Talk:20.109(S08):Start-up protein engineering (Day1): Difference between revisions

From OpenWetWare
Jump to navigationJump to search
No edit summary
Line 98: Line 98:
===All class mutations===
===All class mutations===
<code>
<code>
1                                                                                                99
1                                                                                                99
TDQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIYFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGY
TDQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIYFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGY
                   P      D                          H  E  P                            H D D
                   P      D                          H  E  P                            H D D
                   R      R                          I  K  D                            A K P
                   R      R                          I  K  D                            A K P
Line 106: Line 106:


    
    
100                                          148
100                                          148
ISAAQLRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK
ISAAQLRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK
  L                              R               
  L                              R               
  T                              W               
  T                              W               

Revision as of 19:26, 13 March 2008

TR lab

Team colour Mutant 1 Primer 1 (forward) Mutant 2 Primer 2 (forward)
Red D133R GGGAAGCAGATATCGATGGTCGTGGCCAAGTAAACTATGAAG D133W GGGAAGCAGATATCGATGGTTGGGGCCAAGTAAACTATGAAGAG
Purple Y64P GCTGATGGCAATGGAACGATTCCCTTTCCTGAATTTCTTACTATG Y64K GCTGATGGCAATGGAACGATTAAGTTTCCTGAATTTCTTACTATG
Blue G98D GACAAGGATGGGAACGACTACATCAGCGCTGCTCAGTTACGTC G98P GACAAGGATGGGAACCCCTACATCAGCGCTGCTCAGTTACGTC
Pink G96D CGTGTTTTTGACAAGGATGACAACGGCTACATCAGCGCTGC G96K GTTTTTGACAAGGATAAGAACGGCTACATCAGCGCTGCTCAG
Yellow T28D CGACAAGGATGGGGACGGCACCATCGACACAAAGGAAC T28R GATGGGGACGGCACCATCAGGACAAAGGAACTTGGCACCG
Green Y64D GGCAATGGAACGATTGACTTTCCTGAATTTCTGACTATGATGGC Y64H GGCAATGGAACGATTCACTTTCCTGAATTTCTCACTATGATGGC


WF lab

Team colour Mutant 1 Primer 1 (forward) Mutant 2 Primer 2 (forward
PINK D56->P CTTCTCATTATTCCCCAAGGATGGGGACGGCACCATCACC D56->R CTTCTCATTATTCCGCAAGGATGGGGACGGCACCATCACC
PURPLE S101->L GATGGGAACGGCTACATCCTCGCTGCTCAG S101->T GATGGGAACGGCTACATCACCGCTGCTCAG
BLUE N60->E GATGCTGATGGCGAAGGAACGATTTAC N60->K GATGCTGATGGCAAGGGAACGATTTAC
RED G98->P GTTTTTGACAAGGATGGGAACCCCTACATCAGCGCTGCTCAG G98->W GTTTTTGACAAGGATGGGAACTGGTACATCAGCGCTGCTCAG
Yellow D56H 5' GAT ATG ATC AAT GAA GTC CAT GCT GAT GGC AAT GGA ACG 3' D56I 5' GAT ATG ATC AAT GAA GTC ATT GCT GAT GGC AAT GGA ACG 3'
GREEN K94->H gcattccgtgtttttgacCACgatgggaacggctacatcagcgc K94->A gcattccgtgtttttgacGCGgatgggaacggctacatcagcgc


All class mutations

1                                                                                                99
TDQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIYFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGY
                  P       D                           H   E   P                             H D D
                  R       R                           I   K   D                             A K P
                                                              K                                 P
                                                              H                                 W


100                                           148
ISAAQLRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK
L                               R              
T                               W