User:Ana Matos/Notebook/Aulas de BioMolecular/2010/03/02: Difference between revisions

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Como?'''
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Sim. Iniciamos a leitura no codão de iniciação e depois de 3 em 3 nucleotidos vemos que codão corresponde a cada proteína.
Sim. Iniciamos a leitura no codão de iniciação e depois de 3 em 3 nucleotidos vemos que codão corresponde a cada proteína.


'''A sequência apresentada codifica alguma proteína?'''  
'''A sequência apresentada codifica alguma proteína?'''  
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'''Que diferenças encontra se em vez de aplicar o código genético standard aplicar a variante bacteriana?'''
'''Que diferenças encontra se em vez de aplicar o código genético standard aplicar a variante bacteriana?'''
Vendo o código de transcrição 11(bacteriano) o inicio da sequencia é logo UUG, portanto começando logo com iniciação da meteonina, assim as proteínas transcritas serão diferentes.
Vendo o código de transcrição 11(bacteriano) o inicio da sequencia é logo UUG, portanto começando logo com iniciação da meteonina, assim as proteínas transcritas serão diferentes.


'''Como poderia saber de que organismo provém esta sequência?'''
'''Como poderia saber de que organismo provém esta sequência?'''

Revision as of 04:55, 2 March 2010

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Aula 1

Considere a seguinte representação de uma molécula biológica.

TTGACACTACCGAGGTGTACTATTTTTACCCGAGTCGCTAATTTTTGCCGCAAGGTGCTAAGCCGCGAGG AAAGCGAGGCTGAACAGGCAGTCGCCCGTCCACAGGTGACGGTGATCCCGCGTGAGCAGCATGCTATTTC CCGCAAAGATATCAGTGAAAATGCCCTGAAGGTAATGTACAGGCTCAATAAAGCGGGATACGAAGCCTGG


Lembre-se que qualquer representações tem subjacente um conjunto de convenções.

Que moléculas se podem representar desta forma e que convenções estarão implícitas nos diferentes casos? Moléculas de DNA, RNA. Não se muda a T para U.

Supondo que se trata de DNA, indique uma forma de apresentação alternativa que represente melhor a sua estrutura real. Representação com complementaridade(cadeia dupla) com informação das cadeias 5´->3´ e 3' ->5´.

Poderá esta sequência conter um gene? Justifique a sua resposta. ~ Sim. Contém o codão de iniciação meteonina(ATG), logo codifica uma proteína. Tem de ter um quadro de leitura aberto.

Indique o resultado da transcrição desta sequência. Mudamos a sequencia codificante de T para U. Na outra sequencia fazemos a complementariedade mas do fim para o fim.

É possível prever que proteína se encontra codificada numa sequência nucleotídica? Como? Sim. Iniciamos a leitura no codão de iniciação e depois de 3 em 3 nucleotidos vemos que codão corresponde a cada proteína.

A sequência apresentada codifica alguma proteína? Codifica a proteína: Met Y R L N K A G Y E A W Stop, assumindo que é um código eucariótico.

Que diferenças encontra se em vez de aplicar o código genético standard aplicar a variante bacteriana? Vendo o código de transcrição 11(bacteriano) o inicio da sequencia é logo UUG, portanto começando logo com iniciação da meteonina, assim as proteínas transcritas serão diferentes.

Como poderia saber de que organismo provém esta sequência? Poderiamos fazer um BLAST.