User:Ines Sofia Silva Vieira/Notebook/Bio Molec - caderno/2010/03/02: Difference between revisions

From OpenWetWare
Jump to navigationJump to search
(Autocreate 2010/03/02 Entry for User:Ines_Sofia_Silva_Vieira/Notebook/Bio_Molec_-_caderno)
 
No edit summary
Line 6: Line 6:
| colspan="2"|
| colspan="2"|
<!-- ##### DO NOT edit above this line unless you know what you are doing. ##### -->
<!-- ##### DO NOT edit above this line unless you know what you are doing. ##### -->
==Entry title==
=='''Exercicio TP1==
* Insert content here...
* Considere a seguinte representação de uma molécula biológica.  
 
TTGACACTACCGAGGTGTACTATTTTTACCCGAGTCGCTAATTTTTGCCGCAAGGTGCTAAGCCGCGAGG AAAGCGAGGCTGAACAGGCAGTCGCCCGTCCACAGGTGACGGTGATCCCGCGTGAGCAGCATGCTATTTC CCGCAAAGATATCAGTGAAAATGCCCTGAAGGTAATGTACAGGCTCAATAAAGCGGGATACGAAGCCTGG
 
 
Lembre-se que qualquer representações tem subjacente um conjunto de convenções.
 
Que moléculas se podem representar desta forma e que convenções estarão implícitas nos diferentes casos?'''
DNA e DNA mitocondrial. É um código genético representado por quatro letras diferentes em repetição que representam quatro nucleótidos: Adenina(A), Guanina(G), Citosina(C) e Timina(T). É uma cadeia antiparalela e complementar com o sentido 5' ->3'.
 
Supondo que se trata de DNA, indique uma forma de apresentação alternativa que represente melhor a sua estrutura real.
Sentido: 5' -> 3', Cadeia dupla com uma ponte de hidrogénio entre as base AT e com duas pontes de H entre C e G.
 
Poderá esta sequência conter um gene? Justifique a sua resposta.
Esta sequência para conter um gene precisa de ter algumas características tais como um codão de iniciação AUG(MET)( que em DNA corresponde a ATG) - foram encontrados 3 no sentido 5' -> 3', no sentido contrário encontramos dois ATG; necessitamos também de um codão STOP UAA, UAG e UGG(encontramos diversos em ambos os sentidos! - CGG, TAG, TGA). Para a sequência conter um ou mais genes, os nucleótidos têm de estar entre estes codões de iniciação e STOP.
 
 
Indique o resultado da transcrição desta sequência.  
É possível prever que proteína se encontra codificada numa sequência nucleotídica?
Como?
ATGCTATTTCCCG -->
ATGCCCTGA
sentido contrário:
AGTGAAAATGCCCTGAAGGTA
 
A sequência apresentada codifica alguma proteína?
Consulte aqui o código genético
 
Que diferenças encontra se em vez de aplicar o código genético standard aplicar a variante bacteriana?
Como poderia saber de que organismo provém esta sequência?
 





Revision as of 05:04, 2 March 2010

Project name <html><img src="/images/9/94/Report.png" border="0" /></html> Main project page
Next entry<html><img src="/images/5/5c/Resultset_next.png" border="0" /></html>

Exercicio TP1

  • Considere a seguinte representação de uma molécula biológica.

TTGACACTACCGAGGTGTACTATTTTTACCCGAGTCGCTAATTTTTGCCGCAAGGTGCTAAGCCGCGAGG AAAGCGAGGCTGAACAGGCAGTCGCCCGTCCACAGGTGACGGTGATCCCGCGTGAGCAGCATGCTATTTC CCGCAAAGATATCAGTGAAAATGCCCTGAAGGTAATGTACAGGCTCAATAAAGCGGGATACGAAGCCTGG


Lembre-se que qualquer representações tem subjacente um conjunto de convenções.

Que moléculas se podem representar desta forma e que convenções estarão implícitas nos diferentes casos? DNA e DNA mitocondrial. É um código genético representado por quatro letras diferentes em repetição que representam quatro nucleótidos: Adenina(A), Guanina(G), Citosina(C) e Timina(T). É uma cadeia antiparalela e complementar com o sentido 5' ->3'.

Supondo que se trata de DNA, indique uma forma de apresentação alternativa que represente melhor a sua estrutura real. Sentido: 5' -> 3', Cadeia dupla com uma ponte de hidrogénio entre as base AT e com duas pontes de H entre C e G.

Poderá esta sequência conter um gene? Justifique a sua resposta. Esta sequência para conter um gene precisa de ter algumas características tais como um codão de iniciação AUG(MET)( que em DNA corresponde a ATG) - foram encontrados 3 no sentido 5' -> 3', no sentido contrário encontramos dois ATG; necessitamos também de um codão STOP UAA, UAG e UGG(encontramos diversos em ambos os sentidos! - CGG, TAG, TGA). Para a sequência conter um ou mais genes, os nucleótidos têm de estar entre estes codões de iniciação e STOP.


Indique o resultado da transcrição desta sequência. É possível prever que proteína se encontra codificada numa sequência nucleotídica? Como? ATGCTATTTCCCG --> ATGCCCTGA sentido contrário: AGTGAAAATGCCCTGAAGGTA

A sequência apresentada codifica alguma proteína? Consulte aqui o código genético

Que diferenças encontra se em vez de aplicar o código genético standard aplicar a variante bacteriana? Como poderia saber de que organismo provém esta sequência?