User:Diogo Amaral/Notebook/Caderno BioMol/2010/04/20: Difference between revisions

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* Como qualquer DNA polimerase, a transcriptase reversa requer um primer iniciador, que pode ser de 3 tipos distintos: específico de gene, oligo-dT ou random (uma mistura aleatória de 6 a 8 nucleótidos). Em que situações pode ser utilizado cada um destes primers e que vantagens/desvantagens relativas apresentam?


especifico de gene: É um primer com DNA complementar a uma sequencia específica de mRNA e deve ser usado quando queremos sequenciar o produto da transcrição de um gene conhecido, mas se houver uma mutação na zona do primer pode não ligar.
oligo DT: É um primer de cDNA que se liga à cauda poly-A do mRNA (como a transcriptase reversa), na terminação 3' da seuquencia. A desvantagem é que se o gene for muito grande a enzima pode não conseguir chegar a extremidade 5' e consequentemente não sequenciar o local de intresse. A vantagem é que pode sequenciar mRNAs difrentes, já que a cauda de poly-A é comum.
Primer Random:


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Revision as of 03:33, 20 April 2010

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TP5

  • Como qualquer DNA polimerase, a transcriptase reversa requer um primer iniciador, que pode ser de 3 tipos distintos: específico de gene, oligo-dT ou random (uma mistura aleatória de 6 a 8 nucleótidos). Em que situações pode ser utilizado cada um destes primers e que vantagens/desvantagens relativas apresentam?

especifico de gene: É um primer com DNA complementar a uma sequencia específica de mRNA e deve ser usado quando queremos sequenciar o produto da transcrição de um gene conhecido, mas se houver uma mutação na zona do primer pode não ligar.

oligo DT: É um primer de cDNA que se liga à cauda poly-A do mRNA (como a transcriptase reversa), na terminação 3' da seuquencia. A desvantagem é que se o gene for muito grande a enzima pode não conseguir chegar a extremidade 5' e consequentemente não sequenciar o local de intresse. A vantagem é que pode sequenciar mRNAs difrentes, já que a cauda de poly-A é comum.

Primer Random: