http://www.openwetware.org/index.php?title=PNK_Treatment_of_DNA_Ends_protocol&action=history Revision history for this page on the wiki en MediaWiki 1.13.2 Sat, 18 May 2013 07:39:46 GMT http://www.openwetware.org/index.php?title=PNK_Treatment_of_DNA_Ends_protocol&diff=368850&oldid=prev <p></p> <table style="background-color: white; color:black;"> <col class='diff-marker' /> <col class='diff-content' /> <col class='diff-marker' /> <col class='diff-content' /> <tr valign='top'> <td colspan='2' style="background-color: white; color:black;">←Older revision</td> <td colspan='2' style="background-color: white; color:black;">Revision as of 07:15, 20 November 2009</td> </tr> <tr><td colspan="2" class="diff-lineno">Line 1:</td> <td colspan="2" class="diff-lineno">Line 1:</td></tr> <tr><td class='diff-marker'> </td><td style="background: #eee; color:black; font-size: smaller;"><div>&lt;html&gt;</div></td><td class='diff-marker'> </td><td style="background: #eee; color:black; font-size: smaller;"><div>&lt;html&gt;</div></td></tr> <tr><td class='diff-marker'>-</td><td style="background: #ffa; color:black; font-size: smaller;"><div>&lt;h2&gt;Solutions/reagents:&lt;/h2&gt;&lt;ul type=&quot;circle&quot;&gt;&lt;li&gt; &lt;a name=&quot;PNK stock&quot;&gt;PNK stock &lt;i&gt;&lt;br&gt;&lt;tab&gt;&lt;div style=&quot;margin-right: 600px;&quot;&gt;(10, 000 U/ml)&lt;/div&gt;&lt;/i&gt;&lt;/a&gt;&lt;/li&gt;&lt;li&gt;T4 ligase buffer&lt;/li&gt;&lt;li&gt;substrate&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;&lt;h2&gt;Equipment:&lt;/h2&gt;&lt;ul type=&quot;circle&quot;&gt;&lt;li&gt;Incubator&lt;/li&gt;&lt;li&gt;Reaction tubes&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;&lt;h2&gt;Steps:&lt;/h2&gt;&lt;ol&gt;&lt;p&gt;&lt;li&gt;&lt;b&gt;&lt;font size=3&gt;Reaction Mix (10 µl)&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;br&gt;Use the following table as a checklist for preparing the reaction:&lt;br&gt;&lt;br&gt;&lt;table border cellpadding=5 rules=all frame=void bordercolor=#357EC7&gt;&lt;thead&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&amp;nbsp;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;PNK stock&lt;/font&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;T4 ligase buffer&lt;/font&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;substrate&lt;/font&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/thead&gt;&lt;tbody&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;Reaction Mix&lt;/font&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;b&gt;&lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;1 µl&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;b&gt;&lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;1 µl&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;b&gt;&lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;8 µl&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/body&gt;&lt;/table&gt;&lt;/li&gt;&lt;/p&gt;&lt;p&gt;&lt;li&gt;&lt;b&gt;&lt;font size=3&gt;Reaction Conditions&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;br&gt;Incubate at &lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;37°C&lt;/font&gt;&lt;/b&gt; for &lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;30 mins&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;.&lt;br&gt;Incubate at &lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;65°C&lt;/font&gt;&lt;/b&gt; for &lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;20 mins&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;.&lt;br&gt;Store <del class="diffchange diffchange-inline">at </del>&lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;<del class="diffchange diffchange-inline">4°C</del>&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;.&lt;br&gt;&lt;/li&gt;&lt;/p&gt;&lt;/ol&gt;</div></td><td class='diff-marker'>+</td><td style="background: #cfc; color:black; font-size: smaller;"><div>&lt;h2&gt;Solutions/reagents:&lt;/h2&gt;&lt;ul type=&quot;circle&quot;&gt;&lt;li&gt; &lt;a name=&quot;PNK stock&quot;&gt;PNK stock &lt;i&gt;&lt;br&gt;&lt;tab&gt;&lt;div style=&quot;margin-right: 600px;&quot;&gt;(10, 000 U/ml)&lt;/div&gt;&lt;/i&gt;&lt;/a&gt;&lt;/li&gt;&lt;li&gt;T4 ligase buffer&lt;/li&gt;&lt;li&gt;substrate&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;&lt;h2&gt;Equipment:&lt;/h2&gt;&lt;ul type=&quot;circle&quot;&gt;&lt;li&gt;Incubator&lt;/li&gt;&lt;li&gt;Reaction tubes&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;&lt;h2&gt;Steps:&lt;/h2&gt;&lt;ol&gt;&lt;p&gt;&lt;li&gt;&lt;b&gt;&lt;font size=3&gt;Reaction Mix (10 µl)&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;br&gt;Use the following table as a checklist for preparing the reaction <ins class="diffchange diffchange-inline">in reaction tube (1)</ins>:&lt;br&gt;&lt;br&gt;&lt;table border cellpadding=5 rules=all frame=void bordercolor=#357EC7&gt;&lt;thead&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&amp;nbsp;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;PNK stock&lt;/font&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;T4 ligase buffer&lt;/font&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;substrate&lt;/font&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/thead&gt;&lt;tbody&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;Reaction Mix&lt;/font&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;b&gt;&lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;1 µl&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;b&gt;&lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;1 µl&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;b&gt;&lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;8 µl&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/body&gt;&lt;/table&gt;&lt;/li&gt;&lt;/p&gt;&lt;p&gt;&lt;li&gt;&lt;b&gt;&lt;font size=3&gt;Reaction Conditions&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;br&gt;Incubate at &lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;37°C&lt;/font&gt;&lt;/b&gt; for &lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;30 mins&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;.&lt;br&gt;Incubate at &lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;65°C&lt;/font&gt;&lt;/b&gt; for &lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;20 mins&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;.&lt;br&gt;Store <ins class="diffchange diffchange-inline">the tube </ins>&lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;<ins class="diffchange diffchange-inline">on ice</ins>&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;.&lt;br&gt;&lt;/li&gt;&lt;/p&gt;&lt;/ol<ins class="diffchange diffchange-inline">&gt;&lt;p&gt;&lt;b&gt;TOTAL TIME REQUIRED FOR THE COMPLETION OF THE PROTOCOL :&lt;font color=#357EC7&gt;~ 50 mins&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;/p</ins>&gt;</div></td></tr> <tr><td class='diff-marker'> </td><td style="background: #eee; color:black; font-size: smaller;"><div>&lt;/html&gt;</div></td><td class='diff-marker'> </td><td style="background: #eee; color:black; font-size: smaller;"><div>&lt;/html&gt;</div></td></tr> <!-- diff generator: internal 2013-05-18 07:39:46 --> </table> Fri, 20 Nov 2009 07:15:53 GMT Vaishnavi Ananth http://www.openwetware.org/wiki/Talk:PNK_Treatment_of_DNA_Ends_protocol http://www.openwetware.org/index.php?title=PNK_Treatment_of_DNA_Ends_protocol&diff=355547&oldid=prev <p>New page: &lt;html&gt; &lt;h2&gt;Solutions/reagents:&lt;/h2&gt;&lt;ul type=&quot;circle&quot;&gt;&lt;li&gt; &lt;a name=&quot;PNK stock&quot;&gt;PNK stock &lt;i&gt;&lt;br&gt;&lt;tab&gt;&lt;div style=&quot;margin-right: 600px;&quot;&gt;(10, 000 U/ml)&lt;/div&gt;&lt;/i&gt;&lt;/a&gt;&lt;/li&gt;&lt;li&gt;T4 ligase buffer&lt;...</p> <p><b>New page</b></p><div>&lt;html&gt;<br /> &lt;h2&gt;Solutions/reagents:&lt;/h2&gt;&lt;ul type=&quot;circle&quot;&gt;&lt;li&gt; &lt;a name=&quot;PNK stock&quot;&gt;PNK stock &lt;i&gt;&lt;br&gt;&lt;tab&gt;&lt;div style=&quot;margin-right: 600px;&quot;&gt;(10, 000 U/ml)&lt;/div&gt;&lt;/i&gt;&lt;/a&gt;&lt;/li&gt;&lt;li&gt;T4 ligase buffer&lt;/li&gt;&lt;li&gt;substrate&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;&lt;h2&gt;Equipment:&lt;/h2&gt;&lt;ul type=&quot;circle&quot;&gt;&lt;li&gt;Incubator&lt;/li&gt;&lt;li&gt;Reaction tubes&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;&lt;h2&gt;Steps:&lt;/h2&gt;&lt;ol&gt;&lt;p&gt;&lt;li&gt;&lt;b&gt;&lt;font size=3&gt;Reaction Mix (10 µl)&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;br&gt;Use the following table as a checklist for preparing the reaction:&lt;br&gt;&lt;br&gt;&lt;table border cellpadding=5 rules=all frame=void bordercolor=#357EC7&gt;&lt;thead&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&amp;nbsp;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;PNK stock&lt;/font&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;T4 ligase buffer&lt;/font&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;substrate&lt;/font&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/thead&gt;&lt;tbody&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;Reaction Mix&lt;/font&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;b&gt;&lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;1 µl&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;b&gt;&lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;1 µl&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;b&gt;&lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;8 µl&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/body&gt;&lt;/table&gt;&lt;/li&gt;&lt;/p&gt;&lt;p&gt;&lt;li&gt;&lt;b&gt;&lt;font size=3&gt;Reaction Conditions&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;&lt;br&gt;Incubate at &lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;37°C&lt;/font&gt;&lt;/b&gt; for &lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;30 mins&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;.&lt;br&gt;Incubate at &lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;65°C&lt;/font&gt;&lt;/b&gt; for &lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;20 mins&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;.&lt;br&gt;Store at &lt;b&gt;&lt;font color=#357EC7&gt;4°C&lt;/font&gt;&lt;/b&gt;.&lt;br&gt;&lt;/li&gt;&lt;/p&gt;&lt;/ol&gt;<br /> &lt;/html&gt;</div> Thu, 01 Oct 2009 10:05:06 GMT Vaishnavi Ananth http://www.openwetware.org/wiki/Talk:PNK_Treatment_of_DNA_Ends_protocol