User:Maiko Furubayashi/jp

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**[http://inn-temp.weizmann.ac.il/cgi-bin/emboss/pepwheel pepwheel]
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*[http://bitesizebio.com/ Bitesize bio]
 
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*[http://www.neb.com/nebecomm/tech_reference/default.asp NEB technical reference]
 
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*[http://cse.fra.affrc.go.jp/ksaitoh/techtips.html K.saito氏のちょいテク]:[http://cse.fra.affrc.go.jp/ksaitoh/economy3100.html ABI3100けちけちtips]
 
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*[http://catalog.takara-bio.co.jp/techinfo/techinfo.asp?mode=1 TAKARAバイオ テクニカルサポート]
 
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*[http://staff.aist.go.jp/s-hanai/link1.html#03 プライマーデザインのコツ - 花井@産総研]
 
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*[http://www.gls.co.jp/technique/technique_data/usage_of_hplc/index.html HPLCの上手な使い方 | ジーエルサイエンス]
 
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*[http://www.gls.co.jp/technique/technique_data/basics_of_gc/index.html ガスクロマトグラフィーの基礎 | ジーエルサイエンス]
 
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*[http://micro.fhw.oka-pu.ac.jp/microbiology/microbiology-index.html 微生物の世界 (Web講義室) - 岡山県立大学山本研究室]
 
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*グラフソフト
*グラフソフト
**[http://www.ochiailab.dnj.ynu.ac.jp/mjograph/indexj.html mjograph]:簡単/シンプル/mac/win
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***v4.0.0だとeps出力したとき1つの線が複数のオブジェクトに分かれる。
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***v4.0.0だとeps出力したとき1つの線が複数のオブジェクトに分かれる
***v.3.9.2なら分れない
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**[http://home.gna.org/veusz/ Veusz]
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**[http://plot.micw.eu/ Plot]
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**[http://www.gnuplot.info/ gnuplot]
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*ドローソフト
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**[http://www.cenon.info/frame_gb.html Cenon] eps読み込んで分解できるらしい
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*[http://bitesizebio.com/ Bitesize bio]
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*[http://www.neb.com/nebecomm/tech_reference/default.asp NEB technical reference]
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*[http://cse.fra.affrc.go.jp/ksaitoh/techtips.html K.saito氏のちょいテク]:[http://cse.fra.affrc.go.jp/ksaitoh/economy3100.html ABI3100けちけちtips]
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*[http://catalog.takara-bio.co.jp/techinfo/techinfo.asp?mode=1 TAKARAバイオ テクニカルサポート]
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*[http://staff.aist.go.jp/s-hanai/link1.html#03 プライマーデザインのコツ - 花井@産総研]
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*[http://www.gls.co.jp/technique/technique_data/usage_of_hplc/index.html HPLCの上手な使い方 | ジーエルサイエンス]
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*[http://www.gls.co.jp/technique/technique_data/basics_of_gc/index.html ガスクロマトグラフィーの基礎 | ジーエルサイエンス]
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*[http://micro.fhw.oka-pu.ac.jp/microbiology/microbiology-index.html 微生物の世界 (Web講義室) - 岡山県立大学山本研究室]
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*[http://www.kenkyuu.net/biotechforum.html Bio Technical フォーラム - 研究留学ネット]
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===おてがるクローニング===
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*Bryksin AV & Matsumura I, '''Overlap extension PCR cloning: a simple and reliable way to create recombinant plasmids.''' BioTechniques, Vol. 48, No. 6, 2010, pp. 463–465, [http://www.biotechniques.com/BiotechniquesJournal/2010/June/Overlap-extension-PCR-cloning-a-simple-and-reliable-way-to-create-recombinant-plasmids/biotechniques-280116.html link]
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**digestion/ligationをせずにSOE PCRだけでクローニング!
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*Kotera I & Nagai T, '''A high-throughput and single-tube recombination of crude PCR products using a DNA polymerase inhibitor and type IIS restriction enzyme.''' J Biotechnol, Vol 137, 10, 2008, Pages 1-7, [http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168165608020804 link]
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**Type IIS 制限酵素を使って同時に digestion & ligation
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*Gibson Assembly
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**Gibson DG et al. '''Enzymatic assembly of DNA molecules up to several hundred kilobases.''' Nature Methods 6, 343 - 345 (2009) [http://www.nature.com/nmeth/journal/v6/n5/full/nmeth.1318.html link]
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**[http://www.synbio.org.uk/dna-assembly/guidetogibsonassembly.html 2010 Cambridge iGEM team による素晴らしい解説ページ].[http://www.gibthon.org/ Gibthon]も.
==ほか==
==ほか==

Revision as of 03:18, 11 December 2011

English/日本語

Maiko Furubayashi in 2010
Maiko Furubayashi in 2010

古林 真衣子

  • 千葉大学大学院 工学研究科 共生応用化学専攻 博士後期課程1年
  • バイオマテリアル研究室 梅野太輔グループ
  • 日本学術振興会 特別研究員 (DC1)

Contact

  • maiko.furubayashi *at* gmail.com
  • 263-8522 千葉市稲毛区弥生町1-33 千葉大学工学部1号棟313号室


業績

論文・総説

  1. Furubayashi M, Umeno D, Directed Evolution of Carotenoid Synthases for the Production of Unnatural Carotenoids. Methods Mol Biol, in press (2011)
  2. 古林真衣子, 田代洋平, 梅野太輔, 材料科学のための合成生物学, 未来材料, 10, 2-7 (2010) link
  3. 梅野太輔, 古林真衣子, 三沢典彦, 第3章・カロテノイドの生合成, 宮下和夫(監修)カロテノイドの科学と最新応用技術, シーエムシー出版, pp.27-37 (2009) link
  4. 梅野太輔, 田代洋平, 古林真衣子, 細胞のプログラム死と合成生物学. 極限環境微生物学会誌, 7, 31-35 (2008) link
  5. Tashiro Y, Furubayashi M, Morijiri T, Suzuki K, Yasuno K, Matsuno S, Katabami A, Saito K, Umeno D, Escherichia coli robots that freeze, smell, swell, and time-keep. Synthetic Biology, IET., 1, 41-43 (2007)

特許

  1. 梅野太輔,古林真衣子,三沢典彦,高市真一「炭素数50のカロテノイドの製造方法」特願2011-130326 (2011/6/10)
  2. 梅野太輔,生悦住茉友,古林真衣子,方波見彰仁,斎藤恭一「テルペン合成酵素遺伝子のスクリーニング方法」特願 2009‐264294 (2009/11) / 特開2011-125334 (2011/6/30)

受賞

  1. ○古林真衣子,生悦住茉友,高市真一,斎藤恭一,梅野太輔「人工代謝経路によるC50-β-Caroteneの生合成」日本農芸化学会関東支部 2011年度大会,若手奨励賞(口頭発表・学生部門)
  2. iGEM Chiba,千葉大学 平成18年度課外活動等による学長表彰(コンペ部門)(2007)



べんりリンク

リンク集

bioinformatics tools


free software links

文献管理/SBM

database

実験tips

おてがるクローニング

  • Bryksin AV & Matsumura I, Overlap extension PCR cloning: a simple and reliable way to create recombinant plasmids. BioTechniques, Vol. 48, No. 6, 2010, pp. 463–465, link
    • digestion/ligationをせずにSOE PCRだけでクローニング!
  • Kotera I & Nagai T, A high-throughput and single-tube recombination of crude PCR products using a DNA polymerase inhibitor and type IIS restriction enzyme. J Biotechnol, Vol 137, 10, 2008, Pages 1-7, link
    • Type IIS 制限酵素を使って同時に digestion & ligation
  • Gibson Assembly

ほか

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