User:Ana Matos/Notebook/Aulas de BioMolecular/2010/03/02: Difference between revisions
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Considere a seguinte representação de uma molécula biológica. | |||
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Lembre-se que qualquer representações tem subjacente um conjunto de convenções. | |||
'''Que moléculas se podem representar desta forma e que convenções estarão implícitas nos diferentes casos?''' | |||
Moléculas de DNA, RNA. Não se muda a T para U. | |||
'''Supondo que se trata de DNA, indique uma forma de apresentação alternativa que represente melhor a sua estrutura real.''' | |||
Representação com complementaridade(cadeia dupla) com informação das cadeias 5´->3´ e 3' ->5´. | |||
'''Poderá esta sequência conter um gene? Justifique a sua resposta.''' ~ | |||
Sim. Contém o codão de iniciação meteonina(ATG), logo codifica uma proteína. Tem de ter um quadro de leitura aberto. | |||
'''Indique o resultado da transcrição desta sequência.''' | |||
Mudamos a sequencia codificante de T para U. Na outra sequencia fazemos a complementariedade mas do fim para o fim. | |||
'''É possível prever que proteína se encontra codificada numa sequência nucleotídica? | |||
Como?''' | |||
Sim. Iniciamos a leitura no codão de iniciação e depois de 3 em 3 nucleotidos vemos que codão corresponde a cada proteína. | |||
'''A sequência apresentada codifica alguma proteína?''' | |||
Codifica a proteína: Met Y R L N K A G Y E A W Stop, assumindo que é um código eucariótico. | |||
'''Que diferenças encontra se em vez de aplicar o código genético standard aplicar a variante bacteriana?''' | |||
Vendo o código de transcrição 11(bacteriano) o inicio da sequencia é logo UUG, portanto começando logo com iniciação da meteonina, assim as proteínas transcritas serão diferentes. | |||
'''Como poderia saber de que organismo provém esta sequência?''' | |||
Poderiamos fazer um BLAST. | |||
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Revision as of 04:54, 2 March 2010
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Aula 1Considere a seguinte representação de uma molécula biológica. TTGACACTACCGAGGTGTACTATTTTTACCCGAGTCGCTAATTTTTGCCGCAAGGTGCTAAGCCGCGAGG AAAGCGAGGCTGAACAGGCAGTCGCCCGTCCACAGGTGACGGTGATCCCGCGTGAGCAGCATGCTATTTC CCGCAAAGATATCAGTGAAAATGCCCTGAAGGTAATGTACAGGCTCAATAAAGCGGGATACGAAGCCTGG
Que moléculas se podem representar desta forma e que convenções estarão implícitas nos diferentes casos? Moléculas de DNA, RNA. Não se muda a T para U. Supondo que se trata de DNA, indique uma forma de apresentação alternativa que represente melhor a sua estrutura real. Representação com complementaridade(cadeia dupla) com informação das cadeias 5´->3´ e 3' ->5´. Poderá esta sequência conter um gene? Justifique a sua resposta. ~ Sim. Contém o codão de iniciação meteonina(ATG), logo codifica uma proteína. Tem de ter um quadro de leitura aberto. Indique o resultado da transcrição desta sequência. Mudamos a sequencia codificante de T para U. Na outra sequencia fazemos a complementariedade mas do fim para o fim. É possível prever que proteína se encontra codificada numa sequência nucleotídica? Como? Sim. Iniciamos a leitura no codão de iniciação e depois de 3 em 3 nucleotidos vemos que codão corresponde a cada proteína.
Que diferenças encontra se em vez de aplicar o código genético standard aplicar a variante bacteriana? Vendo o código de transcrição 11(bacteriano) o inicio da sequencia é logo UUG, portanto começando logo com iniciação da meteonina, assim as proteínas transcritas serão diferentes.
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