Etchevers:Notebook/STRA6 in eye development/2009/08/01: Difference between revisions

From OpenWetWare
Jump to navigationJump to search
Line 27: Line 27:
Mais il y en avait 96638 d'alignements!!
Mais il y en avait 96638 d'alignements!!


Parmi eux:
Parmi eux quelques sequences (et cela formatte tres mal, et je recois l'avertissement "WARNING: This page is 205 kilobytes long; some browsers may have problems editing pages approaching or longer than 32kb. Please consider breaking the page into smaller sections."
 
Si seulement je voyais comment preserver les retours chariots!
>ref|NT_039260.7|Mm4_39300_37 Download subject sequence spanning the                                    HSP Mus musculus chromosome 4 genomic contig, strain C57BL/6J
>ref|NT_039260.7|Mm4_39300_37 Download subject sequence spanning the                                    HSP Mus musculus chromosome 4 genomic contig, strain C57BL/6J
Length=28591323
Length=28591323
Line 1,361: Line 1,363:




Features in this part of subject sequence:
(more in tomorrow's entry)
  astrotactin 2 isoform a
  astrotactin 2 isoform b
 
 
Score = 1370 bits (1518),  Expect = 0.0
Identities = 2607/3802 (68%), Gaps = 54/3802 (1%)
Strand=Plus/Minus
 
Query  2425    AATGGACTAAATGCTCCAATTAAAAGACACAGACTAGCAAATTGGATAAAGAGTCAAGAC  2484
                ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| || | |  ||||||
Sbjct  5358753  AATGGTCTCAACTCGCCAATAAAAAGACATAGACTAACAAACTGGCTACACAAACAAGAC  5358694
 
Query  2485    CCATCAGTGTGCTGTATTCAGGAAACCCATCTCACATGCAGAGACACACATAGGCTCAAA  2544
                ||| || | |||||  | |||||||| ||||||| |  | ||| | |||    |||| |
Sbjct  5358693  CCAACATTTTGCTGCTTACAGGAAACTCATCTCAGAGAAAAAGATAGACACTACCTCAGA  5358634
 
Query  2545    ATAAAGGGATGGAGGAAGATCTACCAAGCAAACGGAAAACAAAAAAAGGCAGGGGTTGCA  2604
                || || || ||||  |  || | ||||||||| || |  | ||| | ||||| || ||
Sbjct  5358633  ATGAAAGGCTGGAAAACAATTTTCCAAGCAAATGGTATGAAGAAACAAGCAGGAGTAGCC  5358574
 
Query  2605    ATCCTAGTCTCTGATAAAACAGACTTTAAACCAACAAAG--ATCAAAAGAGACAAAGAAG  2662
                |||||| | |||||||| |  |||||  ||||  |||||  ||||||| |||||| || |
Sbjct  5358573  ATCCTAATATCTGATAAGATTGACTTCCAACC--CAAAGTCATCAAAAAAGACAAGGAGG  5358516
 
Query  2663    GCCATTACATAATGGTAAAGGGATCAATTCAACAAGAAGAGCTAACTATCCTAAATATAT  2722
                | || | |||  |  | || ||  ||| |  ||||| || ||  | || || ||||| |
Sbjct  5358515  GACACTTCATTCTCATCAAAGGTAAAATCCTCCAAGAGGAACTCTCAATTCTGAATATCT  5358456
 
Query  2723    ATGCACCCAATACAGGAGCACCAAGATTCA-TAAAGCAAGTCCTGAGTGACCTACAAAG-  2780
                |||| || |||||| ||||| | | ||||| ||||| || |  | ||| |    |||||
Sbjct  5358455  ATGCTCCAAATACAAGAGCAGCCACATTCACTAAAGAAACT--TTAGTAAAGCTCAAAGC  5358398
 
Query  2781    AGACTTAGACTCCCACACATTAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAACATTAGA  2840
                | || | |  | |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || | ||
Sbjct  5358397  ACACATTGCGCCTCACACAATAATAGTGGGAGACTTCAACACACCACTTTCACCAATGGA  5358338
 
Query  2841    CAGATCAACGAGACAGAAAGTCAACAAGGATACCCAGGAATTGAACTCAGCTCTGCAGCA  2900
                |||||||  || ||||||| | |||| ||| || | | || | |    ||  || | ||
Sbjct  5358337  CAGATCATGGAAACAGAAACTAAACAGGGACACACTGAAACTAACAGAAGTGATGAAACA  5358278
 
Query  2901    AGCGGACCTAATAGACATCTACAGAACTCTCCACCCCAAATCAACAGAATATACATTTTT  2960
                |  ||| || | ||| |||||||||||  |  | || ||| ||| || |||||| || ||
Sbjct  5358277  AATGGATCTGACAGATATCTACAGAACATTTTATCCTAAAACAAAAGGATATACCTTCTT  5358218
 
Query  2961    TTCAGCACCACACCACACCTACTCCAAAATTGACCACATACTGGGAAGTAAAGCACTCCT  3020
                |||||||| ||    |||| ||||||||||||||||||| | ||    ||| ||  |||
Sbjct  5358217  CTCAGCACCTCATGGTACCTTCTCCAAAATTGACCACATAATAGGTCACAAATCAGGCCT  5358158
 
Query  3021    CAGCAAATGTAAAAGAACAGAAATTATAACAAACTATC-TCTCAGACCACAGTGCAATCA  3079
                || || ||  ||||  |  |||||| |  ||  |||| | ||||| |||  |||| | |
Sbjct  5358157  CAACAGATTCAAAAATATTGAAATTGTCCCATG-TATCCTATCAGATCACCATGCACTAA  5358099
 
Query  3080    AACTAGAACTCAGGATTAAGA-ATCTCACTCAAAACCGCTCAACTACATGGAAACTGAAC  3138
                  |||    |||  |  || | |  | ||  ||| ||  ||  || ||||||||||||
Sbjct  5358098  GGCTAATCTTCAATAACAAAATAAATAACAGAAAGCCAA-CATTCACGTGGAAACTGAAC  5358040
 
Query  3139    AACCTGCTCCTGAATGACTACTGGGTACATAACGAAATGAAGGCAGAAATAAAGTTGTTC  3198
                |||  || || |||||  || |||  |  | | ||| |||  |||||| ||    ||
Sbjct  5358039  AACACTCTTCTCAATGATACCTTGGTCAAGGAAGGAATAAAGAAAGAAATTAAAGACTTT  5357980
 
Query  3199    TTTGAAACCAATGAGAACAAAGACACAACATACCAGAATCTCTGGGATGCATTCAAAGCA  3258
                || ||    ||||| ||  ||| |||||| ||||  || || |||||  || | ||||||
Sbjct  5357979  TTAGAGTTTAATGAAAATGAAGCCACAACGTACCCAAACCTTTGGGACACAATGAAAGCA  5357920
 
Query  3259    GTGTGCAGAGGGAAATTTATAGCACTGAATGCCCACAAGAGAAAGCAGGAAAGATCCAAA  3318
                |    ||||||||| | |||||  ||| ||||  ||||| ||| | ||| ||| |  |
Sbjct  5357919  TTTCTAAGAGGGAAACTCATAGCTATGAGTGCCTTCAAGAAAAAACGGGAGAGAGCACAT  5357860
 
Query  3319    ATTGACACCCTAACATCACAATTAAAAGAACTAGAAAAGCAAGA-GCAAACACATTCAAA  3377
                | |  || | | ||| ||||  ||||||  ||||||||  | || |||||  ||  |||
Sbjct  5357859  ACTAGCAGCTTGACAACACATCTAAAAGCTCTAGAAAAAAAGGAAGCAAATTCACCCAAG  5357800
 
Query  3378    AGCTAGCAGAAGGGAAGAAATAACTAAAATCAGAGCAGAACTGAAGGAAATAGAGACACA  3437
                ||  || ||| || | |||||||  ||| |||| |  ||| | ||  || | || ||| 
Sbjct  5357799  AGG-AGTAGACGGCAGGAAATAATCAAACTCAGGGGTGAAATCAACCAAGTGGAAACAAG  5357741
 
Query  3438    AAAAACCCTTCAAAAAATTAATGAATCCAGGAGCTGGTTTTTTGAAAGGATAAACAAAAT  3497
                || |||  |||||| ||||||  || | ||||| ||||| ||||| |  || ||||| ||
Sbjct  5357740  AAGAACTATTCAAAGAATTAACCAAACGAGGAGTTGGTTCTTTGAGAAAATCAACAAGAT  5357681
 
Query  3498    TGATAGACCGCTAGCAAGACTAA-TAAAGAAAAAAAGAGAGAAGAATCAAATAGATGCAA  3556
                |||| |||  |||| ||||| | |||||  | | | || || |  | |||  |  ||
Sbjct  5357680  AGATAAACCCTTAGCTAGACTCACTAAAGGGCACAGG-GACAAAATCCTAATTAACAAAA  5357622
 
Query  3557    TAAAAAAATGATAAAGGGGATATCACCACCAATCCCACAGAAATACAAACTACCATCAGA  3616
                | | ||| ||| || || || || || ||  ||||  |||||| ||||  |||||||||
Sbjct  5357621  TCAGAAA-TGAAAAGGGAGACATAACAACAGATCCTGAAGAAATCCAAAACACCATCAGA  5357563
 
Query  3617    GAATACTACAAACACCTCTACGCAAATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAATGGATAAATTC  3676
                  | |||||||  || ||| |||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||
Sbjct  5357562  TCCTTCTACAAAAGGCTATACTCAACAAAACTGGAAAACCTGGACGAAATGGACAAATTT  5357503
 
Query  3677    CTGGACACATACACTCTCCCAAGACTAAACCAGGAAGAAGTTGAATCTCTGAATAGACCA  3736
                ||||||| ||||    | ||||  | || |||||  |||||||  ||| || || ||
Sbjct  5357502  CTGGACAGATACCAGGTACCAAAGTTGAATCAGGATCAAGTTGACCTTCTAAACAGTCCC  5357443
 
Query  3737    ATAACAGGAGCTGAAATTGTGGCAATAATCAATAGCTTACCAACCAAAAAGAGTCCAGGA  3796
                ||| |      ||||| |  ||| | || |||||  | ||| ||||||| || ||||||
Sbjct  5357442  ATATCCCCTAAAGAAATAGAAGCAGTTATTAATAGTCTCCCAGCCAAAAAAAGCCCAGGA  5357383
 
Query  3797    CCAGATGGATTCACAGCCGAATTCTACCAGAGGTACAAGGAGGAACTGGTACCATTCCTT  3856
                ||||| ||||| |  || || ||||| ||||  | ||| || || ||    ||| | ||
Sbjct  5357382  CCAGACGGATTTAGTGCAGAGTTCTATCAGACCTTCAAAGAAGATCTAACTCCAGTTCTG  5357323
 
Query  3857    CTGAAACTATTCCAATCAATAGAAAAAGAGGGAATCCTCCCTAACTCATTTTATGACGCC  3916
                |  ||||| || ||    ||||||  ||| || || || || |||||||||||||| |||
Sbjct  5357322  CACAAACTTTTTCACAAGATAGAAGTAGAAGGTATTCTACCCAACTCATTTTATGAAGCC  5357263
 
Query  3917    AGCATCATTCTGATACCAAAGCCAGGCAGAGACACAACAAAAAAAGAGAATTTTAGACCA  3976
                |  || | ||||||||| || |||  | |||  ||||||| | |||||| || ||||||
Sbjct  5357262  ACTATTACTCTGATACCTAAACCACAGAAAGATCCAACAAAGATAGAGAACTTCAGACCA  5357203
 
Query  3977    ATATCCTTGATGAACATTGAGGCAAAAATCCTCAATAAAACACTGGCAAAATGAATCCAG  4036
                || ||  | |||||||| || |||||||| || |||||||  || || ||  |||||||
Sbjct  5357202  ATTTCTCTTATGAACATCGATGCAAAAATTCTTAATAAAATTCTCGCTAACCGAATCCAA  5357143
 
Query  4037    CAGCACATCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAAGGC  4096
                | ||||| |||    | ||||| | ||| ||||| || || || || |||||||| ||
Sbjct  5357142  GAACACATTAAAGCAATCATCCATCCTGACCAAGTAGGTTTTATTCCAGGGATGCAGGGA  5357083
 
Query  4097    TGGTTCAATATACGCAAATCAATAAATGTAATCCAGCATAAAAACAGAGCCAAAGACAAA  4156
                ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||
Sbjct  5357082  TGGTTTAATATACGAAAATCCATCAATGTAATCCATTATATAAACAAACTCAAAGACAAA  5357023
 
Query  4157    AACCACATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAAGCCTTTGACAAAATTCAACAACCCTTC  4216
                ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||
Sbjct  5357022  AACCACATGATCATCTCGTTAGATGCAGAAAAAGCATTTGACAAGATCCAACACCCATTC  5356963
 
Query  4217    ATGCTAAAAACTCTCAATAAATTAGGTATTGATGGGACGTATTTCAAAATAATAAGAGCT  4276
                ||| ||||| ||||  | | || ||| ||| | ||    ||  | || || |||| |||
Sbjct  5356962  ATGATAAAAGCTCTGGAAAGATCAGGAATTCAAGGCCAATACCTAAACATGATAAAAGCA  5356903
 
Query  4277    ATCTATGACAAACCCACAGCCAATATCATACTGAATGGGCAAAAACTGGAAGCATTCTCT  4336
                |||||  ||||||  |||||| |||| | | |||||  | || ||||||||| || |
Sbjct  5356902  ATCTACAGCAAACCAGTAGCCAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCCA  5356843
 
Query  4337    TTGAAAACTGGCACAAGACAGGGATGCCCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTGTTG  4396
                | ||| | || || ||||| || ||||| || || ||  ||| |||||||||||  |
Sbjct  5356842  CTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGTACTT  5356783
 
Query  4397    GAAGTTCTGGCCAGGGCAATTAGGCAGGAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGAAAA  4456
                |||||  | ||||| |||||| | ||  | ||||| || ||||| || ||| | ||||||
Sbjct  5356782  GAAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACAAATTGGAAAA  5356723
 
Query  4457    GAGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCAGACGACATGATTGTATATCTAGAAAACCCCATT  4516
                |||||||||||| | || || |||||||| || ||||| |||||| ||    |||| | 
Sbjct  5356722  GAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAAA  5356663
 
Query  4517    GTCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAA  4576
                  ||  ||  | | ||||| || ||||||| || |||| |  ||||  | ||||| |||
Sbjct  5356662  AATTCCACCAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGGATATAAA  5356603
 
Query  4577    ATCAATGTACAAAAATCACAAGCATTCTTATACACCAACAACAGACAAACAGAGAGCCAA  4636
                || ||  | | || |||  ||  |  | ||||| || || | |||  | ||||  ||
Sbjct  5356602  ATTAACTCAAACAAGTCAATGGCCCTTCTCTACACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGAA  5356543
 
Query  4637    ATCA-TGAGTGAACTCCCATTCACAATTGCTTCAAAGAGAATAAAATACCTAGGAATCCA  4695
                || |  ||  ||| ||| ||| |||| ||  |||| |  |||||||| || ||  | 
Sbjct  5356542  ATTAGGGAAACAACACCC-TTCTCAATAGCCACAAATAATATAAAATATCTCGGCGTGAC  5356484
 
Query  4696    ACTTACAAGGGATGTGAAGGGCCTCTTCAAGGAGAACTACAAACCTCTGCTCAAGGAAAT  4755
                || || | ||| ||||| |  || |  |  | |||| |||  | |||  || |||||
Sbjct  5356483  TCTAACGAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAGTCCCTGAAGAAAGAAAT  5356424
 
Query  4756    AAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAATAT  4815
                ||||| |||  |  | ||||||  |  | |||||||||||| | || || | ||| ||
Sbjct  5356423  TAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGACCAACAT  5356364
 
Query  4816    CGTGAAAATGGCCATACTCCTCAAGGTAATTTACAGATTCAATGCCATCCCCATCAAGCT  4875
                || |||||||| ||  | |  || | ||| |||||||||||||| |||||||| ||  |
Sbjct  5356363  TGTAAAAATGGCTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATTAAAAT  5356304
 
Query  4876    ACCAATGACTTTCTTCACAGAACTGGAAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAAA  4935
                ||||    |||||||  ||| | |||  | | | ||  || ||||| |||||  | ||
Sbjct  5356303  TCCAACTCAATTCTTCAACGAATTAGAAGGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAATAACAA  5356244
 
Query  4936    GAGAGCCCACATCGCCAAGTCAATCCT--AAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACA  4993
                | | |    || || ||  |  | ||  | |  ||||||||    |||| || |||||
Sbjct  5356243  AAAACCGAGGATAGCAAAAACTCTTCTCAAGGATAAAAGAAC--CTCTGGTGGAATCACC  5356186
 
Query  4994    CTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGGTAC  5053
                | |||||| | || || |||||||  || |  || |  ||||| ||||||||||||||
Sbjct  5356185  ATGCCTGACCTAAAGCTTTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGGTAT  5356126
 
Query  5054    CAAAACAGAGATATTGATCAATGGAACAGAACAGGGCCCTCAGAAATAACGCCGCATATC  5113
                  | ||||| |  | || |||||||| ||||  |    | ||||||| |  || || | |
Sbjct  5356125  AGAGACAGACAAGTGGACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACACACC  5356066
 
Query  5114    TACAACTATCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTA  5173
                ||    |  ||||||| |||||    | ||||| ||  || |||  || ||  | |
Sbjct  5356065  TATGGTCACTTGATCTTCGACAAGGGAGCCAAAACCATCCAGTGGAAGAAAGACAGCATT  5356006
 
Query  5174    TTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCAT-ATGTAGAAAGCTGAAACTGGATCC  5232
                || || || ||||||||| | |||||| | |  || ||||||||  ||  | | |||||
Sbjct  5356005  TTCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGG-TTGTTATCATGTAGAAGAATGCGAATTGATCC  5355947
 
Query  5233    CTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTTAGACC  5292
                | | |  | |||| ||| ||  |||| || |  ||||| || ||  |  || | | |||
Sbjct  5355946  ATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAAGGAACTTCACATAAAACC  5355887
 
Query  5293    TAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACGTAGGCATTACCATTCAGGACATAGGCATGGG  5352
                  | ||  | |||    |||| || || || || |  | | || | || || ||||  ||
Sbjct  5355886  AGAGACACTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTTGAAGATATGGGCACAGG  5355827
 
Query  5353    CAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGC---AAC---AAAAGACAAAATTGA  5406
                  |  | ||| ||    ||||  || |||||||||    ||  || |  | ||||||
Sbjct  5355826  GGAAAAATTCCTG-----AACA-GAACAGCAATGGCTTGTACTGTAAGATCGAGAATTGA  5355773
 
Query  5407    CAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACT-ACCATCAGAG  5465
                ||||||||| ||||| |||||  | || |||||||  |||||||| |||  | || |||
Sbjct  5355772  CAAATGGGACCTAATGAAACTCCAAAGTTTCTGCAAGGCAAAAGACACTGTCTATAAGA-  5355714
 
Query  5466    TGAACAGGCAACCTACAAAATGGGAGAAAATTTTTGC--AACCTACTCATCTGACAAAGG  5523
                  || || | ||| ||| | ||||| |  || ||| |  | ||||  ||| || |  ||
Sbjct  5355713  CAAAAAGACCACCAACAGACTGGGAAAGGATCTTTACCTATCCTA--AATCAGATAGGGG  5355656
 
Query  5524    GCTAATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAATTTACAAGAAAAAAACAAACAACCC  5583
                ||||||||||  || || || ||||||||  |  |  ||  | |||| |||| |||||
Sbjct  5355655  ACTAATATCCAACATATATAAAGAACTCAAGAAGGTGGACCTCAGAAAATCAAATAACCC  5355596
 
Query  5584    CATCAAAAAGTGGGTGAAGGACATGAACAGACACTTCTCA---AAAGAAGACATTTATGC  5640
                | | ||||| ||||    ||  |||||| | | ||||||    | ||| ||    |||
Sbjct  5355595  CCTTAAAAAATGGGGCTCAGAACTGAACAAAGAATTCTCACCTGAGGAATAC-CGAATG-  5355538
 
Query  5641    AGCCAACAGACACATGAAAAAATGCTCATCATCACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAA  5700
                ||  | |  ||| |||||||||| ||| ||||  |  |||||| ||||||||||||||
Sbjct  5355537  -GCAGAGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAA  5355479
 
Query  5701    AACCACAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGCGATCATTAAAAAGTCAGGAAA  5760
                ||| ||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |  || ||||| |||||  |
Sbjct  5355478  AACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTGAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGA  5355419
 
Query  5761    CAACAGGTGCTGGAGAGGATGTGGAGAAATAGGAACATTTTTACACTGTTGGTGGGACTG  5820
                || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |  | || ||||||||||| ||
Sbjct  5355418  CAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTG  5355359
 
Query  5821    TAAACTAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAGAACTGGA  5880
                |  || || |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||  |  | ||  | |
Sbjct  5355358  CAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGT  5355299
 
Query  5881    AATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCATG  5940
                | ||||    || ||||| || ||  | ||||| ||||| ||| | ||    |  | 
Sbjct  5355298  ACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGA----AGCCCCAA  5355243
 
Query  5941    CTGCT-ATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCATTATTCACAATAGCAAAGA  5999
                ||| | | || ||||||||| |  |||||| || || || ||||| | |||||| |  |
Sbjct  5355242  CTGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAA  5355183
 
Query  6000    CTTGGAACCAACCCAAATGTCTAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATAT  6059
                  |||||  |||||| ||| |  |||    || |||||  ||||||||||| |||| |
Sbjct  5355182  ACTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCT  5355123
 
Query  6060    ACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACAT  6119
                |||| ||||| |||||  |||| || |||||  |||| || |||  ||  |||  | ||
Sbjct  5355122  ACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAAT  5355063
 
Query  6120    GGATGAAATTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACC  6179
                ||||| |  |||| | |||||| || ||| |  || | |||  |||||  | |  ||||
Sbjct  5355062  GGATGGACCTGGAGAGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACAATCACAAAGGAACTCACACA  5355003
 
Query  6180    GCATATTCTCACTCATAGGTGG  6201
                  || | |||||| ||| ||||
Sbjct  5355002  ATATGTACTCACTGATAAGTGG  5354981
 
 
Features flanking this part of subject sequence:
  1016884 bp at 5' side: tripartite motif protein 32
  192001 bp at 3' side: toll-like receptor 4
 
 
Score = 1370 bits (1518),  Expect = 0.0
Identities = 2604/3797 (68%), Gaps = 44/3797 (1%)
Strand=Plus/Minus
 
Query  2425    AATGGACTAAATGCTCCAATTAAAAGACACAGACTAGCAAATTGGATAAAGAGTCAAGAC  2484
                ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| || | |  ||||||
Sbjct  5925480  AATGGTCTCAACTCGCCAATAAAAAGACATAGACTAACAAACTGGCTACACAAACAAGAC  5925421
 
Query  2485    CCATCAGTGTGCTGTATTCAGGAAACCCATCTCACATGCAGAGACACACATAGGCTCAAA  2544
                ||| || | |||||  | |||||||| ||||||| |  | ||| | |||    |||| |
Sbjct  5925420  CCAACATTTTGCTGCTTACAGGAAACTCATCTCAGAGAAAAAGATAGACACTACCTCAGA  5925361
 
Query  2545    ATAAAGGGATGGAGGAAGATCTACCAAGCAAACGGAAAACAAAAAAAGGCAGGGGTTGCA  2604
                || || || ||||  |  || | ||||||||| || |  | ||| | ||||| || ||
Sbjct  5925360  ATGAAAGGCTGGAAAACAATTTTCCAAGCAAATGGTATGAAGAAACAAGCAGGAGTAGCC  5925301
 
Query  2605    ATCCTAGTCTCTGATAAAACAGACTTTAAACCAACAAAG--ATCAAAAGAGACAAAGAAG  2662
                |||||| | |||||||| |  |||||  ||||  |||||  ||||||| |||||| || |
Sbjct  5925300  ATCCTAATATCTGATAAGATTGACTTCCAACC--CAAAGTCATCAAAAAAGACAAGGAGG  5925243
 
Query  2663    GCCATTACATAATGGTAAAGGGATCAATTCAACAAGAAGAGCTAACTATCCTAAATATAT  2722
                | || | |||  |  | || ||  ||| |  ||||| || ||  | || || ||||| |
Sbjct  5925242  GACACTTCATTCTCATCAAAGGTAAAATCCTCCAAGAGGAACTCTCAATTCTGAATATCT  5925183
 
Query  2723    ATGCACCCAATACAGGAGCACCAAGATTCA-TAAAGCAAGTCCTGAGTGACCTACAAAG-  2780
                |||| || |||||| ||||| | | ||||| ||||| || |  | ||| |    |||||
Sbjct  5925182  ATGCTCCAAATACAAGAGCAGCCACATTCACTAAAGAAACT--TTAGTAAAGCTCAAAGC  5925125
 
Query  2781    AGACTTAGACTCCCACACATTAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAACATTAGA  2840
                | || | |  | |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || | ||
Sbjct  5925124  ACACATTGCGCCTCACACAATAATAGTGGGAGACTTCAACACACCACTTTCACCAATGGA  5925065
 
Query  2841    CAGATCAACGAGACAGAAAGTCAACAAGGATACCCAGGAATTGAACTCAGCTCTGCAGCA  2900
                |||||||  || ||||||| | |||| ||| || | | || | |    ||  || | ||
Sbjct  5925064  CAGATCATGGAAACAGAAACTAAACAGGGACACACTGAAACTAACAGAAGTGATGAAACA  5925005
 
Query  2901    AGCGGACCTAATAGACATCTACAGAACTCTCCACCCCAAATCAACAGAATATACATTTTT  2960
                |  ||| || | ||| |||||||||||  |  |||| ||| ||| || |||||| || ||
Sbjct  5925004  AATGGATCTGACAGATATCTACAGAACATTTTACCCTAAAACAAAAGGATATACCTTCTT  5924945
 
Query  2961    TTCAGCACCACACCACACCTACTCCAAAATTGACCACATACTGGGAAGTAAAGCACTCCT  3020
                |||||||| ||    |||| ||||||||||||||||||| | ||    ||| ||  |||
Sbjct  5924944  CTCAGCACCTCATGGTACCTTCTCCAAAATTGACCACATAATAGGTCACAAAACAGGCCT  5924885
 
Query  3021    CAGCAAATGTAAAAGAACAGAAATTATAACAAACTATC-TCTCAGACCACAGTGCAATCA  3079
                || || ||  ||||  |  |||||| |  ||  |||| | ||||| |||  |||| | |
Sbjct  5924884  CAACAGATTCAAAAATATTGAAATTGTCCCATG-TATCCTATCAGATCACCATGCACTAA  5924826
 
Query  3080    AACTAGAACT-CAGGATTAAGA-ATCTCACTCAAAACCGCTCAACTACATGGAAACTGAA  3137
                  || || || ||  |  || | |  | ||  ||| ||  ||  ||||||||||||||
Sbjct  5924825  GGCT-GATCTTCAATAACAAAATAAATAACAGAAAGCCAA-CATTCACATGGAAACTGAA  5924768
 
Query  3138    CAACCTGCTCCTGAATGACTACTGGGTACATAACGAAATGAAGGCAGAAATAAAGTTGTT  3197
                ||||  || || |||||  || |||  |  | | ||| |||  |||||| ||    ||
Sbjct  5924767  CAACACTCTTCTCAATGATACCTTGGTCAAGGAAGGAATAAAGAAAGAAATTAAAGACTT  5924708
 
Query  3198    CTTTGAAACCAATGAGAACAAAGACACAACATACCAGAATCTCTGGGATGCATTCAAAGC  3257
                || ||    ||||| ||  ||| |||||| ||||  || || |||||  || | |||||
Sbjct  5924707  TTTAGAGTTTAATGAAAATGAAGCCACAACGTACCCAAACCTTTGGGACACAATGAAAGC  5924648
 
Query  3258    AGTGTGCAGAGGGAAATTTATAGCACTGAATGCCCACAAGAGAAAGCAGGAAAGATCCAA  3317
                | |    ||||||||| | |||||  ||| ||||  ||||| ||| | ||| ||| |  |
Sbjct  5924647  ATTTCTAAGAGGGAAACTCATAGCTATGAGTGCCTTCAAGAAAAAACGGGAGAGAGCACA  5924588
 
Query  3318    AATTGACACCCTAACATCACAATTAAAAGAACTAGAAAAGCAAGA-GCAAACACATTCAA  3376
                | |  || | | ||| ||||  ||||||  ||||||||  | || |||||  ||  |||
Sbjct  5924587  TACTAGCAGCTTGACAACACATCTAAAAGCTCTAGAAAAAAAGGAAGCAAATTCACCCAA  5924528
 
Query  3377    AAGCTAGCAGAAGGGAAGAAATAACTAAAATCAGAGCAGAACTGAAGGAAATAGAGACAC  3436
                ||  || ||| || | |||||||  ||| |||| |  ||| | ||  || | || |||
Sbjct  5924527  GAGG-AGTAGACGGCAGGAAATAATCAAACTCAGGGGTGAAATCAACCAAGTGGAAACAA  5924469
 
Query  3437    AAAAAACCCTTCAAAAAATTAATGAATCCAGGAGCTGGTTTTTTGAAAGGATAAACAAAA  3496
                || |||  |||||| ||||||  || | ||||| ||||| ||||| |  || ||||| |
Sbjct  5924468  GAAGAACTATTCAAAGAATTAACCAAACGAGGAGTTGGTTCTTTGAGAAAATCAACAAGA  5924409
 
Query  3497    TTGATAGACCGCTAGCAAGACTAA-TAAAGAAAAAAAGAGAGAAGAATCAAATAGATGCA  3555
                | |||| |||  |||| ||||| | |||||  | | | || || |  | |||  |  |
Sbjct  5924408  TAGATAAACCCTTAGCTAGACTCACTAAAGGGCACAGG-GACAAAATCCTAATTAACAAA  5924350
 
Query  3556    ATAAAAAAATGATAAAGGGGATATCACCACCAATCCCACAGAAATACAAACTACCATCAG  3615
                || | ||| ||| || || || || || ||  ||||  |||||| ||||  ||||||||
Sbjct  5924349  ATCAGAAA-TGAAAAGGGAGACATAACAACAGATCCTGAAGAAATCCAAAACACCATCAG  5924291
 
Query  3616    AGAATACTACAAACACCTCTACGCAAATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAATGGATAAATT  3675
                |  | |||||||  || ||| |||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||
Sbjct  5924290  ATCCTTCTACAAAAGGCTATACTCAACAAAACTGGAAAACCTGGACGAAATGGACAAATT  5924231
 
Query  3676    CCTGGACACATACACTCTCCCAAGACTAAACCAGGAAGAAGTTGAATCTCTGAATAGACC  3735
                ||||||| ||||    | ||||  | || |||||  |||||||  ||| || || ||
Sbjct  5924230  TCTGGACAGATACCAGGTACCAAAGTTGAATCAGGATCAAGTTGACCTTCTAAACAGTCC  5924171
 
Query  3736    AATAACAGGAGCTGAAATTGTGGCAATAATCAATAGCTTACCAACCAAAAAGAGTCCAGG  3795
                ||| |      ||||| |  ||| | || |||||  | ||| ||||||| || |||||
Sbjct  5924170  CATATCCCCTAAAGAAATAGAAGCAGTTATTAATAGTCTCCCAGCCAAAAAAAGCCCAGG  5924111
 
Query  3796    ACCAGATGGATTCACAGCCGAATTCTACCAGAGGTACAAGGAGGAACTGGTACCATTCCT  3855
                |||||| || || |  || || ||||| ||||  | ||| || || ||    ||| | ||
Sbjct  5924110  ACCAGACGGGTTTAGTGCAGAGTTCTATCAGACCTTCAAAGAAGATCTAACTCCAGTTCT  5924051
 
Query  3856    TCTGAAACTATTCCAATCAATAGAAAAAGAGGGAATCCTCCCTAACTCATTTTATGACGC  3915
                |  ||||| || ||    ||||||  ||| || || || || |||||||||||||| ||
Sbjct  5924050  GCACAAACTTTTTCACAAGATAGAAGTAGAAGGTATTCTACCCAACTCATTTTATGAAGC  5923991
 
Query  3916    CAGCATCATTCTGATACCAAAGCCAGGCAGAGACACAACAAAAAAAGAGAATTTTAGACC  3975
                ||  || | ||||||||| || |||  | |||  ||||||| | |||||| || |||||
Sbjct  5923990  CACTATTACTCTGATACCTAAACCACAGAAAGATCCAACAAAGATAGAGAACTTCAGACC  5923931
 
Query  3976    AATATCCTTGATGAACATTGAGGCAAAAATCCTCAATAAAACACTGGCAAAATGAATCCA  4035
                ||| ||  | |||||||| || ||||||||||| |||||||  || || ||  |||||||
Sbjct  5923930  AATTTCTCTTATGAACATCGATGCAAAAATCCTTAATAAAATTCTCGCTAACCGAATCCA  5923871
 
Query  4036    GCAGCACATCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAAGG  4095
                  | ||||| |||    | ||||| | ||| ||||| || || || || |||||||| ||
Sbjct  5923870  AGAACACATTAAAGCAATCATCCATCCTGACCAAGTAGGTTTTATTCCAGGGATGCAGGG  5923811
 
Query  4096    CTGGTTCAATATACGCAAATCAATAAATGTAATCCAGCATAAAAACAGAGCCAAAGACAA  4155
                ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  ||| ||||| |  |||||||||
Sbjct  5923810  ATGGTTTAATATACGAAAATCCATCAATGTAATCCATTATATAAACAAACTCAAAGACAA  5923751
 
Query  4156    AAACCACATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAAGCCTTTGACAAAATTCAACAACCCTT  4215
                |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||
Sbjct  5923750  AAACCACATGATCATCTCGTTAGATGCAGAAAAAGCATTTGACAAGATCCAACACCCATT  5923691
 
Query  4216    CATGCTAAAAACTCTCAATAAATTAGGTATTGATGGGACGTATTTCAAAATAATAAGAGC  4275
                |||| |||||  |||  | | || ||| ||| | ||    ||  | || || |||| |||
Sbjct  5923690  CATGATAAAAGTTCTGGAAAGATCAGGAATTCAAGGCCAATACCTAAACATGATAAAAGC  5923631
 
Query  4276    TATCTATGACAAACCCACAGCCAATATCATACTGAATGGGCAAAAACTGGAAGCATTCTC  4335
                |||||  ||||||  |||||| |||| | | |||||  | || ||||||||| || |
Sbjct  5923630  AATCTACAGCAAACCAGTAGCCAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCC  5923571
 
Query  4336    TTTGAAAACTGGCACAAGACAGGGATGCCCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTGTT  4395
                  | ||| | || || ||||| || ||||| || || ||  ||| |||||||||||  |
Sbjct  5923570  ACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGTACT  5923511
 
Query  4396    GGAAGTTCTGGCCAGGGCAATTAGGCAGGAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGAAA  4455
                |||||  | ||||| |||||| | ||  | ||||| || ||||| || ||| | |||||
Sbjct  5923510  TGAAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACAAATTGGAAA  5923451
 
Query  4456    AGAGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCAGACGACATGATTGTATATCTAGAAAACCCCAT  4515
                ||||||||||||| | || || |||||||| || ||||| |||||| ||    |||| |
Sbjct  5923450  AGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAA  5923391
 
Query  4516    TGTCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAA  4575
                    ||  |  | | ||||| ||  |||||| || |||| |  ||||  | ||||| ||
Sbjct  5923390  AAATTCCAACAGAGAACTCCTAAACTTGATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGGATATAA  5923331
 
Query  4576    AATCAATGTACAAAAATCACAAGCATTCTTATACACCAACAACAGACAAACAGAGAGCCA  4635
                ||| ||  | | || |||  || ||  | ||||| || || | |||  | ||||  |
Sbjct  5923330  AATTAACTCAAACAAGTCAATGGCCTTTCTCTACACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGA  5923271
 
Query  4636    AATCA-TGAGTGAACTCCCATTCACAATTGCTTCAAAGAGAATAAAATACCTAGGAATCC  4694
                ||| |  ||  ||| ||| ||| |||| ||  |||| |  |||||||| || ||  | 
Sbjct  5923270  AATTAGGGAAACAACACCC-TTCTCAATAGCCACAAATAATATAAAATATCTCGGCGTGA  5923212
 
Query  4695    AACTTACAAGGGATGTGAAGGGCCTCTTCAAGGAGAACTACAAACCTCTGCTCAAGGAAA  4754
                  || || | ||| ||||| |  || |  |  | |||| |||  | |||  || ||||
Sbjct  5923211  CTCTAACGAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAGTCCCTGAAGAAAGAAA  5923152
 
Query  4755    TAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAATA  4814
                | ||||| |||  |  | ||||||  |  | |||||||||||| | || || | ||| |
Sbjct  5923151  TTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGACCAACA  5923092
 
Query  4815    TCGTGAAAATGGCCATACTCCTCAAGGTAATTTACAGATTCAATGCCATCCCCATCAAGC  4874
                | || |||||||| ||  | |  || | ||| |||||||||||||| |||||||| || 
Sbjct  5923091  TTGTAAAAATGGCTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATTAAAA  5923032
 
Query  4875    TACCAATGACTTTCTTCACAGAACTGGAAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAA  4934
                | ||||    |||||||  ||| | |||  | | | ||  || ||||| |||||  | |
Sbjct  5923031  TTCCAACTCAATTCTTCAACGAATTAGAAGGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAATAACA  5922972
 
Query  4935    AGAGAGCCCACATCGCCAAGTCAATCCT--AAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCAC  4992
                | | | |    || || ||  |  | ||  | |  ||||||||    |||| || |||||
Sbjct  5922971  AAAAACCGAGGATAGCAAAAACTCTTCTCAAGGATAAAAGAAC--CTCTGGTGGAATCAC  5922914
 
Query  4993    ACTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGGTA  5052
                  | |||||| | || || |||||||  || |  || |  ||||| ||||||||||||||
Sbjct  5922913  CATGCCTGACCTAAAGCTTTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGGTA  5922854
 
Query  5053    CCAAAACAGAGATATTGATCAATGGAACAGAACAGGGCCCTCAGAAATAACGCCGCATAT  5112
                  | ||||| |  | || |||||||| ||||  |    | ||||||| |  || || |
Sbjct  5922853  TAGAGACAGACAAGTGGACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACACAC  5922794
 
Query  5113    CTACAACTATCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCT  5172
                |||    |  ||||||| |||||    | ||||| ||  || |||  || ||  | |
Sbjct  5922793  CTATGGTCACTTGATCTTCGACAAGGGAGCCAAAACCATCCAGTGGAAGAAAGACAGCAT  5922734
 
Query  5173    ATTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCAT-ATGTAGAAAGCTGAAACTGGATC  5231
                || || || ||||||||| | |||||| | |  || ||||||||  ||  | | ||||
Sbjct  5922733  TTTCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGG-TTGTTATCATGTAGAAGAATGCGAATCGATC  5922675
 
Query  5232    CCTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTTAGAC  5291
                | | | |  | |||| ||| ||  |||| || |  ||||| || ||  |  || | | ||
Sbjct  5922674  CATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAAGGAACTTCACATAAAAC  5922615
 
Query  5292    CTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACGTAGGCATTACCATTCAGGACATAGGCATGG  5351
                |  | ||  | |||    |||| || || || || |  | | || | || || ||||  |
Sbjct  5922614  CAGAGACACTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTTGAAGATATGGGCACAG  5922555
 
Query  5352    GCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGACAAAATTGACAAAT  5411
                |  |  | ||| ||  | |||| |||  ||    ||  || |  | |||||||||||
Sbjct  5922554  GGGAAAAATTCCTGAACAGAACAGCAATGGCTTGTGCTGTAAGATCGAGAATTGACAAAT  5922495
 
Query  5412    GGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACT-ACCATCAGAGTGAAC  5470
                |||| ||||| |||||  | || |||||||  |||||||| |||  | || |||  ||
Sbjct  5922494  GGGACCTAATGAAACTCCAAAGTTTCTGCAAGGCAAAAGACACTGTCTATAAGA-CAAAA  5922436
 
Query  5471    AGGCAACCTACAAAATGGGAGAAAATTTTTGC--AACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAA  5528
                || | ||| ||| | ||||| |  || ||| |  | ||||  ||| || |  || ||||
Sbjct  5922435  AGACCACCAACAGACTGGGAAAGGATCTTTACCTATCCTA--AATCAGATAGGGGACTAA  5922378
 
Query  5529    TATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAATTTACAAGAAAAAAACAAACAACCCCATCA  5588
                ||||||  || || || ||||||||  |  |  ||  | |||| |||| |||||| | |
Sbjct  5922377  TATCCAACATATATAAAGAACTCAAGAAGGTGGACCTCAGAAAATCAAATAACCCCCTTA  5922318
 
Query  5589    AAAAGTGGGTGAAGGACATGAACAGACACTTCTCA---AAAGAAGACATTTATGCAGCCA  5645
                |||| ||||    ||  |||||| | | ||||||    | ||| ||    |||  || 
Sbjct  5922317  AAAAATGGGGCTCAGAACTGAACAAAGAATTCTCACCTGAGGAATAC-CGAATG--GCAG  5922261
 
Query  5646    ACAGACACATGAAAAAATGCTCATCATCACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCA  5705
                | |  ||| |||||||||| ||| ||||  |  |||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct  5922260  AGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAA  5922201
 
Query  5706    CAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGCGATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACA  5765
                |  |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |  || ||||| |||||  ||| ||
Sbjct  5922200  CCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTGAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCA  5922141
 
Query  5766    GGTGCTGGAGAGGATGTGGAGAAATAGGAACATTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAAC  5825
                | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |  | || ||||||||||| || |  |
Sbjct  5922140  GATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGC  5922081
 
Query  5826    TAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAGAACTGGAAATAC  5885
                | || |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||  |  | ||  | | | |||
Sbjct  5922080  TTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTAC  5922021
 
Query  5886    CATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCATGCTGCT  5945
                |    || ||||| || ||  | ||||| ||||| ||| | ||    |  |  ||| |
Sbjct  5922020  CGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGA----AGCCCCAACTGGT  5921965
 
Query  5946    -ATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTGG  6004
                | || ||||||||| |  |||||| || || || ||||| | |||||| |  |  |||
Sbjct  5921964  AAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAACTGG  5921905
 
Query  6005    AACCAACCCAAATGTCTAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACC  6064
                ||  |||||| ||| |  |||    || |||||  ||||||||||| |||| |||||
Sbjct  5921904  AAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACA  5921845
 
Query  6065    ATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATG  6124
                ||||| |||||  |||| || |||||  |||| || |||  ||  |||  | |||||||
Sbjct  5921844  ATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATG  5921785
 
Query  6125    AAATTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATA  6184
                |  |||| | |||||| || ||| |  || | |||  |||||  | |  ||||  ||
Sbjct  5921784  GACCTGGAGAGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACAATCACAAAGGAACTCACACAATATG  5921725
 
Query  6185    TTCTCACTCATAGGTGG  6201
                | |||||| ||| ||||
Sbjct  5921724  TACTCACTGATAAGTGG  5921708
 
 
Features flanking this part of subject sequence:
  641758 bp at 5' side: hypothetical protein
  173772 bp at 3' side: hypothetical protein LOC66928
 
 
Score = 1370 bits (1518),  Expect = 0.0
Identities = 2605/3797 (68%), Gaps = 45/3797 (1%)
Strand=Plus/Plus
 
Query  2425      AATGGACTAAATGCTCCAATTAAAAGACACAGACTAGCAAATTGGATAAAGAGTCAAGAC  2484
                ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| || | |  ||||||
Sbjct  14374681  AATGGTCTCAACTCGCCAATAAAAAGACATAGACTAACAAACTGGCTACACAAACAAGAC  14374740
 
Query  2485      CCATCAGTGTGCTGTATTCAGGAAACCCATCTCACATGCAGAGACACACATAGGCTCAAA  2544
                ||| || | |||||  | |||||||| ||||||| |  | ||| | |||    |||| |
Sbjct  14374741  CCAACATTTTGCTGCTTACAGGAAACTCATCTCAGAGAAAAAGATAGACACTACCTCAGA  14374800
 
Query  2545      ATAAAGGGATGGAGGAAGATCTACCAAGCAAACGGAAAACAAAAAAAGGCAGGGGTTGCA  2604
                || || || ||||  |  || | ||||||||| || |  | ||| | ||||| || ||
Sbjct  14374801  ATGAAAGGCTGGAAAACAATTTTCCAAGCAAATGGTATGAAGAAACAAGCAGGAGTAGCC  14374860
 
Query  2605      ATCCTAGTCTCTGATAAAACAGACTTTAAACCAACAAAG--ATCAAAAGAGACAAAGAAG  2662
                |||||| | |||||||| |  |||||  ||||  |||||  ||||||| |||||| || |
Sbjct  14374861  ATCCTAATATCTGATAAGATTGACTTCCAACC--CAAAGTCATCAAAAAAGACAAGGAGG  14374918
 
Query  2663      GCCATTACATAATGGTAAAGGGATCAATTCAACAAGAAGAGCTAACTATCCTAAATATAT  2722
                | || | |||  |  | || ||  ||| |  ||||| || ||  | || || ||||| |
Sbjct  14374919  GACACTTCATTCTCATCAAAGGTAAAATCCTCCAAGAGGAACTCTCAATTCTGAATATCT  14374978
 
Query  2723      ATGCACCCAATACAGGAGCACCAAGATTCA-TAAAGCAAGTCCTGAGTGACCTACAAAG-  2780
                |||| || |||||| ||||| | | ||||| ||||| || |  | ||| |    |||||
Sbjct  14374979  ATGCTCCAAATACAAGAGCAGCCACATTCACTAAAGAAACT--TTAGTAAAGCTCAAAGC  14375036
 
Query  2781      AGACTTAGACTCCCACACATTAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAACATTAGA  2840
                | || | |  | |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || | ||
Sbjct  14375037  ACACATTGCGCCTCACACAATAATAGTGGGAGACTTCAACACACCACTTTCACCAATGGA  14375096
 
Query  2841      CAGATCAACGAGACAGAAAGTCAACAAGGATACCCAGGAATTGAACTCAGCTCTGCAGCA  2900
                |||||||  || ||||||| | |||| ||| || | | || | |    ||  || | ||
Sbjct  14375097  CAGATCATGGAAACAGAAACTAAACAGGGACACACTGAAACTAACAGAAGTGATGAAACA  14375156
 
Query  2901      AGCGGACCTAATAGACATCTACAGAACTCTCCACCCCAAATCAACAGAATATACATTTTT  2960
                |  ||| || | ||| |||||||||||  |  |||| ||| ||| || |||||| || ||
Sbjct  14375157  AATGGATCTGACAGATATCTACAGAACATTTTACCCTAAAACAAAAGGATATACCTTCTT  14375216
 
Query  2961      TTCAGCACCACACCACACCTACTCCAAAATTGACCACATACTGGGAAGTAAAGCACTCCT  3020
                  |||||||| ||    |||| ||||||||||||||||||| | ||    ||| ||  |||
Sbjct  14375217  CTCAGCACCTCATGGTACCTTCTCCAAAATTGACCACATAATAGGTCACAAATCAGGCCT  14375276
 
Query  3021      CAGCAAATGTAAAAGAACAGAAATTATAACAAACTATC-TCTCAGACCACAGTGCAATCA  3079
                || || ||  ||||  |  |||||| |  ||  |||| | ||||| |||  |||| | |
Sbjct  14375277  CAACAGATTCAAAAATATTGAAATTGTCCCATG-TATCCTATCAGATCACCATGCACTAA  14375335
 
Query  3080      AACTAGAACT-CAGGATTAAGA-ATCTCACTCAAAACCGCTCAACTACATGGAAACTGAA  3137
                  || || || ||  |  || | |  | ||  ||| ||  ||  ||||||||||||||
Sbjct  14375336  GGCT-GATCTTCAATAACAAAATAAATAACAGAAAGCCAA-CATTCACATGGAAACTGAA  14375393
 
Query  3138      CAACCTGCTCCTGAATGACTACTGGGTACATAACGAAATGAAGGCAGAAATAAAGTTGTT  3197
                ||||  || || |||||  || |||  |  | | ||| |||  | || |||||  ||
Sbjct  14375394  CAACACTCTTCTCAATGATACCTTGGTCAAGGAAGGAATAAAGAAAAAATTAAAGACTTT  14375453
 
Query  3198      CTTTGAAACCAATGAGAACAAAGACACAACATACCAGAATCTCTGGGATGCATTCAAAGC  3257
                  || ||    ||||| ||  ||| |||||| ||||  || || |||||  || | |||||
Sbjct  14375454  -TTAGAGTTTAATGAAAATGAAGCCACAACGTACCCAAACCTTTGGGACACAATGAAAGC  14375512
 
Query  3258      AGTGTGCAGAGGGAAATTTATAGCACTGAATGCCCACAAGAGAAAGCAGGAAAGATCCAA  3317
                | |    ||||||||| | |||||  ||| ||||  ||||| ||| | ||| ||| |  |
Sbjct  14375513  ATTTCTAAGAGGGAAACTCATAGCTATGAGTGCCTTCAAGAAAAAACGGGAGAGAGCACA  14375572
 
Query  3318      AATTGACACCCTAACATCACAATTAAAAGAACTAGAAAAGCAAGA-GCAAACACATTCAA  3376
                  | |  || | | ||| ||||  ||||||  ||||||||  | || |||||  ||  |||
Sbjct  14375573  TACTAGCAGCTTGACAACACATCTAAAAGCTCTAGAAAAAAAGGAAGCAAATTCACCCAA  14375632
 
Query  3377      AAGCTAGCAGAAGGGAAGAAATAACTAAAATCAGAGCAGAACTGAAGGAAATAGAGACAC  3436
                  ||  || ||| || | |||||||  ||| |||| |  ||| | ||  || | || |||
Sbjct  14375633  GAGG-AGTAGACGGCAGGAAATAATCAAACTCAGGGGTGAAATCAACCAAGTGGAAACAA  14375691
 
Query  3437      AAAAAACCCTTCAAAAAATTAATGAATCCAGGAGCTGGTTTTTTGAAAGGATAAACAAAA  3496
                  || |||  |||||| ||||||  || | ||||| ||||| ||||| |  || ||||| |
Sbjct  14375692  GAAGAACTATTCAAAGAATTAACCAAACGAGGAGTTGGTTCTTTGAGAAAATCAACAAGA  14375751
 
Query  3497      TTGATAGACCGCTAGCAAGACTAA-TAAAGAAAAAAAGAGAGAAGAATCAAATAGATGCA  3555
                | |||| |||  |||| ||||| | |||||  | | | || || |  | |||  |  |
Sbjct  14375752  TAGATAAACCCTTAGCTAGACTCACTAAAGGGCACAGG-GACAAAATCCTAATTAACAAA  14375810
 
Query  3556      ATAAAAAAATGATAAAGGGGATATCACCACCAATCCCACAGAAATACAAACTACCATCAG  3615
                || | ||| ||| || || || || || ||  ||||  |||||| ||||  ||||||||
Sbjct  14375811  ATCAGAAA-TGAAAAGGGAGACATAACAACAGATCCTGAAGAAATCCAAAACACCATCAG  14375869
 
Query  3616      AGAATACTACAAACACCTCTACGCAAATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAATGGATAAATT  3675
                |  | |||||||  || ||| |||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||
Sbjct  14375870  ATCCTTCTACAAAAGGCTATACTCAACAAAACTGGAAAACCTGGACGAAATGGACAAATT  14375929
 
Query  3676      CCTGGACACATACACTCTCCCAAGACTAAACCAGGAAGAAGTTGAATCTCTGAATAGACC  3735
                  ||||||| ||||    | ||||  | || |||||  |||||||  ||| || || ||
Sbjct  14375930  TCTGGACAGATACCAGGTACCAAAGTTGAATCAGGATCAAGTTGACCTTCTAAACAGTCC  14375989
 
Query  3736      AATAACAGGAGCTGAAATTGTGGCAATAATCAATAGCTTACCAACCAAAAAGAGTCCAGG  3795
                  ||| |      ||||| |  ||| | || |||||  | ||| ||||||| || |||||
Sbjct  14375990  CATATCCCCTAAAGAAATAGAAGCAGTTATTAATAGTCTCCCAGCCAAAAAAAGCCCAGG  14376049
 
Query  3796      ACCAGATGGATTCACAGCCGAATTCTACCAGAGGTACAAGGAGGAACTGGTACCATTCCT  3855
                |||||| || || |  || || ||||| ||||  | ||| || || ||    ||| | ||
Sbjct  14376050  ACCAGACGGGTTTAGTGCAGAGTTCTATCAGACCTTCAAAGAAGATCTAACTCCAGTTCT  14376109
 
Query  3856      TCTGAAACTATTCCAATCAATAGAAAAAGAGGGAATCCTCCCTAACTCATTTTATGACGC  3915
                  |  ||||| || ||    ||||||  ||| || || || || |||||||||||||| ||
Sbjct  14376110  GCACAAACTTTTTCACAAGATAGAAGTAGAAGGTATTCTACCCAACTCATTTTATGAAGC  14376169
 
Query  3916      CAGCATCATTCTGATACCAAAGCCAGGCAGAGACACAACAAAAAAAGAGAATTTTAGACC  3975
                ||  || | ||||||||| || |||  | |||  ||||||| | |||||| || |||||
Sbjct  14376170  CACTATTACTCTGATACCTAAACCACAGAAAGATCCAACAAAGATAGAGAACTTCAGACC  14376229
 
Query  3976      AATATCCTTGATGAACATTGAGGCAAAAATCCTCAATAAAACACTGGCAAAATGAATCCA  4035
                ||| ||  | |||||||| || ||||||||||| |||||||  || || ||  |||||||
Sbjct  14376230  AATTTCTCTTATGAACATCGATGCAAAAATCCTTAATAAAATTCTCGCTAACCGAATCCA  14376289
 
Query  4036      GCAGCACATCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAAGG  4095
                  | ||||| |||    | ||||| | ||| ||||| || || || || |||||||| ||
Sbjct  14376290  AGAACACATTAAAGCAATCATCCATCCTGACCAAGTAGGTTTTATTCCAGGGATGCAGGG  14376349
 
Query  4096      CTGGTTCAATATACGCAAATCAATAAATGTAATCCAGCATAAAAACAGAGCCAAAGACAA  4155
                  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  ||| ||||| |  |||||||||
Sbjct  14376350  ATGGTTTAATATACGAAAATCCATCAATGTAATCCATTATATAAACAAACTCAAAGACAA  14376409
 
Query  4156      AAACCACATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAAGCCTTTGACAAAATTCAACAACCCTT  4215
                |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||
Sbjct  14376410  AAACCACATGATCATCTCGTTAGATGCAGAAAAAGCATTTGACAAGATCCAACACCCATT  14376469
 
Query  4216      CATGCTAAAAACTCTCAATAAATTAGGTATTGATGGGACGTATTTCAAAATAATAAGAGC  4275
                |||| |||||  |||  | | || ||| ||| | ||    ||  | || || |||| |||
Sbjct  14376470  CATGATAAAAGTTCTGGAAAGATCAGGAATTCAAGGCCAATACCTAAACATGATAAAAGC  14376529
 
Query  4276      TATCTATGACAAACCCACAGCCAATATCATACTGAATGGGCAAAAACTGGAAGCATTCTC  4335
                  |||||  ||||||  |||||| |||| | | |||||  | || ||||||||| || |
Sbjct  14376530  AATCTACAGCAAACCAGTAGCCAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCC  14376589
 
Query  4336      TTTGAAAACTGGCACAAGACAGGGATGCCCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTGTT  4395
                  | ||| | || || ||||| || ||||| || || ||  ||| |||||||||||  |
Sbjct  14376590  ACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGTACT  14376649
 
Query  4396      GGAAGTTCTGGCCAGGGCAATTAGGCAGGAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGAAA  4455
                  |||||  | ||||| |||||| | ||  | ||||| || ||||| || ||| | |||||
Sbjct  14376650  TGAAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACAAATTGGAAA  14376709
 
Query  4456      AGAGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCAGACGACATGATTGTATATCTAGAAAACCCCAT  4515
                ||||||||||||| | || || |||||||| || ||||| |||||| ||    |||| |
Sbjct  14376710  AGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAA  14376769
 
Query  4516      TGTCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAA  4575
                    ||  |  | | ||||| || ||||||| || |||| |  ||||  | ||||| ||
Sbjct  14376770  AAATTCCAACAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGGATATAA  14376829
 
Query  4576      AATCAATGTACAAAAATCACAAGCATTCTTATACACCAACAACAGACAAACAGAGAGCCA  4635
                ||| ||  | | || |||  || ||  | ||||| || || | |||  | ||||  |
Sbjct  14376830  AATTAACTCAAACAAGTCAATGGCCTTTCTCTACACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGA  14376889
 
Query  4636      AATCA-TGAGTGAACTCCCATTCACAATTGCTTCAAAGAGAATAAAATACCTAGGAATCC  4694
                ||| |  ||  ||| ||| ||| |||| ||  |||| |  |||||||| || ||  | 
Sbjct  14376890  AATTAGGGAAACAACACCC-TTCTCAATAGCCACAAATAATATAAAATATCTCGGCGTGA  14376948
 
Query  4695      AACTTACAAGGGATGTGAAGGGCCTCTTCAAGGAGAACTACAAACCTCTGCTCAAGGAAA  4754
                  || || | ||| ||||| |  || |  |  | |||| |||  | |||  || ||||
Sbjct  14376949  CTCTAACGAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAGTCCCTGAAGAAAGAAA  14377008
 
Query  4755      TAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAATA  4814
                | ||||| |||  |  | ||||||  |  | |||||||||||| | || || | ||| |
Sbjct  14377009  TTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGACCAACA  14377068
 
Query  4815      TCGTGAAAATGGCCATACTCCTCAAGGTAATTTACAGATTCAATGCCATCCCCATCAAGC  4874
                | || |||||||| ||  | |  || | ||| |||||||||||||| |||||||| || 
Sbjct  14377069  TTGTAAAAATGGCTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATTAAAA  14377128
 
Query  4875      TACCAATGACTTTCTTCACAGAACTGGAAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAA  4934
                | ||||    |||||||  ||| | |||  | | | ||  || ||||| |||||  | |
Sbjct  14377129  TTCCAACTCAATTCTTCAACGAATTAGAAGGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAATAACA  14377188
 
Query  4935      AGAGAGCCCACATCGCCAAGTCAATCCT--AAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCAC  4992
                | | | |    || || ||  |  | ||  | |  ||||||||    |||| || |||||
Sbjct  14377189  AAAAACCGAGGATAGCAAAAACTCTTCTCAAGGATAAAAGAAC--CTCTGGTGGAATCAC  14377246
 
Query  4993      ACTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGGTA  5052
                  | |||||| | || || |||||||  || |  || |  ||||| ||||||||||||||
Sbjct  14377247  CATGCCTGACCTAAAGCTTTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGGTA  14377306
 
Query  5053      CCAAAACAGAGATATTGATCAATGGAACAGAACAGGGCCCTCAGAAATAACGCCGCATAT  5112
                    | ||||| |  | || |||||||| ||||  |    | ||||||| |  || || |
Sbjct  14377307  TAGAGACAGACAAGTGGACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACACAC  14377366
 
Query  5113      CTACAACTATCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCT  5172
                |||    |  ||||||| |||||    | ||||| ||  || |||  || ||  | |
Sbjct  14377367  CTATGGTCACTTGATCTTCGACAAGGGAGCCAAAACCATCCAGTGGAAGAAAGACAGCAT  14377426
 
Query  5173      ATTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCAT-ATGTAGAAAGCTGAAACTGGATC  5231
                  || || || ||||||||| | |||||| | |  || ||||||||  ||  | | ||||
Sbjct  14377427  TTTCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGG-TTGTTATCATGTAGAAGAATGCGAATCGATC  14377485
 
Query  5232      CCTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTTAGAC  5291
                | | | |  | |||| ||| ||  |||| || |  ||||| || ||  |  || | | ||
Sbjct  14377486  CATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAAGGAACTTCACATAAAAC  14377545
 
Query  5292      CTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACGTAGGCATTACCATTCAGGACATAGGCATGG  5351
                |  | ||  | |||    |||| || || || || |  | | || | || || ||||  |
Sbjct  14377546  CAGAGACACTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTTGAAGATATGGGCACAG  14377605
 
Query  5352      GCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGACAAAATTGACAAAT  5411
                |  |  | ||| ||  | |||| |||  ||    ||  || |  | |||||||||||
Sbjct  14377606  GGGAAAAATTCCTGAACAGAACAGCAATGGCTTGTGCTGTAAGATCGAGAATTGACAAAT  14377665
 
Query  5412      GGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACT-ACCATCAGAGTGAAC  5470
                |||| ||||| |||||  | || |||||||  |||||||| |||  | || |||  ||
Sbjct  14377666  GGGACCTAATGAAACTCCAAAGTTTCTGCAAGGCAAAAGACACTGTCTATAAGA-CAAAA  14377724
 
Query  5471      AGGCAACCTACAAAATGGGAGAAAATTTTTGC--AACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAA  5528
                || | ||| ||| | ||||| |  || ||| |  | ||||  ||| || |  || ||||
Sbjct  14377725  AGACCACCAACAGACTGGGAAAGGATCTTTACCTATCCTA--AATCAGATAGGGGACTAA  14377782
 
Query  5529      TATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAATTTACAAGAAAAAAACAAACAACCCCATCA  5588
                ||||||  || || || ||||||||  |  |  ||  | |||| |||| |||||| | |
Sbjct  14377783  TATCCAACATATATAAAGAACTCAAGAAGGTGGACCTCAGAAAATCAAATAACCCCCTTA  14377842
 
Query  5589      AAAAGTGGGTGAAGGACATGAACAGACACTTCTCA---AAAGAAGACATTTATGCAGCCA  5645
                |||| ||||    ||  |||||| | | ||||||    | ||| ||    |||  || 
Sbjct  14377843  AAAAATGGGGCTCAGAACTGAACAAAGAATTCTCACCTGAGGAATAC-CGAATG--GCAG  14377899
 
Query  5646      ACAGACACATGAAAAAATGCTCATCATCACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCA  5705
                | |  ||| |||||||||| ||| ||||  |  |||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct  14377900  AGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAA  14377959
 
Query  5706      CAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGCGATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACA  5765
                |  |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |  || ||||| |||||  ||| ||
Sbjct  14377960  CCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTGAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCA  14378019
 
Query  5766      GGTGCTGGAGAGGATGTGGAGAAATAGGAACATTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAAC  5825
                | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |  | || ||||||||||| || |  |
Sbjct  14378020  GATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGC  14378079
 
Query  5826      TAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAGAACTGGAAATAC  5885
                | || |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||  |  | ||  | | | |||
Sbjct  14378080  TTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTAC  14378139
 
Query  5886      CATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCATGCTGCT  5945
                |    || ||||| || ||  | ||||| ||||| ||| | ||    |  |  ||| |
Sbjct  14378140  CGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGA----AGCCCCAACTGGT  14378195
 
Query  5946      -ATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTGG  6004
                  | || ||||||||| |  |||||| || || || ||||| | |||||| |  |  |||
Sbjct  14378196  AAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAACTGG  14378255
 
Query  6005      AACCAACCCAAATGTCTAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACC  6064
                ||  |||||| ||| |  |||    || |||||  ||||||||||| |||| |||||
Sbjct  14378256  AAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACA  14378315
 
Query  6065      ATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATG  6124
                ||||| |||||  |||| || |||||  |||| || |||  ||  |||  | |||||||
Sbjct  14378316  ATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATG  14378375
 
Query  6125      AAATTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATA  6184
                  |  |||| | |||||| || ||| |  || | |||  |||||  | |  ||||  ||
Sbjct  14378376  GACCTGGAGAGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACAATCACAAAGGAACTCACACAATATG  14378435
 
Query  6185      TTCTCACTCATAGGTGG  6201
                | |||||| ||| ||||
Sbjct  14378436  TACTCACTGATAAGTGG  14378452
 
 
Features flanking this part of subject sequence:
  647409 bp at 5' side: hypothetical protein LOC66928
  15526 bp at 3' side: protein tyrosine phosphatase, receptor type, D isoform B
 
 
Score = 1370 bits (1518),  Expect = 0.0
Identities = 2604/3797 (68%), Gaps = 44/3797 (1%)
Strand=Plus/Minus
 
Query  2425      AATGGACTAAATGCTCCAATTAAAAGACACAGACTAGCAAATTGGATAAAGAGTCAAGAC  2484
                ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| || | |  ||||||
Sbjct  15203951  AATGGTCTCAACTCGCCAATAAAAAGACATAGACTAACAAACTGGCTACACAAACAAGAC  15203892
 
Query  2485      CCATCAGTGTGCTGTATTCAGGAAACCCATCTCACATGCAGAGACACACATAGGCTCAAA  2544
                ||| || | |||||  | |||||||| ||||||| |  | ||| | |||    |||| |
Sbjct  15203891  CCAACATTTTGCTGCTTACAGGAAACTCATCTCAGAGAAAAAGATAGACACTACCTCAGA  15203832
 
Query  2545      ATAAAGGGATGGAGGAAGATCTACCAAGCAAACGGAAAACAAAAAAAGGCAGGGGTTGCA  2604
                || || || ||||  |  || | ||||||||| || |  | ||| | ||||| || ||
Sbjct  15203831  ATGAAAGGCTGGAAAACAATTTTCCAAGCAAATGGTATGAAGAAACAAGCAGGAGTAGCC  15203772
 
Query  2605      ATCCTAGTCTCTGATAAAACAGACTTTAAACCAACAAAG--ATCAAAAGAGACAAAGAAG  2662
                |||||| | |||||||| |  |||||  ||||  |||||  ||||||| |||||| || |
Sbjct  15203771  ATCCTAATATCTGATAAGATTGACTTCCAACC--CAAAGTCATCAAAAAAGACAAGGAGG  15203714
 
Query  2663      GCCATTACATAATGGTAAAGGGATCAATTCAACAAGAAGAGCTAACTATCCTAAATATAT  2722
                | || | |||  |  | || ||  ||| |  ||||| || ||  | || || ||||| |
Sbjct  15203713  GACACTTCATTCTCATCAAAGGTAAAATCCTCCAAGAGGAACTCTCAATTCTGAATATCT  15203654
 
Query  2723      ATGCACCCAATACAGGAGCACCAAGATTCA-TAAAGCAAGTCCTGAGTGACCTACAAAG-  2780
                |||| || |||||| ||||| | | ||||| ||||| || |  | ||| |    |||||
Sbjct  15203653  ATGCTCCAAATACAAGAGCAGCCACATTCACTAAAGAAACT--TTAGTAAAGCTCAAAGC  15203596
 
Query  2781      AGACTTAGACTCCCACACATTAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAACATTAGA  2840
                | || | |  | |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || | ||
Sbjct  15203595  ACACATTGCGCCTCACACAATAATAGTGGGAGACTTCAACACACCACTTTCACCAATGGA  15203536
 
Query  2841      CAGATCAACGAGACAGAAAGTCAACAAGGATACCCAGGAATTGAACTCAGCTCTGCAGCA  2900
                |||||||  || ||||||| | |||| ||| || | | || | |    ||  || | ||
Sbjct  15203535  CAGATCATGGAAACAGAAACTAAACAGGGACACACTGAAACTAACAGAAGTGATGAAACA  15203476
 
Query  2901      AGCGGACCTAATAGACATCTACAGAACTCTCCACCCCAAATCAACAGAATATACATTTTT  2960
                |  ||| || | ||| |||||||||||  |  |||| ||| ||| || |||||| || ||
Sbjct  15203475  AATGGATCTGACAGATATCTACAGAACATTTTACCCTAAAACAAAAGGATATACCTTCTT  15203416
 
Query  2961      TTCAGCACCACACCACACCTACTCCAAAATTGACCACATACTGGGAAGTAAAGCACTCCT  3020
                  |||||||| ||    |||| ||||||||||||||||||| | ||    ||| ||  |||
Sbjct  15203415  CTCAGCACCTCATGGTACCTTCTCCAAAATTGACCACATAATAGGTCACAAATCAGGCCT  15203356
 
Query  3021      CAGCAAATGTAAAAGAACAGAAATTATAACAAACTATC-TCTCAGACCACAGTGCAATCA  3079
                || || ||  ||||  |  |||||| |  ||  |||| | ||||| |||  |||| | |
Sbjct  15203355  CAACAGATTCAAAAATATTGAAATTGTCCCATG-TATCCTATCAGATCACCATGCACTAA  15203297
 
Query  3080      AACTAGAACT-CAGGATTAAGA-ATCTCACTCAAAACCGCTCAACTACATGGAAACTGAA  3137
                  || || || ||  |  || | |  | ||  ||| ||  ||  ||||||||||||||
Sbjct  15203296  GGCT-GATCTTCAATAACAAAATAAATAACAGAAAGCCAA-CATTCACATGGAAACTGAA  15203239
 
Query  3138      CAACCTGCTCCTGAATGACTACTGGGTACATAACGAAATGAAGGCAGAAATAAAGTTGTT  3197
                ||||  || || |||||  || |||  |  | | ||| |||  |||||| ||    ||
Sbjct  15203238  CAACACTCTTCTCAATGATACCTTGGTCAAGGAAGGAATAAAGAAAGAAATTAAAGACTT  15203179
 
Query  3198      CTTTGAAACCAATGAGAACAAAGACACAACATACCAGAATCTCTGGGATGCATTCAAAGC  3257
                  || ||    ||||| ||  ||| |||||| ||||  || || |||||  || | |||||
Sbjct  15203178  TTTAGAGTTTAATGAAAATGAAGCCACAACGTACCCAAACCTTTGGGACACAATGAAAGC  15203119
 
Query  3258      AGTGTGCAGAGGGAAATTTATAGCACTGAATGCCCACAAGAGAAAGCAGGAAAGATCCAA  3317
                | |    ||||||||| | |||||  ||| ||||  ||||| ||| | ||| ||| |  |
Sbjct  15203118  ATTTCTAAGAGGGAAACTCATAGCTATGAGTGCCTTCAAGAAAAAACGGGAGAGAGCACA  15203059
 
Query  3318      AATTGACACCCTAACATCACAATTAAAAGAACTAGAAAAGCAAGA-GCAAACACATTCAA  3376
                  | |  || | | ||| ||||  ||||||  ||||||||  | || |||||  ||  |||
Sbjct  15203058  TACTAGCAGCTTGACAACACATCTAAAAGCTCTAGAAAAAAAGGAAGCAAATTCACCCAA  15202999
 
Query  3377      AAGCTAGCAGAAGGGAAGAAATAACTAAAATCAGAGCAGAACTGAAGGAAATAGAGACAC  3436
                  ||  || ||| || | |||||||  ||| |||| |  ||| | ||  || | || |||
Sbjct  15202998  GAGG-AGTAGACGGCAGGAAATAATCAAACTCAGGGGTGAAATCAACCAAGTGGAAACAA  15202940
 
Query  3437      AAAAAACCCTTCAAAAAATTAATGAATCCAGGAGCTGGTTTTTTGAAAGGATAAACAAAA  3496
                  || |||  |||||| ||||||  || | ||||| ||||| ||||| |  || ||||| |
Sbjct  15202939  GAAGAACTATTCAAAGAATTAACCAAACGAGGAGTTGGTTCTTTGAGAAAATCAACAAGA  15202880
 
Query  3497      TTGATAGACCGCTAGCAAGACTAA-TAAAGAAAAAAAGAGAGAAGAATCAAATAGATGCA  3555
                | |||| |||  |||| ||||| | |||||  | | | || || |  | |||  |  |
Sbjct  15202879  TAGATAAACCCTTAGCTAGACTCACTAAAGGGCACAGG-GACAAAATCCTAATTAACAAA  15202821
 
Query  3556      ATAAAAAAATGATAAAGGGGATATCACCACCAATCCCACAGAAATACAAACTACCATCAG  3615
                || | ||| ||| || || || || || ||  ||||  |||||| ||||  ||||||||
Sbjct  15202820  ATCAGAAA-TGAAAAGGGAGACATAACAACAGATCCTGAAGAAATCCAAAACACCATCAG  15202762
 
Query  3616      AGAATACTACAAACACCTCTACGCAAATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAATGGATAAATT  3675
                |  | |||||||  || ||| |||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||
Sbjct  15202761  ATCCTTCTACAAAAGGCTATACTCAACAAAACTGGAAAACCTGGACGAAATGGACAAATT  15202702
 
Query  3676      CCTGGACACATACACTCTCCCAAGACTAAACCAGGAAGAAGTTGAATCTCTGAATAGACC  3735
                  ||||||| ||||    | ||||  | || |||||  |||||||  ||| || || ||
Sbjct  15202701  TCTGGACAGATACCAGGTACCAAAGTTGAATCAGGATCAAGTTGACCTTCTAAACAGTCC  15202642
 
Query  3736      AATAACAGGAGCTGAAATTGTGGCAATAATCAATAGCTTACCAACCAAAAAGAGTCCAGG  3795
                  ||| |      ||||| |  ||| | || |||||  | ||| ||||||| || |||||
Sbjct  15202641  CATATCCCCTAAAGAAATAGAAGCAGTTATTAATAGTCTCCCAGCCAAAAAAAGCCCAGG  15202582
 
Query  3796      ACCAGATGGATTCACAGCCGAATTCTACCAGAGGTACAAGGAGGAACTGGTACCATTCCT  3855
                |||||| || || |  || || ||||| ||||  | ||| || || ||    ||| | ||
Sbjct  15202581  ACCAGACGGGTTTAGTGCAGAGTTCTATCAGACCTTCAAAGAAGATCTAACTCCAGTTCT  15202522
 
Query  3856      TCTGAAACTATTCCAATCAATAGAAAAAGAGGGAATCCTCCCTAACTCATTTTATGACGC  3915
                  |  ||||| || ||    ||||||  ||| || || || || |||||||||||||| ||
Sbjct  15202521  GCACAAACTTTTTCACAAGATAGAAGTAGAAGGTATTCTACCCAACTCATTTTATGAAGC  15202462
 
Query  3916      CAGCATCATTCTGATACCAAAGCCAGGCAGAGACACAACAAAAAAAGAGAATTTTAGACC  3975
                ||  || | ||||||||| || |||  | |||  ||||||| | |||||| || |||||
Sbjct  15202461  CACTATTACTCTGATACCTAAACCACAGAAAGATCCAACAAAGATAGAGAACTTCAGACC  15202402
 
Query  3976      AATATCCTTGATGAACATTGAGGCAAAAATCCTCAATAAAACACTGGCAAAATGAATCCA  4035
                ||| ||  | |||||||| || ||||||||||| |||||||  || || ||  |||||||
Sbjct  15202401  AATTTCTCTTATGAACATCGATGCAAAAATCCTTAATAAAATTCTCGCTAACCGAATCCA  15202342
 
Query  4036      GCAGCACATCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAAGG  4095
                  | ||||| |||    | ||||| | ||| ||||| || || || || |||||||| ||
Sbjct  15202341  AGAACACATTAAAGCAATCATCCATCCTGACCAAGTAGGTTTTATTCCAGGGATGCAGGG  15202282
 
Query  4096      CTGGTTCAATATACGCAAATCAATAAATGTAATCCAGCATAAAAACAGAGCCAAAGACAA  4155
                  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  ||| ||||| |  |||||||||
Sbjct  15202281  ATGGTTTAATATACGAAAATCCATCAATGTAATCCATTATATAAACAAACTCAAAGACAA  15202222
 
Query  4156      AAACCACATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAAGCCTTTGACAAAATTCAACAACCCTT  4215
                |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||
Sbjct  15202221  AAACCACATGATCATCTCGTTAGATGCAGAAAAAGCATTTGACAAGATCCAACACCCATT  15202162
 
Query  4216      CATGCTAAAAACTCTCAATAAATTAGGTATTGATGGGACGTATTTCAAAATAATAAGAGC  4275
                |||| |||||  |||  | | || ||| ||| | ||    ||  | || || |||| |||
Sbjct  15202161  CATGATAAAAGTTCTGGAAAGATCAGGAATTCAAGGCCAATACCTAAACATGATAAAAGC  15202102
 
Query  4276      TATCTATGACAAACCCACAGCCAATATCATACTGAATGGGCAAAAACTGGAAGCATTCTC  4335
                  |||||  ||||||  |||||| |||| | | |||||  | || ||||||||| || |
Sbjct  15202101  AATCTACAGCAAACCAGTAGCCAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCC  15202042
 
Query  4336      TTTGAAAACTGGCACAAGACAGGGATGCCCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTGTT  4395
                  | ||| | || || ||||| || ||||| || || ||  ||| |||||||||||  |
Sbjct  15202041  ACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGTACT  15201982
 
Query  4396      GGAAGTTCTGGCCAGGGCAATTAGGCAGGAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGAAA  4455
                  |||||  | ||||| |||||| | ||  | ||||| || ||||| || ||| | |||||
Sbjct  15201981  TGAAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACAAATTGGAAA  15201922
 
Query  4456      AGAGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCAGACGACATGATTGTATATCTAGAAAACCCCAT  4515
                ||||||||||||| | || || |||||||| || ||||| |||||| ||    |||| |
Sbjct  15201921  AGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAA  15201862
 
Query  4516      TGTCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAA  4575
                    ||  |  | | ||||| || ||||||| || |||| |  ||||  | ||||| ||
Sbjct  15201861  AAATTCCAACAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGGATATAA  15201802
 
Query  4576      AATCAATGTACAAAAATCACAAGCATTCTTATACACCAACAACAGACAAACAGAGAGCCA  4635
                ||| ||  | | || |||  || ||  | ||||| || || | |||  | ||||  |
Sbjct  15201801  AATTAACTCAAACAAGTCAATGGCCTTTCTCTACACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGA  15201742
 
Query  4636      AATCA-TGAGTGAACTCCCATTCACAATTGCTTCAAAGAGAATAAAATACCTAGGAATCC  4694
                ||| |  ||  ||| ||| ||| |||| ||  |||| |  |||||||| || ||  | 
Sbjct  15201741  AATTAGGGAAACAACACCC-TTCTCAATAGCCACAAATAATATAAAATATCTCGGCGTGA  15201683
 
Query  4695      AACTTACAAGGGATGTGAAGGGCCTCTTCAAGGAGAACTACAAACCTCTGCTCAAGGAAA  4754
                  || || | ||| ||||| |  || |  |  | |||| |||  | |||  || ||||
Sbjct  15201682  CTCTAACGAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAGTCCCTGAAGAAAGAAA  15201623
 
Query  4755      TAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAATA  4814
                | ||||| |||  |  | ||||||  |  | |||||||||||| | || || | ||| |
Sbjct  15201622  TTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGACCAACA  15201563
 
Query  4815      TCGTGAAAATGGCCATACTCCTCAAGGTAATTTACAGATTCAATGCCATCCCCATCAAGC  4874
                | || |||||||| ||  | |  || | ||| |||||||||||||| |||||||| || 
Sbjct  15201562  TTGTAAAAATGGCTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATTAAAA  15201503
 
Query  4875      TACCAATGACTTTCTTCACAGAACTGGAAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAA  4934
                | ||||    |||||||  ||| | |||  | | | ||  || ||||| |||||  | |
Sbjct  15201502  TTCCAACTCAATTCTTCAACGAATTAGAAGGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAATAACA  15201443
 
Query  4935      AGAGAGCCCACATCGCCAAGTCAATCCT--AAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCAC  4992
                | | | |    || || ||  |  | ||  | |  ||||||||    |||| || |||||
Sbjct  15201442  AAAAACCGAGGATAGCAAAAACTCTTCTCAAGGATAAAAGAAC--CTCTGGTGGAATCAC  15201385
 
Query  4993      ACTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGGTA  5052
                  | |||||| | || || |||||||  || |  || |  ||||| ||||||||||||||
Sbjct  15201384  CATGCCTGACCTAAAGCTTTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGGTA  15201325
 
Query  5053      CCAAAACAGAGATATTGATCAATGGAACAGAACAGGGCCCTCAGAAATAACGCCGCATAT  5112
                    | ||||| |  | || |||||||| ||||  |    | ||||||| |  || || |
Sbjct  15201324  TAGAGACAGACAAGTGGACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACACAC  15201265
 
Query  5113      CTACAACTATCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCT  5172
                |||    |  ||||||| |||||    | ||||| ||  || |||  || ||  | |
Sbjct  15201264  CTATGGTCACTTGATCTTCGACAAGGGAGCCAAAACCATCCAGTGGAAGAAAGACAGCAT  15201205
 
Query  5173      ATTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCAT-ATGTAGAAAGCTGAAACTGGATC  5231
                  || || || ||||||||| | |||||| | |  || ||||||||  ||  | | ||||
Sbjct  15201204  TTTCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGG-TTGTTATCATGTAGAAGAATGCGAATCGATC  15201146
 
Query  5232      CCTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTTAGAC  5291
                | | | |  | |||| ||| ||  |||| || |  ||||| || ||    || | | ||
Sbjct  15201145  CATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAAGGAACCTCACATAAAAC  15201086
 
Query  5292      CTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACGTAGGCATTACCATTCAGGACATAGGCATGG  5351
                |  | ||  | |||    |||| || || || || |  | | || | || || ||||  |
Sbjct  15201085  CAGAGACACTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTTGAAGATATGGGCACAG  15201026
 
Query  5352      GCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGACAAAATTGACAAAT  5411
                |  |  | ||| ||  | |||| |||  ||    ||  || |  | |||||||||||
Sbjct  15201025  GGGAAAAATTCCTGAACAGAACAGCAATGGCTTGTGCTGTAAGATCGAGAATTGACAAAT  15200966
 
Query  5412      GGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACT-ACCATCAGAGTGAAC  5470
                |||| ||||| |||||  | || |||||||  |||||||| |||  | || |||  ||
Sbjct  15200965  GGGACCTAATGAAACTCCAAAGTTTCTGCAAGGCAAAAGACACTGTCTATAAGA-CAAAA  15200907
 
Query  5471      AGGCAACCTACAAAATGGGAGAAAATTTTTGC--AACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAA  5528
                || | ||| ||| | ||||| |  || ||| |  | ||||  ||| || |  || ||||
Sbjct  15200906  AGACCACCAACAGACTGGGAAAGGATCTTTACCTATCCTA--AATCAGATAGGGGACTAA  15200849
 
Query  5529      TATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAATTTACAAGAAAAAAACAAACAACCCCATCA  5588
                ||||||  || || || ||||||||  |  |  ||  | |||| |||| |||||| | |
Sbjct  15200848  TATCCAACATATATAAAGAACTCAAGAAGGTGGACCTCAGAAAATCAAATAACCCCCTTA  15200789
 
Query  5589      AAAAGTGGGTGAAGGACATGAACAGACACTTCTCA---AAAGAAGACATTTATGCAGCCA  5645
                |||| ||||    ||  |||||| | | ||||||    | ||| ||    |||  || 
Sbjct  15200788  AAAAATGGGGCTCAGAACTGAACAAAGAATTCTCACCTGAGGAATAC-CGAATG--GCAG  15200732
 
Query  5646      ACAGACACATGAAAAAATGCTCATCATCACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCA  5705
                | |  ||| |||||||||| ||| ||||  |  |||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct  15200731  AGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAA  15200672
 
Query  5706      CAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGCGATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACA  5765
                |  |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |  || ||||| |||||  ||| ||
Sbjct  15200671  CCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTGAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCA  15200612
 
Query  5766      GGTGCTGGAGAGGATGTGGAGAAATAGGAACATTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAAC  5825
                | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |  | || ||||||||||| || |  |
Sbjct  15200611  GATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGC  15200552
 
Query  5826      TAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAGAACTGGAAATAC  5885
                | || |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||  |  | ||  | | | |||
Sbjct  15200551  TTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTAC  15200492
 
Query  5886      CATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCATGCTGCT  5945
                |    || ||||| || ||  | ||||| ||||| ||| | ||    |  |  ||| |
Sbjct  15200491  CGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGA----AGCCCCAACTGGT  15200436
 
Query  5946      -ATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTGG  6004
                  | || ||||||||| |  |||||| || || || ||||| | |||||| |  |  |||
Sbjct  15200435  AAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAACTGG  15200376
 
Query  6005      AACCAACCCAAATGTCTAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACC  6064
                ||  |||||| ||| |  |||    || |||||  ||||||||||| |||| |||||
Sbjct  15200375  AAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACA  15200316
 
Query  6065      ATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATG  6124
                ||||| |||||  |||| || |||||  |||| || |||  ||  |||  | |||||||
Sbjct  15200315  ATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATG  15200256
 
Query  6125      AAATTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATA  6184
                  |  |||| | |||||| || ||| |  || | |||  |||||  | |  ||||  ||
Sbjct  15200255  GACCTGGAGAGCATCATCCTGAGTGAGTTAACACAATCACAAAGGAACTCACACAATATG  15200196
 
Query  6185      TTCTCACTCATAGGTGG  6201
                | |||||| ||| ||||
Sbjct  15200195  TACTCACTGATAAGTGG  15200179
 
 
Features flanking this part of subject sequence:
  931606 bp at 5' side: protein tyrosine phosphatase, receptor type, D isoform A
  856861 bp at 3' side: hypothetical protein
 
 
Score = 1370 bits (1518),  Expect = 0.0
Identities = 2604/3797 (68%), Gaps = 44/3797 (1%)
Strand=Plus/Plus
 
Query  2425      AATGGACTAAATGCTCCAATTAAAAGACACAGACTAGCAAATTGGATAAAGAGTCAAGAC  2484
                ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| || | |  ||||||
Sbjct  16339407  AATGGTCTCAACTCGCCAATAAAAAGACATAGACTAACAAACTGGCTACACAAACAAGAC  16339466
 
Query  2485      CCATCAGTGTGCTGTATTCAGGAAACCCATCTCACATGCAGAGACACACATAGGCTCAAA  2544
                ||| || | |||||  | |||||||| ||||||| |  | ||| | |||    |||| |
Sbjct  16339467  CCAACATTTTGCTGCTTACAGGAAACTCATCTCAGAGAAAAAGATAGACACTACCTCAGA  16339526
 
Query  2545      ATAAAGGGATGGAGGAAGATCTACCAAGCAAACGGAAAACAAAAAAAGGCAGGGGTTGCA  2604
                || || || ||||  |  || | ||||||||| || |  | ||| | ||||| || ||
Sbjct  16339527  ATGAAAGGCTGGAAAACAATTTTCCAAGCAAATGGTATGAAGAAACAAGCAGGAGTAGCC  16339586
 
Query  2605      ATCCTAGTCTCTGATAAAACAGACTTTAAACCAACAAAG--ATCAAAAGAGACAAAGAAG  2662
                |||||| | |||||||| |  |||||  ||||  |||||  ||||||| |||||| || |
Sbjct  16339587  ATCCTAATATCTGATAAGATTGACTTCCAACC--CAAAGTCATCAAAAAAGACAAGGAGG  16339644
 
Query  2663      GCCATTACATAATGGTAAAGGGATCAATTCAACAAGAAGAGCTAACTATCCTAAATATAT  2722
                | || | |||  |  | || ||  ||| |  ||||| || ||  | || || ||||| |
Sbjct  16339645  GACACTTCATTCTCATCAAAGGTAAAATCCTCCAAGAGGAACTCTCAATTCTGAATATCT  16339704
 
Query  2723      ATGCACCCAATACAGGAGCACCAAGATTCA-TAAAGCAAGTCCTGAGTGACCTACAAAG-  2780
                |||| || |||||| ||||| | | ||||| ||||| || |  | ||| |    |||||
Sbjct  16339705  ATGCTCCAAATACAAGAGCAGCCACATTCACTAAAGAAACT--TTAGTAAAGCTCAAAGC  16339762
 
Query  2781      AGACTTAGACTCCCACACATTAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAACATTAGA  2840
                | || | |  | |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || | ||
Sbjct  16339763  ACACATTGCGCCTCACACAATAATAGTGGGAGACTTCAACACACCACTTTCACCAATGGA  16339822
 
Query  2841      CAGATCAACGAGACAGAAAGTCAACAAGGATACCCAGGAATTGAACTCAGCTCTGCAGCA  2900
                |||||||  || ||||||| | |||| ||| || | | || | |    ||  || | ||
Sbjct  16339823  CAGATCATGGAAACAGAAACTAAACAGGGACACACTGAAACTAACAGAAGTGATGAAACA  16339882
 
Query  2901      AGCGGACCTAATAGACATCTACAGAACTCTCCACCCCAAATCAACAGAATATACATTTTT  2960
                |  ||| |||| ||| |||||||||||  |  | || ||| ||| || |||||| || ||
Sbjct  16339883  AATGGATCTAACAGATATCTACAGAACATTTTATCCTAAAACAAAAGGATATACCTTCTT  16339942
 
Query  2961      TTCAGCACCACACCACACCTACTCCAAAATTGACCACATACTGGGAAGTAAAGCACTCCT  3020
                  |||||||| ||    |||| ||||||||||||||||||| | ||    ||| ||  |||
Sbjct  16339943  CTCAGCACCTCATGGTACCTTCTCCAAAATTGACCACATAATAGGTCACAAATCAGGCCT  16340002
 
Query  3021      CAGCAAATGTAAAAGAACAGAAATTATAACAAACTATC-TCTCAGACCACAGTGCAATCA  3079
                || || ||  ||||  |  |||||| |  ||  |||| | ||||| |||  |||| | |
Sbjct  16340003  CAACAGATTCAAAAATATTGAAATTGTCCCATG-TATCCTATCAGATCACCATGCACTAA  16340061
 
Query  3080      AACTAGAACT-CAGGATTAAGA-ATCTCACTCAAAACCGCTCAACTACATGGAAACTGAA  3137
                  || || || ||  |  || | |  | ||  ||| ||  ||  ||||||||||||||
Sbjct  16340062  GGCT-GATCTTCAATAACAAAATAAATAACAGAAAGCCAA-CATTCACATGGAAACTGAA  16340119
 
Query  3138      CAACCTGCTCCTGAATGACTACTGGGTACATAACGAAATGAAGGCAGAAATAAAGTTGTT  3197
                ||||  || || |||||  || |||  |  | | ||| |||  |||||| ||    ||
Sbjct  16340120  CAACACTCTTCTCAATGATACCTTGGTCAAGGAAGGAATAAAGAAAGAAATTAAAGACTT  16340179
 
Query  3198      CTTTGAAACCAATGAGAACAAAGACACAACATACCAGAATCTCTGGGATGCATTCAAAGC  3257
                  || ||    ||||| ||  ||| |||||| ||||  || || |||||  || | |||||
Sbjct  16340180  TTTAGAGTTTAATGAAAATGAAGCCACAACGTACCCAAACCTTTGGGACACAATGAAAGC  16340239
 
Query  3258      AGTGTGCAGAGGGAAATTTATAGCACTGAATGCCCACAAGAGAAAGCAGGAAAGATCCAA  3317
                | |    ||||||||| | ||||| |||| ||||  || ||  || | ||| ||| |  |
Sbjct  16340240  ATTTCTAAGAGGGAAACTCATAGCTCTGAGTGCCTCCATGAAGAAACGGGAGAGAGCACA  16340299
 
Query  3318      AATTGACACCCTAACATCACAATTAAAAGAACTAGAAAAGCAAGA-GCAAACACATTCAA  3376
                  | |  || | | ||| ||||| ||||||  ||||||||  | || |||||  ||  |||
Sbjct  16340300  TACTAGCAGCTTGACAACACAACTAAAAGCTCTAGAAAAAAAGGAAGCAAATTCACCCAA  16340359
 
Query  3377      AAGCTAGCAGAAGGGAAGAAATAACTAAAATCAGAGCAGAACTGAAGGAAATAGAGACAC  3436
                  ||  || ||| || | |||||||  ||| |||| |  ||| | ||  || | || |||
Sbjct  16340360  GAGG-AGTAGACGGCAGGAAATAATCAAACTCAGGGGTGAAATCAACCAAGTGGAAACAA  16340418
 
Query  3437      AAAAAACCCTTCAAAAAATTAATGAATCCAGGAGCTGGTTTTTTGAAAGGATAAACAAAA  3496
                  || |||  |||||| ||||||  || | ||||| ||||| ||||| |  || ||||| |
Sbjct  16340419  GAAGAACTATTCAAAGAATTAACCAAACGAGGAGTTGGTTCTTTGAGAAAATCAACAAGA  16340478
 
Query  3497      TTGATAGACCGCTAGCAAGACTAA-TAAAGAAAAAAAGAGAGAAGAATCAAATAGATGCA  3555
                | |||| |||  |||| ||||| | |||||  | | | || || |  | |||  |  |
Sbjct  16340479  TAGATAAACCCTTAGCTAGACTCACTAAAGGGCACAGG-GACAAAATCCTAATTAACAAA  16340537
 
Query  3556      ATAAAAAAATGATAAAGGGGATATCACCACCAATCCCACAGAAATACAAACTACCATCAG  3615
                || | ||| ||| || || || || || ||  ||||  |||||| ||||  ||||||||
Sbjct  16340538  ATCAGAAA-TGAAAAGGGAGACATAACAACAGATCCTGAAGAAATCCAAAACACCATCAG  16340596
 
Query  3616      AGAATACTACAAACACCTCTACGCAAATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAATGGATAAATT  3675
                |  | |||||||  || ||| |||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||
Sbjct  16340597  ATCCTTCTACAAAAGGCTATACTCAACAAAACTGGAAAACCTGGACGAAATGGACAAATT  16340656
 
Query  3676      CCTGGACACATACACTCTCCCAAGACTAAACCAGGAAGAAGTTGAATCTCTGAATAGACC  3735
                  ||||||| ||||    | ||||  | || |||||  |||||||  ||| || || ||
Sbjct  16340657  TCTGGACAGATACCAGGTACCAAAGTTGAATCAGGATCAAGTTGACCTTCTAAACAGTCC  16340716
 
Query  3736      AATAACAGGAGCTGAAATTGTGGCAATAATCAATAGCTTACCAACCAAAAAGAGTCCAGG  3795
                  ||| |      ||||| |  ||| | || |||||  |  | ||||||| || |||||
Sbjct  16340717  CATATCCCCTAAAGAAATAGAAGCAGTTATTAATAGTCTCTGAGCCAAAAAAAGCCCAGG  16340776
 
Query  3796      ACCAGATGGATTCACAGCCGAATTCTACCAGAGGTACAAGGAGGAACTGGTACCATTCCT  3855
                |||||| || || |  || || ||||| ||||  | ||| || || ||    ||| | ||
Sbjct  16340777  ACCAGACGGGTTTAGTGCAGAGTTCTATCAGACCTTCAAAGAAGATCTAACTCCAGTTCT  16340836
 
Query  3856      TCTGAAACTATTCCAATCAATAGAAAAAGAGGGAATCCTCCCTAACTCATTTTATGACGC  3915
                  |  ||||| || ||    ||||||  ||| || || || || |||||||||||||| ||
Sbjct  16340837  GCACAAACTTTTTCACAAGATAGAAGTAGAAGGTATTCTACCCAACTCATTTTATGAAGC  16340896
 
Query  3916      CAGCATCATTCTGATACCAAAGCCAGGCAGAGACACAACAAAAAAAGAGAATTTTAGACC  3975
                ||  || | ||||||||| || |||  | |||  ||||||| | |||||| || |||||
Sbjct  16340897  CACTATTACTCTGATACCTAAACCACAGAAAGATCCAACAAAGATAGAGAACTTCAGACC  16340956
 
Query  3976      AATATCCTTGATGAACATTGAGGCAAAAATCCTCAATAAAACACTGGCAAAATGAATCCA  4035
                ||| ||  | |||||||| || ||||||||||| |||||||  || || ||  |||||||
Sbjct  16340957  AATTTCTCTTATGAACATCGATGCAAAAATCCTTAATAAAATTCTCGCTAACCGAATCCA  16341016
 
Query  4036      GCAGCACATCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAAGG  4095
                  | ||||| |||    | ||||| | ||| ||||| || || || || |||||||| ||
Sbjct  16341017  AGAACACATTAAAGCAATCATCCATCCTGACCAAGTAGGTTTTATTCCAGGGATGCAGGG  16341076
 
Query  4096      CTGGTTCAATATACGCAAATCAATAAATGTAATCCAGCATAAAAACAGAGCCAAAGACAA  4155
                  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  ||| ||||| |  |||||||||
Sbjct  16341077  ATGGTTTAATATACGAAAATCCATCAATGTAATCCATTATATAAACAAACTCAAAGACAA  16341136
 
Query  4156      AAACCACATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAAGCCTTTGACAAAATTCAACAACCCTT  4215
                |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||
Sbjct  16341137  AAACCACATGATCATCTCGTTAGATGCAGAAAAAGCATTTGACAAGATCCAACACCCATT  16341196
 
Query  4216      CATGCTAAAAACTCTCAATAAATTAGGTATTGATGGGACGTATTTCAAAATAATAAGAGC  4275
                |||| |||||  |||  | | || ||| ||| | ||    ||  | || || |||| |||
Sbjct  16341197  CATGATAAAAGTTCTGGAAAGATCAGGAATTCAAGGCCAATACCTAAACATGATAAAAGC  16341256
 
Query  4276      TATCTATGACAAACCCACAGCCAATATCATACTGAATGGGCAAAAACTGGAAGCATTCTC  4335
                  |||||  ||||||  |||||| |||| | | |||||  | || ||||||||| || |
Sbjct  16341257  AATCTACAGCAAACCAGTAGCCAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCC  16341316
 
Query  4336      TTTGAAAACTGGCACAAGACAGGGATGCCCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTGTT  4395
                  | ||| | || || ||||| || ||||| || || ||  ||| |||||||||||  |
Sbjct  16341317  ACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGTACT  16341376
 
Query  4396      GGAAGTTCTGGCCAGGGCAATTAGGCAGGAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGAAA  4455
                  |||||  | ||||| |||||| | ||  | ||||| || ||||| || ||| | |||||
Sbjct  16341377  TGAAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACAAATTGGAAA  16341436
 
Query  4456      AGAGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCAGACGACATGATTGTATATCTAGAAAACCCCAT  4515
                ||||||||||||| | || || |||||||| || ||||| |||||| ||    |||| |
Sbjct  16341437  AGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAA  16341496
 
Query  4516      TGTCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAA  4575
                    ||  ||  | | ||||| || ||||||| || |||| |  ||||  | ||||| ||
Sbjct  16341497  AAATTCTACCAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGGATATAA  16341556
 
Query  4576      AATCAATGTACAAAAATCACAAGCATTCTTATACACCAACAACAGACAAACAGAGAGCCA  4635
                ||| ||  | | || |||  || ||  | ||||| || || | |||  | ||||  |
Sbjct  16341557  AATTAACTCAAACAAGTCAATGGCCTTTCTCTACACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGA  16341616
 
Query  4636      AATCA-TGAGTGAACTCCCATTCACAATTGCTTCAAAGAGAATAAAATACCTAGGAATCC  4694
                ||| |  ||  ||| ||| ||| |||| ||  |||| |  |||||||| || ||  | 
Sbjct  16341617  AATTAGGGAAACAACACCC-TTCTCAATAGCCACAAATAATATAAAATATCTCGGCGTGA  16341675
 
Query  4695      AACTTACAAGGGATGTGAAGGGCCTCTTCAAGGAGAACTACAAACCTCTGCTCAAGGAAA  4754
                  || || | ||| ||||| |  || |  |  | |||| |||  | |||  || ||||
Sbjct  16341676  CTCTAACGAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAGTCCCTGAAGAAAGAAA  16341735
 
Query  4755      TAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAATA  4814
                | ||||| |||  |  | ||||||  |  | |||||||||||| | || || | ||| |
Sbjct  16341736  TTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGACCAACA  16341795
 
Query  4815      TCGTGAAAATGGCCATACTCCTCAAGGTAATTTACAGATTCAATGCCATCCCCATCAAGC  4874
                | || |||||||| ||  | |  || | ||| |||||||||||||| |||||||| || 
Sbjct  16341796  TTGTAAAAATGGCTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATTAAAA  16341855
 
Query  4875      TACCAATGACTTTCTTCACAGAACTGGAAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAA  4934
                | ||||    |||||||  ||| | |||  | | | ||  || ||||| |||||  | |
Sbjct  16341856  TTCCAACTCAATTCTTCAACGAATTAGAAGGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAATAACA  16341915
 
Query  4935      AGAGAGCCCACATCGCCAAGTCAATCCT--AAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCAC  4992
                | | | |    || || ||  |  | ||  | |  ||||||||    |||| || |||||
Sbjct  16341916  AAAAACCGAGGATAGCAAAAACTCTTCTCAAGGATAAAAGAAC--CTCTGGTGGAATCAC  16341973
 
Query  4993      ACTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGGTA  5052
                  | |||||| | || || |||||||  || |  || |  ||||| ||||||||||||||
Sbjct  16341974  CATGCCTGACCTAAAGCTTTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGGTA  16342033
 
Query  5053      CCAAAACAGAGATATTGATCAATGGAACAGAACAGGGCCCTCAGAAATAACGCCGCATAT  5112
                    | ||||| |  | || |||||||| ||||  |    | ||||||| |  || || |
Sbjct  16342034  TAGAGACAGACAAGTGGACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACACAC  16342093
 
Query  5113      CTACAACTATCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCT  5172
                |||    |  ||||||| |||||    | ||||| ||  || |||  || ||  | |
Sbjct  16342094  CTATGGTCACTTGATCTTCGACAAGGGAGCCAAAACCATCCAGTGGAAGAAAGACAGCAT  16342153
 
Query  5173      ATTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCAT-ATGTAGAAAGCTGAAACTGGATC  5231
                  || || || ||||||||| | |||||| | |  || ||||||||  ||  | | ||||
Sbjct  16342154  TTTCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGG-TTGTTATCATGTAGAAGAATGCGAATCGATC  16342212
 
Query  5232      CCTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTTAGAC  5291
                | | | |  | |||| ||| ||  |||| || |  ||||| || ||  |  || | | ||
Sbjct  16342213  CATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAAGGAACTTCACATAAAAC  16342272
 
Query  5292      CTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACGTAGGCATTACCATTCAGGACATAGGCATGG  5351
                |  | ||  | |||    |||| || || || || |  | | || | || || ||||  |
Sbjct  16342273  CAGAGACACTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTTGAAGATATGGGCACAG  16342332
 
Query  5352      GCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGACAAAATTGACAAAT  5411
                |  |  | ||| ||  | |||| |||  ||    ||  || |  | |||||||||||
Sbjct  16342333  GGGAAAAATTCCTGAACAGAACAGCAATGGCTTGTGCTGTAAGATCGAGAATTGACAAAT  16342392
 
Query  5412      GGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACT-ACCATCAGAGTGAAC  5470
                |||| ||||| |||||  | || |||||||  |||||||| |||  | || |||  ||
Sbjct  16342393  GGGACCTAATGAAACTCCAAAGTTTCTGCAAGGCAAAAGACACTGTCTATAAGA-CAAAA  16342451
 
Query  5471      AGGCAACCTACAAAATGGGAGAAAATTTTTGC--AACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAA  5528
                || | ||| ||| | ||||| |  || ||| |  | ||||  ||| || |  || ||||
Sbjct  16342452  AGACCACCAACAGACTGGGAAAGGATCTTTACCTATCCTA--AATCAGATAGGGGACTAA  16342509
 
Query  5529      TATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAATTTACAAGAAAAAAACAAACAACCCCATCA  5588
                ||||||  || || || ||||||||  |  |  ||  | |||| |||| |||||| | |
Sbjct  16342510  TATCCAACATATATAAAGAACTCAAGAAGGTGGACCTCAGAAAATCAAATAACCCCCTTA  16342569
 
Query  5589      AAAAGTGGGTGAAGGACATGAACAGACACTTCTCA---AAAGAAGACATTTATGCAGCCA  5645
                |||| ||||    ||  |||||| | | ||||||    | ||| ||    |||  || 
Sbjct  16342570  AAAAATGGGGCTCAGAACTGAACAAAGAATTCTCACCTGAGGAATAC-CGAATG--GCAG  16342626
 
Query  5646      ACAGACACATGAAAAAATGCTCATCATCACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCA  5705
                | |  ||| |||||||||| ||| ||||  |  |||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct  16342627  AGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAA  16342686
 
Query  5706      CAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGCGATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACA  5765
                |  |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |  || ||||| |||||  ||| ||
Sbjct  16342687  CCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTGAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCA  16342746
 
Query  5766      GGTGCTGGAGAGGATGTGGAGAAATAGGAACATTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAAC  5825
                | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |  | || ||||||||||| || |  |
Sbjct  16342747  GATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGC  16342806
 
Query  5826      TAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAGAACTGGAAATAC  5885
                | || |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||  |  | ||  | | | |||
Sbjct  16342807  TTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTAC  16342866
 
Query  5886      CATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCATGCTGCT  5945
                |    || ||||| || ||  | ||||| ||||| ||| | ||    |  |  ||| |
Sbjct  16342867  CGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGA----AGCCCCAACTGGT  16342922
 
Query  5946      -ATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTGG  6004
                  | || ||||||||| |  |||||| || || || ||||| | |||||| |  |  |||
Sbjct  16342923  AAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAACTGG  16342982
 
Query  6005      AACCAACCCAAATGTCTAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACC  6064
                ||  |||||| ||| |  |||    || |||||  ||||||||||| |||| |||||
Sbjct  16342983  AAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACA  16343042
 
Query  6065      ATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATG  6124
                ||||| |||||  |||| || |||||  |||| || |||  ||  |||  | |||||||
Sbjct  16343043  ATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATG  16343102
 
Query  6125      AAATTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATA  6184
                  |  |||| | |||||| || ||| |  || | |||  |||||  | |  ||||  ||
Sbjct  16343103  GACCTGGAGAGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACAATCACAAAGGAACTCACACAATATG  16343162
 
Query  6185      TTCTCACTCATAGGTGG  6201
                | |||||| ||| ||||
Sbjct  16343163  TACTCACTGATAAGTGG  16343179
 
 
Features flanking this part of subject sequence:
  42184 bp at 5' side: hypothetical protein
  18552 bp at 3' side: hypothetical protein
 
 
Score = 1370 bits (1518),  Expect = 0.0
Identities = 2604/3797 (68%), Gaps = 44/3797 (1%)
Strand=Plus/Plus
 
Query  2425      AATGGACTAAATGCTCCAATTAAAAGACACAGACTAGCAAATTGGATAAAGAGTCAAGAC  2484
                ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| || | |  ||||||
Sbjct  21318084  AATGGTCTCAACTCGCCAATAAAAAGACATAGACTAACAAACTGGCTACACAAACAAGAC  21318143
 
Query  2485      CCATCAGTGTGCTGTATTCAGGAAACCCATCTCACATGCAGAGACACACATAGGCTCAAA  2544
                ||| || | |||||  | |||||||| ||||||| |  | ||| | |||    |||| |
Sbjct  21318144  CCAACATTTTGCTGCTTACAGGAAACTCATCTCAGAGAAAAAGATAGACACTACCTCAGA  21318203
 
Query  2545      ATAAAGGGATGGAGGAAGATCTACCAAGCAAACGGAAAACAAAAAAAGGCAGGGGTTGCA  2604
                || || || ||||  |  || | ||||||||| || |  | ||| | ||||| || ||
Sbjct  21318204  ATGAAAGGCTGGAAAACAATTTTCCAAGCAAATGGTATGAAGAAACAAGCAGGAGTAGCC  21318263
 
Query  2605      ATCCTAGTCTCTGATAAAACAGACTTTAAACCAACAAAG--ATCAAAAGAGACAAAGAAG  2662
                |||||| | |||||||| |  |||||  ||||  |||||  ||||||| |||||| || |
Sbjct  21318264  ATCCTAATATCTGATAAGATTGACTTCCAACC--CAAAGTCATCAAAAAAGACAAGGAGG  21318321
 
Query  2663      GCCATTACATAATGGTAAAGGGATCAATTCAACAAGAAGAGCTAACTATCCTAAATATAT  2722
                | || | |||  |  | || ||  ||| |  ||||| || ||  | || || ||||| |
Sbjct  21318322  GACACTTCATTCTCATCAAAGGTAAAATCCTCCAAGAGGAACTCTCAATTCTGAATATCT  21318381
 
Query  2723      ATGCACCCAATACAGGAGCACCAAGATTCA-TAAAGCAAGTCCTGAGTGACCTACAAAG-  2780
                |||| || |||||| ||||| | | ||||| ||||| || |  | ||| |    |||||
Sbjct  21318382  ATGCTCCAAATACAAGAGCAGCCACATTCACTAAAGAAACT--TTAGTAAAGCTCAAAGC  21318439
 
Query  2781      AGACTTAGACTCCCACACATTAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAACATTAGA  2840
                | || | |  | |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || | ||
Sbjct  21318440  ACACATTGCGCCTCACACAATAATAGTGGGAGACTTCAACACACCACTTTCACCAATGGA  21318499
 
Query  2841      CAGATCAACGAGACAGAAAGTCAACAAGGATACCCAGGAATTGAACTCAGCTCTGCAGCA  2900
                |||||||  || ||||||| | |||| ||| || | | || | |    ||  || | ||
Sbjct  21318500  CAGATCATGGAAACAGAAACTAAACAGGGACACACTGAAACTAACAGAAGTGATGAAACA  21318559
 
Query  2901      AGCGGACCTAATAGACATCTACAGAACTCTCCACCCCAAATCAACAGAATATACATTTTT  2960
                |  ||| || | ||| |||||||||||  |  |||| ||| ||| || |||||| || ||
Sbjct  21318560  AATGGATCTGACAGATATCTACAGAACATTTTACCCTAAAACAAAAGGATATACCTTCTT  21318619
 
Query  2961      TTCAGCACCACACCACACCTACTCCAAAATTGACCACATACTGGGAAGTAAAGCACTCCT  3020
                  |||||||| ||    |||| ||||||||||||||||||| | ||    ||| ||  |||
Sbjct  21318620  CTCAGCACCTCATGGTACCTTCTCCAAAATTGACCACATAATAGGTCACAAATCAGGCCT  21318679
 
Query  3021      CAGCAAATGTAAAAGAACAGAAATTATAACAAACTATC-TCTCAGACCACAGTGCAATCA  3079
                || || ||  ||||  |  |||||| |  ||  |||| | ||||| |||  |||| | |
Sbjct  21318680  CAACAGATTCAAAAATATTGAAATTGTCCCATG-TATCCTATCAGATCACCATGCACTAA  21318738
 
Query  3080      AACTAGAACT-CAGGATTAAGA-ATCTCACTCAAAACCGCTCAACTACATGGAAACTGAA  3137
                  || || || ||  |  || | |  | ||  ||| ||  ||  ||||||||||||||
Sbjct  21318739  GGCT-GATCTTCAATAACAAAATAAATAACAGAAAGCCAA-CATTCACATGGAAACTGAA  21318796
 
Query  3138      CAACCTGCTCCTGAATGACTACTGGGTACATAACGAAATGAAGGCAGAAATAAAGTTGTT  3197
                ||||  || || |||||  || |||  |  | | ||| |||  |||||| ||    ||
Sbjct  21318797  CAACACTCTTCTCAATGATACCTTGGTCAAGGAAGGAATAAAGAAAGAAATTAAAGACTT  21318856
 
Query  3198      CTTTGAAACCAATGAGAACAAAGACACAACATACCAGAATCTCTGGGATGCATTCAAAGC  3257
                  || ||    ||||| ||  ||| |||||| ||||  || || |||||  || | |||||
Sbjct  21318857  TTTAGAGTTTAATGAAAATGAAGCCACAACGTACCCAAACCTTTGGGACACAATGAAAGC  21318916
 
Query  3258      AGTGTGCAGAGGGAAATTTATAGCACTGAATGCCCACAAGAGAAAGCAGGAAAGATCCAA  3317
                | |    ||||||||| | |||||  ||| ||||  ||||| ||| | ||| ||| |  |
Sbjct  21318917  ATTTCTAAGAGGGAAACTCATAGCTATGAGTGCCTTCAAGAAAAAACGGGAGAGAGCACA  21318976
 
Query  3318      AATTGACACCCTAACATCACAATTAAAAGAACTAGAAAAGCAAGA-GCAAACACATTCAA  3376
                  | |  || | | ||| ||||  ||||||  ||||||||  | || |||||  ||  |||
Sbjct  21318977  TACTAGCAGCTTGACAACACATCTAAAAGCTCTAGAAAAAAAGGAAGCAAATTCACCCAA  21319036
 
Query  3377      AAGCTAGCAGAAGGGAAGAAATAACTAAAATCAGAGCAGAACTGAAGGAAATAGAGACAC  3436
                  ||  || ||| || | |||||||  ||| |||| |  ||| | ||  || | || |||
Sbjct  21319037  GAGG-AGTAGACGGCAGGAAATAATCAAACTCAGGGGTGAAATCAACCAAGTGGAAACAA  21319095
 
Query  3437      AAAAAACCCTTCAAAAAATTAATGAATCCAGGAGCTGGTTTTTTGAAAGGATAAACAAAA  3496
                  || |||  |||||| ||||||  || | ||||| ||||| ||||| |  || ||||| |
Sbjct  21319096  GAAGAACTATTCAAAGAATTAACCAAACGAGGAGTTGGTTCTTTGAGAAAATCAACAAGA  21319155
 
Query  3497      TTGATAGACCGCTAGCAAGACTAA-TAAAGAAAAAAAGAGAGAAGAATCAAATAGATGCA  3555
                | |||| |||  |||| ||||| | |||||  | | | || || |  | |||  |  |
Sbjct  21319156  TAGATAAACCCTTAGCTAGACTCACTAAAGGGCACAGG-GACAAAATCCTAATTAACAAA  21319214
 
Query  3556      ATAAAAAAATGATAAAGGGGATATCACCACCAATCCCACAGAAATACAAACTACCATCAG  3615
                || | ||| ||| || || || || || ||  ||||  |||||| ||||  ||||||||
Sbjct  21319215  ATCAGAAA-TGAAAAGGGAGACATAACAACAGATCCTGAAGAAATCCAAAACACCATCAG  21319273
 
Query  3616      AGAATACTACAAACACCTCTACGCAAATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAATGGATAAATT  3675
                |  | |||||||  || ||| |||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||
Sbjct  21319274  ATCCTTCTACAAAAGGCTATACTCAACAAAACTGGAAAACCTGGACGAAATGGACAAATT  21319333
 
Query  3676      CCTGGACACATACACTCTCCCAAGACTAAACCAGGAAGAAGTTGAATCTCTGAATAGACC  3735
                  ||||||| ||||    | ||||  | || |||||  |||||||  ||| || || ||
Sbjct  21319334  TCTGGACAGATACCAGGTACCAAAGTTGAATCAGGATCAAGTTGACCTTCTAAACAGTCC  21319393
 
Query  3736      AATAACAGGAGCTGAAATTGTGGCAATAATCAATAGCTTACCAACCAAAAAGAGTCCAGG  3795
                  ||| |      ||||| |  ||| | || |||||  | ||| ||||||| || |||||
Sbjct  21319394  CATATCCCCTAAAGAAATAGAAGCAGTTATTAATAGTCTCCCAGCCAAAAAAAGCCCAGG  21319453
 
Query  3796      ACCAGATGGATTCACAGCCGAATTCTACCAGAGGTACAAGGAGGAACTGGTACCATTCCT  3855
                |||||| || || |  || || ||||| ||||  | ||| || || ||    ||| | ||
Sbjct  21319454  ACCAGACGGGTTTAGTGCAGAGTTCTATCAGACCTTCAAAGAAGATCTAACTCCAGTTCT  21319513
 
Query  3856      TCTGAAACTATTCCAATCAATAGAAAAAGAGGGAATCCTCCCTAACTCATTTTATGACGC  3915
                  |  ||||| || ||    ||||||  ||| || || || || |||||||||||||| ||
Sbjct  21319514  GCACAAACTTTTTCACAAGATAGAAGTAGAAGGTATTCTACCCAACTCATTTTATGAAGC  21319573
 
Query  3916      CAGCATCATTCTGATACCAAAGCCAGGCAGAGACACAACAAAAAAAGAGAATTTTAGACC  3975
                ||  || | ||||||||| || |||  | |||  ||||||| | |||||| || |||||
Sbjct  21319574  CACTATTACTCTGATACCTAAACCACAGAAAGATCCAACAAAGATAGAGAACTTCAGACC  21319633
 
Query  3976      AATATCCTTGATGAACATTGAGGCAAAAATCCTCAATAAAACACTGGCAAAATGAATCCA  4035
                ||| ||  | |||||||| || ||||||||||| |||||||  || || ||  |||||||
Sbjct  21319634  AATTTCTCTTATGAACATCGATGCAAAAATCCTTAATAAAATTCTCGCTAACCGAATCCA  21319693
 
Query  4036      GCAGCACATCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAAGG  4095
                  | ||||| |||    | ||||| | ||| ||||| || || || || |||||||| ||
Sbjct  21319694  AGAACACATTAAAGCAATCATCCATCCTGACCAAGTAGGTTTTATTCCAGGGATGCAGGG  21319753
 
Query  4096      CTGGTTCAATATACGCAAATCAATAAATGTAATCCAGCATAAAAACAGAGCCAAAGACAA  4155
                  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  ||| ||||| |  |||||||||
Sbjct  21319754  ATGGTTTAATATACGAAAATCCATCAATGTAATCCATTATATAAACAAACTCAAAGACAA  21319813
 
Query  4156      AAACCACATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAAGCCTTTGACAAAATTCAACAACCCTT  4215
                |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||
Sbjct  21319814  AAACCACATGATCATCTCGTTAGATGCAGAAAAAGCATTTGACAAGATCCAACACCCATT  21319873
 
Query  4216      CATGCTAAAAACTCTCAATAAATTAGGTATTGATGGGACGTATTTCAAAATAATAAGAGC  4275
                |||| |||||  |||  | | || ||| ||| | ||    ||  | || || |||| |||
Sbjct  21319874  CATGATAAAAGTTCTGGAAAGATCAGGAATTCAAGGCCAATACCTAAACATGATAAAAGC  21319933
 
Query  4276      TATCTATGACAAACCCACAGCCAATATCATACTGAATGGGCAAAAACTGGAAGCATTCTC  4335
                  |||||  ||||||  |||||| |||| | | |||||  | || ||||||||| || |
Sbjct  21319934  AATCTACAGCAAACCAGTAGCCAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCC  21319993
 
Query  4336      TTTGAAAACTGGCACAAGACAGGGATGCCCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTGTT  4395
                  | ||| | || || ||||| || ||||| || || ||  ||| |||||||||||  |
Sbjct  21319994  ACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGTACT  21320053
 
Query  4396      GGAAGTTCTGGCCAGGGCAATTAGGCAGGAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGAAA  4455
                  |||||  | ||||| |||||| | ||  | ||||| || ||||| || ||| | |||||
Sbjct  21320054  TGAAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACAAATTGGAAA  21320113
 
Query  4456      AGAGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCAGACGACATGATTGTATATCTAGAAAACCCCAT  4515
                ||||||||||||| | || || |||||||| || ||||| |||||| ||    |||| |
Sbjct  21320114  AGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAA  21320173
 
Query  4516      TGTCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAA  4575
                    ||  |  | | ||||| || ||||||| || |||| |  ||||  | ||||| ||
Sbjct  21320174  AAATTCCAACAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGGATATAA  21320233
 
Query  4576      AATCAATGTACAAAAATCACAAGCATTCTTATACACCAACAACAGACAAACAGAGAGCCA  4635
                ||| ||  | | || |||  || ||  | ||||| || || | |||  | ||||  |
Sbjct  21320234  AATTAACTCAAACAAGTCAATGGCCTTTCTCTACACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGA  21320293
 
Query  4636      AATCA-TGAGTGAACTCCCATTCACAATTGCTTCAAAGAGAATAAAATACCTAGGAATCC  4694
                ||| |  ||  ||| ||| ||| |||| ||  |||| |  |||||||| || ||  | 
Sbjct  21320294  AATTAGGGAAACAACACCC-TTCTCAATAGCCACAAATAATATAAAATATCTCGGCGTGA  21320352
 
Query  4695      AACTTACAAGGGATGTGAAGGGCCTCTTCAAGGAGAACTACAAACCTCTGCTCAAGGAAA  4754
                  || || | ||| ||||| |  || |  |  | |||| |||  | |||  || ||||
Sbjct  21320353  CTCTAACGAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAGTCCCTGAAGAAAGAAA  21320412
 
Query  4755      TAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAATA  4814
                | ||||| |||  |  | ||||||  |  | |||||||||||| | || || | ||| |
Sbjct  21320413  TTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGACCAACA  21320472
 
Query  4815      TCGTGAAAATGGCCATACTCCTCAAGGTAATTTACAGATTCAATGCCATCCCCATCAAGC  4874
                | || |||||||| ||  | |  || | ||| |||||||||||||| |||||||| || 
Sbjct  21320473  TTGTAAAAATGGCTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATTAAAA  21320532
 
Query  4875      TACCAATGACTTTCTTCACAGAACTGGAAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAA  4934
                | ||||    |||||||  ||| | |||  | | | ||  || ||||| |||||  | |
Sbjct  21320533  TTCCAACTCAATTCTTCAACGAATTAGAAGGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAATAACA  21320592
 
Query  4935      AGAGAGCCCACATCGCCAAGTCAATCCT--AAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCAC  4992
                | | | |    || || ||  |  | ||  | |  ||||||||    |||| || |||||
Sbjct  21320593  AAAAACCGAGGATAGCAAAAACTCTTCTCAAGGATAAAAGAAC--CTCTGGTGGAATCAC  21320650
 
Query  4993      ACTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGGTA  5052
                  | |||||| | || || |||||||  || |  || |  ||||| ||||||||||||||
Sbjct  21320651  CATGCCTGACCTAAAGCTTTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGGTA  21320710
 
Query  5053      CCAAAACAGAGATATTGATCAATGGAACAGAACAGGGCCCTCAGAAATAACGCCGCATAT  5112
                    | ||||| |  | || |||||||| ||||  |    | ||||||| |  || || |
Sbjct  21320711  TAGAGACAGACAAGTGGACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACACAC  21320770
 
Query  5113      CTACAACTATCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCT  5172
                |||    |  ||||||| |||||    | ||||| ||  || |||  || ||  | |
Sbjct  21320771  CTATGGTCACTTGATCTTCGACAAGGGAGCCAAAACCATCCAGTGGAAGAAAGACAGCAT  21320830
 
Query  5173      ATTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCAT-ATGTAGAAAGCTGAAACTGGATC  5231
                  || || || ||||||||| | |||||| | |  || ||||||||  ||  | | ||||
Sbjct  21320831  TTTCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGG-TTGTTATCATGTAGAAGAATGCGAATCGATC  21320889
 
Query  5232      CCTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTTAGAC  5291
                | | | |  | |||| ||| ||  |||| || |  ||||| || ||  |  || | | ||
Sbjct  21320890  CATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAAGGAACTTCACATAAAAC  21320949
 
Query  5292      CTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACGTAGGCATTACCATTCAGGACATAGGCATGG  5351
                |  | ||  | |||    |||| || || || || |  | | || | || || ||||  |
Sbjct  21320950  CAGAGACACTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTTGAAGATATGGGCACAG  21321009
 
Query  5352      GCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGACAAAATTGACAAAT  5411
                |  |  | ||| ||  | |||| |||  ||    ||  || |  | |||||||||||
Sbjct  21321010  GGGAAAAATTCCTGAACAGAACAGCAATGGCTTGTGCTGTAAGATCGAGAATTGACAAAT  21321069
 
Query  5412      GGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACT-ACCATCAGAGTGAAC  5470
                |||| ||||| |||||  | || |||||||  |||||||| |||  | || |||  ||
Sbjct  21321070  GGGACCTAATGAAACTCCAAAGTTTCTGCAAGGCAAAAGACACTGTCTATAAGA-CAAAA  21321128
 
Query  5471      AGGCAACCTACAAAATGGGAGAAAATTTTTGC--AACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAA  5528
                || | ||| ||| | ||||| |  || ||| |  | ||||  ||| || |  || ||||
Sbjct  21321129  AGACCACCAACAGACTGGGAAAGGATCTTTACCTATCCTA--AATCAGATAGGGGACTAA  21321186
 
Query  5529      TATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAATTTACAAGAAAAAAACAAACAACCCCATCA  5588
                ||||||  || || || ||||||||  |  |  ||  | |||| |||| |||||| | |
Sbjct  21321187  TATCCAACATATATAAAGAACTCAAGAAGGTGGACCTCAGAAAATCAAATAACCCCCTTA  21321246
 
Query  5589      AAAAGTGGGTGAAGGACATGAACAGACACTTCTCA---AAAGAAGACATTTATGCAGCCA  5645
                |||| ||||    ||  |||||| | | ||||||    | ||| ||    |||  || 
Sbjct  21321247  AAAAATGGGGCTCAGAACTGAACAAAGAATTCTCACCTGAGGAATAC-CGAATG--GCAG  21321303
 
Query  5646      ACAGACACATGAAAAAATGCTCATCATCACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCA  5705
                | |  ||| |||||||||| ||| ||||  |  |||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct  21321304  AGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAA  21321363
 
Query  5706      CAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGCGATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACA  5765
                |  |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |  || ||||| |||||  ||| ||
Sbjct  21321364  CCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTGAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCA  21321423
 
Query  5766      GGTGCTGGAGAGGATGTGGAGAAATAGGAACATTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAAC  5825
                | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |  | || ||||||||||| || |  |
Sbjct  21321424  GATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGC  21321483
 
Query  5826      TAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAGAACTGGAAATAC  5885
                | || |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||  |  | ||  | | | |||
Sbjct  21321484  TTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTAC  21321543
 
Query  5886      CATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCATGCTGCT  5945
                |    || ||||| || ||  | || || ||||| ||| | ||    |  |  ||| |
Sbjct  21321544  CGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTAGGCATATATCCAGAAGA----AGCCCCAACTGGT  21321599
 
Query  5946      -ATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTGG  6004
                  | || ||||||||| |  |||||| || || || ||||| | |||||| |  |  |||
Sbjct  21321600  AAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAACTGG  21321659
 
Query  6005      AACCAACCCAAATGTCTAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACC  6064
                ||  |||||| ||| |  |||    || |||||  ||||||||||| |||| |||||
Sbjct  21321660  AAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACA  21321719
 
Query  6065      ATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATG  6124
                ||||| |||||  |||| || |||||  |||| || |||  ||  |||  | |||||||
Sbjct  21321720  ATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATG  21321779
 
Query  6125      AAATTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATA  6184
                  |  |||| | |||||| || ||| |  || | |||  |||||  | |  ||||  ||
Sbjct  21321780  GACCTGGAGAGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACAATCACAAAGGAACTCACACAATATG  21321839
 
Query  6185      TTCTCACTCATAGGTGG  6201
                | |||||| ||| ||||
Sbjct  21321840  TACTCACTGATAAGTGG  21321856
 
 
Features in this part of subject sequence:
  hypothetical protein LOC230393
 
 
Score = 1370 bits (1518),  Expect = 0.0
Identities = 2604/3797 (68%), Gaps = 44/3797 (1%)
Strand=Plus/Plus
 
Query  2425      AATGGACTAAATGCTCCAATTAAAAGACACAGACTAGCAAATTGGATAAAGAGTCAAGAC  2484
                ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| || | |  ||||||
Sbjct  27637477  AATGGTCTCAACTCGCCAATAAAAAGACATAGACTAACAAACTGGCTACACAAACAAGAC  27637536
 
Query  2485      CCATCAGTGTGCTGTATTCAGGAAACCCATCTCACATGCAGAGACACACATAGGCTCAAA  2544
                ||| || | |||||  | |||||||| ||||||| |  | ||| | |||    |||| |
Sbjct  27637537  CCAACATTTTGCTGCTTACAGGAAACTCATCTCAGAGAAAAAGATAGACACTACCTCAGA  27637596
 
Query  2545      ATAAAGGGATGGAGGAAGATCTACCAAGCAAACGGAAAACAAAAAAAGGCAGGGGTTGCA  2604
                || || || ||||  |  || | ||||||||| || |  | ||| | ||||| || ||
Sbjct  27637597  ATGAAAGGCTGGAAAACAATTTTCCAAGCAAATGGTATGAAGAAACAAGCAGGAGTAGCC  27637656
 
Query  2605      ATCCTAGTCTCTGATAAAACAGACTTTAAACCAACAAAG--ATCAAAAGAGACAAAGAAG  2662
                |||||| | |||||||| |  |||||  ||||  |||||  ||||||| |||||| || |
Sbjct  27637657  ATCCTAATATCTGATAAGATTGACTTCCAACC--CAAAGTCATCAAAAAAGACAAGGAGG  27637714
 
Query  2663      GCCATTACATAATGGTAAAGGGATCAATTCAACAAGAAGAGCTAACTATCCTAAATATAT  2722
                | || | |||  |  | || ||  ||| |  ||||| || ||  | || || ||||| |
Sbjct  27637715  GACACTTCATTCTCATCAAAGGTAAAATCCTCCAAGAGGAACTCTCAATTCTGAATATCT  27637774
 
Query  2723      ATGCACCCAATACAGGAGCACCAAGATTCA-TAAAGCAAGTCCTGAGTGACCTACAAAG-  2780
                |||| || |||||| ||||| | | ||||| ||||| || |  | ||| |    |||||
Sbjct  27637775  ATGCTCCAAATACAAGAGCAGCCACATTCACTAAAGAAACT--TTAGTAAAGCTCAAAGC  27637832
 
Query  2781      AGACTTAGACTCCCACACATTAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAACATTAGA  2840
                | || | |  | |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || | ||
Sbjct  27637833  ACACATTGCGCCTCACACAATAATAGTGGGAGACTTCAACACACCACTTTCACCAATGGA  27637892
 
Query  2841      CAGATCAACGAGACAGAAAGTCAACAAGGATACCCAGGAATTGAACTCAGCTCTGCAGCA  2900
                |||||||  || ||||||| | |||| ||| || | | || | |    ||  || | ||
Sbjct  27637893  CAGATCATGGAAACAGAAACTAAACAGGGACACACTGAAACTAACAGAAGTGATGAAACA  27637952
 
Query  2901      AGCGGACCTAATAGACATCTACAGAACTCTCCACCCCAAATCAACAGAATATACATTTTT  2960
                |  ||| || | ||| |||||||||||  |  ||| ||| ||| || |||||| || ||
Sbjct  27637953  AATGGATCTGACAGATATCTACAGAACATTTTTCCCTAAAACAAAAGGATATACCTTCTT  27638012
 
Query  2961      TTCAGCACCACACCACACCTACTCCAAAATTGACCACATACTGGGAAGTAAAGCACTCCT  3020
                  |||||||| ||    |||| ||||||||||||||||||| | ||    ||| ||  |||
Sbjct  27638013  CTCAGCACCTCATGGTACCTTCTCCAAAATTGACCACATAATAGGTCACAAATCAGGCCT  27638072
 
Query  3021      CAGCAAATGTAAAAGAACAGAAATTATAACAAACTATC-TCTCAGACCACAGTGCAATCA  3079
                || || ||  ||||  |  |||||| |  ||  |||| | ||||| |||  |||| | |
Sbjct  27638073  CAACAGATTCAAAAATATTGAAATTGTCCCATG-TATCCTATCAGATCACCATGCACTAA  27638131
 
Query  3080      AACTAGAACT-CAGGATTAAGA-ATCTCACTCAAAACCGCTCAACTACATGGAAACTGAA  3137
                  || || || ||  |  || | |  | ||  ||| ||  ||  ||||||||||||||
Sbjct  27638132  GGCT-GATCTTCAATAACAAAATAAATAACAGAAAGCCAA-CATTCACATGGAAACTGAA  27638189
 
Query  3138      CAACCTGCTCCTGAATGACTACTGGGTACATAACGAAATGAAGGCAGAAATAAAGTTGTT  3197
                ||||  || || |||||  || |||  |  | | ||| |||  |||||| ||    ||
Sbjct  27638190  CAACACTCTTCTCAATGATACCTTGGTCAAGGAAGGAATAAAGAAAGAAATTAAAGACTT  27638249
 
Query  3198      CTTTGAAACCAATGAGAACAAAGACACAACATACCAGAATCTCTGGGATGCATTCAAAGC  3257
                  || ||    ||||| ||  ||| |||||| ||||  || || |||||  || | |||||
Sbjct  27638250  TTTAGAGTTTAATGAAAATGAAGCCACAACGTACCCAAACCTTTGGGACACAATGAAAGC  27638309
 
Query  3258      AGTGTGCAGAGGGAAATTTATAGCACTGAATGCCCACAAGAGAAAGCAGGAAAGATCCAA  3317
                | |    ||||||||| | |||||  ||| ||||  ||||| ||| | ||| ||| |  |
Sbjct  27638310  ATTTCTAAGAGGGAAACTCATAGCTATGAGTGCCTTCAAGAAAAAACGGGAGAGAGCACA  27638369
 
Query  3318      AATTGACACCCTAACATCACAATTAAAAGAACTAGAAAAGCAAGA-GCAAACACATTCAA  3376
                  | |  || | | ||| ||||  ||||||  ||||||||  | || |||||  ||  |||
Sbjct  27638370  TACTAGCAGCTTGACAACACATCTAAAAGCTCTAGAAAAAAAGGAAGCAAATTCACCCAA  27638429
 
Query  3377      AAGCTAGCAGAAGGGAAGAAATAACTAAAATCAGAGCAGAACTGAAGGAAATAGAGACAC  3436
                  ||  || ||| || | |||||||  ||| |||| |  ||| | ||  || | || |||
Sbjct  27638430  GAGG-AGTAGACGGCAGGAAATAATCAAACTCAGGGGTGAAATCAACCAAGTGGAAACAA  27638488
 
Query  3437      AAAAAACCCTTCAAAAAATTAATGAATCCAGGAGCTGGTTTTTTGAAAGGATAAACAAAA  3496
                  || |||  |||||| ||||||  || | ||||| ||||| ||||| |  || ||||| |
Sbjct  27638489  GAAGAACTATTCAAAGAATTAACCAAACGAGGAGTTGGTTCTTTGAGAAAATCAACAAGA  27638548
 
Query  3497      TTGATAGACCGCTAGCAAGACTAA-TAAAGAAAAAAAGAGAGAAGAATCAAATAGATGCA  3555
                | |||| |||  |||| ||||| | |||||  | | | || || |  | |||  |  |
Sbjct  27638549  TAGATAAACCCTTAGCTAGACTCACTAAAGGGCACAGG-GACAAAATCCTAATTAACAAA  27638607
 
Query  3556      ATAAAAAAATGATAAAGGGGATATCACCACCAATCCCACAGAAATACAAACTACCATCAG  3615
                || | ||| ||| || || || || || ||  ||||  |||||| ||||  ||||||||
Sbjct  27638608  ATCAGAAA-TGAAAAGGGAGACATAACAACAGATCCTGAAGAAATCCAAAACACCATCAG  27638666
 
Query  3616      AGAATACTACAAACACCTCTACGCAAATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAATGGATAAATT  3675
                |  | |||||||  || ||| |||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||
Sbjct  27638667  ATCCTTCTACAAAAGGCTATACTCAACAAAACTGGAAAACCTGGACGAAATGGACAAATT  27638726
 
Query  3676      CCTGGACACATACACTCTCCCAAGACTAAACCAGGAAGAAGTTGAATCTCTGAATAGACC  3735
                  ||||||| ||||    | ||||  | || |||||  |||||||  ||| || || ||
Sbjct  27638727  TCTGGACAGATACCAGGTACCAAAGTTGAATCAGGATCAAGTTGACCTTCTAAACAGTCC  27638786
 
Query  3736      AATAACAGGAGCTGAAATTGTGGCAATAATCAATAGCTTACCAACCAAAAAGAGTCCAGG  3795
                  ||| |      ||||| |  ||| | || |||||  | ||| ||||||| || |||||
Sbjct  27638787  CATATCCCCTAAAGAAATAGAAGCAGTTATTAATAGTCTCCCAGCCAAAAAAAGCCCAGG  27638846
 
Query  3796      ACCAGATGGATTCACAGCCGAATTCTACCAGAGGTACAAGGAGGAACTGGTACCATTCCT  3855
                |||||| || || |  || || ||||| ||||  | ||| || || ||    ||| | ||
Sbjct  27638847  ACCAGACGGGTTTAGTGCAGAGTTCTATCAGACCTTCAAAGAAGATCTAACTCCAGTTCT  27638906
 
Query  3856      TCTGAAACTATTCCAATCAATAGAAAAAGAGGGAATCCTCCCTAACTCATTTTATGACGC  3915
                  |  ||||| || ||    ||||||  ||| || || || || |||||||||||||| ||
Sbjct  27638907  GCACAAACTTTTTCACAAGATAGAAGTAGAAGGTATTCTACCCAACTCATTTTATGAAGC  27638966
 
Query  3916      CAGCATCATTCTGATACCAAAGCCAGGCAGAGACACAACAAAAAAAGAGAATTTTAGACC  3975
                ||  || | ||||||||| || |||  | |||  ||||||| | |||||| || |||||
Sbjct  27638967  CACTATTACTCTGATACCTAAACCACAGAAAGATCCAACAAAGATAGAGAACTTCAGACC  27639026
 
Query  3976      AATATCCTTGATGAACATTGAGGCAAAAATCCTCAATAAAACACTGGCAAAATGAATCCA  4035
                ||| ||  | |||||||| || |||||||| || |||||||  || || ||  |||||||
Sbjct  27639027  AATTTCTCTTATGAACATCGATGCAAAAATTCTTAATAAAATTCTCGCTAACCGAATCCA  27639086
 
Query  4036      GCAGCACATCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAAGG  4095
                  | ||||| |||    | ||||| | ||| ||||| || || || || |||||||| ||
Sbjct  27639087  AGAACACATTAAAGCAATCATCCATCCTGACCAAGTAGGTTTTATTCCAGGGATGCAGGG  27639146
 
Query  4096      CTGGTTCAATATACGCAAATCAATAAATGTAATCCAGCATAAAAACAGAGCCAAAGACAA  4155
                  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  ||| ||||| |  |||||||||
Sbjct  27639147  ATGGTTTAATATACGAAAATCCATCAATGTAATCCATTATATAAACAAACTCAAAGACAA  27639206
 
Query  4156      AAACCACATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAAGCCTTTGACAAAATTCAACAACCCTT  4215
                |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||
Sbjct  27639207  AAACCACATGATCATCTCGTTAGATGCAGAAAAAGCATTTGACAAGATCCAACACCCATT  27639266
 
Query  4216      CATGCTAAAAACTCTCAATAAATTAGGTATTGATGGGACGTATTTCAAAATAATAAGAGC  4275
                |||| |||||  |||  | | || ||| ||| | ||    ||  | || || |||| |||
Sbjct  27639267  CATGATAAAAGTTCTGGAAAGATCAGGAATTCAAGGCCAATACCTAAACATGATAAAAGC  27639326
 
Query  4276      TATCTATGACAAACCCACAGCCAATATCATACTGAATGGGCAAAAACTGGAAGCATTCTC  4335
                  |||||  ||||||  |||||| |||| | | |||||  | || ||||||||| || |
Sbjct  27639327  AATCTACAGCAAACCAGTAGCCAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCC  27639386
 
Query  4336      TTTGAAAACTGGCACAAGACAGGGATGCCCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTGTT  4395
                  | ||| | || || ||||| || ||||| || || ||  ||| |||||||||||  |
Sbjct  27639387  ACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGTACT  27639446
 
Query  4396      GGAAGTTCTGGCCAGGGCAATTAGGCAGGAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGAAA  4455
                  |||||  | ||||| |||||| | ||  | ||||| || ||||| || ||| | |||||
Sbjct  27639447  TGAAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACAAATTGGAAA  27639506
 
Query  4456      AGAGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCAGACGACATGATTGTATATCTAGAAAACCCCAT  4515
                ||||||||||||| | || || |||||||| || ||||| |||||| ||    |||| |
Sbjct  27639507  AGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAA  27639566
 
Query  4516      TGTCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAA  4575
                    ||  |  | | ||||| || ||||||| || |||| |  ||||  | ||||| ||
Sbjct  27639567  AAATTCCAACAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGGATATAA  27639626
 
Query  4576      AATCAATGTACAAAAATCACAAGCATTCTTATACACCAACAACAGACAAACAGAGAGCCA  4635
                ||| ||  | | || |||  || ||  | ||||| || || | |||  | ||||  |
Sbjct  27639627  AATTAACTCAAACAAGTCAATGGCCTTTCTCTACACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGA  27639686
 
Query  4636      AATCA-TGAGTGAACTCCCATTCACAATTGCTTCAAAGAGAATAAAATACCTAGGAATCC  4694
                ||| |  ||  ||| ||| ||| |||| ||  |||| |  |||||||| || ||  | 
Sbjct  27639687  AATTAGGGAAACAACACCC-TTCTCAATAGCCACAAATAATATAAAATATCTCGGCGTGA  27639745
 
Query  4695      AACTTACAAGGGATGTGAAGGGCCTCTTCAAGGAGAACTACAAACCTCTGCTCAAGGAAA  4754
                  || || | ||| ||||| |  || |  |  | |||| |||  | |||  || ||||
Sbjct  27639746  CTCTAACGAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAGTCCCTGAAGAAAGAAA  27639805
 
Query  4755      TAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAATA  4814
                | ||||| |||  |  | ||||||  |  | |||||||||||| | || || | ||| |
Sbjct  27639806  TTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGACCAACA  27639865
 
Query  4815      TCGTGAAAATGGCCATACTCCTCAAGGTAATTTACAGATTCAATGCCATCCCCATCAAGC  4874
                | || |||||||| ||  | |  || | ||| |||||||||||||| |||||||| || 
Sbjct  27639866  TTGTAAAAATGGCTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATTAAAA  27639925
 
Query  4875      TACCAATGACTTTCTTCACAGAACTGGAAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAA  4934
                | ||||    |||||||  ||| | |||  | | | ||  || ||||| |||||  | |
Sbjct  27639926  TTCCAACTCAATTCTTCAACGAATTAGAAGGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAATAACA  27639985
 
Query  4935      AGAGAGCCCACATCGCCAAGTCAATCCT--AAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCAC  4992
                | | | |    || || ||  |  | ||  | |  ||||||||    |||| || |||||
Sbjct  27639986  AAAAACCGAGGATAGCAAAAACTCTTCTCAAGGATAAAAGAAC--CTCTGGTGGAATCAC  27640043
 
Query  4993      ACTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGGTA  5052
                  | |||||| | || || |||||||  || |  || |  ||||| ||||||||||||||
Sbjct  27640044  CATGCCTGACCTAAAGCTTTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGGTA  27640103
 
Query  5053      CCAAAACAGAGATATTGATCAATGGAACAGAACAGGGCCCTCAGAAATAACGCCGCATAT  5112
                    | ||||| |  | || |||||||| ||||  |    | ||||||| |  || || |
Sbjct  27640104  TAGAGACAGACAAGTGGACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACACAC  27640163
 
Query  5113      CTACAACTATCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCT  5172
                |||    |  ||||||| |||||    | ||||| ||  || |||  || ||  | |
Sbjct  27640164  CTATGGTCACTTGATCTTCGACAAGGGAGCCAAAACCATCCAGTGGAAGAAAGACAGCAT  27640223
 
Query  5173      ATTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCAT-ATGTAGAAAGCTGAAACTGGATC  5231
                  || || || ||||||||| | |||||| | |  || ||||||||  ||  | ||||||
Sbjct  27640224  TTTCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGG-TTGTTATCATGTAGAAGAATGCGAATGGATC  27640282
 
Query  5232      CCTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTTAGAC  5291
                | | | |  | |||| ||| ||  |||| || |  ||||| || ||  |  || | | ||
Sbjct  27640283  CATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAAGGAACTTCACATAAAAC  27640342
 
Query  5292      CTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACGTAGGCATTACCATTCAGGACATAGGCATGG  5351
                |  | ||  | |||    |||| || || || || |  | | || | || || ||||  |
Sbjct  27640343  CAGAGACACTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTTGAAGATATGGGCACAG  27640402
 
Query  5352      GCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGACAAAATTGACAAAT  5411
                |  |  | ||| ||  | |||| |||  ||    ||  || |  | |||||||||||
Sbjct  27640403  GGGAAAAATTCCTGAACAGAACAGCAATGGCTTGTGCTGTAAGATCGAGAATTGACAAAT  27640462
 
Query  5412      GGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACT-ACCATCAGAGTGAAC  5470
                |||| ||||| |||||  | || |||||||  |||||||| |||  | || |||  ||
Sbjct  27640463  GGGACCTAATGAAACTCCAAAGTTTCTGCAAGGCAAAAGACACTGTCTATAAGA-CAAAA  27640521
 
Query  5471      AGGCAACCTACAAAATGGGAGAAAATTTTTGC--AACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAA  5528
                || | ||| ||| | ||||| |  || ||| |  | ||||  ||| || |  || ||||
Sbjct  27640522  AGACCACCAACAGACTGGGAAAGGATCTTTACCTATCCTA--AATCAGATAGGGGACTAA  27640579
 
Query  5529      TATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAATTTACAAGAAAAAAACAAACAACCCCATCA  5588
                ||||||  || || || ||||||||  |  |  ||  | |||| |||| |||||| | |
Sbjct  27640580  TATCCAACATATATAAAGAACTCAAGAAGGTGGACCTCAGAAAATCAAATAACCCCCTTA  27640639
 
Query  5589      AAAAGTGGGTGAAGGACATGAACAGACACTTCTCA---AAAGAAGACATTTATGCAGCCA  5645
                |||| ||||    ||  |||||| | | ||||||    | ||| ||    |||  || 
Sbjct  27640640  AAAAATGGGGCTCAGAACTGAACAAAGAATTCTCACCTGAGGAATAC-CGAATG--GCAG  27640696
 
Query  5646      ACAGACACATGAAAAAATGCTCATCATCACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCA  5705
                | |  ||| |||||||||| ||| ||||  |  |||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct  27640697  AGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAA  27640756
 
Query  5706      CAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGCGATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACA  5765
                |  |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |  || ||||| |||||  ||| ||
Sbjct  27640757  CCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTGAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCA  27640816
 
Query  5766      GGTGCTGGAGAGGATGTGGAGAAATAGGAACATTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAAC  5825
                | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |  | || ||||||||||| || |  |
Sbjct  27640817  GATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGC  27640876
 
Query  5826      TAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAGAACTGGAAATAC  5885
                | || |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||  |  | ||  | | | |||
Sbjct  27640877  TTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTAC  27640936
 
Query  5886      CATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCATGCTGCT  5945
                |    || ||||| || ||  | ||||| ||||| ||| | ||    |  |  ||| |
Sbjct  27640937  CGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGA----AGCCCCAACTGGT  27640992
 
Query  5946      -ATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTGG  6004
                  | || ||||||||| |  |||||| || || || ||||| | |||||| |  |  |||
Sbjct  27640993  AAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAACTGG  27641052
 
Query  6005      AACCAACCCAAATGTCTAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACC  6064
                ||  |||||| ||| |  |||    || |||||  ||||||||||| |||| |||||
Sbjct  27641053  AAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACA  27641112
 
Query  6065      ATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATG  6124
                ||||| |||||  |||| || |||||  |||| || |||  ||  |||  | |||||||
Sbjct  27641113  ATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATG  27641172
 
Query  6125      AAATTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATA  6184
                  |  |||| | |||||| || ||| |  || | |||  |||||  | |  ||||  ||
Sbjct  27641173  GACCTGGAGAGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACAATCACAAAGGAACTCACACAATATG  27641232
 
Query  6185      TTCTCACTCATAGGTGG  6201
                | |||||| ||| ||||
Sbjct  27641233  TACTCACTGATAAGTGG  27641249
 
 
Features flanking this part of subject sequence:
  400561 bp at 5' side: tenascin C
  699609 bp at 3' side: pregnancy-associated plasma protein A
 
 
Score = 1368 bits (1516),  Expect = 0.0
Identities = 2606/3799 (68%), Gaps = 48/3799 (1%)
Strand=Plus/Minus
 
Query  2425    AATGGACTAAATGCTCCAATTAAAAGACACAGACTAGCAAATTGGATAAAGAGTCAAGAC  2484
                ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| || | |  ||||||
Sbjct  3714582  AATGGTCTCAACTCGCCAATAAAAAGACATAGACTAACAAACTGGCTACACAAACAAGAC  3714523
 
Query  2485    CCATCAGTGTGCTGTATTCAGGAAACCCATCTCACATGCAGAGACACACATAGGCTCAAA  2544
                ||| || | |||||  | |||||||| ||||||| |  | ||| | |||    |||| |
Sbjct  3714522  CCAACATTTTGCTGCTTACAGGAAACTCATCTCAGAGAAAAAGATAGACACTACCTCAGA  3714463
 
Query  2545    ATAAAGGGATGGAGGAAGATCTACCAAGCAAACGGAAAACAAAAAAAGGCAGGGGTTGCA  2604
                || || || ||||  |  || | ||||||||| || |  | ||| | ||||| || ||
Sbjct  3714462  ATGAAAGGCTGGAAAACAATTTTCCAAGCAAATGGTATGAAGAAACAAGCAGGAGTAGCC  3714403
 
Query  2605    ATCCTAGTCTCTGATAAAACAGACTTTAAACCAACAAAG--ATCAAAAGAGACAAAGAAG  2662
                |||||| | |||||||| |  |||||  ||||  |||||  ||||||| |||||| || |
Sbjct  3714402  ATCCTAATATCTGATAAGATTGACTTCCAACC--CAAAGTCATCAAAAAAGACAAGGAGG  3714345
 
Query  2663    GCCATTACATAATGGTAAAGGGATCAATTCAACAAGAAGAGCTAACTATCCTAAATATAT  2722
                | || | |||  |  | || ||  ||| |  ||||| || ||  | || || ||||| |
Sbjct  3714344  GACACTTCATTCTCATCAAAGGTAAAATCCTCCAAGAGGAACTCTCAATTCTGAATATCT  3714285
 
Query  2723    ATGCACCCAATACAGGAGCACCAAGATTCA-TAAAGCAAGTCCTGAGTGACCTACAAAG-  2780
                |||| || |||||| ||||| | | ||||| ||||| || |  | ||| |    |||||
Sbjct  3714284  ATGCTCCAAATACAAGAGCAGCCACATTCACTAAAGAAACT--TTAGTAAAGCTCAAAGC  3714227
 
Query  2781    AGACTTAGACTCCCACACATTAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAACATTAGA  2840
                | || | |  | |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || | ||
Sbjct  3714226  ACACATTGCGCCTCACACAATAATAGTGGGAGACTTCAACACACCACTTTCACCAATGGA  3714167
 
Query  2841    CAGATCAACGAGACAGAAAGTCAACAAGGATACCCAGGAATTGAACTCAGCTCTGCAGCA  2900
                |||||||  || ||||||| | |||| ||| || | | || | |    ||  || | ||
Sbjct  3714166  CAGATCATGGAAACAGAAACTAAACAGGGACACACTGAAACTAACAGAAGTGATGAAACA  3714107
 
Query  2901    AGCGGACCTAATAGACATCTACAGAACTCTCCACCCCAAATCAACAGAATATACATTTTT  2960
                |  ||| || | ||| |||||||||||  |  | || ||| ||| || |||||| || ||
Sbjct  3714106  AATGGATCTGACAGATATCTACAGAACATTTTATCCTAAAACAAAAGGATATACCTTCTT  3714047
 
Query  2961    TTCAGCACCACACCACACCTACTCCAAAATTGACCACATACTGGGAAGTAAAGCACTCCT  3020
                |||||||| ||    |||| ||||||||||||||||||| | ||    ||| ||  |||
Sbjct  3714046  CTCAGCACCTCATGGTACCTTCTCCAAAATTGACCACATAATAGGTCACAAATCAGGCCT  3713987
 
Query  3021    CAGCAAATGTAAAAGAACAGAAATTATAACAAACTATC-TCTCAGACCACAGTGCAATCA  3079
                || || ||| ||||  |  |||||| |  ||  |||| | ||||| |||  |||| | |
Sbjct  3713986  CAACAGATGCAAAAATATTGAAATTGTCCCATG-TATCCTATCAGATCACCATGCACTAA  3713928
 
Query  3080    AACTAGAACT-CAGGATTAAGA-ATCTCACTCAAAACCGCTCAACTACATGGAAACTGAA  3137
                  || || || ||  |  || | |  | ||  ||| ||  ||  ||||||||||||||
Sbjct  3713927  GGCT-GATCTTCAATAACAAAATAAATAACAGAAAGCCAA-CATTCACATGGAAACTGAA  3713870
 
Query  3138    CAACCTGCTCCTGAATGACTACTGGGTACATAACGAAATGAAGGCAGAAATAAAGTTGTT  3197
                ||||  || || |||||  || |||  |  | ||||| |||  |||||| ||    ||
Sbjct  3713869  CAACACTCTTCTCAATGATACCTTGGTCAAGGAAGAAATAAAGAAAGAAATTAAAGACTT  3713810
 
Query  3198    CTTTGAAACCAATGAGAACAAAGACACAACATACCAGAATCTCTGGGATGCATTCAAAGC  3257
                || ||    ||||| ||  ||| |||||| ||||  || || |||||  || | |||||
Sbjct  3713809  TTTAGAGTTTAATGAAAATGAAGCCACAACGTACCCAAACCTTTGGGACACAATGAAAGC  3713750
 
Query  3258    AGTGTGCAGAGGGAAATTTATAGCACTGAATGCCCACAAGAGAAAGCAGGAAAGATCCAA  3317
                | |    ||||||||| | |||||  ||| ||||  ||||| ||| | ||| ||| |  |
Sbjct  3713749  ATTTCTAAGAGGGAAACTCATAGCTATGAGTGCCTTCAAGAAAAAACGGGAGAGAGCACA  3713690
 
Query  3318    AATTGACACCCTAACATCACAATTAAAAGAACTAGAAAAGCAAGA-GCAAACACATTCAA  3376
                | |  || | | ||| ||||  ||||||  ||||||||  | || |||||  ||  |||
Sbjct  3713689  TACTAGCAGCTTGACAACACATCTAAAAGCTCTAGAAAAAAAGGAAGCAAATTCACCCAA  3713630
 
Query  3377    AAGCTAGCAGAAGGGAAGAAATAACTAAAATCAGAGCAGAACTGAAGGAAATAGAGACAC  3436
                ||  || ||| || | |||||||  ||| |||| |  ||| | ||  || | || |||
Sbjct  3713629  GAGG-AGTAGACGGCAGGAAATAATCAAACTCAGGGGTGAAATCAACCAAGTGGAAACAA  3713571
 
Query  3437    AAAAAACCCTTCAAAAAATTAATGAATCCAGGAGCTGGTTTTTTGAAAGGATAAACAAAA  3496
                || |||  |||||| ||||||  || | ||||| ||||| ||||| |  || ||||| |
Sbjct  3713570  GAAGAACTATTCAAAGAATTAACCAAACGAGGAGTTGGTTCTTTGAGAAAATCAACAAGA  3713511
 
Query  3497    TTGATAGACCGCTAGCAAGACTAA-TAAAGAAAAAAAGAGAGAAGAATCAAATAGATGCA  3555
                | |||| |||  ||| ||||| | |||||  | | | || || |  | |||  |  |
Sbjct  3713510  TAGATAAACCCTCAGCTAGACTCACTAAAGGGCACAGG-GACAAAATCCTAATTAACAAA  3713452
 
Query  3556    ATAAAAAAATGATAAAGGGGATATCACCACCAATCCCACAGAAATACAAACTACCATCAG  3615
                || | ||| ||| || || || || || ||  ||||  |||||| ||||  ||||||||
Sbjct  3713451  ATCAGAAA-TGAAAAGGGAGACATAACAACAGATCCTGAAGAAATCCAAAACACCATCAG  3713393
 
Query  3616    AGAATACTACAAACACCTCTACGCAAATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAATGGATAAATT  3675
                |  | |||||||  || ||| |||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||
Sbjct  3713392  ATCCTTCTACAAAAGGCTATACTCAACAAAACTGGAAAACCTGGACGAAATGGACAAATT  3713333
 
Query  3676    CCTGGACACATACACTCTCCCAAGACTAAACCAGGAAGAAGTTGAATCTCTGAATAGACC  3735
                ||||||| ||||    | ||||  | || |||||  |||||||  ||| || || ||
Sbjct  3713332  TCTGGACAGATACCAGGTACCAAAGTTGAATCAGGATCAAGTTGACCTTCTAAACAGTCC  3713273
 
Query  3736    AATAACAGGAGCTGAAATTGTGGCAATAATCAATAGCTTACCAACCAAAAAGAGTCCAGG  3795
                ||| |      ||||| |  ||| | || |||||  | ||| ||||||| || |||||
Sbjct  3713272  CATATCCCCTAAAGAAATAGAAGCAGTTATTAATAGTCTCCCAGCCAAAAAAAGCCCAGG  3713213
 
Query  3796    ACCAGATGGATTCACAGCCGAATTCTACCAGAGGTACAAGGAGGAACTGGTACCATTCCT  3855
                ||||||  | || |  || || ||||| ||||  | ||| || || ||    ||| | ||
Sbjct  3713212  ACCAGACAGGTTTAGTGCAGAGTTCTATCAGACCTTCAAAGAAGATCTAACTCCAGTTCT  3713153
 
Query  3856    TCTGAAACTATTCCAATCAATAGAAAAAGAGGGAATCCTCCCTAACTCATTTTATGACGC  3915
                |  ||||| || ||    ||||||  ||| || || || || |||||||||||||| ||
Sbjct  3713152  GCACAAACTTTTTCACAAGATAGAAGTAGAAGGTATTCTACCCAACTCATTTTATGAAGC  3713093
 
Query  3916    CAGCATCATTCTGATACCAAAGCCAGGCAGAGACACAACAAAAAAAGAGAATTTTAGACC  3975
                ||  || | ||||||||| || |||  | |||  ||||||| | |||||| || |||||
Sbjct  3713092  CACTATTACTCTGATACCTAAACCACAGAAAGATCCAACAAAGATAGAGAACTTCAGACC  3713033
 
Query  3976    AATATCCTTGATGAACATTGAGGCAAAAATCCTCAATAAAACACTGGCAAAATGAATCCA  4035
                ||| ||  | |||||||| || ||||||||||| |||||||  || || ||  |||||||
Sbjct  3713032  AATTTCTCTTATGAACATCGATGCAAAAATCCTTAATAAAATTCTCGCTAACCGAATCCA  3712973
 
Query  4036    GCAGCACATCAAAAAGC--TTATCCACCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAA  4093
                  || ||||  |||||  | ||||| | ||| ||||| || || || || ||||||||
Sbjct  3712972  --AGAACATATTAAAGCAATCATCCATCCTGACCAAGTAGGTTTTATTCCAGGGATGCAG  3712915
 
Query  4094    GGCTGGTTCAATATACGCAAATCAATAAATGTAATCCAGCATAAAAACAGAGCCAAAGAC  4153
                || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  ||| ||||| |  |||||||
Sbjct  3712914  GGATGGTTTAATATACGAAAATCCATCAATGTAATCCATTATATAAACAAACTCAAAGAC  3712855
 
Query  4154    AAAAACCACATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAAGCCTTTGACAAAATTCAACAACCC  4213
                |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||
Sbjct  3712854  AAAAACCACATGATCATCTCGTTAGATGCAGAAAAAGCATTTGACAAGATCCAACACCCA  3712795
 
Query  4214    TTCATGCTAAAAACTCTCAATAAATTAGGTATTGATGGGACGTATTTCAAAATAATAAGA  4273
                |||||| |||||  |||  | | || ||| ||| | ||    ||  | || || |||| |
Sbjct  3712794  TTCATGATAAAAGTTCTGGAAAGATCAGGAATTCAAGGCCAATACCTAAACATGATAAAA  3712735
 
Query  4274    GCTATCTATGACAAACCCACAGCCAATATCATACTGAATGGGCAAAAACTGGAAGCATTC  4333
                || |||||  ||||||  |||||| |||| | | |||||  | || |||||| || ||
Sbjct  3712734  GCAATCTACAGCAAACCAGTAGCCAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAACAATC  3712675
 
Query  4334    TCTTTGAAAACTGGCACAAGACAGGGATGCCCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTG  4393
                |  | ||| | || || ||||| || ||||| || || ||  ||| |||||||||||
Sbjct  3712674  CCACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGTA  3712615
 
Query  4394    TTGGAAGTTCTGGCCAGGGCAATTAGGCAGGAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGA  4453
                | |||||  | ||||| |||||| | ||  | ||||| || ||||| || ||| | |||
Sbjct  3712614  CTTGAAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACAAATTGGA  3712555
 
Query  4454    AAAGAGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCAGACGACATGATTGTATATCTAGAAAACCCC  4513
                ||||||||||||||| | || || |||||||| || ||||| |||||| ||    ||||
Sbjct  3712554  AAAGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCT  3712495
 
Query  4514    ATTGTCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATAC  4573
                |    ||  |  | | ||||| || ||||||| || |||| |  ||||  | |||||
Sbjct  3712494  AAAAATTCCAACAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGGATAT  3712435
 
Query  4574    AAAATCAATGTACAAAAATCACAAGCATTCTTATACACCAACAACAGACAAACAGAGAGC  4633
                ||||| ||  | | || |||  || ||  | ||||| || || | |||  | |||| 
Sbjct  3712434  AAAATTAACTCAAACAAGTCAATGGCCTTTCTCTACACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAA  3712375
 
Query  4634    CAAATCA-TGAGTGAACTCCCATTCACAATTGCTTCAAAGAGAATAAAATACCTAGGAAT  4692
                |||| |  ||  ||| ||| ||| |||| ||  |||| |  |||||||| || ||  |
Sbjct  3712374  GAAATTAGGGAAACAACACCC-TTCTCAATAGCCACAAATAATATAAAATATCTCGGCGT  3712316
 
Query  4693    CCAACTTACAAGGGATGTGAAGGGCCTCTTCAAGGAGAACTACAAACCTCTGCTCAAGGA  4752
                    || || | ||| ||||| |  || |  |  | |||| |||| |||||  || ||
Sbjct  3712315  GACTCTAACGAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAATCTCTGAAGAAAGA  3712256
 
Query  4753    AATAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAA  4812
                ||| ||||| |||  |  | ||||||  |  | |||||||||||| | || || | |||
Sbjct  3712255  AATTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGACCAA  3712196
 
Query  4813    TATCGTGAAAATGGCCATACTCCTCAAGGTAATTTACAGATTCAATGCCATCCCCATCAA  4872
                || || |||||||| ||  | |  || | ||| |||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct  3712195  CATTGTAAAAATGGCTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATTAA  3712136
 
Query  4873    GCTACCAATGACTTTCTTCACAGAACTGGAAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCA  4932
                  | ||||    |||||||  ||| | |||  | | | ||  || ||||| |||||  |
Sbjct  3712135  AATTCCAACTCAATTCTTCAACGAATTAGAAGGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAATAA  3712076
 
Query  4933    AAAGAGAGCCCACATCGCCAAGTCAATCCT--AAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATC  4990
                || | | |    || || ||  |  | ||  | |  ||||||||    |||| || |||
Sbjct  3712075  CAAAAAACCGAGGATAGCAAAAACTCTTCTCAAGGATAAAAGAAC--CTCTGGTGGAATC  3712018
 
Query  4991    ACACTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGG  5050
                ||  | |||||| | || || |||||||  || |  || |  ||||| ||||||||||||
Sbjct  3712017  ACCATGCCTGACCTAAAGCTTTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGG  3711958
 
Query  5051    TACCAAAACAGAGATATTGATCAATGGAACAGAACAGGGCCCTCAGAAATAACGCCGCAT  5110
                ||  | ||||| |  | || |||||||| ||||  |    | ||||||| |  || ||
Sbjct  3711957  TATAGAGACAGACAAGTGGACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACAC  3711898
 
Query  5111    ATCTACAACTATCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCC  5170
                | |||    |  ||||||| |||||    | ||||| ||  || |||  || ||  |
Sbjct  3711897  ACCTATGGTCACTTGATCTTCGACAAGGGAGCCAAAACCATCCAGTGGAAGAAAGACAGC  3711838
 
Query  5171    CTATTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCAT-ATGTAGAAAGCTGAAACTGGA  5229
                | || || || ||||||||| | |||||| | |  || ||||||||  ||  | | ||
Sbjct  3711837  ATTTTCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGG-TTGTTATCATGTAGAAGAATGCGAATCGA  3711779
 
Query  5230    TCCCTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTTAG  5289
                ||| | | |  | |||| ||| ||  |||| || |  ||||| || ||  |  || | |
Sbjct  3711778  TCCATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAAGGATCTTCACATAAA  3711719
 
Query  5290    ACCTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACGTAGGCATTACCATTCAGGACATAGGCAT  5349
                |||  | ||  | |||    |||| || || || || |  | | || | || || ||||
Sbjct  3711718  ACCAGAGACACTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTTGAAGATATGGGCAC  3711659
 
Query  5350    GGGCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGACAAAATTGACAA  5409
                ||  |  | ||| ||  | |||| |||  ||    ||  || |  | |||||||||
Sbjct  3711658  AGGGGAAAAATTCCTGAACAGAACAGCAATGGCTTGTGCTGTAAGATCGAGAATTGACAA  3711599
 
Query  5410    ATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACT-ACCATCAGAGTGA  5468
                |||||| ||||| |||||  | || |||||||  |||||||| |||  | || |||  |
Sbjct  3711598  ATGGGACCTAATGAAACTCCAAAGTTTCTGCAAGGCAAAAGACACTGTCTATAAGA-CAA  3711540
 
Query  5469    ACAGGCAACCTACAAAATGGGAGAAAATTTTTGC--AACCTACTCATCTGACAAAGGGCT  5526
                | || | ||| ||| | ||||| |  || ||| |  | ||||  ||| || |  || ||
Sbjct  3711539  AAAGACCACCAACAGACTGGGAAAGGATCTTTACCTATCCTA--AATCAGATAGGGGACT  3711482
 
Query  5527    AATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAATTTACAAGAAAAAAACAAACAACCCCAT  5586
                ||||||||  || || || ||||||||  |  |  ||  | |||| |||| |||||| |
Sbjct  3711481  AATATCCAACATATATAAAGAACTCAAGAAGGTGGACTTCAGAAAATCAAATAACCCCCT  3711422
 
Query  5587    CAAAAAGTGGGTGAAGGACATGAACAGACACTTCTCA---AAAGAAGACATTTATGCAGC  5643
                ||||| ||||    ||  |||||| | | ||||||    | ||| ||    |||  ||
Sbjct  3711421  TAAAAAATGGGGCTCAGAACTGAACAAAGAATTCTCACCTGAGGAATAC-CGAATG--GC  3711365
 
Query  5644    CAACAGACACATGAAAAAATGCTCATCATCACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAAC  5703
                  | |  ||| |||||||||| ||| ||||  |  |||||| |||||||||||||||||
Sbjct  3711364  AGAGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAAC  3711305
 
Query  5704    CACAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGCGATCATTAAAAAGTCAGGAAACAA  5763
                ||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |  || ||||| |||||  |||
Sbjct  3711304  AACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAG  3711245
 
Query  5764    CAGGTGCTGGAGAGGATGTGGAGAAATAGGAACATTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAA  5823
                ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |  | || ||||||||||| || |
Sbjct  3711244  CAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAG  3711185
 
Query  5824    ACTAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAGAACTGGAAAT  5883
                || || |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||  |  | ||  | | | |
Sbjct  3711184  GCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACT  3711125
 
Query  5884    ACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCATGCTG  5943
                |||    || ||||| || ||  | ||||| ||||| ||| | ||    |  |  |||
Sbjct  3711124  ACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGA----AGCCCCAACTG  3711069
 
Query  5944    CT-ATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTT  6002
                | | || ||||||||| |  |||||| || || || ||||| | |||||| |  |  |
Sbjct  3711068  GTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAACT  3711009
 
Query  6003    GGAACCAACCCAAATGTCTAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACA  6062
                ||||  |||||| ||| |  |||    || |||||  ||||||||||| |||| ||||
Sbjct  3711008  GGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACA  3710949
 
Query  6063    CCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGA  6122
                | ||||| |||||  |||| || |||||  |||| || |||  ||  |||  | |||||
Sbjct  3710948  CAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGA  3710889
 
Query  6123    TGAAATTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCA  6182
                || |  ||||  |||||| || ||| |  || | |||  |||||  | |  ||||  |
Sbjct  3710888  TGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACAATCACAAAGGAACTCACACAATA  3710829
 
Query  6183    TATTCTCACTCATAGGTGG  6201
                | | |||||| ||| ||||
Sbjct  3710828  TGTACTCACTGATAAGTGG  3710810
 


and that's not all.
and that's not all.

Revision as of 05:11, 1 August 2009

Genetics of human eye development <html><img src="/images/9/94/Report.png" border="0" /></html> Main project page
<html><img src="/images/c/c3/Resultset_previous.png" border="0" /></html>Previous entry<html>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</html>Next entry<html><img src="/images/5/5c/Resultset_next.png" border="0" /></html>

Choosing mouse primers for ChIP trials upon Nicolas' return

Amorces pour tester enrichissement de fragments après ChIP - souris

  • Typique pour FAIRE chez l'homme
  • Typiquement pas ressortissant par FAIRE

Synteny pour le chromosome 1 vaguement du début jusqu'à 60,000,000 c’est pareil que 90-150,000,000 sur le chromosome 4 de souris (Ensembl). Et de 160,000,000-210,000,000 c’est pareil que de 140,000,000 a la fin sur le chromosome 1 murin.

Si je BLAST une séquence du chr 1 humain elle s'aligne sur le chr 4 murin position 58,680K-63,140K comme attendu entre 4B3 et 4C1, beaucoup de petites séquences alignées.

La demande etait:

07-31 15:29 76HH15VW01N blastn Nucleotide Sequence (7158 letters) 7158 gpipe/10090/all_contig (expires) 08-02 03:29

Parmi les resultats,

ref|NT_039260.7|Mm4_39300_37 Mus musculus chromosome 4 genomi... 1389

Mais il y en avait 96638 d'alignements!!

Parmi eux quelques sequences (et cela formatte tres mal, et je recois l'avertissement "WARNING: This page is 205 kilobytes long; some browsers may have problems editing pages approaching or longer than 32kb. Please consider breaking the page into smaller sections."

Si seulement je voyais comment preserver les retours chariots! >ref|NT_039260.7|Mm4_39300_37 Download subject sequence spanning the HSP Mus musculus chromosome 4 genomic contig, strain C57BL/6J Length=28591323

Features flanking this part of subject sequence:
  7941 bp at 5' side: hypothetical protein LOC52829
  313973 bp at 3' side: multiple PDZ domain protein


Score = 1389 bits (1540),  Expect = 0.0
Identities = 2606/3795 (68%), Gaps = 40/3795 (1%)
Strand=Plus/Minus

Query 2425 AATGGACTAAATGCTCCAATTAAAAGACACAGACTAGCAAATTGGATAAAGAGTCAAGAC 2484

Sbjct 20240169 AATGGTCTCAACTCGCCAATAAAAAGACATAGACTAACAAACTGGTTACAGAAACAAGAC 20240110

Query 2485 CCATCAGTGTGCTGTATTCAGGAAACCCATCTCACATGCAGAGACACACATAGGCTCAAA 2544

| | | |

Sbjct 20240109 CCAACATTTTGCTGCTTACAGGAAACTCATCTCAGAGAAAAAGATAGACACTACCTCAGA 20240050

Query 2545 ATAAAGGGATGGAGGAAGATCTACCAAGCAAACGGAAAACAAAAAAAGGCAGGGGTTGCA 2604

| |

Sbjct 20240049 ATGAAAGGCTGGAAAACAATTTTCCAAGCAAATGGTATGAAGAAACAAGCAGGAGTAGCC 20239990

Query 2605 ATCCTAGTCTCTGATAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAGAGACAAAGAAGGC 2664

|

Sbjct 20239989 ATCCTAATATCTGATAAGATTGACTTCCAACCCAAAATCATCAAAAAAGACAAGGAGGGA 20239930

Query 2665 CATTACATAATGGTAAAGGGATCAATTCAACAAGAAGAGCTAACTATCCTAAATATATAT 2724

| | | |

Sbjct 20239929 CACTTCATTCTCATCAAAGGTAAAATCCTCCAAGAGGAACTCTCAATTCTGAATATCTAT 20239870

Query 2725 GCACCCAATACAGGAGCACCAAGATTCA-TAAAGCAAGTCCTGAGTGACCTACAAAG-AG 2782

| | | | |

Sbjct 20239869 GCTCCAAATACAAGAGCAGCCACATTCACTAAAGAAACT--TTAGTAAAGCTCAAAGCAC 20239812

Query 2783 ACTTAGACTCCCACACATTAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAACATTAGACA 2842

| | |

Sbjct 20239811 ACATTGCGCCTCACACAATAATAGTGGGAGACTTCAACACACCACTTTCACCAATGGACA 20239752

Query 2843 GATCAACGAGACAGAAAGTCAACAAGGATACCCAGGAATTGAACTCAGCTCTGCAGCAAG 2902

| | |

Sbjct 20239751 GATCATGGAAACAGAAACTAAACAGGGACACACTGAAACTAACAGAAGTGATGAAACAAA 20239692

Query 2903 CGGACCTAATAGACATCTACAGAACTCTCCACCCCAAATCAACAGAATATACATTTTTTT 2962

|

Sbjct 20239691 TGGATCTGACAGATATCTACAGAACATTTTTCCCTAAAACAAAAGGATATACCTTCTTCT 20239632

Query 2963 CAGCACCACACCACACCTACTCCAAAATTGACCACATACTGGGAAGTAAAGCACTCCTCA 3022

|

Sbjct 20239631 CAGCACCTCATGGTACCTTCTCCAAAATTGACCACATAATAGGTCACAAATCAGGCCTCA 20239572

Query 3023 GCAAATGTAAAAGAACAGAAATTATAACAAACTATC-TCTCAGACCACAGTGCAATCAAA 3081

|

Sbjct 20239571 ACAGATTCAAAAATATTGAAATTGTCCCATG-TATCCTATCAGATCACCATGCACTAAGG 20239513

Query 3082 CTAGAACT-CAGGATTAAGA-ATCTCACTCAAAACCGCTCAACTACATGGAAACTGAACA 3139

| |

Sbjct 20239512 CT-GATCTTCAATAACAAAATAAATAACAGAAAGCCAA-CATTCACATGGAAACTGAACA 20239455

Query 3140 ACCTGCTCCTGAATGACTACTGGGTACATAACGAAATGAAGGCAGAAATAAAGTTGTTCT 3199

| | |

Sbjct 20239454 ACACTCTTCTCAATGATACCTTGGTCAAGGAAGGAATAAAGAAAGAAATTAAAGACTTTT 20239395

Query 3200 TTGAAACCAATGAGAACAAAGACACAACATACCAGAATCTCTGGGATGCATTCAAAGCAG 3259

Sbjct 20239394 TAGAGTTTAATGAAAATGAAGCCACAACGTACCCAAACCTTTGGGACACAATGAAAGCAT 20239335

Query 3260 TGTGCAGAGGGAAATTTATAGCACTGAATGCCCACAAGAGAAAGCAGGAAAGATCCAAAA 3319

| | | | |

Sbjct 20239334 TTCTAAGAGGGAAACTCATAGCTATGAGTGCCTTCAAGAAAAAACGGGAGAGAGCACATA 20239275

Query 3320 TTGACACCCTAACATCACAATTAAAAGAACTAGAAAAGCAAGA-GCAAACACATTCAAAA 3378

| |

Sbjct 20239274 CTAGCAGCTTGACAACACATCTAAAAGCTCTAGAAAAAAAGGAAGCAAATTCACCCAAGA 20239215

Query 3379 GCTAGCAGAAGGGAAGAAATAACTAAAATCAGAGCAGAACTGAAGGAAATAGAGACACAA 3438

| |

Sbjct 20239214 GG-AGTAGATGGCAGGAAATAATCAAACTCAGGGGTGAAATCAACCAAGTGGAAACAAGA 20239156

Query 3439 AAAACCCTTCAAAAAATTAATGAATCCAGGAGCTGGTTTTTTGAAAGGATAAACAAAATT 3498

|

Sbjct 20239155 AGAACTATTCAAAGAATTAACCAAACGAGGAGTTGGTTCTTTGAGAAAATCAACAAGATA 20239096

Query 3499 GATAGACCGCTAGCAAGACTAA-TAAAGAAAAAAAGAGAGAAGAATCAAATAGATGCAAT 3557

| | | | | |

Sbjct 20239095 GATAAACCCTTAGCTAGACTCACTAAAGGGCACAGG-GACAAAATCCTAATTAACAAAAT 20239037

Query 3558 AAAAAAATGATAAAGGGGATATCACCACCAATCCCACAGAAATACAAACTACCATCAGAG 3617

Sbjct 20239036 CAGAAA-TGAAAAGGGAGACATAACAACAGATCCTGAAGAAATCCAAAACACCATCAGAT 20238978

Query 3618 AATACTACAAACACCTCTACGCAAATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAATGGATAAATTCC 3677

|

Sbjct 20238977 CCTTCTACAAAAGGCTATACTCAACAAAACTGGAAAACCTGGACGAAATGGACAAATTTC 20238918

Query 3678 TGGACACATACACTCTCCCAAGACTAAACCAGGAAGAAGTTGAATCTCTGAATAGACCAA 3737

Sbjct 20238917 TGGACAGATACCAGGTACCAAAGTTGAATCAGGATCAAGTTGACCTTCTAAACAGTCCCA 20238858

Query 3738 TAACAGGAGCTGAAATTGTGGCAATAATCAATAGCTTACCAACCAAAAAGAGTCCAGGAC 3797

| | |

Sbjct 20238857 TATCACCTAAAGAAATAGAAGCAGTTATTAATAGTCTCCCAGCCAAAAAAAGCCCAGGAC 20238798

Query 3798 CAGATGGATTCACAGCCGAATTCTACCAGAGGTACAAGGAGGAACTGGTACCATTCCTTC 3857

|

Sbjct 20238797 CAGACGGGTTTAGTGCAGAGTTCTATCAGACCTTCAAAGAAGATCTAACTCCAGTTCTGC 20238738

Query 3858 TGAAACTATTCCAATCAATAGAAAAAGAGGGAATCCTCCCTAACTCATTTTATGACGCCA 3917

Sbjct 20238737 ACAAACTTTTTCACAAGATAGAAGTAGAAGGTATTCTACCCAACTCATTTTATGAAGCCA 20238678

Query 3918 GCATCATTCTGATACCAAAGCCAGGCAGAGACACAACAAAAAAAGAGAATTTTAGACCAA 3977

| | |

Sbjct 20238677 CTATTACTCTGATACCTAAACCACAGAAAGATCCAACAAAGATAGAGAACTTCAGACCAA 20238618

Query 3978 TATCCTTGATGAACATTGAGGCAAAAATCCTCAATAAAACACTGGCAAAATGAATCCAGC 4037

Sbjct 20238617 TTTCTCTTATGAACATCGATGCAAAAATCCTTAATAAAATTCTCGCTAACCGAATCCAAG 20238558

Query 4038 AGCACATCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAAGGCT 4097

| |

Sbjct 20238557 AACACATTAAAGCAATCATCCATCCTGACCAAGTAGGTTTTATTCCAGGGATGCAGGGAT 20238498

Query 4098 GGTTCAATATACGCAAATCAATAAATGTAATCCAGCATAAAAACAGAGCCAAAGACAAAA 4157

|

Sbjct 20238497 GGTTTAATATACGAAAATCCATCAATGTAATCCATTATATAAACAAACTCAAAGACAAAA 20238438

Query 4158 ACCACATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAAGCCTTTGACAAAATTCAACAACCCTTCA 4217

Sbjct 20238437 ACCACATGATCATCTCGTTAGATGCAGAAAAAGCATTTGACAAGATCCAACACCCATTCA 20238378

Query 4218 TGCTAAAAACTCTCAATAAATTAGGTATTGATGGGACGTATTTCAAAATAATAAGAGCTA 4277

| | | |

Sbjct 20238377 TGATAAAAGTTCTGGAAAGATCAGGAATTCAAGGCCAATACCTAAACATGATAAAAGCAA 20238318

Query 4278 TCTATGACAAACCCACAGCCAATATCATACTGAATGGGCAAAAACTGGAAGCATTCTCTT 4337

| |

Sbjct 20238317 TCTACAGCAAACCAGTAGCCAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCCAC 20238258

Query 4338 TGAAAACTGGCACAAGACAGGGATGCCCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTGTTGG 4397

| | |

Sbjct 20238257 TAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGTACTTG 20238198

Query 4398 AAGTTCTGGCCAGGGCAATTAGGCAGGAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGAAAAG 4457

| |

Sbjct 20238197 AAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACAAATTGGAAAAG 20238138

Query 4458 AGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCAGACGACATGATTGTATATCTAGAAAACCCCATTG 4517

Sbjct 20238137 AGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAAAA 20238078

Query 4518 TCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAA 4577

|

Sbjct 20238077 ATTCTACCAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGGATATAAAA 20238018

Query 4578 TCAATGTACAAAAATCACAAGCATTCTTATACACCAACAACAGACAAACAGAGAGCCAAA 4637

| |

Sbjct 20238017 TAAACTCAAACAAGTCAATGGCCTTTCTCTATACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGAAA 20237958

Query 4638 TCA-TGAGTGAACTCCCATTCACAATTGCTTCAAAGAGAATAAAATACCTAGGAATCCAA 4696

Sbjct 20237957 TTAGGGAAACAACACCC-TTCTCAATAGTCACAAATAATATAAAATATCTTGGCGTGACT 20237899

Query 4697 CTTACAAGGGATGTGAAGGGCCTCTTCAAGGAGAACTACAAACCTCTGCTCAAGGAAATA 4756

| | |

Sbjct 20237898 CTAACTAAGGAGGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAATCTCTGAAGAAAGAAATT 20237839

Query 4757 AAAGAGGATACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAATATC 4816

| | |

Sbjct 20237838 AAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGACCAACATT 20237779

Query 4817 GTGAAAATGGCCATACTCCTCAAGGTAATTTACAGATTCAATGCCATCCCCATCAAGCTA 4876

|

Sbjct 20237778 GTAAAAATGGCTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATTAAAATT 20237719

Query 4877 CCAATGACTTTCTTCACAGAACTGGAAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAAAG 4936

| | | | |

Sbjct 20237718 CCAACTCAATTCTTCAACGAATTAGAAGGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAATAACAAA 20237659

Query 4937 AGAGCCCACATCGCCAAGTCAATCCT--AAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACAC 4994

| | |

Sbjct 20237658 AAACCGAGGATAGCAAAAACTCTTCTCAAGGATAAAAGAAC--CTCTGGTGGAATCACCA 20237601

Query 4995 TACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGGTACC 5054

Sbjct 20237600 TGCCTGACCTAAAACTTTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGGTATA 20237541

Query 5055 AAAACAGAGATATTGATCAATGGAACAGAACAGGGCCCTCAGAAATAACGCCGCATATCT 5114

| | | |

Sbjct 20237540 GAGACAGACAAGTGGACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACACACCT 20237481

Query 5115 ACAACTATCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTAT 5174

| | |

Sbjct 20237480 ATGGTCACTTGATCTTCGACAAGGGAGCCAAAACCATCCAGTGGAAGAAAGACAGCATTT 20237421

Query 5175 TTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCAT-ATGTAGAAAGCTGAAACTGGATCCC 5233

| | |

Sbjct 20237420 TCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGG-TTGTTATCATGTAGAAGAATGCGAATCGATCCA 20237362

Query 5234 TTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTTAGACCT 5293

| | |

Sbjct 20237361 TACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAAGGAACTTCACATAAAACCA 20237302

Query 5294 AAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACGTAGGCATTACCATTCAGGACATAGGCATGGGC 5353

| |

Sbjct 20237301 GAGACACTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTTGAAGATATGGGCACAGGG 20237242

Query 5354 AAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGACAAAATTGACAAATGG 5413

|

Sbjct 20237241 GAAAAATTCCTGAATAGAACAGCAATGGCTTGTGCTGTAAGATCGAGAATTGACAAATGG 20237182

Query 5414 GATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACT-ACCATCAGAGTGAACAG 5472

| |

Sbjct 20237181 GACCTAATGAAACTCCAAAGTTTCTGCAAGGCAAAAGACACTGTCTATAAGA-CAAAAAG 20237123

Query 5473 GCAACCTACAAAATGGGAGAAAATTTTTGC--AACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAATA 5530

| | | |

Sbjct 20237122 ACCACCAACAGACTGGGAAAGGATCTTTACCTATCCTA--AATCAGATAGGGGACTAATA 20237065

Query 5531 TCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAATTTACAAGAAAAAAACAAACAACCCCATCAAA 5590

|

Sbjct 20237064 TCCAACATATATAAAGAACTCAAGAAGGTGGACCTCAGAAAATCAAATAACCCCCTTAAA 20237005

Query 5591 AAGTGGGTGAAGGACATGAACAGACACTTCTCA---AAAGAAGACATTTATGCAGCCAAC 5647

|

Sbjct 20237004 AAATGGGGCTCAGAACTGAACAAAGAATTCTCACCTGAGGAATAC-CGAATG--GCAGAG 20236948

Query 5648 AGACACATGAAAAAATGCTCATCATCACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCACA 5707

Sbjct 20236947 AAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACC 20236888

Query 5708 ATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGCGATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACAGG 5767

Sbjct 20236887 CTGAGATTCCACCTCACACCAGTGAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGA 20236828

Query 5768 TGCTGGAGAGGATGTGGAGAAATAGGAACATTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAACTA 5827

| |

Sbjct 20236827 TGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTT 20236768

Query 5828 GTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAGAACTGGAAATACCA 5887

| | |

Sbjct 20236767 GTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCG 20236708

Query 5888 TTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCATGCTGCT-A 5946

| | | |

Sbjct 20236707 GAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGA----AGCCCCAACTGGTAA 20236652

Query 5947 TAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAA 6006

| | |

Sbjct 20236651 GAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAACTGGAA 20236592

Query 6007 CCAACCCAAATGTCTAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCAT 6066

|

Sbjct 20236591 AGAAACCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACAAT 20236532

Query 6067 GGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAA 6126

| |

Sbjct 20236531 GGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATGGA 20236472

Query 6127 ATTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATATT 6186

| | | |

Sbjct 20236471 CCTGGAGAGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACAATCACAAAGGAACTCACACAATATGTA 20236412

Query 6187 CTCACTCATAGGTGG 6201

Sbjct 20236411 CTCACTGATAAGTGG 20236397


Features flanking this part of subject sequence:
  30424 bp at 5' side: similar to major urinary protein 1
  42331 bp at 3' side: similar to major urinary protein 1


Score = 1379 bits (1528),  Expect = 0.0
Identities = 2606/3797 (68%), Gaps = 44/3797 (1%)
Strand=Plus/Minus

Query 2425 AATGGACTAAATGCTCCAATTAAAAGACACAGACTAGCAAATTGGATAAAGAGTCAAGAC 2484

|

Sbjct 257771 AATGGTCTCAACTCGCCAATAAAAAGACATAGACTAACAAACTGGCTACACAAACAAGAC 257712

Query 2485 CCATCAGTGTGCTGTATTCAGGAAACCCATCTCACATGCAGAGACACACATAGGCTCAAA 2544

| | | |

Sbjct 257711 CCAACATTTTGCTGCTTACAGGAAACTCATCTCAGAGAAAAAGATAGACACTACCTCAGA 257652

Query 2545 ATAAAGGGATGGAGGAAGATCTACCAAGCAAACGGAAAACAAAAAAAGGCAGGGGTTGCA 2604

| |

Sbjct 257651 ATGAAAGGCTGGAAAACAATTTTCCAAGCAAATGGTATGAAGAAACAAGCAGGAGTAGCC 257592

Query 2605 ATCCTAGTCTCTGATAAAACAGACTTTAAACCAACAAAG--ATCAAAAGAGACAAAGAAG 2662

|

Sbjct 257591 ATCCTAATATCTGATAAGATTGACTTCCAACC--CAAAGTCATCAAAAAAGACAAGGAGG 257534

Query 2663 GCCATTACATAATGGTAAAGGGATCAATTCAACAAGAAGAGCTAACTATCCTAAATATAT 2722

| | | |

Sbjct 257533 GACACTTCATTCTCATCAAAGGTAAAATCCTCCAAGAGGAACTCTCAATTCTGAATATCT 257474

Query 2723 ATGCACCCAATACAGGAGCACCAAGATTCA-TAAAGCAAGTCCTGAGTGACCTACAAAG- 2780

| | | |

Sbjct 257473 ATGCTCCAAATACAAGAGCAGCCACATTCACTAAAGAAACT--TTAGTAAAGCTCAAAGC 257416

Query 2781 AGACTTAGACTCCCACACATTAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAACATTAGA 2840

| |

Sbjct 257415 ACACATTGCGCCTCACACAATAATAGTGGGAGACTTCAACACACCACTTTCACCAATGGA 257356

Query 2841 CAGATCAACGAGACAGAAAGTCAACAAGGATACCCAGGAATTGAACTCAGCTCTGCAGCA 2900

| | |

Sbjct 257355 CAGATCATGGAAACAGAAACTAAACAGGGACACACTGAAACTAACAGAAGTGATGAAACA 257296

Query 2901 AGCGGACCTAATAGACATCTACAGAACTCTCCACCCCAAATCAACAGAATATACATTTTT 2960

|

Sbjct 257295 AATGGATCTGACAGATATCTAGAGAACATTTTACCCTAAAACAAAAGGATATACCTTCTT 257236

Query 2961 TTCAGCACCACACCACACCTACTCCAAAATTGACCACATACTGGGAAGTAAAGCACTCCT 3020

|

Sbjct 257235 CTCAGCACCTCATGGTACCTTCTCCAAAATTGACCACATAATAGGTCACAAATCAGGCCT 257176

Query 3021 CAGCAAATGTAAAAGAACAGAAATTATAACAAACTATC-TCTCAGACCACAGTGCAATCA 3079

|

Sbjct 257175 CAACAGATTCAAAAATATTGAAATTGTCCCATG-TATCCTATCAGATCACCATGCACTAA 257117

Query 3080 AACTAGAACT-CAGGATTAAGA-ATCTCACTCAAAACCGCTCAACTACATGGAAACTGAA 3137

| |

Sbjct 257116 GGCT-GATCTTCAATAACAAAATAAATAACAGAAAGCCAA-CATTCACATGGAAACTGAA 257059

Query 3138 CAACCTGCTCCTGAATGACTACTGGGTACATAACGAAATGAAGGCAGAAATAAAGTTGTT 3197

| | |

Sbjct 257058 CAACACTCTTCTCAATGATACCTTGGTCAAGGAAGGAATAAAGAAAGAAATTAAAGACTT 256999

Query 3198 CTTTGAAACCAATGAGAACAAAGACACAACATACCAGAATCTCTGGGATGCATTCAAAGC 3257

Sbjct 256998 TTTAGAGTTTAATGAAAATGAAGCCACAACGTACCCAAACCTTTGGGACACAATGAAAGC 256939

Query 3258 AGTGTGCAGAGGGAAATTTATAGCACTGAATGCCCACAAGAGAAAGCAGGAAAGATCCAA 3317

| | | |

Sbjct 256938 ATTTCTAAGAGGGAAACTCATAGCTATGAGTGCCTTCAAGAAAAAACGGGAGAGAGCACA 256879

Query 3318 AATTGACACCCTAACATCACAATTAAAAGAACTAGAAAAGCAAGA-GCAAACACATTCAA 3376

|

Sbjct 256878 TACTAGCAGCTTGACAACACATCTAAAAGCTCTAGAAAAAAAGGAAGCAAATTCACCCAA 256819

Query 3377 AAGCTAGCAGAAGGGAAGAAATAACTAAAATCAGAGCAGAACTGAAGGAAATAGAGACAC 3436

|

Sbjct 256818 GAGG-AGTAGACGGCAGGAAATAATCAAACTCAGGGGTGAAATCAACCAAGTGGAAACAA 256760

Query 3437 AAAAAACCCTTCAAAAAATTAATGAATCCAGGAGCTGGTTTTTTGAAAGGATAAACAAAA 3496

| |

Sbjct 256759 GAAGAACTATTCAAAGAATTAACCAAACGAGGAGTTGGTTCTTTGAGAAAATCAACAAGA 256700

Query 3497 TTGATAGACCGCTAGCAAGACTAA-TAAAGAAAAAAAGAGAGAAGAATCAAATAGATGCA 3555

| | | | | | |

Sbjct 256699 TAGATAAACCCTTAGCTAGACTCACTAAAGGGCACAGG-GACAAAATCCTAATTAACAAA 256641

Query 3556 ATAAAAAAATGATAAAGGGGATATCACCACCAATCCCACAGAAATACAAACTACCATCAG 3615

|

Sbjct 256640 ATCAGAAA-TGAAAAGGGAGACATAACAACAGATCCTGAAGAAATCCAAAACACCATCAG 256582

Query 3616 AGAATACTACAAACACCTCTACGCAAATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAATGGATAAATT 3675

Sbjct 256581 ATCCTTCTACAAAAGGCTATACTCAACAAAACTGGAAAACCTGGACGAAATGGACAAATT 256522

Query 3676 CCTGGACACATACACTCTCCCAAGACTAAACCAGGAAGAAGTTGAATCTCTGAATAGACC 3735

Sbjct 256521 TCTGGACAGATACCAGGTACCAAAGTTGAATCAGGATCAAGTTGACCTTCTAAACAGTCC 256462

Query 3736 AATAACAGGAGCTGAAATTGTGGCAATAATCAATAGCTTACCAACCAAAAAGAGTCCAGG 3795

| |

Sbjct 256461 CATATCCCCTAAAGAAATAGTAGCAGTTATTAATAGTCTCCCAGCCAAAAAAAGCCCAGG 256402

Query 3796 ACCAGATGGATTCACAGCCGAATTCTACCAGAGGTACAAGGAGGAACTGGTACCATTCCT 3855

|

Sbjct 256401 ACCAGATGGGTTTAGTGCAGAGTTCTATCAGACCTTCAAAGAAGATCTAACTCCAGTTCT 256342

Query 3856 TCTGAAACTATTCCAATCAATAGAAAAAGAGGGAATCCTCCCTAACTCATTTTATGACGC 3915

Sbjct 256341 GCACAAACTTTTTCACAAGATAGAAGTAGAAGGTATTCTACCCAACTCATTTTATGAAGC 256282

Query 3916 CAGCATCATTCTGATACCAAAGCCAGGCAGAGACACAACAAAAAAAGAGAATTTTAGACC 3975

| |

Sbjct 256281 CACTATTACTCTGATACCTAAACCACAGAAAGATCCAACAAAGATAGAGAACTTCAGACC 256222

Query 3976 AATATCCTTGATGAACATTGAGGCAAAAATCCTCAATAAAACACTGGCAAAATGAATCCA 4035

Sbjct 256221 AATTTCTCTTATGAACATCGATGCAAAAATCCTTAATAAAATTCTCGCTAACCGAATCCA 256162

Query 4036 GCAGCACATCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAAGG 4095

| |

Sbjct 256161 AGAACACATTAAAGCAATCATCCATCCTGACCAAGTAGGTTTTATTCCAGGGATGCAGGG 256102

Query 4096 CTGGTTCAATATACGCAAATCAATAAATGTAATCCAGCATAAAAACAGAGCCAAAGACAA 4155

|

Sbjct 256101 ATGGTTTAATATACGAAAATCCATCAATGTAATCCATTATATAAACAAACTCAAAGACAA 256042

Query 4156 AAACCACATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAAGCCTTTGACAAAATTCAACAACCCTT 4215

Sbjct 256041 AAACCACATGATCATCTCGTTAGATGCAGAAAAAGCATTTGACAAGATCCAACACCCATT 255982

Query 4216 CATGCTAAAAACTCTCAATAAATTAGGTATTGATGGGACGTATTTCAAAATAATAAGAGC 4275

| | |

Sbjct 255981 CATGATAAAAGTTCTGGAAAGATCAGGAATTCAAGGCCAATACCTAAACATGATAAAAGC 255922

Query 4276 TATCTATGACAAACCCACAGCCAATATCATACTGAATGGGCAAAAACTGGAAGCATTCTC 4335

| |

Sbjct 255921 AATCTACAGCAAACCAGTAGCCAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCC 255862

Query 4336 TTTGAAAACTGGCACAAGACAGGGATGCCCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTGTT 4395

| |

Sbjct 255861 ACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGTACT 255802

Query 4396 GGAAGTTCTGGCCAGGGCAATTAGGCAGGAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGAAA 4455

|

Sbjct 255801 TGAAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACAAATTGGAAA 255742

Query 4456 AGAGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCAGACGACATGATTGTATATCTAGAAAACCCCAT 4515

Sbjct 255741 AGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAA 255682

Query 4516 TGTCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAA 4575

| | |

Sbjct 255681 AAATTCCAACAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGGATATAA 255622

Query 4576 AATCAATGTACAAAAATCACAAGCATTCTTATACACCAACAACAGACAAACAGAGAGCCA 4635

| |

Sbjct 255621 AATTAACTCAAACAAGTCAATGGCCTTTCTCTACACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGA 255562

Query 4636 AATCA-TGAGTGAACTCCCATTCACAATTGCTTCAAAGAGAATAAAATACCTAGGAATCC 4694

Sbjct 255561 AATTAGGGAAACAACACCC-TTCTCAATAGCCACAAATAATATAAAATATCTCGGCGTGA 255503

Query 4695 AACTTACAAGGGATGTGAAGGGCCTCTTCAAGGAGAACTACAAACCTCTGCTCAAGGAAA 4754

| | | |

Sbjct 255502 CTCTAACGAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAGTCCCTGAAGAAAGAAA 255443

Query 4755 TAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAATA 4814

| | | |

Sbjct 255442 TTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGACCAACA 255383

Query 4815 TCGTGAAAATGGCCATACTCCTCAAGGTAATTTACAGATTCAATGCCATCCCCATCAAGC 4874

|

Sbjct 255382 TTGTAAAAATGGCTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATTAAAA 255323

Query 4875 TACCAATGACTTTCTTCACAGAACTGGAAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAA 4934

| | | | | |

Sbjct 255322 TTCCAACTCAATTCTTCAAGGAATTAGAAGGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAATAACA 255263

Query 4935 AGAGAGCCCACATCGCCAAGTCAATCCT--AAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCAC 4992

| | | |

Sbjct 255262 AAAAACCGAGGATAGCAAAAACTCTTCTCAAGGATAAAAGAAC--CTCTGGTGGAATCAC 255205

Query 4993 ACTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGGTA 5052

Sbjct 255204 CATGCCTGACCTAAAGCTTTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGGTA 255145

Query 5053 CCAAAACAGAGATATTGATCAATGGAACAGAACAGGGCCCTCAGAAATAACGCCGCATAT 5112

| | | |

Sbjct 255144 TAGAGACAGACAAGTGGACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACACAC 255085

Query 5113 CTACAACTATCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCT 5172

| |

Sbjct 255084 CTATGGTCACTTGATCTTCGACAAGGGAGCCAAAACCATCCAGTGGAAGAAAGACAGCAT 255025

Query 5173 ATTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCAT-ATGTAGAAAGCTGAAACTGGATC 5231

| | |

Sbjct 255024 TTTCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGG-TTGTTATCATGTAGAAGAATGCGAATCGATC 254966

Query 5232 CCTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTTAGAC 5291

| | | |

Sbjct 254965 CATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAAGGAACTTCACATAAAAC 254906

Query 5292 CTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACGTAGGCATTACCATTCAGGACATAGGCATGG 5351

| |

Sbjct 254905 CAGAGACACTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTTGAAGATATGGGCACAG 254846

Query 5352 GCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGACAAAATTGACAAAT 5411

| |

Sbjct 254845 GGGAAAAATTCCTGAACAGAACAGCAATGGCTTGTGCTGTAAGATCGAGAATTGACAAAT 254786

Query 5412 GGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACT-ACCATCAGAGTGAAC 5470

| |

Sbjct 254785 GGGACCTAATGAAACTCCAAAGTTTCTGCAAGGCAAAAGACACTGTCTATAAGA-CAAAA 254727

Query 5471 AGGCAACCTACAAAATGGGAGAAAATTTTTGC--AACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAA 5528

| | | | |

Sbjct 254726 AGACCACCAACAGACTGGGAAAGGATCTTTACCTATCCTA--AATCAGATAGGGGACTAA 254669

Query 5529 TATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAATTTACAAGAAAAAAACAAACAACCCCATCA 5588

| |

Sbjct 254668 TATCCAACATATATAAAGAACTCAAGAAGGTGGACCTCAGAAAATCAAATAACCCCCTTA 254609

Query 5589 AAAAGTGGGTGAAGGACATGAACAGACACTTCTCA---AAAGAAGACATTTATGCAGCCA 5645

|

Sbjct 254608 AAAAATGGGGCTCAGAACTGAACAAAGAATTCTCACCTGAGGAATAC-CGAATG--GCAG 254552

Query 5646 ACAGACACATGAAAAAATGCTCATCATCACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCA 5705

|

Sbjct 254551 AGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAA 254492

Query 5706 CAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGCGATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACA 5765

Sbjct 254491 CCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTGAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCA 254432

Query 5766 GGTGCTGGAGAGGATGTGGAGAAATAGGAACATTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAAC 5825

| | |

Sbjct 254431 GATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGC 254372

Query 5826 TAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAGAACTGGAAATAC 5885

| | |

Sbjct 254371 TTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTAC 254312

Query 5886 CATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCATGCTGCT 5945

| | |

Sbjct 254311 CGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGA----AGCCCCAACTGGT 254256

Query 5946 -ATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTGG 6004

| | |

Sbjct 254255 AAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAACTGG 254196

Query 6005 AACCAACCCAAATGTCTAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACC 6064

|

Sbjct 254195 AAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACA 254136

Query 6065 ATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATG 6124

|

Sbjct 254135 ATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATG 254076

Query 6125 AAATTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATA 6184

| | |

Sbjct 254075 GACCTGGAGAGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACAATCACAAAGGAACTCACACAATATG 254016

Query 6185 TTCTCACTCATAGGTGG 6201

Sbjct 254015 TACTCACTGATAAGTGG 253999


Features flanking this part of subject sequence:
  85416 bp at 5' side: hypothetical protein
  105101 bp at 3' side: nuclear factor I/B


Score = 1377 bits (1526),  Expect = 0.0
Identities = 2608/3798 (68%), Gaps = 46/3798 (1%)
Strand=Plus/Minus

Query 2425 AATGGACTAAATGCTCCAATTAAAAGACACAGACTAGCAAATTGGATAAAGAGTCAAGAC 2484

|

Sbjct 21466212 AATGGTCTCAACTCGCCAATAAAAAGACATAGACTAACAAACTGGCTACACAAACAAGAC 21466153

Query 2485 CCATCAGTGTGCTGTATTCAGGAAACCCATCTCACATGCAGAGACACACATAGGCTCAAA 2544

| | | |

Sbjct 21466152 CCAACATTTTGCTGCTTACAGGAAACTCATCTCAGAGAAAAAGATAGACACTACCTCAGA 21466093

Query 2545 ATAAAGGGATGGAGGAAGATCTACCAAGCAAACGGAAAACAAAAAAAGGCAGGGGTTGCA 2604

| |

Sbjct 21466092 ATGAAAGGCTGGAAAACAATTTTCCAAGCAAATGGTATGAAGAAACAAGCAGGAGTAGCC 21466033

Query 2605 ATCCTAGTCTCTGATAAAACAGACTTTAAACCAACAAAG--ATCAAAAGAGACAAAGAAG 2662

|

Sbjct 21466032 ATCCTAATATCTGATAAGATTGACTTCCAACC--CAAAGTCATCAAAAAAGACAAGGAGG 21465975

Query 2663 GCCATTACATAATGGTAAAGGGATCAATTCAACAAGAAGAGCTAACTATCCTAAATATAT 2722

| | | |

Sbjct 21465974 GACACTTCATTCTCATCAAAGGTAAAATCCTCCAAGAGGAACTCTCAATTCTGAATATCT 21465915

Query 2723 ATGCACCCAATACAGGAGCACCAAGATTCA-TAAAGCAAGTCCTGAGTGACCTACAAAG- 2780

| | | |

Sbjct 21465914 ATGCTCCAAATACAAGAGCAGCCACATTCACTAAAGAAACT--TTAGTAAAGCTCAAAGC 21465857

Query 2781 AGACTTAGACTCCCACACATTAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAACATTAGA 2840

| |

Sbjct 21465856 ACACATTGCGCCTCACACAATAATAGTGGGAGACTTCAACACACCACTTTCACCAATGGA 21465797

Query 2841 CAGATCAACGAGACAGAAAGTCAACAAGGATACCCAGGAATTGAACTCAGCTCTGCAGCA 2900

| | |

Sbjct 21465796 CAGATCATGGAAACAGAAACTAAACAGGGACACACTGAAACTAACAGAAGTGATGAAACA 21465737

Query 2901 AGCGGACCTAATAGACATCTACAGAACTCTCCACCCCAAATCAACAGAATATACATTTTT 2960

|

Sbjct 21465736 AATGGATCTGACAGATATCTACAGAACATTTTACCCTAAAACAAAAGGATATACCTTCTT 21465677

Query 2961 TTCAGCACCACACCACACCTACTCCAAAATTGACCACATACTGGGAAGTAAAGCACTCCT 3020

|

Sbjct 21465676 CTCAGCACCTCATGGTACCTTCTCCAAAATTGACCACATAATAGGTCACAAATCAGGCCT 21465617

Query 3021 CAGCAAATGTAAAAGAACAGAAATTATAACAAACTATC-TCTCAGACCACAGTGCAATCA 3079

|

Sbjct 21465616 CAACAGATTCAAAAATATTGAAATTGTCCCATG-TATCCTATCAGATCACCATGCACTAA 21465558

Query 3080 AACTAGAACT-CAGGATTAAGA-ATCTCACTCAAAACCGCTCAACTACATGGAAACTGAA 3137

| |

Sbjct 21465557 GGCT-GATCTTCAATAACAAAATAAATAACAGAAAGCCAA-CATTCACATGGAAACTGAA 21465500

Query 3138 CAACCTGCTCCTGAATGACTACTGGGTACATAACGAAATGAAGGCAGAAATAAAGTTGTT 3197

| | |

Sbjct 21465499 CAACACTCTTCTCAATGATACCTTGGTCAAGGAAGGAATAAAGAAAGAAATTAAAGACTT 21465440

Query 3198 CTTTGAAACCAATGAGAACAAAGACACAACATACCAGAATCTCTGGGATGCATTCAAAGC 3257

Sbjct 21465439 TTTAGAGTTTAATGAAAATGAAGCCACAACGTACCCAAACCTTTGGGACACAATGAAAGC 21465380

Query 3258 AGTGTGCAGAGGGAAATTTATAGCACTGAATGCCCACAAGAGAAAGCAGGAAAGATCCAA 3317

| | | |

Sbjct 21465379 ATTTCTAAGAGGGAAACTCATAGCTATGAGTGCCTTCAAGAAAAAACGGGAGAGAGCACA 21465320

Query 3318 AATTGACACCCTAACATCACAATTAAAAGAACTAGAAAAGCAAGA-GCAAACACATTCAA 3376

|

Sbjct 21465319 TACTAGCAGCTTGACAACACATCTAAAAGCTCTAGAAAAAAAGGAAGCAAATTCACCCAA 21465260

Query 3377 AAGCTAGCAGAAGGGAAGAAATAACTAAAATCAGAGCAGAACTGAAGGAAATAGAGACAC 3436

|

Sbjct 21465259 GAGG-AGTAGACGGCAGGAAATAATCAAACTCAGGGGTGAAATCAACCAAGTGGAAACAA 21465201

Query 3437 AAAAAACCCTTCAAAAAATTAATGAATCCAGGAGCTGGTTTTTTGAAAGGATAAACAAAA 3496

| |

Sbjct 21465200 GAAGAACTATTCAAAGAATTAACCAAACGAGGAGTTGGTTCTTTGAGAAAATCAACAAGA 21465141

Query 3497 TTGATAGACCGCTAGCAAGACTAA-TAAAGAAAAAAAGAGAGAAGAATCAAATAGATGCA 3555

| | | | | | |

Sbjct 21465140 TAGATAAACCCTTAGCTAGACTCACTAAAGGGCACAGG-GACAAAATCCTAATTAACAAA 21465082

Query 3556 ATAAAAAAATGATAAAGGGGATATCACCACCAATCCCACAGAAATACAAACTACCATCAG 3615

|

Sbjct 21465081 ATCAGAAA-TGAAAAGGGAGACATAACAACAGATCCTGAAGAAATCCAAAACACCATCAG 21465023

Query 3616 AGAATACTACAAACACCTCTACGCAAATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAATGGATAAATT 3675

Sbjct 21465022 ATCCTTCTACAAAAGGCTATACTCAACAAAACTGGAAAACCTGGACGAAATGGACAAATT 21464963

Query 3676 CCTGGACACATACACTCTCCCAAGACTAAACCAGGAAGAAGTTGAATCTCTGAATAGACC 3735

Sbjct 21464962 TCTGGACAGATACCAGGTACCAAAGTTGAATCAGGATCAAGTTGACCTTCTAAACAGTCC 21464903

Query 3736 AATAACAGGAGCTGAAATTGTGGCAATAATCAATAGCTTACCAACCAAAAAGAGTCCAGG 3795

| | |

Sbjct 21464902 CATATCACCTAAAGAAATAGAAGCAGTTATTAATAGTCTCCCAGCCAAAAAAAGCCCAGG 21464843

Query 3796 ACCAGATGGATTCACAGCCGAATTCTACCAGAGGTACAAGGAGGAACTGGTACCATTCCT 3855

|

Sbjct 21464842 ACCAGACGGGTTTAGTGCAGAGTTCTATCAGACCTTCAAAGAAGATCTAACTCCAGTTCT 21464783

Query 3856 TCTGAAACTATTCCAATCAATAGAAAAAGAGGGAATCCTCCCTAACTCATTTTATGACGC 3915

Sbjct 21464782 GCACAAACTTTTTCACAAGATAGAAGTAGAAGGTATTCTACCCAACTCATTTTATGAAGC 21464723

Query 3916 CAGCATCATTCTGATACCAAAGCCAGGCAGAGACACAACAAAAAAAGAGAATTTTAGACC 3975

| |

Sbjct 21464722 CACTATTACTCTGATACCTAAACCACAGAAAGATCCAACAAAGATAGAGAACTTCAGACC 21464663

Query 3976 AATATCCTTGATGAACATTGAGGCAAAAATCCTCAATAAAACACTGGCAAAATGAATCCA 4035

Sbjct 21464662 AATTTCTCTTATGAACATCGATGCAAAAATCCTTAATAAAATTCTCGCTAACCGAATCCA 21464603

Query 4036 GCAGCACATCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAAGG 4095

| | |

Sbjct 21464602 AGAACACATTAAAGCGATCATCCATCCTGACCAAGTAGGTTTTATTCCAGGGATGCAGGG 21464543

Query 4096 CTGGTTCAATATACGCAAATCAATAAATGTAATCCAGCATAAAAACAGAGCCAAAGACAA 4155

|

Sbjct 21464542 ATGGTTTAATATACGAAAATCCATCAATGTAATCCATTATATAAACAAACTCAAAGACAA 21464483

Query 4156 AAACCACATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAAGCCTTTGACAAAATTCAACAACCCTT 4215

Sbjct 21464482 AAACCACATGATCATCTCGTTAGATGCAGAAAAAGCATTTGACAAGATCCAACACCCATT 21464423

Query 4216 CATGCTAAAAACTCTCAATAAATTAGGTATTGATGGGACGTATTTCAAAATAATAAGAGC 4275

| | |

Sbjct 21464422 CATGATAAAAGTTCTGGAAAGATCAGGAATTCAAGGCCAATACCTAAACATGATAAAAGC 21464363

Query 4276 TATCTATGACAAACCCACAGCCAATATCATACTGAATGGGCAAAAACTGGAAGCATTCTC 4335

| |

Sbjct 21464362 AATCTACAGCAAACCAGTAGCAAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCC 21464303

Query 4336 TTTGAAAACTGGCACAAGACAGGGATGCCCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTGTT 4395

| |

Sbjct 21464302 ACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGTACT 21464243

Query 4396 GGAAGTTCTGGCCAGGGCAATTAGGCAGGAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGAAA 4455

|

Sbjct 21464242 TGAAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACAAATTGGAAA 21464183

Query 4456 AGAGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCAGACGACATGATTGTATAT-CTAGAAAACCCCA 4514

Sbjct 21464182 AGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATATGCAAGTGACCCTAA 21464123

Query 4515 TTGTCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACA 4574

| |

Sbjct 21464122 AAATTCCAACAGAGAA-CTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGGATATA 21464064

Query 4575 AAATCAATGTACAAAAATCACAAGCATTCTTATACACCAACAACAGACAAACAGAGAGCC 4634

| |

Sbjct 21464063 AAATTAACTCAAACAAGTCAATGGCCTTTCTCTACACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAG 21464004

Query 4635 AAATCA-TGAGTGAACTCCCATTCACAATTGCTTCAAAGAGAATAAAATACCTAGGAATC 4693

|

Sbjct 21464003 AAATTAGGGAAACAACACCC-TTCTCAATAGCCACAAATAATATAAAATATCTCGGCGTG 21463945

Query 4694 CAACTTACAAGGGATGTGAAGGGCCTCTTCAAGGAGAACTACAAACCTCTGCTCAAGGAA 4753

| | | |

Sbjct 21463944 ACTCTAACGAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAGTCCCTGAAGAAAGAA 21463885

Query 4754 ATAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAAT 4813

| | |

Sbjct 21463884 ATTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGACCAAC 21463825

Query 4814 ATCGTGAAAATGGCCATACTCCTCAAGGTAATTTACAGATTCAATGCCATCCCCATCAAG 4873

|

Sbjct 21463824 ATTGTAAAAATGGCTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATTAAA 21463765

Query 4874 CTACCAATGACTTTCTTCACAGAACTGGAAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAA 4933

| | | | |

Sbjct 21463764 ATTCCAACTCAATTCTTCAACGAATTAGAAGGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAATAAC 21463705

Query 4934 AAGAGAGCCCACATCGCCAAGTCAATCCT--AAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCA 4991

| | | | |

Sbjct 21463704 AAAAAACCGAGGATAGCAAAAACTCTTCTCAAGGATAAAAGAAC--CTCTGGTGGAATCA 21463647

Query 4992 CACTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGGT 5051

Sbjct 21463646 CCATGCCTGACCTAAAGCTTTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGGT 21463587

Query 5052 ACCAAAACAGAGATATTGATCAATGGAACAGAACAGGGCCCTCAGAAATAACGCCGCATA 5111

| | | |

Sbjct 21463586 ATAGAGACAGACAAGTGGACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACACA 21463527

Query 5112 TCTACAACTATCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCC 5171

|

Sbjct 21463526 CCTATGGTCACTTGATCTTCGACAAGGGAGCCAAAACCATCCAGTGGAAGAAAGACAGCA 21463467

Query 5172 TATTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCAT-ATGTAGAAAGCTGAAACTGGAT 5230

| | |

Sbjct 21463466 TTTTCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGG-TTGTTATCATGTAGAAGAATGCGAATTGAT 21463408

Query 5231 CCCTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTTAGA 5290

| | | | | |

Sbjct 21463407 CCATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAAGGAACTTCACATAAAA 21463348

Query 5291 CCTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACGTAGGCATTACCATTCAGGACATAGGCATG 5350

| | |

Sbjct 21463347 CCAGAGACACTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTTGAAGATATGGGCACA 21463288

Query 5351 GGCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGACAAAATTGACAAA 5410

| | |

Sbjct 21463287 GGGGAAAAATTCCTGAACAGAACAGCAATGGCTTGTGCTGTAAGATCGAGAATTGACAAA 21463228

Query 5411 TGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACT-ACCATCAGAGTGAA 5469

| |

Sbjct 21463227 TGGGACCTAATGAAACTCCAAAGTTTCTGCAAGGCAAAAGACACTGTCTATAAGA-CAAA 21463169

Query 5470 CAGGCAACCTACAAAATGGGAGAAAATTTTTGC--AACCTACTCATCTGACAAAGGGCTA 5527

| | | | |

Sbjct 21463168 AAGACCACCAACAGACTGGGAAAGGATCTTTACCTATCCTA--AATCAGATAGGGGACTA 21463111

Query 5528 ATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAATTTACAAGAAAAAAACAAACAACCCCATC 5587

|

Sbjct 21463110 ATATCCAACATATATAAAGAACTCAAGAAGGTGGACCTCAGAAAATCAAATAACCCCCTT 21463051

Query 5588 AAAAAGTGGGTGAAGGACATGAACAGACACTTCTCA---AAAGAAGACATTTATGCAGCC 5644

|

Sbjct 21463050 AAAAAATGGGGCTCAGAACTGAACAAAGAATTCTCACCTGAGGAATAC-CGAATG--GCA 21462994

Query 5645 AACAGACACATGAAAAAATGCTCATCATCACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACC 5704

Sbjct 21462993 GAGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACA 21462934

Query 5705 ACAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGCGATCATTAAAAAGTCAGGAAACAAC 5764

|

Sbjct 21462933 ACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTGAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGC 21462874

Query 5765 AGGTGCTGGAGAGGATGTGGAGAAATAGGAACATTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAA 5824

| |

Sbjct 21462873 AGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGG 21462814

Query 5825 CTAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAGAACTGGAAATA 5884

| | |

Sbjct 21462813 CTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTA 21462754

Query 5885 CCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCATGCTGC 5944

| |

Sbjct 21462753 CCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGA----AGCCCCAACTGG 21462698

Query 5945 T-ATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTG 6003

| | |

Sbjct 21462697 TAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAACTG 21462638

Query 6004 GAACCAACCCAAATGTCTAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACAC 6063

|

Sbjct 21462637 GAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACAC 21462578

Query 6064 CATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGAT 6123

|

Sbjct 21462577 AATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGAT 21462518

Query 6124 GAAATTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCAT 6183

| | |

Sbjct 21462517 GGACCTGGAGAGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACAATCACAAAGGAACTCACACAATAT 21462458

Query 6184 ATTCTCACTCATAGGTGG 6201

Sbjct 21462457 GTACTCACTGATAAGTGG 21462440


Features flanking this part of subject sequence:
  436814 bp at 5' side: tenascin C
  663356 bp at 3' side: pregnancy-associated plasma protein A


Score = 1373 bits (1522),  Expect = 0.0
Identities = 2610/3803 (68%), Gaps = 56/3803 (1%)
Strand=Plus/Plus

Query 2425 AATGGACTAAATGCTCCAATTAAAAGACACAGACTAGCAAATTGGATAAAGAGTCAAGAC 2484

|

Sbjct 3747063 AATGGTCTCAACTCGCCAATAAAAAGACATAGACTAACAAACTGGCTACACAAACAAGAC 3747122

Query 2485 CCATCAGTGTGCTGTATTCAGGAAACCCATCTCACATGCAGAGACACACATAGGCTCAAA 2544

| | | |

Sbjct 3747123 CCAACATTTTGCTGCTTACAGGAAACTCATCTCAGAGAAAAAGATAGACACTACCTCAGA 3747182

Query 2545 ATAAAGGGATGGAGGAAGATCTACCAAGCAAACGGAAAACAAAAAAAGGCAGGGGTTGCA 2604

| |

Sbjct 3747183 ATGAAAGGCTGGAAAACAATTTTCCAAGCAAATGGTATGAAGAAACAAGCAGGAGTAGCC 3747242

Query 2605 ATCCTAGTCTCTGATAAAACAGACTTTAAACCAACAAAG--ATCAAAAGAGACAAAGAAG 2662

|

Sbjct 3747243 ATCCTAATATCTGATAAGATTGACTTCCAACC--CAAAGTCATCAAAAAAGACAAGGAGG 3747300

Query 2663 GCCATTACATAATGGTAAAGGGATCAATTCAACAAGAAGAGCTAACTATCCTAAATATAT 2722

| | | |

Sbjct 3747301 GACACTTCATTCTCATCAAAGGTAAAATCCTCCAAGAGGAACTCTCAATTCTGAATATCT 3747360

Query 2723 ATGCACCCAATACAGGAGCACCAAGATTCA-TAAAGCAAGTCCTGAGTGACCTACAAAG- 2780

| | | |

Sbjct 3747361 ATGCTCCAAATACAAGAGCAGCCACATTCACTAAAGAAACT--TTAGTAAAGCTCAAAGC 3747418

Query 2781 AGACTTAGACTCCCACACATTAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAACATTAGA 2840

| |

Sbjct 3747419 ACACATTGCACCTCACACAATAATAGTGGGAGACTTCAACACACCACTTTCACCAATGGA 3747478

Query 2841 CAGATCAACGAGACAGAAAGTCAACAAGGATACCCAGGAATTGAACTCAGCTCTGCAGCA 2900

| | |

Sbjct 3747479 CAGATCATGGAAACAGAAACTAAACAGGGACACACTGAAACTAACAGAAGTGATGAAACA 3747538

Query 2901 AGCGGACCTAATAGACATCTACAGAACTCTCCACCCCAAATCAACAGAATATACATTTTT 2960

| |

Sbjct 3747539 AATGGATCTGACAGATATCTACAGAACATTTTATCCTAAAACAAAAGGATATACCTTCTT 3747598

Query 2961 TTCAGCACCACACCACACCTACTCCAAAATTGACCACATACTGGGAAGTAAAGCACTCCT 3020

|

Sbjct 3747599 CTCAGCACCTCATGGTACCTTCTCCAAAATTGACCACATAATAGGTCACAAATCAGGCCT 3747658

Query 3021 CAGCAAATGTAAAAGAACAGAAATTATAACAAACTATC-TCTCAGACCACAGTGCAATCA 3079

|

Sbjct 3747659 CAACAGATGCAAAAATATTGAAATTGTCCCATG-TATCCTATCAGATCACCATGCACTAA 3747717

Query 3080 AACTAGAACT-CAGGATTAAGA-ATCTCACTCAAAACCGCTCAACTACATGGAAACTGAA 3137

| |

Sbjct 3747718 GGCT-GATCTTCAATAACAAAATAAATAACAGAAAGCCAA-CATTCACATGGAAACTGAA 3747775

Query 3138 CAACCTGCTCCTGAATGACTACTGGGTACATAACGAAATGAAGGCAGAAATAAAGTTGTT 3197

| | |

Sbjct 3747776 CAACACTCTTCTCAATGATACCTTGGTCAAGGAAGGAATAAAGAAAGAAATTAAAGACTT 3747835

Query 3198 CTTTGAAACCAATGAGAACAAAGACACAACATACCAGAATCTCTGGGATGCATTCAAAGC 3257

Sbjct 3747836 TTTAGAGTTTAATGACAATGAAGCCACAACGTACCCAAACCTTTGGGACACAATGAAAGC 3747895

Query 3258 AGTGTGCAGAGGGAAATTTATAGCACTGAATGCCCACAAGAGAAAGCAGGAAAGATCCAA 3317

| | | |

Sbjct 3747896 ATTTCTAAGAGGGAAACTCATAGCTATGAGTGCCTTCAAGAAAAAACGGGAGAGAGCACA 3747955

Query 3318 AATTGACACCCTAACATCACAATTAAAAGAACTAGAAAAGCAAGA-GCAAACACATTCAA 3376

|

Sbjct 3747956 TACTAGCAGCTTGACAACACATCTAAAAGCTCTAGAAAAAAAGGAAGCAAATTCACCCAA 3748015

Query 3377 AAGCTAGCAGAAGGGAAGAAATAACTAAAATCAGAGCAGAACTGAAGGAAATAGAGACAC 3436

|

Sbjct 3748016 GAGG-AGTAGACGGCAGGAAATAATCAAACTCAGGGGTGAAATCAACCAAGTGGAAACAA 3748074

Query 3437 AAAAAACCCTTCAAAAAATTAATGAATCCAGGAGCTGGTTTTTTGAAAGGATAAACAAAA 3496

| |

Sbjct 3748075 GAAGAACTATTCAAAGAATTAACCAAACGAGGAGTTGGTTCTTTGAGAAAATCAACAAGA 3748134

Query 3497 TTGATAGACCGCTAGCAAGACTAA-TAAAGAAAAAAAGAGAGAAGAATCAAATAGATGCA 3555

| | | | | | |

Sbjct 3748135 TAGATAAACCCTTAGCTAGACTCACTAAAGGGCACAGG-GACAAAATCCTAATTAACAAA 3748193

Query 3556 ATAAAAAAATGATAAAGGGGATATCACCACCAATCCCACAGAAATACAAACTACCATCAG 3615

|

Sbjct 3748194 ATCAGAAA-TGAAAAGGGAGACATAACAACAGATCCTGAAGAAATCCAAAACACCATCAG 3748252

Query 3616 AGAATACTACAAACACCTCTACGCAAATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAATGGATAAATT 3675

Sbjct 3748253 ATCCTTCTACAAAAGGCTATACTCAACAAAACTGGAAAACCTGGACGAAATGGACAAATT 3748312

Query 3676 CCTGGACACATACACTCTCCCAAGACTAAACCAGGAAGAAGTTGAATCTCTGAATAGACC 3735

Sbjct 3748313 TCTGGACAGATACCAGGTACCAAAGTTGAATCAGGATCAAGTTGACCTTCTAAACAGTCC 3748372

Query 3736 AATAACAGGAGCTGAAATTGTGGCAATAATCAATAGCTTACCAACCAAAAAGAGTCCAGG 3795

| | |

Sbjct 3748373 CATATCCCCTAAAGAAATAGAAGCAGTTATTAATAGTCTCCCAGCCAAAAAAAGCCCAGG 3748432

Query 3796 ACCAGATGGATTCACAGCCGAATTCTACCAGAGGTACAAGGAGGAACTGGTACCATTCCT 3855

|

Sbjct 3748433 ACCAGACGGGTTTAGTGCAGAGTTCTATCAGACCTTCAAAGAAGATCTAACTCCAGTTCT 3748492

Query 3856 TCTGAAACTATTCCAATCAATAGAAAAAGAGGGAATCCTCCCTAACTCATTTTATGACGC 3915

Sbjct 3748493 GCACAAACTTTTTCACAAGATAGAAGTAGAAGGTATTCTACCCAACTCATTTTATGAAGC 3748552

Query 3916 CAGCATCATTCTGATACCAAAGCCAGGCAGAGACACAACAAAAAAAGAGAATTTTAGACC 3975

| |

Sbjct 3748553 CACTATTACTCTGATACCTAAACCACAGAAAGATCCAACAAAGATAGAGAACTTCAGACC 3748612

Query 3976 AATATCCTTGATGAACATTGAGGCAAAAATCCTCAATAAAACACTGGCAAAATGAATCCA 4035

Sbjct 3748613 AATTTCTCTTATGAACATCGATGCAAAAATTCTTAATAAAATTCTCGCTAACCGAATCCA 3748672

Query 4036 GCAGCACATCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAAGG 4095

| |

Sbjct 3748673 AGAACACATTAAAGCAATCATCCATCCTGACCAAGTAGGTTTTATTCCAGGGATGCAGGG 3748732

Query 4096 CTGGTTCAATATACGCAAATCAATAAATGTAATCCAGCATAAAAACAGAGCCAAAGACAA 4155

|

Sbjct 3748733 ATGGTTTAATATACGAAAATCCATCAATGTAATCCATTATATAAACAAACTCAAAGACAA 3748792

Query 4156 AAACCACATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAAGCCTTTGACAAAATTCAACAACCCTT 4215

Sbjct 3748793 AAACCACATGATCATCTCGTTAGATGCAGAAAAAGCATTTGACAAGATCCAACACCCATT 3748852

Query 4216 CATGCTAAAAACTCTCAATAAATTAGGTATTGATGGGACGTATTTCAAAATAATAAGAGC 4275

| | |

Sbjct 3748853 CATGATAAAAGTTCTGGAAAGATCAGGAATTCAAGGCCAATACCTAAACATGATAAAAGC 3748912

Query 4276 TATCTATGACAAACCCACAGCCAATATCATACTGAATGGGCAAAAACTGGAAGCATTCTC 4335

| |

Sbjct 3748913 AATCTACAGCAAACCAGTAGCCAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCC 3748972

Query 4336 TTTGAAAACTGGCACAAGACAGGGATGCCCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTGTT 4395

| |

Sbjct 3748973 ACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGTACT 3749032

Query 4396 GGAAGTTCTGGCCAGGGCAATTAGGCAGGAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGAAA 4455

|

Sbjct 3749033 TGAAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACAAATTGGAAA 3749092

Query 4456 AGAGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCAGACGACATGATTGTATATCTAGAAAACCCCAT 4515

Sbjct 3749093 AGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAA 3749152

Query 4516 TGTCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAA 4575

| | |

Sbjct 3749153 AAATTCCAACAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGGATATAA 3749212

Query 4576 AATCAATGTACAAAAATCACAAGCATTCTTATACACCAACAACAGACAAACAGAGAGCCA 4635

| |

Sbjct 3749213 AATTAACTCAAACAAGTCAATGGCCTTTCTCTACACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGA 3749272

Query 4636 AATCA-TGAGTGAACTCCCATTCACAATTGCTTCAAAGAGAATAAAATACCTAGGAATCC 4694

Sbjct 3749273 AATTAGGGAAACAACACCC-TTCTCAATAGCCACAAATAATATAAAATATCTCGGCGTGA 3749331

Query 4695 AACTTACAAGGGATGTGAAGGGCCTCTTCAAGGAGAACTACAAACCTCTGCTCAAGGAAA 4754

| | | |

Sbjct 3749332 CTCTAACGAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAGTCCCTGAAGAAAGAAA 3749391

Query 4755 TAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAATA 4814

| | | |

Sbjct 3749392 TTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGACCAACA 3749451

Query 4815 TCGTGAAAATGGCCATACTCCTCAAGGTAATTTACAGATTCAATGCCATCCCCATCAAGC 4874

|

Sbjct 3749452 TTGTAAAAATGGCTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATTAAAA 3749511

Query 4875 TACCAATGACTTTCTTCACAGAACTGGAAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAA 4934

| | | | | |

Sbjct 3749512 TTCCAACTCAATTCTTCAACGAATTAGAAGGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAATAACA 3749571

Query 4935 AGAGAGCCCACATCGCCAAGTCAATCCT--AAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCAC 4992

| | | |

Sbjct 3749572 AAAAACCGAGGATAGCAAAAACTCTTCTCAAGGATAAAAGAAC--CTCTGGTGGAATCAC 3749629

Query 4993 ACTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGGTA 5052

Sbjct 3749630 CATGCCTGACCTCAAGCTTTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGGTA 3749689

Query 5053 CCAAAACAGAGATATTGATCAATGGAACAGAACAGGGCCCTCAGAAATAACGCCGCATAT 5112

| | | |

Sbjct 3749690 TAGAGACAGACAAGTGGACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACACAC 3749749

Query 5113 CTACAACTATCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCT 5172

| |

Sbjct 3749750 CTATGGTCACTTGATCTTCGACAAGGGAGCCAAAACCATCCAGTGGAAGAAAGACAGCAT 3749809

Query 5173 ATTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCAT-ATGTAGAAAGCTGAAACTGGATC 5231

| | |

Sbjct 3749810 TTTCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGG-TTGTTATCATGTAGAAGAATGCGAATCGATC 3749868

Query 5232 CCTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTTAGAC 5291

| | | |

Sbjct 3749869 CATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAAGGAACTTCACATAAAAC 3749928

Query 5292 CTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACGTAGGCATTACCATTCAGGACATAGGCATGG 5351

| |

Sbjct 3749929 CAGAGACACTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTTGAAGATATGGGCACAG 3749988

Query 5352 GCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGC---AAC---AAAAGACAAAATTG 5405

| |

Sbjct 3749989 GGGAAAAATTCCTG-----AACA-GAACAGCAATGGCTTGTACTGTAAGATCGAGAATTG 3750042

Query 5406 ACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACT-ACCATCAGA 5464

| |

Sbjct 3750043 ACAAATGGGACCTAATGAAACTCCAAAGTTTCTGCAAGGCAAAAGACACTGTCTATAAGA 3750102

Query 5465 GTGAACAGGCAACCTACAAAATGGGAGAAAATTTTTGC--AACCTACTCATCTGACAAAG 5522

| | | | |

Sbjct 3750103 -CAAAAAGACCACCAACAGACTGGGAAAGGATCTTTACCTATCCTA--AATCAGATAGGG 3750159

Query 5523 GGCTAATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAATTTACAAGAAAAAAACAAACAACC 5582

|

Sbjct 3750160 GACTAATATCCAACATATATAAAGAACTCAAGAAGGTGGACCTCAGAAAATCAAATAACC 3750219

Query 5583 CCATCAAAAAGTGGGTGAAGGACATGAACAGACACTTCTCA---AAAGAAGACATTTATG 5639

| |

Sbjct 3750220 CCCTTAAAAAATGGGGCTCAGAACTGAACAAAGAATTCTCACCTGAGGAATAC-CGAATG 3750278

Query 5640 CAGCCAACAGACACATGAAAAAATGCTCATCATCACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCA 5699

| |

Sbjct 3750279 --GCAGAGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCA 3750336

Query 5700 AAACCACAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGCGATCATTAAAAAGTCAGGAA 5759

Sbjct 3750337 AAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTGAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTG 3750396

Query 5760 ACAACAGGTGCTGGAGAGGATGTGGAGAAATAGGAACATTTTTACACTGTTGGTGGGACT 5819

| | |

Sbjct 3750397 ACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATT 3750456

Query 5820 GTAAACTAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAGAACTGG 5879

| |

Sbjct 3750457 GCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAG 3750516

Query 5880 AAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCAT 5939

| |

Sbjct 3750517 TACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGA----AGCCCCA 3750572

Query 5940 GCTGCT-ATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCATTATTCACAATAGCAAAG 5998

| | |

Sbjct 3750573 ACTGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGA 3750632

Query 5999 ACTTGGAACCAACCCAAATGTCTAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATA 6058

|

Sbjct 3750633 AACTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATC 3750692

Query 6059 TACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACA 6118

| |

Sbjct 3750693 TACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAA 3750752

Query 6119 TGGATGAAATTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACAC 6178

| | | |

Sbjct 3750753 TGGATGGACCTGGAGAGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACAATCACAAAGGAACTCACAC 3750812

Query 6179 CGCATATTCTCACTCATAGGTGG 6201

|

Sbjct 3750813 AATATGTACTCACTGATAAGTGG 3750835


Features flanking this part of subject sequence:
  447385 bp at 5' side: solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchan...
  95043 bp at 3' side: myeloid/lymphoid or mixed lineage-leukemia translocation ...


Score = 1373 bits (1522),  Expect = 0.0
Identities = 2605/3797 (68%), Gaps = 44/3797 (1%)
Strand=Plus/Minus

Query 2425 AATGGACTAAATGCTCCAATTAAAAGACACAGACTAGCAAATTGGATAAAGAGTCAAGAC 2484

|

Sbjct 26953491 AATGGTCTCAACTCGCCAATAAAAAGACATAGACTAACAAACTGGCTACACAAACAAGAC 26953432

Query 2485 CCATCAGTGTGCTGTATTCAGGAAACCCATCTCACATGCAGAGACACACATAGGCTCAAA 2544

| | | |

Sbjct 26953431 ACAACATTTTGCTGCTTACAGGAAACTCATCTCAGAGAAAAAGATAGACACTACCTCAGA 26953372

Query 2545 ATAAAGGGATGGAGGAAGATCTACCAAGCAAACGGAAAACAAAAAAAGGCAGGGGTTGCA 2604

| |

Sbjct 26953371 ATGAAAGGCTGGAAAACAATTTTCCAAGCAAATGGTATGAAGAAACAAGCAGGAGTAGCC 26953312

Query 2605 ATCCTAGTCTCTGATAAAACAGACTTTAAACCAACAAAG--ATCAAAAGAGACAAAGAAG 2662

|

Sbjct 26953311 ATCCTAATATCTGATAAGATTGACTTCCAACC--CAAAGTCATCAAAAAAGACAAGGAGG 26953254

Query 2663 GCCATTACATAATGGTAAAGGGATCAATTCAACAAGAAGAGCTAACTATCCTAAATATAT 2722

| | | |

Sbjct 26953253 GACACTTCATTCTCATCAAAGGTAAAATCCTCCAAGAGGAACTCTCAATTCTGAATATCT 26953194

Query 2723 ATGCACCCAATACAGGAGCACCAAGATTCA-TAAAGCAAGTCCTGAGTGACCTACAAAG- 2780

| | | |

Sbjct 26953193 ATGCTCCAAATACAAGAGCAGCCACATTCACTAAAGAAACT--TTAGTAAAGCTCAAAGC 26953136

Query 2781 AGACTTAGACTCCCACACATTAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAACATTAGA 2840

| |

Sbjct 26953135 ACACATTGCGCCTCACACAATAATAGTGGGAGACTTCAACACACCACTTTCACCAATGGA 26953076

Query 2841 CAGATCAACGAGACAGAAAGTCAACAAGGATACCCAGGAATTGAACTCAGCTCTGCAGCA 2900

| | |

Sbjct 26953075 CAGATCATGGAAACAGAAACTAAACAGGGACACACTGAAACTAACAGAAGTGATGAAACA 26953016

Query 2901 AGCGGACCTAATAGACATCTACAGAACTCTCCACCCCAAATCAACAGAATATACATTTTT 2960

|

Sbjct 26953015 AATGGATCTGACAGATATCTACAGAACATTTTACCCTAAAACAAAAGGATATACCTTCTT 26952956

Query 2961 TTCAGCACCACACCACACCTACTCCAAAATTGACCACATACTGGGAAGTAAAGCACTCCT 3020

|

Sbjct 26952955 CTCAGCACCTCATGGTACCTTCTCCAAAATTGACCACATAATAGGTCACAAATCAGGCCT 26952896

Query 3021 CAGCAAATGTAAAAGAACAGAAATTATAACAAACTATC-TCTCAGACCACAGTGCAATCA 3079

|

Sbjct 26952895 CAACAGATTCAAAAATATTGAAATTGTCCCATG-TATCCTATCAGATCACCATGCACTAA 26952837

Query 3080 AACTAGAACT-CAGGATTAAGA-ATCTCACTCAAAACCGCTCAACTACATGGAAACTGAA 3137

| |

Sbjct 26952836 GGCT-GATCTTCAATAACAAAATAAATAACAGAAAGCCAA-CATTCACATGGAAACTGAA 26952779

Query 3138 CAACCTGCTCCTGAATGACTACTGGGTACATAACGAAATGAAGGCAGAAATAAAGTTGTT 3197

| | |

Sbjct 26952778 CAACACTCTTCTCAATGATACCTTGGTCAAGGAAGGAATAAAGAAAGAAATTAAAGACTT 26952719

Query 3198 CTTTGAAACCAATGAGAACAAAGACACAACATACCAGAATCTCTGGGATGCATTCAAAGC 3257

Sbjct 26952718 TTTAGAGTTTAATGAAAATGAAGCCACAACGTACCCAAACCTTTGGGACACAATGAAAGC 26952659

Query 3258 AGTGTGCAGAGGGAAATTTATAGCACTGAATGCCCACAAGAGAAAGCAGGAAAGATCCAA 3317

| | | |

Sbjct 26952658 ATTTCTAAGAGGGAAACTCATAGCTATGAGTGCCTTCAAGAAAAAACGGGAGAGAGCACA 26952599

Query 3318 AATTGACACCCTAACATCACAATTAAAAGAACTAGAAAAGCAAGA-GCAAACACATTCAA 3376

|

Sbjct 26952598 TACTAGCAGCTTGACAACACATCTAAAAGCTCTAGAAAAAAAGGAAGCAAATTCACCCAA 26952539

Query 3377 AAGCTAGCAGAAGGGAAGAAATAACTAAAATCAGAGCAGAACTGAAGGAAATAGAGACAC 3436

|

Sbjct 26952538 GAGG-AGTAGACGGCAGGAAATAATCAAACTCAGGGGTGAAATCAACCAAGTGGAAACAA 26952480

Query 3437 AAAAAACCCTTCAAAAAATTAATGAATCCAGGAGCTGGTTTTTTGAAAGGATAAACAAAA 3496

| |

Sbjct 26952479 GAAGAACTATTCAAAGAATTAACCAAACGAGGAGTTGGTTCTTTGAGAAAATCAACAAGA 26952420

Query 3497 TTGATAGACCGCTAGCAAGACTAA-TAAAGAAAAAAAGAGAGAAGAATCAAATAGATGCA 3555

| | | | | | |

Sbjct 26952419 TAGATAAACCCTTAGCTAGACTCACTAAAGGGCACAGG-GACAAAATCCTAATTAACAAA 26952361

Query 3556 ATAAAAAAATGATAAAGGGGATATCACCACCAATCCCACAGAAATACAAACTACCATCAG 3615

|

Sbjct 26952360 ATCAGAAA-TGAAAAGGGAGACATAACAACAGATCCTGAAGAAATCCAAAACACCATCAG 26952302

Query 3616 AGAATACTACAAACACCTCTACGCAAATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAATGGATAAATT 3675

Sbjct 26952301 ATCCTTCTACAAAAGGCTATACTCAACAAAACTGGAAAACCTGGACGAAATGGACAAATT 26952242

Query 3676 CCTGGACACATACACTCTCCCAAGACTAAACCAGGAAGAAGTTGAATCTCTGAATAGACC 3735

Sbjct 26952241 TCTGGACAGATACCAGGTACCAAAGTTGAATCAGGATCAAGTTGACCTTCTAAACAGTCC 26952182

Query 3736 AATAACAGGAGCTGAAATTGTGGCAATAATCAATAGCTTACCAACCAAAAAGAGTCCAGG 3795

| | |

Sbjct 26952181 CATATCCCCTAAAGAAATAGAAGCAGTTATTAATAGTCTCCCAGCCAAAAAAAGCCCAGG 26952122

Query 3796 ACCAGATGGATTCACAGCCGAATTCTACCAGAGGTACAAGGAGGAACTGGTACCATTCCT 3855

|

Sbjct 26952121 ACCAGACGGGTTTAGTGCAGAGTTCTATCAGACCTTCAAAGAAGATCTAACTCCAGTTCT 26952062

Query 3856 TCTGAAACTATTCCAATCAATAGAAAAAGAGGGAATCCTCCCTAACTCATTTTATGACGC 3915

Sbjct 26952061 GCACAAACTTTTTCACAAGATAGAAGTAGAAGGTATTCTACCCAACTCATTTTATGAAGC 26952002

Query 3916 CAGCATCATTCTGATACCAAAGCCAGGCAGAGACACAACAAAAAAAGAGAATTTTAGACC 3975

| |

Sbjct 26952001 CACTATTACTCTGATACCTAAACCACAGAAAGATCCAACAAAGATAGAGAACTTCAGACC 26951942

Query 3976 AATATCCTTGATGAACATTGAGGCAAAAATCCTCAATAAAACACTGGCAAAATGAATCCA 4035

Sbjct 26951941 AATTTCTCTTATGAACATCGATGCAAAAATCCTTAATAAAATTCTCGCTAACCGAATCCA 26951882

Query 4036 GCAGCACATCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAAGG 4095

| |

Sbjct 26951881 AGAACACATTAAAGCAATCATCCATCCTGACCAAGTAGGTTTTATTCCAGGGATGCAGGG 26951822

Query 4096 CTGGTTCAATATACGCAAATCAATAAATGTAATCCAGCATAAAAACAGAGCCAAAGACAA 4155

|

Sbjct 26951821 ATGGTTTAATATACGAAAATCCATCAATGTAATCCATTATATAAACAAACTCAAAGACAA 26951762

Query 4156 AAACCACATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAAGCCTTTGACAAAATTCAACAACCCTT 4215

Sbjct 26951761 AAACCACATGATCATCTCGTTAGATGCAGAAAAAGCATTTGACAAGATCCAACACCCATT 26951702

Query 4216 CATGCTAAAAACTCTCAATAAATTAGGTATTGATGGGACGTATTTCAAAATAATAAGAGC 4275

| | |

Sbjct 26951701 CATGATAAAAGTTCTGGAAAGATCAGGAATTCAAGGCCAATACCTAAACATGATAAAAGC 26951642

Query 4276 TATCTATGACAAACCCACAGCCAATATCATACTGAATGGGCAAAAACTGGAAGCATTCTC 4335

| |

Sbjct 26951641 AATCTACAGCAAACCAGTAGCCAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCC 26951582

Query 4336 TTTGAAAACTGGCACAAGACAGGGATGCCCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTGTT 4395

| |

Sbjct 26951581 ACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGTACT 26951522

Query 4396 GGAAGTTCTGGCCAGGGCAATTAGGCAGGAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGAAA 4455

|

Sbjct 26951521 TGAAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACAAATTGGAAA 26951462

Query 4456 AGAGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCAGACGACATGATTGTATATCTAGAAAACCCCAT 4515

Sbjct 26951461 AGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAA 26951402

Query 4516 TGTCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAA 4575

| | |

Sbjct 26951401 AAATTCCAACAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGGATATAA 26951342

Query 4576 AATCAATGTACAAAAATCACAAGCATTCTTATACACCAACAACAGACAAACAGAGAGCCA 4635

| |

Sbjct 26951341 AATTAACTCAAACAAGTCAATGGCCTTTCTCTACACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGA 26951282

Query 4636 AATCA-TGAGTGAACTCCCATTCACAATTGCTTCAAAGAGAATAAAATACCTAGGAATCC 4694

Sbjct 26951281 AATTAGGGAAACAACACCC-TTCTCAATAGCCACAAATAATATAAAATATCTCGGCGTGA 26951223

Query 4695 AACTTACAAGGGATGTGAAGGGCCTCTTCAAGGAGAACTACAAACCTCTGCTCAAGGAAA 4754

| | | |

Sbjct 26951222 CTCTAACGAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAGTCCCTGAAGAAAGAAA 26951163

Query 4755 TAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAATA 4814

| | | |

Sbjct 26951162 TTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGACCAACA 26951103

Query 4815 TCGTGAAAATGGCCATACTCCTCAAGGTAATTTACAGATTCAATGCCATCCCCATCAAGC 4874

|

Sbjct 26951102 TTGTAAAAATGGCTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATTAAAA 26951043

Query 4875 TACCAATGACTTTCTTCACAGAACTGGAAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAA 4934

| | | | | |

Sbjct 26951042 TTCCAACTCAATTCTTCAACGAATTAGAAGGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAATAACA 26950983

Query 4935 AGAGAGCCCACATCGCCAAGTCAATCCT--AAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCAC 4992

| | | |

Sbjct 26950982 AAAAACCGAGGATAGCAAAAACTCTTCTCAAGGATAAAAGAAC--CTCTGGTGGAATCAC 26950925

Query 4993 ACTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGGTA 5052

Sbjct 26950924 CATGCCTGACCTAAAGCTTTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTACTGGTA 26950865

Query 5053 CCAAAACAGAGATATTGATCAATGGAACAGAACAGGGCCCTCAGAAATAACGCCGCATAT 5112

| | | |

Sbjct 26950864 TAGAGACAGACAAGTGGACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAGAAATGAACCCACACAC 26950805

Query 5113 CTACAACTATCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCT 5172

|

Sbjct 26950804 CTATGGTCACTTGATCTTCGACAAGGGAGCCAAAACCATCCAGTGGAAGAAAGACACCAT 26950745

Query 5173 ATTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCAT-ATGTAGAAAGCTGAAACTGGATC 5231

| | |

Sbjct 26950744 TTTCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGG-TTGTTATCATGTAGAAGAATGCGAATCGATC 26950686

Query 5232 CCTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTTAGAC 5291

| | | |

Sbjct 26950685 CATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAAGGAACTTCACATAAAAC 26950626

Query 5292 CTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACGTAGGCATTACCATTCAGGACATAGGCATGG 5351

| |

Sbjct 26950625 CAGAGACACTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTTGAAGATATGGGCACAG 26950566

Query 5352 GCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGACAAAATTGACAAAT 5411

| |

Sbjct 26950565 GGGAAAAATTCCTGAACAGAACAGCAATGGCTTGTGCTGTAAGATCGAGAATTGACAAAT 26950506

Query 5412 GGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACT-ACCATCAGAGTGAAC 5470

| |

Sbjct 26950505 GGGACCTAATGAAACTCCAAAGTTTCTGCAAGGCAAAAGACACTGTCTATAAGA-CAAAA 26950447

Query 5471 AGGCAACCTACAAAATGGGAGAAAATTTTTGC--AACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAA 5528

| | | | |

Sbjct 26950446 AGACCACCAACAGACTGGGAAAGGATCTTTACCTATCCTA--AATCAGATAGGGGACTAA 26950389

Query 5529 TATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAATTTACAAGAAAAAAACAAACAACCCCATCA 5588

| |

Sbjct 26950388 TATCCAACATATATAAAGAACTCAAGAAGGTGGACCTCAGAAAATCAAATAACCCCCTTA 26950329

Query 5589 AAAAGTGGGTGAAGGACATGAACAGACACTTCTCA---AAAGAAGACATTTATGCAGCCA 5645

|

Sbjct 26950328 AAAAATGGGGCTCAGAACTGAACAAAGAATTCTCACCTGAGGAATAC-CGAATG--GCAG 26950272

Query 5646 ACAGACACATGAAAAAATGCTCATCATCACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCA 5705

|

Sbjct 26950271 AGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAA 26950212

Query 5706 CAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGCGATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACA 5765

Sbjct 26950211 CCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTGAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCA 26950152

Query 5766 GGTGCTGGAGAGGATGTGGAGAAATAGGAACATTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAAC 5825

| | |

Sbjct 26950151 GATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGC 26950092

Query 5826 TAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAGAACTGGAAATAC 5885

| | |

Sbjct 26950091 TTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTAC 26950032

Query 5886 CATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCATGCTGCT 5945

| | |

Sbjct 26950031 CGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGA----AGCCCCAACTGGT 26949976

Query 5946 -ATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTGG 6004

| | |

Sbjct 26949975 AAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAACTGG 26949916

Query 6005 AACCAACCCAAATGTCTAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACC 6064

|

Sbjct 26949915 AAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACA 26949856

Query 6065 ATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATG 6124

|

Sbjct 26949855 ATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATG 26949796

Query 6125 AAATTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATA 6184

| | |

Sbjct 26949795 GACCTGGAGAGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACAATCACAAAGGAACTCACACAATATG 26949736

Query 6185 TTCTCACTCATAGGTGG 6201

Sbjct 26949735 TACTCACTGATAAGTGG 26949719


(more in tomorrow's entry)

and that's not all.

So what does that mean? the sequence is a really, really common one at this level of identity? (Chr4 is the 4th, after equal similitude to parts of chr15 for example).

  • Heather 08:08, 1 August 2009 (EDT):