous avons récemment montré que la kinase PAR-4 (l’homologue du suppresseur de tumeur LKB1) et une ubiquitine ligase basée sur la culline CUL-5  sont impliquées dans une nouvelle voie de signalisation requise pour coupler le positionnement du sillon de cytocinèse avec celui du fuseau mitotique. Nous recherchons un étudiant de M2 qui caractérisera les  mécanismes moléculaires par lesquels PAR-4 et CUL-5 régulent le positionnement du sillon de cytocinèse et ainsi l’asymétrie de la division. Ce travail nécessitera une combinaison d’approches génétiques et de microscopie (vidéomicroscopie par DIC et microscopie confocale).