User:Gabriela Santos/Notebook/GabrielaSantos BIOMOL/2010/03/02: Difference between revisions

From OpenWetWare
Jump to navigationJump to search
No edit summary
No edit summary
Line 22: Line 22:


#DNA
#DNA
#RNA
#RNA T-->U


*Supondo que se trata de DNA, indique uma forma de apresentação alternativa que represente melhor a sua estrutura real.
*Supondo que se trata de DNA, indique uma forma de apresentação alternativa que represente melhor a sua estrutura real.
Tripletos


*Poderá esta sequência conter um gene? Justifique a sua resposta.
*Poderá esta sequência conter um gene? Justifique a sua resposta.
Pode, se contiver o codão de iniciaçao e codão de stop.


*Indique o resultado da transcrição desta sequência.
*Indique o resultado da transcrição desta sequência.
UUGACACUACCGAGGUGUACUAUUUUUACCCGAGUCGCUAAUUUUUGCCGCAAGGUGCUAAGCCGCGAGG
AAAGCGAGGCUGAACAGGCAGUCGCCCGUCCACAGGUGACGGUGAUCCCGCGUGAGCAGCAUGCUAUUUC
CCGCAAAGAUAUCAGUGAAAAUGCCCUGAAGGUAAUGUACAGGCUCAAUAAAGCGGGAUACGAAGCCUGG


*É possível prever que proteína se encontra codificada numa sequência nucleotídica?  
*É possível prever que proteína se encontra codificada numa sequência nucleotídica?  
Como?  
Como?  
Sim, pelos tripletos (aminoacidos)


*A sequência apresentada codifica alguma proteína?
*A sequência apresentada codifica alguma proteína?
#5'3' Frame 1
L T L P R C T I F T R V A N F C R K V L S R E E S E A E Q A V A R P Q V T V I P R E Q H A I S R K D I S E N A L K V Met Y R L N K A G Y E A W
#5'3' Frame 2
Stop H Y R G V L F L P E S L I F A A R C Stop A A R K A R L N R Q S P V H R Stop R Stop S R V S S Met L F P A K I S V K Met P Stop R Stop C T G S I K R D T K P
#5'3' Frame 3
D T T E V Y Y F Y P S R Stop F L P Q G A K P R G K R G Stop T G S R P S T G D G D P A Stop A A C Y F P Q R Y Q Stop K C P E G N V Q A Q Stop S G I R S L
#3'5' Frame 1
P G F V S R F I E P V H Y L Q G I F T D I F A G N S Met L L T R D H R H L W T G D C L F S L A F L A A Stop H L A A K I S D S G K N S T P R Stop C Q
#3'5' Frame 2
Q A S Y P A L L S L Y I T F R A F S L I S L R E I A C C S R G I T V T C G R A T A C S A S L S S R L S T L R Q K L A T R V K I V H L G S V
#3'5' Frame 3
R L R I P L Y Stop A C T L P S G H F H Stop Y L C G K Stop H A A H A G S P S P V D G R L P V Q P R F P R G L A P C G K N Stop R L G Stop K Stop Y T S V V S


[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/taxonomyhome.html/index.cgi?chapter=tgencodes#SG1  Consulte aqui o código genético]
[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/taxonomyhome.html/index.cgi?chapter=tgencodes#SG1  Consulte aqui o código genético]

Revision as of 04:57, 2 March 2010

Project name <html><img src="/images/9/94/Report.png" border="0" /></html> Main project page
Next entry<html><img src="/images/5/5c/Resultset_next.png" border="0" /></html>

Exercício

Considere a seguinte representação de uma molécula biológica.

TTGACACTACCGAGGTGTACTATTTTTACCCGAGTCGCTAATTTTTGCCGCAAGGTGCTAAGCCGCGAGG AAAGCGAGGCTGAACAGGCAGTCGCCCGTCCACAGGTGACGGTGATCCCGCGTGAGCAGCATGCTATTTC CCGCAAAGATATCAGTGAAAATGCCCTGAAGGTAATGTACAGGCTCAATAAAGCGGGATACGAAGCCTGG


Lembre-se que qualquer representações tem subjacente um conjunto de convenções.

  • Que moléculas se podem representar desta forma e que convenções estarão implícitas nos diferentes casos?
  1. DNA
  2. RNA T-->U
  • Supondo que se trata de DNA, indique uma forma de apresentação alternativa que represente melhor a sua estrutura real.

Tripletos

  • Poderá esta sequência conter um gene? Justifique a sua resposta.

Pode, se contiver o codão de iniciaçao e codão de stop.

  • Indique o resultado da transcrição desta sequência.

UUGACACUACCGAGGUGUACUAUUUUUACCCGAGUCGCUAAUUUUUGCCGCAAGGUGCUAAGCCGCGAGG AAAGCGAGGCUGAACAGGCAGUCGCCCGUCCACAGGUGACGGUGAUCCCGCGUGAGCAGCAUGCUAUUUC CCGCAAAGAUAUCAGUGAAAAUGCCCUGAAGGUAAUGUACAGGCUCAAUAAAGCGGGAUACGAAGCCUGG


  • É possível prever que proteína se encontra codificada numa sequência nucleotídica?

Como?

Sim, pelos tripletos (aminoacidos)

  • A sequência apresentada codifica alguma proteína?
  1. 5'3' Frame 1

L T L P R C T I F T R V A N F C R K V L S R E E S E A E Q A V A R P Q V T V I P R E Q H A I S R K D I S E N A L K V Met Y R L N K A G Y E A W

  1. 5'3' Frame 2

Stop H Y R G V L F L P E S L I F A A R C Stop A A R K A R L N R Q S P V H R Stop R Stop S R V S S Met L F P A K I S V K Met P Stop R Stop C T G S I K R D T K P

  1. 5'3' Frame 3

D T T E V Y Y F Y P S R Stop F L P Q G A K P R G K R G Stop T G S R P S T G D G D P A Stop A A C Y F P Q R Y Q Stop K C P E G N V Q A Q Stop S G I R S L

  1. 3'5' Frame 1

P G F V S R F I E P V H Y L Q G I F T D I F A G N S Met L L T R D H R H L W T G D C L F S L A F L A A Stop H L A A K I S D S G K N S T P R Stop C Q

  1. 3'5' Frame 2

Q A S Y P A L L S L Y I T F R A F S L I S L R E I A C C S R G I T V T C G R A T A C S A S L S S R L S T L R Q K L A T R V K I V H L G S V

  1. 3'5' Frame 3

R L R I P L Y Stop A C T L P S G H F H Stop Y L C G K Stop H A A H A G S P S P V D G R L P V Q P R F P R G L A P C G K N Stop R L G Stop K Stop Y T S V V S

Consulte aqui o código genético

  • Que diferenças encontra se em vez de aplicar o código genético standard aplicar a variante bacteriana?
  • Como poderia saber de que organismo provém esta sequência?


Conceitos a ter no final desta aula:

Estrutura do DNA e RNA

Região 5’ e 3’

Sequência complementar e complemento reverso

Transcrição, direcção da transcrição

Quadro de leitura, quadro de leitura aberto, código genético



Retrieved from "https://openwetware.org/mediawiki/index.php?title=User:Gabriela_Santos/Notebook/GabrielaSantos_BIOMOL/2010/03/02&oldid=395747"